Biochimie exam 3 Flashcards Preview

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Flashcards in Biochimie exam 3 Deck (139):
1

Quels sont les 3 phases du cycle de krebs

- entrée du pyruvate dans la mitochondrie
- décarboxylation du pyruvate dans la mitochondrie
- oxydation du citrate

2

Quel est le bilan énergétique du cycle de kreb

- 6 NADH
- 2 FADH ou QH2
- 2 ATP

3

Où se produit le cycle de krebs

Matrice mitochondriale

4

Quel sont les déchet métabolique du cycle de krebs

-H2O
-CO2

5

Comment s'apelle le transporteur qui permet de faire passer le pyruvate de l'espace intermembranaire de la mitochondrie à la matrice mitochondriale

Translocase du pyruvate

6

Comment est-ce-que le pyruvate entre-t-il dans l'espace intermembranaire de la mitochondrie

par une porine en transport passif

7

Vrai ou faux
L'espace intermembranaire est chargé négativement

Faux, positifement

8

Combien y-a-t'il de d'enzyme et de coenzyme dans le complexe plurienzymatique de la pyruvate déshydrogénase

- 3 enzymes
- 5 co-enzymes

9

Quel est l'avantage du complexe plurienzymatique de la pyruvate déshydrogénase

produit ne diffusent pas dans le millieu mais subissent la catalyse de l'enzyme suivant

10

Quel est le désavantage du complexe plurienzymatique de la pyruvate déshydrogénase

pas de diffusion des intermédiaire

11

Quel sont les 3 enzymes du complexe plurienzymatique de la pyruvate déshydrogénase

- Pyruvate décarboxylase
-Dihydrolipoyl transacetylase
- Dihydrolipoyl dehydrogenase

12

Quels sont les 5 co-enzymes du complexe plurienzymatique de la pyruvate déshydrogénase

-Thiamine pyrophosphate
-Co-enzyme A
- FAD
-NAD
-Acide lipoic

13

Comment d'ATP peut être créé grâce au cycle de krebs d'un acétyl-CoA

12 ATP

14

Vrai ou Faux
le cycle de krebs ne nécessite pas d'O2 pour fonctionner

Faux

15

Quels sont les étape pour passer du pyruvate à l'acétyl-CoA

pyruvate -> hydroxyéthyl TPP -> groupe hydroéthyl + acide lipoïque -> Acétyl-CoA

16

Quel enzyme fait la réaction pyruvate -> hydroxyéthyl TPP

Pyruvate décarboxylase

17

Quel enzyme fait la réaction hydroxyéthyl TPP -> groupe hydroéthyl + acide lipoïque

Dihydroliposyl transacétylase

18

Quel enzyme fait la réaction groupe hydroéthyl + acide lipoïque -> Acétyl-CoA

Dihydroliposyl déhydrogénase

19

Quel molécule inhibe la pyruvate déhydrogénase

-NAD+
-CoA-SH

20

Quel molécule active la pyruvate déhydrogénase

-Acétyl-CoA
- NADH

21

Quel enzyme fait la réaction pyruvate déhydrogénase -> PDH-P

PDH kinase

22

Quel molécule active la PDH kinase

-NADH
-Acétyl-CoA

23

Quel molécule inhibe la PDH kinase

pyruvate

24

Quel enzyme fait la réaction PDH-P -> pyruvate déhydrogénase

PDH phosphatase

25

Quel molécule active la PDH phosphatase

Ca

26

Quels sont les 8 étapes du cycle de krebs

citrate -> isocitrate -> alpha-cétoglutarate -> succinul-CoA -> succinate -> fumarate -> Malate -> Oxaloacétate

27

Quel enzyme fait la réaction citrate -> isocitrate

aconitase

28

Quel enzyme fait la réaction isocitrate -> alpha-cétoglutarate

Isocitrate déshydrogénase

29

Quel enzyme fait la réaction succinul-CoA -> succinate

Succinyl CoA sunthetase

30

Quel enzyme fait la réaction alpha-cétoglutarate -> succinul-CoA

Complexe alpha-cétoglutarate déhydrogénase

31

Quel enzyme fait la réaction succinate -> fumarate

succinate déhydrogénase

32

Quel enzyme fait la réaction fumarate -> Malate

fumarase

33

Quel enzyme fait la réaction Malate -> Oxaloacétate

malate déshydrogénase

34

Quel enzyme fait la réaction oxaloacétate -> Citrate

citrate synthase

35

A quel étape du cycle de kreb y-a-t-il réduction de NAD+ en NADH+H

-isocitrate -> alpha-cétoglutarate
-alpha-cétoglutarate -> succinyl CoA
-Malate -> Oxaloacétate

