Inactivation du chromosome X Flashcards

1
Q

La différence entre les 2 sexes est due à quoi?

A

à la constitution en gonosome

Les femmes possèdent 2 chromosomes X et les hommes possèdent un chromosome X et un chromosome Y.

Les garçons n’ont qu’une seule dose des gènes que l’on retrouve sur le X, alors que les filles en ont deux.

La quantité de produit génique déterminée par l’allèle unique chez les mâles est identique à celle engendrée par la paire d’allèles chez les femelles.

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Q

Qu’est ce que l’inactivation du X

A

Système de compensation du dosage génique entre le mâle (46,XY) et la femelle (46,XX)

Mécanisme utilisé chez les mammifères

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3
Q

Quel est plutôt le mécanisme chez les insectes?

A

augmentation de l’expression des gènes du X chez le mâle

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4
Q

Quel est plutôt le mécanisme chez les nématodes?

A

répression de 50% des gènes sur chacun des X de la femelle

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5
Q

Caractéristiques du X inactif (4)

A

Similaire à 1. l’hétérochromatine:
Hyperméthylation des ilôts CpG des régions promotrices et des histones H3
2. Hypoacétylation des histones H4
3. Condensation maximale maintenue durant l’interphase
4. Réplication de l’ADN tardive

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6
Q

Le mécanisme de l’inactivation du X correspond à quoi? (indice: modifications épigénétiques)

A

Hétérochromatisation:
- C’est le processus par lequel le chromosome X est inactivé.

Hyperméthylation (CH3):

  • L’hétérochromatisation se fait par l’ajout massif de groupements méthyl (CH3)
    sur les îlots CpG de l’ADN.
    • Les îlots CpG sont des régions riches en guanine (G) et en cytosine (C).
  • La cellule eucaryote utilise la méthylation de l’ADN pour inhiber l’expression des gènes que ne sont pas nécessaires à son fonctionnement.
  • Il y a aussi méthylation des histones H3 contenues dans le nucléosome.
    • Ceci a pour effet de compacter la structure de la chromatine.

Hypoacétylation:

L’hétérochromatisation n’est pas complète sans l’enlèvement de groupements acétyls sur les histones H4 formant le nucléosome.

Cette réaction a pour but de resserrer l’ADN autour des nucléosomes et de compacter encore plus l’ADN.

Le chromosome X inactivé ressemblera alors à de l’hétérochromatine, c’est-à-dire de l’ADN génétiquement inactif.

Le chromosome X inactivé s’appellera de l’hétérochromatine facultative.

L’hétérochromatine retrouvée sur les autres chromosomes se nomme hétérochromatine constitutive

(Hétérochromatine constitutive est par exemple l’hétérochromatine qu’on retrouve au niveau des centromères
«facultative» car elle contient des gènes contrairement à l’hétérochromatine constitutive qui fait vrm partie de la structure du chromosome et ne contient pas de gènes)

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7
Q

Étapes de l’inactivation du X (5)

A
  1. Comptage du ratio X:autosome
  2. Choix aléatoire du X à inactiver (au hasard)
  3. Inactivation ou initiation
  4. Propagation
  5. Maintient
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8
Q

Combien de X activé doit être présent dans la cellule? Pk?

A

La présence d’un seul X actif est essentielle à la survie de la cellule diploïde.
L’absence d’un chromosome X actif est létal.
La présence de 2 chromosomes X actifs est également létale.

Par conséquent, un seul X doit être protégé de l’induction de l’inactivation chez la femme XX

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9
Q

Quelle est la règle qui nous indique le nombre de X a inactiver? Donne quelques exemples.

A

Règle du # de X-1 pour la cellule diploïde

Femme normale: 46,XX: 2-1=1
Homme normal: 46,XY: 1-1=0

Anomalies des chromosomes sexuels:
Syndr. de Turner: 45,X: 1-1=0
Syndr. de Klinefelter: 47,XXY: 2-1=1
47,XXX: 3-1=2
47,XYY: 1-1=0

Donc chez l’homme aucun chromosome X ne doit être désactivé
Chez la femme atteinte du syndrome de Turner (qui n’a donc qu’un chromosome X), aucun chromosome X ne doit être désactivé

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10
Q

Étapes de l’inactivation du X

Explique l’étape du Ratio X:autosome

A

Mécanismes moléculaires mal connus

On retrouve un centre d’inactivation (CI) sur le bras long du chromosome X en Xq13.

