cancers: génétique et génomique Flashcards

1
Q

vrai ou faux.
cancer = maladie complexe et c’est un problème de santé publique

A

vrai

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Q

en termes ce chiffre - évoluation de l’incidence et de mortalité du cancer => 2011 à 2021

A
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3
Q

vrai ou faux.
pour les deux sexes - on juge que 1/2 auront un cancer de n’importe quel type
en termes de mortalité —> 1/4 personnes meurent

A

vrai

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4
Q

Cancers de l’Enfant vs Cancers de l’Adulte
1. fréquence + incidence:
2. types de cancers de l’enfant:
3. Facteurs de risques et étiologies
4. traitement et pronostic

A
  1. Fréquence et incidence:
    § Les cancers pédiatriques représentent 1% de l’ensemble des cancers. + c’est un problème de santé public
    § Taux d’incidence est d’environ 14/100,000 enfants par an.
    § Environ 300,000 nouveaux cas dans le monde chaque année
    § Le Diagnostic est souvent fait entre 0 et 4 ans
  2. Types de cancers de l’enfant:
    § D’une manière générale ceux sont des tumeurs embryonnaires ( blastème)
    § Leurs croissances est très rapide.
    § Leucémies, Lymphomes, tumeurs du SNC, sarcomes.
    § Les carcinomes sont très rares comparativement à l’adulte
  3. Facteurs de risques et étiologies
    § Les facteurs de risques environnementaux et mode de vie ne jouent pas un grand rôle chez les
    enfants
    § Certaines formes de prédispositions syndromiques exposent à un risque augmenté de cancers à l’âge pédiatrique. Certaines mutations génétiques jouent un rôle dominant négatif dans les cancers de l’enfant contrairement à leurs expressions à l’âge adulte.
  4. Traitement et Pronostic :
    § Les cancers pédiatriques ont un potentiel de guérison largement supérieur à ceux des adultes
    § Le pronostic dépend du type de cancer et de la qualité de la guérison du fait de l’agressivité
    des traitements.
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5
Q

observes

A
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6
Q

3 types de circonstances menant au cancer chez l’enfant:

A
  • accident génétique hérité = prédisposition (peu de formes)
  • conditions génétiques syndromiques => prédisposition
  • le plus souvent —> accident génétique de novo pas hérité et non transmissible (gain de fonction)
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7
Q

qui suis-je?
j’ai décris pour la première fois l’implication des gènes BRCA1+ BRCA2 dans cancers du sein et de l’ovaire en 1995.

A

Marie-Claire King

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8
Q

On distingue cinq principaux groupes de carcinogènes :

A
  1. Agents chimiques et environnementaux
  2. Radiations ionisantes : UV, rayons X et gamma, Radon
  3. Infections virales et bacteriennes :
    HTLV-1 et 2 —> Lymphomes
    papillomavirus et Herpes –> Cancer du col de l’utérus
    Helicobacter pylori –> Cancer de l’estomac
  4. Mode de vie et alimentation « moderne»

1 à 4 =>Environnement et susceptibilité - génétique - ÉPIGÉNÉTIQUE (gène structurellement normal mais dont sa fonction est anormale)

  1. Hérédité* ( PRÉDISPOSITION HÉRÉDITAIRE)
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9
Q

le cancer est une maladie génétique liée à une succession d’événements multi-étapes:

A
  1. Désordre de l’homéostasie tissulaire engendrant un déséquilibre :
    * Prolifération cellulaire
    * Spécialisation des tissus
    * Senescence et apoptose
  2. Prolifération monoclonale avec transmission aux cellules filles:
    * Acquisition de mécanismes de résistances à l’apoptose
    * Développement d’une néo angiogenèse
    * Prolifération
    * immortalisation
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10
Q

Bases moléculaires de la carcinogénèse
interaction gènes / environnements
- les facteurs génétiques et environnemetaux:

A
  1. Facteurs génétiques:
    —> Altérations morphologiques des gènes:
    * Oncogènes ( gain de fonction)
    * Gènes Suppresseurs de Tumeurs ( perte de fonction)
    * Gènes réparateurs du DNA et régulateurs du cycle cellulaire
    –> Épigénétique: ( Altérations fonctionnelles des gènes) :
    * Méthylation
    ( perte de fonction)
    * Acétylation des Histones
  2. Facteurs environnementaux ( facteurs initiateurs et promoteurs)
    - Chimique, physique, tabac, alcool… ( création d’adduits)
    - Endocriniens hormonaux… ( perturbateurs endocriniens)
    - Radiation
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11
Q

Qu’est ce qu’un Oncogène?