36

A quel étape du cycle de kreb y-a-t-il réduction de FAD en FADH2

succinate -> fumarate

37

A quel étape du cycle de kreb y-a-t-il production d'ATP

succinyl CoA -> succinate

38

A quel étape du cycle de kreb y-a-t-il production d'H2O

fumarate -> malate

39

Quel enzyme du cycle de krebs sont des stéréoenzyme

aconitase et fumarase

40

Pourquoi le cycle de kreb fonctionne comme un enzyme

- augmente la vitesse de réaction sans subir de tranformation réelle
- dégrade l'acétyl-CoA
- les intermédiaires du cycle sont régénéré
- une petite quantité d'intermédiaire siffit pour métaboliser un grand nombre d'acétyl-CoA

41

De quoi dépend la vitesse de la dégradation de l'acétyl-CoA

de la concentration des intermédiaires donc de la concentration des enzymes

42

Quel sont les réaction anaplérotique du cycle de kreb

- glutamate -> alpha-cétoglutarate (transamination)
- oxaloacétate -> aspartate (transamination)
- pyruvate -> oxaloacétate (pyruvate décarboxylase)

43

Quel sont les deux types de modulation du cycle de krebs

- effecteurs allostérique
- modification covalentes

44

Quel peut être le nombre de mitochondrie dans dans une cellule

1 à 500 000

45

Quel est la longueur et le diamètre de la mitochondrie

- longueur: 0,2 à 0,8 um
- Diamètre: 0,5 à 1,5 um

46

Quel est l'origine des protéines mitochondriales

-minorité de l'ADN mitochondriale
- majorité de l'ADN chromosomique

47

quel sont les structures de la mitochondrie

- 2 membranes
- 1 matrice

48

Décrire la membrane mitochondriale externe

-pauvre en protéine
- perméable grâce à la porine
-petite surface de contact

49

Décrire la membrane mitochondriale interne

- riche en protéine
- imperméable aux ions et substances polaires
- transport actif
- formation d'un gradient
- permet la génération d'énergie
-grande surface de contact grâce aux crête

50

Que contient la matrice mitochondriales

-complexe de la pyruvate déshydrogénase
-enzymes du cycle du citrate
-enzymes d'oxydation des acides gras

51

Où se fait l'oxydation de NADH et FADH

chaine de transport des e- dans le membrane mitochondriale interne

52

Quels sont les 2 parties de la phosphorylation oxydative

- formation d'un gradient de concentration en proton
- synthèse d'ATP par l'ATP synthase

53

Qu'est-ce-que un couple rédox

e- voyagent d'un élément très réducteur vers un agent très oxydant

54

Pourquoi le NADH créé 3 ATP

car il permet de pomper 3 électrons dans l'espace intermembranaire et chaque électron crée un ATP

55

Quels sont les 3 complexe de la chaine de transport d'e- du NADH

- complexe de NADH-ubiquinone réductase
- Complexe ubiquinol-cytochrome c réductase
-Complexe cytochrome c oxydase

56

Quel est l'intermédiaire entre le premier et le deuxième complexe de la chaine de transport d'e

ubiquinone

57

Quel est l'intermédiaire entre le deuxième et le troisième complexe de la chaine de transport d'e-

cytochrome C

58

Quel est l'accepteur final d'e- dans la phosphorilation oxydative

O2

59

Quel est le complexe qui permet l'oxydation de la FADH2

complexe succinate-ubiquinone réductase

60

Quels sont les deux type d'agent découplant de la respiration

-actificiel : 2,4-dinitrophénol
-naturel: la thermogénine de la graisse brune des animaux hibernant

