Chapitre 5 - Taxinomie et classification

Question 1

Études des relations phylogénétiques

Answer 1

• Évolution des êtres vivants à partir d’un ancêtre commun
• Taxinomie: décrit et définit les taxons qui servent à classer et nommer les organismes selon un ensemble de règles
• Systématique: Classification des taxons dans un certain ordre hiérarchique. Mène à une présentation pyramidale
• Phylogénie: Classe les organismes en hiérarchie démontrant leur parenté évolutive. Mène à une représentation sous forme d’arbre

Question 2

Taxinomie

Answer 2

Science de la classification, caractéristiques commune entre les organismes

Question 3

La classification des organismes permet:

Answer 3

• Regrouper les organismes similaires
• Identifier des organismes qui ont préalablement été classés
• Établir des critères d’identification de nouvelles espèces et les nommer
• Obtenir de l’information sur la proximité évolutive des organsimes

Question 4

Genre?

Answer 4

Composé d’espèces génétiquement apparentées, mas qui présentes des différences

Question 5

Espèce eucaryote?

Answer 5

Ensemble d’organismes étroitement apparentés et pouvant produire des descendants fertiles

Question 6

Espèce procaryote?

Answer 6

Population des cellules bactériennes ayant des caractéristiques semblables

Question 7

Classification et nomenclature scientifique

Answer 7

• chaque organisme possède un nom scientifique latin unique
• Genre prend TOUJOURS une lettre majuscule
• Épithète spécifique : JAMAIS de lettre majuscule
• Abréger sa première lettre

Question 8

Classification des organismes procaryotes

Answer 8

• Distinction entre les espèces procaryotes
• Distinction entre les membres d’une espèce procaryote (souches bactériennes)
• Nomenclature des souches

Question 9

Qui est considéré comme le père de la taxinomie?

Answer 9

Carl von Linné

Question 10

Système de Woese

Answer 10

-Les recherches de Woese étaient basées principalement sur l’ARN de la petite sous-unité ribosomale
-Étudie les archées: conlut eucaryotes éloignés des procaryotes. Archées sont plus près évolutivement des eucaryotes
-Suggère les domaines et propose un 3 domaine (archées)

Question 11

ARN ribosomal?

Answer 11

• copie segment adn
• Fonction structurale importante au niveau du ribosome
• Séquence très conservée dans l’évolution des organismes
• Relativement petit et facile à séquencer
• idéal pour comparer et classifier organisme

Question 12

Ou sont les virus et autres agents acellulaires?

Answer 12

• virus exclus des 5 règnes de Whittaker et des 3 domaines de Woese
• Espèce virale: population de virus ayant des caractéristiques similaires et une niche écologique spécifique

Question 13

Aujourd’hui..

Answer 13

syst fondé sur l’hypothèse que les êtres vivants descendent d’un ancêtre commun

Question 14

Arbre phylogénique (cladogramme)

Answer 14

• regroupement selon propriétés communes: ancêtre commun, conservations/divergences des caractéristiques
• utilisation des génomes (ARNr): fréquence mutations, moment de divergence

Question 15

Comment comparer des caractéristiques microbiennes?

Answer 15

• culture pure
• revient ultimement à la composition génétique

Question 16

Bergey’s manual of systematic bacteriology

Answer 16

• référence pour la classification des bactéries
• basée sur le séquençage de l’ARNr 16S
• abondance de nouvelles informations
• reclassification = changement dans le nom

Question 17

Classification vs identification

Answer 17

C: Plusieurs caractéristiques à déterminer (taxons)
I: technique la plus rapide possible

Question 18

Méthodes de classification ou d’identification

Answer 18

• Méthodes traditionnelles: Caractères morphologiques, caractères tinctoriaux, épreuves biochimiques, épreuves sérologiques
• Méthodes moléculaires: Composition des bases de l’adn, séquençage de l’ARNr

Question 19

Caractères morphologiques

Answer 19

• Étude bactéries individuelles d’une culture pure
• Microscope: Forme, taille, groupements, structures
• pas suffisant pour une identification formelle

Question 20

Caractères tinctoriaux

Answer 20

• Utilisation de colorants
• Colorations différentes (coloration de gram/coloration acido-alcoolo-résistance)
• résultats des colorations en fct de la composition chimique de la paroi

Question 21

Épreuves biochimiques

Answer 21

• tests faisant ressortir la présence d’enzymes spécifiques
  (fermentation des sucres, oxydase, catalase, production de H2S)

Question 22

Sérologie

Answer 22

Étudie le sérum sanguin et les réponses immunitaires chez un hôte animal

Question 23

Épreuves sérologiques

Answer 23

Permet de différencier des souches (sérotypes ou sérovars)

Question 24

Test agglutination sur lame avec des antisérums de m.o connus?

Answer 24

• agglutination des bactéries et formation d’agrégats (apparence granuleuse)
• bactéries ne forment pas d’agrégats (mélange homogène)

Question 25

Composition des bases de l’ADN

Answer 25

• Évaluation de la teneur en G+C de l’ADN (%)
• Si diffère de plus de 5 ou 10% = pas apparentés
• cette donnée ne peut pas être interprétée seule

Question 26

Séquençage de l’ARN ribosomal

Answer 26

-pour les espèces, similitude supérieure à 97% quant à la séquence d’ARNr 16s
- plus de 5% de différence permettent de constituer un nouveau genre

Question 27

Avantages séquence de arn ribosomal

Answer 27

• présent dans toutes les cellules de microorganismes
• peu de variation temporelle
• analyse possible sans faire croître les microorganismes et rapide