8 - relation entre ADN et phénotype Flashcards

(33 cards)

1
Q

compo génome nucléaire humain (3)

A
  • séqces répétées
  • séqces uniques
  • gènes codant pour prot = 1.5%
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2
Q

rôle des séqces entourant les gènes (3)

A
  • régulation de exp° de ces gènes
  • explication de variabilité de pénétrance + expressivité de certains phénotypes
  • facteurs influencent régulation de exp°
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3
Q

densité génétique (2)

A
  • nb de gènes par mégabase (Mb) d’ADN
  • faible chez orgas complexes = + grand génome mais PAS + de gènes
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4
Q

que permet de créer la variabilité dans régulation de transcription

A

pénétrance + expressivité

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5
Q

pénétrance (3)

A
  • prop° d’inds possédant 1 génotype spq qui expriment réellement ce génotype au niv phénotypique
  • pénétrance complète (100%) VS incomplète
  • calcul au niv de la pop
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6
Q

expressivité (3)

A
  • niv auquel 1 allèle est exprimé au niv phénotypique = intensité phénotype
  • expression variable
  • mesure au niv de chq ind de la pop
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7
Q

distinction expressivité VS pénétrance (3)

A
  • 2 phénomènes ≠
  • pénétrance = absce/présce d’1 phénotype
  • expressivité = degré exp° d’1 phénotype qd présent
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8
Q

de quoi dépend la variabilité de pl. traits phénotypiques et maladies (3)

A
  • dépend du point de polymorphisme simple (SNP)
  • points de polymorphisme pas retrouvés seulement dans gènes codants
  • majT des SNP liés à maladies -> ds ADN intergénique ou ds introns
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9
Q

de quoi dépendent la pénétrance et l’expressivité d’1 phénotype particulier

A

dépendent d’1 phénotype particulier du polymorphisme des régions régulatrices ou entourant le gène d’intêret

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10
Q

effet de la région régulatrice sur l’expression d’1 allèle muté (2)

A
  • si région régulatrice est régulée négativement = allèle muté très peu exprimé
  • si région régulatrice est positive = exp° ++ de allèle muté
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11
Q

que peut donner le génotype pour 1 gène d’intêret (3)

A
  • perte de fonction
  • gain de fonction
  • généralement dominant
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12
Q

quel gène à l’origine de la formation des doigts ?

A

sonic hedgehog (SHH)

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13
Q

à quoi est due la formation de doigts supplémentaires (polydactylie) ?

A

due à une exp° de SHH mal régulée

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14
Q

que provoque 1 mutation/SNP ?

A

provoque changement d’un seul nt dans région régulatrice => changement phénotype

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15
Q

où peuvent se trouver les sites de polymorphisme dans les régions régulatrices ?

A

à une bonne distance du gène affecté

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16
Q

def épigénétique

A

changements stables et transmissibles lors de la mitose, causées par activation + désactivation des gènes / SANS altération des seqces nucléotidiques

17
Q

marqueurs qui modifient accès à ADN et aux gènes transcrits (4)

A
  • ARN
  • méthylation de ADN
  • modif° des histones
  • essentiels pour établissement du destin celR
18
Q

méthylation de ADN (3)

A
  • ajout de grpement méthyle (CH3) directement sur ADN -> formation hétérochrtine (répression transcription)
  • => process extinction des gènes
  • maintien grpements méthyle pdt div° celR + act° méthylation sur brin complémentaire
19
Q

acéthylation de ADN (2)

A
  • ajout d’acétyle ou d’1 grpement phosphate -> neutralisation de charge des histones + accès facilité à ADN
  • => aug° transcription
20
Q

modif° des histones (2)

A
  • de manière post-traductionnelle
  • => complexes remodelants
21
Q

syndrome de l’X fragile (4)

A
  • présence d’1 + grd nb de chr X
  • pl. îlots CpG -> aug° de rep induit méthylation du promoteur du gène FMR1
  • symptômes dégénératifs chez personne âgée
  • pb neurologiques pdt devt
22
Q

qu’est-ce qui est maintenu lors des mitoses ? (2)

A
  • maintien de méthylation de ADN + modif° post-traductionnelle des histones
  • influence de toute lignée celR
23
Q

altération des marqueurs épigénétiques (3)

A
  • par facteurs intrinsèques (homones, âge)
  • par facteurs externes (envtx)
  • => liée à maladies / cancer
24
Q

causes externes qui peuvent altérer les marqueurs épigénétiques (5)

A
  • nutrition
  • exercice
  • polluants
  • drogue
  • temp°
25
visibilité des effets des modif° épigénétiques (3)
- sur pl. générations (transgenerational heritance) - apparence d'hérédité transgénérationnelle - malgré effacement intensif des marques épigénétiques portées par gamètes
26
empreinte génomique (3)
- phénomène où 1 des 2 copies (maternelle ou paternelle) est gardée silencieuse par méthylation - empreintes effacées dans cells germinales primordiales, établies pdt gamétogenèse + maintenues ds embryon - aberrations génétiques et épigénétiques affectent 1 locus
27
dosage chrmique
perte ou gain d'1 chr pdt fécondation ou pdt devt précoce du foetus -> généralement létal
28
compensation de dosage
process par lequel l'exp° des gènes portés par chr X est quantitativement équivalente chez M et F, suite à inactivation des chr X supplémentaires
29
inactivation initiale des chr X
aléatoire + corpuscule de Barr correspond au chr X inactivé
30
inactivation de l'X chez l'humain (4)
- lors du stade blastocyste - aléatoire puis maintien de inactivation du chr à travers div° celR - présence de "région d'inactivation" qui comprend la séqce du long ARN non-codant XIST - XIST devient corpuscule de Barr
31
similarités inactivation du chr X chez souris et humain (2)
- se fait tjs tôt ds devt - aléatoire
32
ratio du corpuscule de Barr
il y a tjs 1 corpuscule de Barr de moins que de chr X totaux
33
inactivation du chr X chez les chats (3)
- M porteurs uniformément colorés - F homozygotes uniformément colorées - F hétérozygotes bicolores