61

Expliquer le fonctionnement de la 2,4-dinitrophénol

transport facilement les H+ d'un côté à l'autre de la membrane et donc réduction de la phosphorylation oxydative

62

Expliquer le fonctionnement de la thermogénine

-sa synthèse est stimulé par l'adrénaline
- le découplage provoqué par la thermogénine permet le dégagement de chaleur

63

Quel sont les 2 navette qui permette l'entré dans la mitochondrie du NADH

-navette du glycérol phosphate
-navette malate-aspartate

64

Où est active la navette du glycérol phosphate

-cerveau
-tissu adipeux brun
-muscle du vol chez les insectes

65

Où est active la navette malate-aspartate

-foie
-coeur

66

Vrai ou Faux
les e- ne sont transféré à l'O2 que losque l'ADP est phosphorylé de façon concomitante en ATP

Vrai, en d'autre mot plus il y a d'ADP plus la phosphorylation oxydative fonctionne

67

Vrai ou Faux
Chez les euraryotes, il y a de multiples origine et terminaison

Vrai

68

Quel ADN polymérase est impliqué dans la réplication de l'ADN

-ADN polymérase I
-ADN polymérase III

69

Quel ADN polymérase est impliqué dans la réparation de l'ADN

-ADN polymérase I
-ADN polymérase II

70

Vrai ou Faux
L'ADN polymérase III est un dimère d'holoenzyme

Vrai

71

Fonctionnement des ADN polymérases

- appariement correct du dNTP
-attaque nucléophile du phosphore alpha du dNTP par l'hydroxyle 3' libre
-formation d'un lien phosphodiester et élimination du groupe pyrophosphate
- l'enzyme saute au nucléotide suivant

72

Caractéristiques de l'ADN polymérase III

-nécessite une matrice et une amorce avec une extrémité OH en 3'
-est une enzyme processive
-a une activité polymérase 5'-3'
-a une activité exonucléase 3'-5'

73

Quel est l'avantage que l'ADN polymérase est une enzyme processive

- il suffit d'un petit nombre d'enzyme processive pour copier l'entièreté du génome

74

Description d'un génome

dépositaire de l'information génétique

75

Vrai ou Faux
Les acides nucléique sont des polymère de nucléotides

Vrai

76

De quoi est composé un nucléotide

- sucre à 5 carbone
- base azoté
-un groupe phosphoryle

77

Quels sont les 2 types de nucléotide

-ribonucléotide
-désoxyribonucléotide

78

Quels sont les 2 types de base azotée

-les pyramidines
-les purines

79

Quels base azoté fait partie des pyramidine

-uracile
-thymine
-cytosine

80

Quels base azoté fait partie des purines

-adénine
-guanine

81

Vrai ou Faux
la liaison phospho-anhydeidw fournie l'énergie nécessaire aux réaction énergétique

Vrai

82

Quel est la règle de Chargaff

A/T = G/C = 1

83

Combien y-a-t'il de lien hydrogène entre A et T

2 pont H

84

Combien y-a-t'il de lien hydrogène entre C et G

3 pont H

85

Vrai ou Faux
l'ADN est un polymère linéaire de désoxyribonucléotides unis par des liaisons phosphodiester 5'-3'

Faux, 3'-5'

86

Caractéristiques de la double hélice

- sens de la polymérisation 5'-3'
- extrémité 5' = phosphate
- extrémité 3' = OH
- à pH neutre, les polyanions sont complexés avec le Mg2+ ou les protéines cationiques
- association antiparallèle de l'ADN en double hélice
- brins sont complémentaires
-la torsion est engendré par les noyau hydrophobe
- présence d'un petit sillon et d'un grand sillon

87

Quels sont les force qui stabilise la double hélice

- les forces hydrophobes
- les forces de Van der Waals
- les liaisons hydrogène
- les interactions électrostatiques entre les groupes phosphate et Mg2+ ou les protéine cationiques

88

Vrai ou Faux
L'ADN monocaténaire est plus stable que lADN bicaténaire

Faux, c'est l'inverse

89

Quels sont les agents causals in vivo de la dénaturation de l'ADN

- la réplication
- la transcription

90

Quels sont les agents causals in vitro de la dénaturation de l'ADN

- augmentation de la température
- agents chaotropes

91

Quels sont les différentes conformations de l'ADN

- ADN-B: ADN classique
- ADN-A: ADN plus tordue, plus serré
-ADN-Z: ADN gauche (tiré)

