9 - mutations ponctuelles et réparation Flashcards
(61 cards)
1
Q
qu’englobent les mutations ?
A
tous les changements de séqce de l’ADN
2
Q
que peuvent être les mutations ? (3)
A
- néfastes
- bénéfiques
- nulles
3
Q
que peuvent affecter les mutations ?
A
structure de la prot et/ou régulation de transcription
4
Q
mutations sont à la base de quoi ? (4)
A
- polymorphisme
- allèles
- évolution
- certaines maladies
5
Q
mutations ponctuelles (4)
A
- substitution de nt
- pdt réplication
- modif° de structure chq d’1 nt déjà présent
- indels (insertion ou délétion d’1 paire de nt)
6
Q
mutations profondes (4)
A
- large insertion ou délétion
- réarrangement chrmique = modif° de orga de large région d’1 chr
- amplification génétique = rép° anormales de régions de ADN suite à réplication -> aug° taille génome
- anomalies chrmiques
7
Q
def substitutions
A
remplacement d’1 nt, réplication suivante assure intégration de la modif de manière permanente sur les 2 brins
8
Q
qu’impliquent les substitutions ?
A
implication des mécanismes de réplication de ADN
9
Q
2 classes de substitutions
A
- transition d’1 pyrimidine à 1 autre (C à T) ou d’1 purine pour 1 autre (A à G)
- transversion d’1 pyrimidine pour 1 purine (T pour A ou G) ou le contraire
10
Q
indels (5)
A
- insertions et délétions de paires de nt
- => changement du cadre de lecture
- souvent causé par 1 glissement de la polymérase pdt réplication
- glissement du brin polymérisé (amorce) -> insertion
- glissement du brin matrice -> délétion
11
Q
que se passe-t-il si une base erronée ou 1 indel n’est pas réparé ? (2)
A
- intégration de mutation au génome de manière permanente dès réplication suivante
- modif° ds cells germinales primordiales -> mutation fixe
12
Q
pl. changements selon position des mutations (3)
A
- changement ds séqce codant 1 prot (trad°)
- changement ds région régulatrice de l’exp° génique (transcription)
- changement dans structure de ADN
13
Q
effet d’1 changement ds séqce codant 1 prot (3)
A
- changement de forme, activité, asso à autres prots
- mutants complets
- mutants partiels
14
Q
def mutants complets
A
mutations touchant site actif de prot ou en sont proche -> perte de fonction de la prot
15
Q
def mutants partiels
A
mutations touchant zones - essentielles d’1 prot -> effet - néfaste
16
Q
points de mutations pathologiques connus du récepteur glucocorticoïde (GR) : subtitution T -> A (2)
A
- dim° ++ affinité aux ligands
- dim° loc° nucléaire (- de récepteurs au niv nucléaire)
17
Q
points de mutations pathologiques connus du récepteur glucocorticoïde (GR) : subtitution G -> C (3)
A
- aug° activation
- diabète
- hypertension
18
Q
points de mutations pathologiques connus du récepteur glucocorticoïde (GR) : subtitution T -> C (2)
A
- dim° activation
- dim° affinité aux ligands
19
Q
substitution silencieuse
A
sans effet sur séqce des AA
20
Q
substitution faux-sens
A
modif° de prot finale
21
Q
substitution non-sens
A
création d’1 codon stop
22
Q
à quoi sont dues les mutations silencieuses ?
A
à redondance (ou dégénérescence) du code génétique -> même AA malgré modif
23
Q
redondance du code génétique
A
64 codons codent pour 20 AA + 3 codons stop ==> pl. codons pour 1 même AA
24
Q
que changent les mutations faux-sens ?
A
changement d’1 codon spécifiant 1 AA en 1 autre codon ne spécifiant pas le même AA => modif de séqce de la prot
25
mutations faux-sens conservatives
due à 1 subsitution qui est sans effet sur fonction de prot
26
mutations faux-sens non conservatives
subsitution d'1 paire de nt entraine mise en place d'1 AA fonctionnellement ≠
27
effet de mutation non-sens (2)
- modif° d'1 codon codant pour 1 AA en 1 codon stop -> arrêt prématuré de synthèse de prot (prot non fonctionnelle car + courte)
- implication chez ~10% patients atteints de maladies génétiques
28
3 types de indels
- décalage du cadre de lecture provoquant 1 long faux-sens
- décalage du cadre de lecture provoquant 1 non-sens immédiat
- décalage du cadre de lecture restreint
29
décalage du cadre de lecture provoquant 1 long faux-sens
prot finale ≠, modif° des AA
30
décalage du cadre de lecture provoquant 1 non-sens immédiat
création d'1 codon STOP
31
décalage du cadre de lecture restreint
ajout ou perte d'1 codon, mais prot finale reste la même
32
est-ce que les substitutions provoquent 1 décalage du cadre de lecture ?