A
  • C’estungènemutantd’unproto-oncogène

–> Proto-oncogène code pour:
- une prolifération cellulaire normale
- la survie cellulaire

  • Oncogène facilite la transformation maligne par :
  • Stimulation de la prolifération cellulaire
  • Inhibition de l’apoptose
  • Les oncogènes codent pour des protéines de:
  • Voies de signalisation de la prolifération cellulaire
  • Facteurs de transcriptions contrôlant l’expression des génes promoteurs de la prolifération cellulaire
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12
Q

Qu’est ce qu’un Gène suppresseur de tumeurs?
(en 2 catégories)

A

GATEKEEPER:
* Contrôle la croissance cellulaire

  • Régulation de la transition au niveau des
    «Checkpoints» (dans le cycle cellulaire)
  • Promotion de l’apoptose
  • Perte de fonction engendre:
    –> Prolifération cellulaire
    –> Immortalisation cellulaire

CARETAKER:
* Garant de l’intégrité du génome

–> Code pour protéines:
* De réparation
* Impliquées dans la disjonction normale des chromosomes lors de la mitose
* Machinerie de l’apoptose

–> Perte de fonction engendre:
* Accumulation de mutations d’oncogènes et de gatekeeper gènes

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13
Q

explications de la two-hit theory:

A

si on a une mutation non héritée => mutation sur une des deux copies du gène (évènement 1) —> pas d’apparitions du cancer sans avoir les deux gènes mutés (deuxième évènements de la mutation)
=> exemple —> cancers non-héréditaires sporadiques

knudson theory = personnne hérite de mutations ou a une mutation de novo précoce ce qui augmente risque de transmission génétique (car cellule pluripotente très jeune —> participe à formation des gonades => peut transmettre la mutation aux générations subséquentes)

=> prédisposition hérédiataire si hérité des parents
mais dans les 2 cas —> nécessaire d‘avoir 2 évènements pour l’apparition de tumeurs chez les individus

deuxième évènement peut être de nature complètement différent au premier

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14
Q

Qu’est-ce qu’un syndrome de prédisposition aux cancers ?

A

Toutes conditions qui:
1- augmentent le risque de développer un cancer durant la vie,
2- pour un individu féminin ou masculin,
3- dans une proportion supérieure au risque observé dans la population générale
4- cela quelque soit l’âge.

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15
Q

Types de présentations : formes syndromiques vs. non-syndromiques:

A
  • Formes Syndromiques ( anomalies associées au risque de cancer):
    toutes les conditions pour lesquelles ont a des symptômes associés
    —> fonction des gènes n’est jamais unique donc certains gènes impliqués dans réparation de l’ADN — peut alors affecté plusieurs fonctions
    —> le risque de cancer peut devenir très élevé à l’âge adulte (le risque se développe plus tard)
  • Formes non Syndromiques ( expression essentiellement tumorale): juste un développement de tumeurs —> n’affecte aucune autres fonctions
    pas exclusif à un groupe d’âge

enfants peuvent être affectés par forme syndromiques et non-syndromiques

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16
Q

syndrome de prédisposition aux cancers (en stats):

A
  • > 50 syndromes de prédisposition aux cancers de transmission mendélienne (source: OMIM)
  • > 100 maladies Mendéliennes prédisposent aux cancers ( source: OMIM)
  • Représentent 15 à 20 % de l’ ensemble des cancers.
  • Leurs identifications est d’une très grande importance:
  • Prise en charge des apparentés
    —> Transmission dominante
    —> Personnalisation du suivi et dépistage
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17
Q

Prédispositions héréditaires aux cancers : Proportion / formes sporadiques

A
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18
Q

héritabilité vs. hérédité

A

héritabilité vs. hérédité
=> héritabilité = probabilité d’avoir une maladie (si y’a un cas de cancer ou condition X dans ma famille) sachant que je n’ai pas d’anomalie dans les gènes de prédisposition héréditaire —> risque relatif (paramètre de la génétique mesurant la part attribuée à la génétique dans la variabilité des performances d’une population donnée)
—> pas de transmission mendélienne, c’est une transmission d’un profil génomique de plusieurs gènes qui sont impliqués dans des processus métaboliques => ça peut être hérité mais c’est pas une % fixe de 1/2
—> gènes qui sont configurés (SNP) de façon à être fragile de développer une condition mais à de faibles %
—> état qui prédispose à des facteurs d’environnement
—> risque de cancers reste localisé dans l’organe