92

Quels sont les différents types d'ADN

- ADN génomique
- ADN mitochondrial
- ADN chloroplaste

93

Quels sont les particularité de l'ARN

- Sucre = ribose
- T est remplacé par U
- Brin monocaténaire qui peut s'apparier et former des régions bicaténaires appelées duplex

94

Quels sont les types d'ARN et leurs fonctions

-ARNr: intégré aux ribosomes
-ARNt: transporte l'aa jusqu'au ribosome
-ARNm: résultat de la transcription de l'ADN codant pour une séquence d'aa
-petits ARN: activité catalytique

95

Quels sont les 3 stades de compression de l'ADN nucléaire

- le collier de perles
- le solénoïde
- les boucles de chromatine associées à des protéines non-histoniques

96

Quels sont les différents type d'histone

- H1
- H2A
- H2B
- H3
- H4

97

Fonctionnement de la synthèse des fragments Okazaki

- synthèse d'une amorce d'ARN par la primase du complexe du primosome
- synhèse d'un ADN par l'ADN polymérase III

98

Quels sont les propriétés enzymatiques de l'ADN polymérase I

- activité exonucléase 5'-3' (élimination de l'amorce)
- activité exonucléase 3'-5' (lecture d'épreuve)
- activité polymérase 5'-3' (synthèse d'ADN)

99

Condition de fonctionnement de l'ADN ligase

- ADN avec une extrémité 3'OH
- ADN avec une extrémité 5'P
-de l'énergie ATP chez les eucaryotes et les bactériophages

100

Quels sont les problème de la fourche de réplication

- synthèse du brin retardé
- déroulement de l'ADN entraîne des torsions en aval
- évitement des boucles à épingle à cheveux
- une fourche avec 2 ADN polymérase III qui vont dans le même sens

101

Quels est la solution de la synthèse du brin retardé

- Les fragment d' Okazaki
- L'élimination de l'amorce d'ADN par l'ADN polymérase I
- L'éliminaiton des brèches par l'ADN ligase

102

Quel est la solution au déroulement de l'ADN qui entraine des torsions en aval

- détorsion par l'hélicase: la vitesse de distorsion est couplée à la vitesse de polymérisation

103

Quel est la solution pour éviter la formation d'épingle à cheveux

SSBP se fixant sur les brin monocaténaire empêche l'ADN de se réapparier

104

Propriété de SSBP

-fixation coopérative
- est un tétramère

105

Solution à la fourche avec 2 ADN polymérase III qui vont dans le même sens

-formation d'un bouche de la matrice du brin retardé

106

Vrai ou Faux
Les histones sont responsable de la lenteur de la réplication, car ils reste fixés à l'ADN pendant la réplication

Vrai

107

Conséquence d'une mutation chez une organisme unicellulaire

- mort de l'organisme
- gêne se transmet à la descendance

108

Conséquence d'une mutation chez une organisme pluricellulaire

-croissance anarchique d'une cellule
-perte de fonction avec une mort cellulaire
- pas de transmisson à la descendance sauf si elle touche le génome d'une cellule germinale

109

Quels sont les causes de modifications chimiques de l'ADN

- rayons UV
- radiation ionisantes
- substances chimiques

110

Quels sont les types de modification chimique

- méthylation
- désamination
- dépurination
- dépyrimidination

111

Quels sont les mécanismes de réparation de l'ADN

- réparation par mécanisme général d'excision-réparation
- réparation des dimires de thymine
- réparation d'une désamination d'une cytosine

112

Par quels molécule est fait la réparation par mécanisme général d'excision-réparation

-endo et exonucléase
- DNA plymérase I
- ADN ligase

113

Par quels molécule est fait la réparation des dimires de thymine

-enzyme photoactivatrice

114

Par quels molécule est fait la réparation d'une désamination d'une cytosine

- uracile N-glycosylase
- endonucléase
- ADN polymérase I
- ADN ligase

115

définition d'un gène

séquence d'ADN transcrite

116

Quels sont les gènes

- gène d'entretien
- gène qui ne s'expriment que dans des circonstances particulières
- gène exprimés dans certaines cellule