non, que les indels
33
effets des mutations dans régions non codantes d'1 gène (3)
- pas effet sur séqce en AA de la prot
- impacts importants sur régulation de exp° des gènes ou maturation
- => impact sur fonctionnement de prot
34
mutation des séqces régulatrices (3)
- reconnues par des activateurs (ou répresseurs)
- si modifiées -> reconnaissance - efficace par molécules régulatrices
- => - bonne régulation du gène + perturbation dans quantité de prot (aug° ou dim°)
35
mutation des séqces promotrices basales (3)
- promoteur basal = séqce reconnue par ARNpol
- essentiel pour bonne transcription du gène
- si modif° de séqce -> accrochage de ARNpol détérioré + perturbation dans quantité de prot
36
mutation du 5'UTR et du site d'initiation de la trad° (3)
- qques nt entourant séqce AUG = essentiels pour id° du site d'initiation de la trad° + début de la prot
- mutation avant AUG -> reconnaissance difficile du site d'initiation de trad°
- sites de régulation impts sur le 5'UTR
37
mutation à jonction intron-exon (3)
- conservation partielle des séqces des jonctions délimitant introns et exons
- nécessaires à reconnaissance de ces régions pour machinerie d'épissage
- mutation en périphérie des introns -> perturbation de épissage de ARNm
38
mutation au codon-stop ou site de coupure du transcrit primaire (3)
- séqces qui arrêtent trad° et transcription
- modif° possible de trad° et transcription
- si modif° de séqce de polyadénylation -> pas terminaison adéquate du transcrit = pas de queue polyA ou instabilité
39
mutations spontanées (3)
- implication de mécanismes de réplication de ADN
- introduction d'1 erreur pdt réplication et pas réparation
- modif° de structure chq d'1 nt déjà présent induit 1 erreur de lecture de polymérase -> asso de mauvaise BA
40
erreurs dans réplication de ADN (2)
- tautomérie
- glissement de machinerie de réplication (décalage cadre de lecture)
41
lésions spontanées (+induites) (3)
- dépurination
- désamination
- endommagement des bases par oxydation ou alkylation
42
tautomérie (4)
- formes alternatives des bases de ADN = tautomères
- => isomères qui diffèrent par position de leurs atomes + par liaison de ces atomes
- insertion d'1 mauvais tautomère d'1 base standard -> mésappariement (création possible d'1 mutation pdt réplication)
- mésappariements = exemples de mutations par substitution
43
glissement de machinerie de réplication : mécanisme de glissement réplicatif
apparition d'indels qd boucles formées ds régions sb stabilisées par 1 "appariement décalé" de séqces répétées pdt réplication
44
glissement de machinerie de réplication : microsatellites (2)
- => séqce d'ADN compo par répétition de qques (2 à 10) nt
- causent des "dérapages" -> aug°/dim° nb répétitions présentes
45
lésions spontanées ou induites (3)
- altération dans séqces d'ADN spontannée par facteurs envtx ou action de l'eau
- désamination (perte d' NH3)
- dépurination (coupure du lien glycosidique reliant purine-sucre) -> donne 1 site apurique (AP)
46
impact de transition C -> T ds génome humain (2)
- modif la + fréquente ds lignées germinales et ds cells cancéreuses
- taux désamination de cytosine = déterminant impt de vitesse de perte info
47
agents mutagènes
altérations chq qui peuvent être provoquées par facteurs envtx -> substances mutagènes (agents mutagènes qui augmentent taux de mutations) + radiations
48
4 mécanismes de mutagènes
- alkylation
- oxydation
- analogue de base
- agent intercalant
49
mécanismes mutagènes : alkylation
ajout de grpements chq sur bases -> mésappariement/pas d'appariement
50
mécanismes mutagènes : oxydation
ajout d'1 O ou perte d'1 H -> mésappariement
51
mécanismes mutagènes : analogue de base
1 autre molécule remplace 1 base + appariement selon molécule ajoutée
52
mécanismes mutagènes : agent intercalant
insertion d'1 molécule entre les bases
53
altérations chq provoquées par radiations (3)
- rayons UV -> fusion photochq (formation anneau de cyclobutane)
- radiations ionisantes directes -> attaque du sucre = cassure db de ADN
- radiations ionisantes indirectes -> favorisation apparition de radicaux libres
54
réparation des mutations (3)
- réparation avant prochaine div° celR
- réparation basée sur info du brin complémentaire -> info génétique redondante au sein de double hélice
- réparation basée sur chr homologue -> info redondante des chrtides soeurs qd présentes
55
conséqces mutations dans cells germinales
affectent cells de lignée germinale -> transmission par gamètes (héréditaires)
56
conséqces mutations dans cells somatiques
affectent ind seulement -> jamais héréditaires (ex: mutations dans régulation du cycle celR = cancer)
57
3 types de conséqces sur valeur adaptative
- nuisibles
- aucun effet
- aug° de valeur adaptative
58
qu'est-ce qui est à la base de l'évolution ?
polymorphisme + mutations de ADN
59
que nécessitent les adaptations ? (2)
- nécessitent 1 variabilité génétique déjà présente dans pop pour permettre sélection de caractères favorables
- pas de création à partir de zéro
60
mutations ponctuelles (3)
- dues à erreurs de réplication / spontanées / aléatoires / rares
- aug° de fréqce par action d'agents mutagènes
- réparation de erreur en général, si non -> reprod° de mutation au cours des cycles celR et héréditaire qd touche cells germinales
61
de quoi les mutations peuvent être la source sur de longues périodes ? (3)
- sources aléatoire de divT des allèles
- à origine des modif° évolutives
- fondements de biodiversité