  • X-pairing region (Xpr): pairage des X à ce niveau au début du processus
  • Séquences similaires retrouvées aussi sur les autosomes: rôle dans le comptage du ratio?
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11
Q

Étapes de l’inactivation: L’initiation

A

Le CI contient le gène XIST (X inactivation (Xi)-specific transcripts) qui est très important dans la régulation de l’inactivation d’un X.

  • Le gène XIST est transcrit en ARN, mais n’est pas traduit en protéine. Il reste dans le noyau en association avec le chromosome X inactif.
  • Le gène XIST est seulement exprimé par l’allèle du chromosome X qui sera inactivé, tandis que l’allèle de XIST du chromosome X actif sera inhibé.

L’ARNm de XIST initie l’inactivation de part et d’autre du CI en s’accumulant sur le futur chromosome X inactivé.

Survient au stade de blastocyste précoce

La présence d’un seul X actif est assurée par la répression de l’activité de XIST sur le X actif.
Ainsi:
- Chez l’homme XY, XIST est inactivé et ainsi, il ne s’exprime pas.
- Chez la femme XX, XIST est exprimé sur le futur X inactivé et réprimé sur le futur X actif.

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12
Q

Étapes de l’inactivation: Propagation

A

L’accumulation de XIST se propage le long des 2 bras chromosomiques du futur X inactivé.

(Se propage de part et d’autre du centre d’inactivation)

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13
Q

Étapes de l’inactivation: Maintenance

A

L’inactivation, donc l’hétérochromatisation, du chromosome X doit être maintenue de façon permanente et à travers les divisions cellulaires.
- Les cellules filles inactiveront toutes le même X (Xpat ou Xmat)

L’inactivation est maintenue suite à des processus épigénétiques:

  • La modification de la chromatine par méthylation et l’hypoacétylation des histones.
    • Entraîne une réplication tardive en phase S du X inactivé.
    • L’ajout de l’histone H2A alternative (la macro-H2A) et la méthylation des îlots CpG de l’ADN qui rendent l’hétérochromatisation irréversible.
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14
Q

Chromatine sexuelle ou corpuscule de Barr

Comment a-t-il été découvert?
À quoi correspond-t-il?

A

1949: Barr et Bertram découvrent une masse à coloration foncée accolée à la membrane nucléaire de neurones de chats femelles. Pas retrouvée chez les mâles.

Même phénomène retrouvé chez l’humain

Spéculent qu’il s’agit d’un chromosome X très condensé en interphase:
Corpuscule de Barr

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15
Q

Chromatine sexuelle def.

A

Définition:

  • Frottis buccal qui est fait dans le but de compter le nombre de corpuscules de Barr.
  • Test rapide qui était effectué lorsque le médecin soupçonnait une anomalie de nombre impliquant les chromosomes sexuels chez un patient.
  • Ce test ne remplace pas le caryotype.

On ne compte que les corpuscules qui sont adhérents à la membrane nucléaire, donc ceux que l’on voit à la périphérie du noyau.

  • Comme le noyau est sphérique et que seuls les corpuscules accolés à la membrane sont comptés, le nombre de corpuscules obtenus est toujours inférieur à la réalité.
  • On considère que la présence du corpuscule dans 20% des cellule examinées représente la situation normale pour les femmes normales.

Technique qui était utilisée en laboratoire: chromatine sexuelle
Pour déterminer le génotype des gonosomes

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16
Q

Exceptions à l’inactivation du X

A

Environ 15% des gènes du chromosome X échappent à l’inactivation.
- Certaines parties demeurent actives.
~10% des gènes ont un patron aléatoire: peuvent ou non être inactivés

Segments de l’X échappant à l’inactivation:
- Les régions pseudoautosomiques (RPA) homologues à l’Y.
Ces régions situées aux extrémités du X et du Y servent à l’appariement à la méiose et sont le site des recombinaisons.
Comme ces régions sont identiques entre l’X et l’Y, le produit des gènes qu’elles contiennent est identique chez l’homme et la femme (2 copies chacun).

Autres régions:

  • Le CI qui contient XIST.
  • D’autres gènes ayant un rôle spécifique chez la femme.
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17
Q

Résumé caractéristiques du X inactif

A

Hyperméthylation
Méthylation des histones H3
Méthylation des îlots CpG de l’ADN

Hypoacétylation des histones H4

Réplication tardive en phase S

État condensé durant l’interphase
Corpuscule de Barr ou chromatine sexuelle

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18
Q

Explique comment se fait le processus d’inactivation du chromosome X dans la cellules mères vs. dans les cellules filles subséquentes.