117

Quels sont les gènes d'entretine

- ARNr
- ARNt
- protéine via les ARNm

118

Qu'est-ce-que le transcripteur contient

-l'ARN polymérase responsable de la synthèse de l'ARN
- des facteurs de transcription
- des protéines qui détordent partiellement l'ADN

119

Quels sont les 3 types d'ARN polymérase

- ARN polymérase I transcrit les grands ARNr
- ARN polymérase II transcrit les ARMm
- ARN polymérase III trancrit les ARNt et les petits ARNr

120

Vrai ou Faux

Tous les ARN polymérase dérivent donc d'un ancêtre commun

121

Quels sont les différences entre les ADN polymérase et les ARN polymérase

- ADN pol à une amorce
- les nucléotide sont différents

122

Quels sont les 3 étapes de la transcription

- initiation de la transcription
- étape de l'élongation de la transcription
- terminaison de la transcription

123

Qu'est-ce-qu'il est nécessaire à l'initiation de la transcription

- facteurs de transcription
- séquences promotrices

124

Quel est la différence entre un promoteur puissant et un promoteur faible

- promoteur puissant: séquences consensus conservées
- promoteur faibles: séquences consensus dégénérées

125

Vrai ou Faux
Si la cellule se divise, il y a une diminution du taux de transcription des gènes ribosomaux

- faux, augmentation

126

Comment fonctionne l'initiation de la transcription

- recherche des séquences promotrices par l'ARN polymérase
- fixation de l'ARN polymérase sur la séquence promontrice
- ouverture de la double hélice
- arrivée du ribonucléotide 3P par diffusion
- catalyse de la liaison phosphodiester

127

Fonctionnement de l,élongation de la transcription

- l'ADN polymérase reste verrouillé à l'ADN
- sigma quitte l'ARN polymérase
- arrivée de Nus A

128

Quels sont les sites de terminaison de la transcription

-richesse en G ou C
- site palindromique
- Enroulement de l'ARN transcrit autour de la protéine Rho

129

décrire un promonteur puissant

- permet la synthèse de protéine demandées en grande quantité

130

Propriété des répresseurs de promoteur puissants

- s'attachent à des séquences particulières
- n'interagissent par nécessairement directement avec l'ARN polymérase
-sont souvent des protéines allostérique qui peuvent être activées par de petite molécules

131

Comment est-ce-que les répresseurs inhibe-t-il l'ARN pol

- empêche l'ARN polymérase de se fixer sur le promoteur
- inhibent l'étape de l'initiation
- bloquent l'avancement de l'ARN polymérase

132

Propriétés des activateurs de promoteurs faibles

-s'attachent aux séquences consensus particulières situées près du promoteur
- interagissent directement avec l'ARN polymérase
- sont souvent des protéines allostérique qui peuvent être activées par de petites molécules

133

3 types de remaniements

- soustraction de nucléotides
- addition de nucléotides non codés par le gène
- modification covalente de certaines bases

134

But du remaniements des transcrits primaires

-rendre les ARN plus stables, les protéger contre les nucléases
- rendre les ARN plus aptes à remplir leur rôle biologique

135

Par quoi est fait la maturation des précurseurs commun de l'ARNt et ARNr des ARNt

- par la ribonucléase P
- par la ribonucléase D
- par l'ARNt nucléotidyl transférase
- par des modification covalente des bases

136

Vrai ou Faux
La maturation de l'ARNr est toujours couplée à l'assemblage des ribosomes dans le nucléole

Vrai

137

Par quoi est fait la maturation des précurseurs commun de l'ARNt et ARNr des ARNr

- ribonucléase III

138

Quels sont les étapes de la maturation de l'ARNm chez les eucaryotes

- capping en 5'
- polyadénylation en 3'
- épissasge des introns dans le noyau

139

Expliquer la polyadénylation en 3'

-séquence de polyadénylation à l'extrémité 3'
- coupure par une endonucléase en aval de la séquence de polyadénylation
- ajout d'une queue de poly A