**=> hérédité : **ce qui est transmis de façon mendélienne (1/2 —> fixe)
—> probalité élevé de développer plusieurs types de cancers dans toute sa vie
prédispositon héréditaire —> condition qui augmente le risque d’avoir plusieurs cancers + concerne gènes qui ont la fonction de réparation de l’ADN

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19
Q

Classification des syndromes de prédisposition héréditaire aux cancers:

A
  • Il est difficile de concevoir une classification universelle.

EXEMPLE: on ne devrait pas parler de prédisposition héréditaire au cancer du sein mais une prédisposition héréditaire lié à un tel gène
puisqu’une prédisposition héréditaire se traduit en une hétérogénéité dans la manifestation du cancer (car les gènes héréditaires peuvent se manifester en plusieurs types de cancers au sein du même personne et au sein d’une famiille)

20
Q

Caractéristiques générales des syndromes de predispositions aux cancers (1)

A
21
Q

Caractéristiques générales des syndromes de predispositions aux cancers (2)

A
22
Q

à savoir sur l’investigation familial pour la présence de cancer:

A

si on a une histoire d’aggrégations dans une branche de la famille —> ça veut pas dire qu’on regarde pas l’autre branche parentale
—> car dans certaines familles ont peu avoir plusieurs mutations qui vient de chacune des branches de la famille

23
Q

Exemples de situations évoquant une possible prédisposition aux cancers

A
  • Histoire familiale de cancer dans la même branche parentale * Spectre tumoral ( sein-ovaire ou colon familial par exemple) * Jeune âge au diagnostic ( avant 50 ans )
  • Cancer du sein chez un homme
  • Localisations tumorales multiples chez une même personne
  • Tumeur particulière ou certaines caractéristiques: – Corticosurrénalome – tumeur des plexus choroïdes
    – Carcinome médullaire de la thyroïde
    – Carcinome médullaire du sein
  • Apparenté proche avec mutation connue.
  • Syndrome connu augmentant le risque de cancer
24
Q

NOTRE MISSION : personnalisation des soins
Pourquoi ? UTILITÉ CLINIQUE

A
25
Q

Comment investiguer?
La séquence d’investigation

A
26
Q

RECOMMANDATION DE SUIVI POUR SYNDROME DE PRÉDISPOSITION AUX CANCERS DU SEIN ET DE L’OVAIRE LIÉ À UNE MUTATION DES GÈNES BRCA1- BRCA2:

A
27
Q

Significations d’un résultat négatif (BRCA)

A
28
Q

Interprétations des résultats:

A
29
Q

évaluation germinale vs. somatiques

A
30
Q

SYNDROME DE PRÉDISPOSITION AU CANCER COLORECTAL NON POLYPOSIQUE
(SYNDROME DE LYNCH OU HNPCC)
- description:

A

*Autosomique dominant sans ‘’polypose associée’’
*Mais avec cancers de endomètre, ovaire, uretère, gliomes…
*Lié à une déficience des gènes réparateurs
des misappariements MMR

31
Q

HNPCC: Mutations dans les gènes de mésappariements (MMR)

A

mésappariements —> produit instabilité génomique
—> réparation par des dimères
non-réparation => instabilité génomique qui fait qu’on peut avoir des dv de ccancers à plusieurs endroits

32
Q

Apport de l’immunohistochimie du bloc tumoral -description:

A
  • Comparel’expressiondesprotéinesMMR(MLH1–MSH2–MSH6etPMS2) dans le tissu tumoral et le tissu sain avoisinant qui sert de contrôle interne

*L’absence d’expression dans le tissu tumoral indique la possibilité de mutation germinale dans l’un des gènes en cause:
—> La présence d’une hyperméthylation du promoteur MLH1et/ou de la mutation V600E de BRAF signe une cause sporadique
–> L’absence d’une hyperméthylation du promoteur MLH1et l’absence de la mutation BRAF V600F orientent vers la présence d’Une mutation germinale dans MLH1 ou PMS 2
*L’extinction de MSH2 et de MSH6 doit faire rechercher une délétion dans EPCAM si absence de mutation dans MSH6 et MSH2.