Comment les cellules s’organisent-elles dans les tissus?

A

Au niveau de l’embryon, le processus pour inactivé le X d’origine maternelle vs celui d’origine paternelle est aléatoire

Lors des mitoses subséquentes, les cellules filles héritent du même X inactivé que celui de la cellule mère (première à subir l’inactivation).

Par la suite dans les tissus, les cellules d’un même type cellulaire se retrouvent regroupées.
Les cellules avec l’X maternel actif sont ensembles et les cellules avec l’X paternel sont ensembles.

(Donc chez les femmes XX, on pourrait dire qu’un femme est mosaïque pour le Xpat ou Xmat qui va avoir été inactivé)

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19
Q

Exemple de la chatte calico

A

Mosaïques pour l’expression du Xpat et Xmat

Pattern de taches noires et taches oranges se trouvent uniquement chez des femelles car les allèles de ces pigments se retrouvent sur le chromosome X - donc les deux peuvent être exprimés comme on a une mosaïque de Xmat et Xpat activés ou inactivés

20
Q

Peut-il y avoir un biais dans l’inactivation du X? Explique.

A

Normalement, l’inactivation du X se fait au hasard.
- Une femme se retrouvera avec ≈50% des cellules avec X paternels inactivés et ≈50% des cellules avec X maternels inactivés.

Ratio 50:50 peut être biaisé vers un ou l’autre des chromosomes X:
- phénomène vu chez 5-20% des femmes

Causes possibles:

  • Statistique
  • Sélection contre une population de cellule qui a inactivé ou activé un certain X
    ex. Translocations X:autosome, délétion impliquant XIC sur un X… certaines maladies monogéniques
  • Familles où sélection biaisée de façon héréditaire

(2e point: par exemple va favoriser un chromosome X qui est plus viable
3e point = très rare)

21
Q

Quelle est le nom de la courbe représentant l’inactivation du chromosome X?

A

Courbe de Gaussienne

Inactivation du chromosome X peut être biaisée seulement par hasard

22
Q

Biais dans l’inactivation: anomalies chromosome X

A

Translocations X;autosomes:

  • Les règles de l’inactivation au hasard ne semblent pas se vérifier.
  • Le processus d’hétérochromatisation se propageant le long du chromosome X peut s’étendre à la portion d’autosome transloquée.
  • Le choix du X à inactiver se fait dans le but de se rapprocher le plus possible des conditions normales ie équilibrée au niveau chromosomique.
  • L’inactivation se fait d’abord au hasard, mais une sélection intercellulaire favorisant le type cellulaire le mieux adapté génétiquement s’effectue.

t(X;autosome) équilibrée: inactivation du chromosome X normal favorisée

t(X;autosome) déséquilibrée: inactivation du chromosome X remanié favorisée

23
Q

Cas du X anormal: Translocation X:autosome équilibrée

A

X normal inactivé
afin que la cellules ne subissent pas de déséquilibre génique

(on garde activé le chromosome qui a subie une translocation car sinon on crée une monosomie fonctionnelle de cet autosome et une disomie du chromosome X qui est létale)

24
Q

Cas du X anormal: Anomalie
du X déséquilibrée
(ex: délétion, translocation déséquilibrée…)

A

X anormal inactivé
afin que la cellules ne subissent pas de déséquilibre génique

(inactivation du X anormal car c’est celui qui cause un déséquilibre)

25
Q

Cas du X anormal: Perte de XIST

A

X normal doit s’inactiver

situation qui est rare, le X normal/qui n’a pas la délétion doit s’inactiver

26
Q

Explique pourquoi l’absence de XIST favorise l’inactivation du chromosome normal

A

En l’absence de XIST, le chromosome X ne peut s’inactiver. Il y aura donc expression des gènes sur le chr X normal et sur celui qui est anormal.

Habituellement le chromosome X anormal est petit.

Probablement non viable si disomie plus importante des gènes du chromosome X

27
Q

Mosaïques pour l’inactivation du X

A

Les femmes sont des mosaïques pour l’expression des gènes liés au chromosome X.

Elles possèdent deux populations cellulaires dans lesquelles l’un ou l’autre des chromosomes X est actif.
Comme il y a plusieurs centaines de gènes sur ce chromosome, le chromosome X d’origine paternelle est nécessairement différent du chromosome X d’origine maternelle, c’est-à-dire que ces deux chromosomes portent des allèles qui pourraient être différents.

Les femmes sont des hétérozygotes pour certains allèles du chromosome X.

  • Comme les deux chromosomes X ont des allèles différents, les femmes sont hétérozygotes pour ces allèles.
  • Un certain nombre de cellules exprimeront les allèles d’origine paternel (X maternel inactivé) et les autres cellules exprimeront les allèles d’origine maternel (X paternel inactivé).
  • Dans certaines situations, les deux types cellulaires ainsi produits donneront des phénotypes différents.
28
Q

Femmes hétérozygotes pour des traits liés au X

A

L’inactivation de du chromosome X se fait au hasard à un stade du développement où le nombre de cellules est faible.

Conséquemment, les hétérozygotes peuvent avoir des proportions variables de cellules où un allèle particulier est actif.

  • L’inactivation d’un chromosome X peut être biaisée vers l’un ou l’autre des X.
    • Ratio X maternel inactivé versus X paternel inactivé pas tout à fait égal à 50/50.

Un biais dans l’inactivation du chromosome X survient dans 5 à 20% des femmes.

  • Biais sans importance lorsque les deux X ont des allèles normaux pour tous les gènes
  • Biais peut être très important dans le contexte où l’on retrouve une mutation dans l’une des 2 copie pour un gène en particulier.
    • L’expression de la mutation ou non dépendra de la proportion de cellules qui a inactivé le chromosome avec la mutation vs le chromosome sans la mutation

Ainsi, les femmes hétérozygotes pour un caractère lié à l’X peuvent avoir des phénotypes variables

29
Q

Inactivation du X et traits liés au X

Lyonisation favorable vs. non favorable

A

Si la femme hétérozygote est porteuse d’un allèle muté responsable d’une maladie, la variation phénotypique peut aller d’une expression normale (pas de maladie) à une manifestation complète de la maladie.

Lyonisation favorable:

  • Elle se produit lorsque la majorité des cellules a inactivé l’X portant l’allèle muté responsable de la maladie.
  • La femme hétérozygote porteuse n’est pas atteinte de la maladie.

Lyonisation non favorable:

  • Elle se produit lorsque la majorité des cellules a inactivé le X normal, non porteur de l’allèle muté.
  • C’est le X portant l’allèle de la maladie qui est actif.
  • La femme hétérozygote peut manifester des symptômes de la maladie jusqu’à être complètement atteinte de la maladie

***Lyonisation signifie Inactivation du X (Mary Lyon qui a émis les premières hypothèse concernant l’inactivation du X

(Lyonisation favorable dans la majorité des cas
Non-favorable – normalement plus de 80% des cellules, symptômes peuvent être même aussi sévères que chez un garçon)

30
Q

Exemple: la Dystrophie musculaire de Duchenne (DMD)

A

Maladie héréditaire récessive liée au chromosome X provoquant une dégénérescence progressive des fibres musculaires.

  • Le gène codant pour la dystrophine (gène DMD) est localisé en Xp21.2.
  • La dystrophine est une protéine très importante pour le fonctionnement musculaire.
  • La délétion de certains exons du gène DMD entraîne une dysfonction dans la synthèse de la dystrophine.

La dystrophine est absente chez les individus atteints et diminuée chez les femmes porteuses. C’est la dystrophie musculaire la plus fréquente

Il est possible de détecter la présence de dystrophine par immunocoloration des cellules musculaires.

31
Q

Exemple 2: Dysplasie ectodermique anhydrotique

A

Atteinte de structures ectodermiques

Cheveux clairsemés- absents
Dents coniques, manquantes
Absence de glandes sudoripares

Condition liée au chromosome X

(Cheveux, dents, ongles, glandes sudoripares
Pilosité diminuée, dents malformées et ne produisent pas de sueur à la chaleur
Dessin = pour une femme porteuse (mosaïque tissulaire)
(Anhydrotique: relatif à l’anhidrose, absence ou réduction forte de la transpiration)

32
Q

Le désordre de la différenciation sexuelle def.

A

La différenciation sexuelle n’est pas seulement basée sur la présence ou l’absence du chromosome Y. (Mais on sait qu’il y a des hommes qui ont des gonosomes XX et des femmes qui ont des gonosomes XY)

Définition: Discordance entre le sexe génotypique (la constitution gonosomique) et le sexe phénotypique (l’apparence physique) d’un individu.