33
Q

Recommandations de suivi: syndrome de Lynch =>

A
  • Au plan digestif:
  • Colonoscopie avec coloration à l’indigo carmin > âge de 20 ans / 2 à 3
    ans sous réserve de normalité. * Au plan gynécologique:
  • > Âge de 30 ans examen clinique – écho endovaginale – biopsie à la pipelle de cornier
  • Hystérectomie prophylactique avec annexectomie après que la famille soit complété.
  • Autres:
  • Voies urinaires, vessie, rein * thyroïde
34
Q

LA POLYPOSE ADÉNOMATEUSE FAMILIALE - description de la maladie:

A
  • LIÉEÀUNEMUTATIONDANSLEGÈNEAPC * TRANSMISSION AUTOSOMIQUE DOMINANTE
  • TRÈS HAUTE PÉNÉTRANCE
  • MUTATION DE NOVO 15 - 30 % DES CAS
  • LE DÉVELOPPEMENT DES POLYPES ADÉNOMATEUX DÉBUTE CHEZ L’ENFANT ET L’ADOLESCENT
  • PRÉS DE 100 % DE RISQUE DE CANCER DU COLON
  • MANIFESTATIONS EXTRACOLONIQUES ( SYNDROME DE GARDNER)
35
Q

Prise en charge de la polypose adénomateuse familiale:

A

Colonoscopie
* À débuter vers10- 12 ans
Périodicité 1 – 2 ans
* Colectomie prophylactique:
—> Fin 10’s
—> Début 20’s
–> Conservation du sphincter anal avec anastomose ileoanale
—> Surveillance annuelle endoscopique
* Endoscopie haute gastrique et duodénale
* Examen annuel de la thyroïde

36
Q

Polyposes associées à la mutation du gène MUTYH (code pour système réparation excision base) - description:

A
  • Forme de polyposes familiales autosomiques récessives * Nombre de polypes > 100
  • Il existe deux mutations communes dans MUTYH:
  • Y165C ( âge moyen cancer du côlon 46 ans)
  • G382D (âge moyen cancer du côlon 58 ans)
  • Hétérozygote composé (âge moyen cancer du côlon 52 ans)
37
Q

Polypose colique juvénile
- manifestations + description
-

A
  • Clinique
  • Rectorragie
    Polypose colique juvénile
  • Prolapsus rectal
  • Douleurs abdominales
  • Risque de cancer du colon aussi haut que 50 % avec âge moyen au diagnostic 43 ans (MAD4H > BMPR1)
  • Début dans l’enfance
  • Polypes de type hamartome * Mutation dans gènes ( 50 %)
  • BMPR1, MAD4H, SMAD4
  • Formes sévères avec délétion de PTEN et BMPR1 * 1- 2% mutations dans PTEN
38
Q

Syndrome Télangiectasie Hémorragique Héréditaire et Polypose juvénile

A
39
Q

polypes

Syndrome de Peutz Jeghers

A
40
Q

LE SYNDROME DE COWDEN: PRÉDISPOSITION HÉRÉDITAIRE AUX CANCERS

A
41
Q

vrai ou faux.
avec les polypes, il peut y avoir plusieurs diagnostics différentiels

A

vrai

42
Q

Les néoplasies endocriniennes multiples de
type :

A
  • Autosomique dominante
  • Pénétrance élevée 90% à 50 ans
  • Habituellement diagnostiquée vers 30–40ans
  • Dépistage systématique dans les familles permet de mettre en évidence des manifestations chez jeune enfants de moins de 8 ans
  • Chacune des présentations peut–être inaugurale de la maladie
  • Anticipation décrite posant le problème des modalités pratiques de suivi ( âge de début du suivi).
    Mutation du gène MEN1
43
Q

Les néoplasies endocriniennes multiples de type 1
Spectre tumoral comprend:

A

Spectre tumoral comprend:

  • tumeur de la parathyroïde
  • Tumeurs du pancréas
  • Hyperplasie de la glande pituitaire - syndrome de Zollinger Ellison
44
Q

Classification des Néoplasies Endocriniennes Multiples de type 2

A
45
Q

Paragangliomes et phéochromocytomes - particulatité dans la transmission

A

transmission mendélienne soumise à l’empreinte parentale