33
Q

Le développement sexuel est de base féminin

A

Le chromosome Y induit le développement masculin.

Le développement féminin résulte de l’inactivation des gènes impliqués dans le développement testiculaire.

La présence du gène SRY localisé sur le Y permet une différenciation et un développement sexuel mâle chez les individus 46,XY.

L’absence du gène SRY entraîne un développement sexuel féminin chez les individus 46,XX.

Cependant, certains individus 46,XX sont de sexe masculin et certains individus 46,XY sont de sexe féminin…

On est en présence du phénomène appelé Désordre de la différenciation sexuelle (DSD ou réversion sexuelle).

Le DSD n’est pas un phénomène complètement expliqué.

34
Q

Quels sont les 3 types de gènes impliqués dans le développement secuel?

A

Gènes localisés sur le chromosome Y

Gènes localisés sur le chromosome X

Gènes localisés sur les autosomes

35
Q

Donne un exemple de gènes localisés sur le chromosome Y

A

SRY

36
Q

Donne deux exemples de gènes localisés sur le chromosome X

A

DAX1

AR

37
Q

Donne trois exemples de gènes localisés sur les autosomes

A
WT1
SOX9
SF1
DMRT1
WNT4
38
Q

SRY un gène clé dans le détermination sexuelle

A

SRY (Sex-determining region of the Y chromosome):

  • Localisé en Yp11.3.
  • Code pour le facteur de détermination testiculaire (TDF pour testis determining factor).
  • SRY est un facteur de transcription.

L’expression du gène SRY est le 1er signal qui déclenche la différenciation de la gonade bipotentielle en testicule.

C’est le gène central du développement sexuel mâle.

39
Q

Les hommes XX - prévalence?

A

1/20 000-1/25 000

40
Q

Quels sont les catégories d’hommes XX?

A
  1. Les hommes XX avec gène SRY (ou SRY+) constituant 80 à 90% des cas
  2. Les hommes XX sans gène SRY ou (SRY- ) constituant 10 à 20% des cas.
41
Q

Recombinaison XY et SRY

A

Recombinaison normale entre l’X et l’Y:

Durant la spermatogenèse, les chromosomes X et Y s’apparient au niveau de la région pseudoautosomique du bras court (RPA Ι).

Le gène SRY est situé juste en dessous de la RPA I du chromosome Y en Yp11.3.

Il n’est donc pas impliqué dans la recombinaison normale entre l’X et l’Y.

Il peut survenir une recombinaison anormale qui passe outre la RPA I.

Les individus XX qui se retrouveront avec un chromosome X contenant SRY auront un développement masculin

42
Q

Femmes XY - prévalence?

A

1/3000-1/5000

43
Q

Femmes XY

cause? explique.

A

SRY non fonctionnel:

Le gène SRY peut avoir subi une mutation ou une délétion.
- Il n’y aura pas de synthèse de SRY.
0 Les individus XY avec un SRY non fonctionnel présentent un développement sexuel féminin.

15 à 20% des femmes XY présentent une mutation ou une délétion (mécanisme le plus fréquent: par translocation inégale; diapo précédente) du gène SRY.

La majorité des mutations entraînent une réversion sexuelle complète, mais il y a quelques cas avec des dysgénésies gonadiques partielles.

44
Q

Qu’est ce qu’une dysgénésies gonadiques?

A

**Dysgénésie gonadique: anomalie de développement des gonades durant le développement embryonnaire et menant à l’absence de cellules germinales. Elle cause l’infertilité.

45
Q

Femmes XY: résistance aux androgènes

A

Mutations du récepteur aux androgènes (Xq11q12)

  • Le complexe hormone-récepteur ne peut se former, ce qui cause une résistance aux androgènes).
  • Les tissus ciblés par les androgènes ne peuvent se différencier
  • SRY présent-> formation de testicules qui produiront testostérone
  • Phénotype féminin externe normal avec la présence interne de testicules dans la région inguinale et vagin court (1/3 distal)
    • Hernie inguinale chez la fille peut être un premier signe de résistance aux androgènes

(Dernière situation: mutation du récepteur aux androgène qui est très important pour continuer la différenciation sexuelle au niveau des organes génitaux externes et au niveau des tissus
Mais les tissus ne répondront pas à la testostérone car ont une mutation qui font en sorte que leurs récepteurs ne réagissent pas aux androgènes
Hernie inguinal chez la fille est normalement bcp moins fréquente et lors de la chirurgie, le chirurgien trouve les gonades)