Chapter 4 prs

Question 1

Vraag

Answer 1

Antwoord

Question 2

[Chapter 4] Welk probleem wordt in dit artikel behandeld?,

Answer 2

Interesse in individuele verschillen en welke factoren daaraan bijdragen. Grote golf van GWAS en bij CR is het nog iets nieuwe om naar de genetica te kijken, maar ik dit paper wilde wekijken naar verband pgs en MH, welbein

Question 3

[Chapter 4] Waarom is dit probleem belangrijk?,

Question 4

[Chapter 4] Wat is je hypothese en waarom?,

Answer 4

Controle checks door morning-> mornig te doen. Verder nog nooit gedaan nog weinig verwachtigen

Question 5

[Chapter 4] What are the key studies that informed this work?,

Answer 5

Jones et al Morningness gwas. Ferguson et al RA gewas

Question 6

[Chapter 4] Heb je voortgebouwd op of een bestaande theorie uitgedaagd?,

Question 7

[Chapter 4] Waarom heb je deze methode of dit model gekozen?,

Answer 7

Verschllende PRS gebruikt met andere cut of waarde voor de genetische varianten: alle variaten is hoge p, streng op variaten is lage p = exploratieve aard van de studie. Between vs within person model runt de analyses in de between sample = between beta. + in de within sample (allemaal twins uit het zelfde huishouden = correctie voor familieomstandigheden en assortaitve mating en leeftijd). Gebootstraps dus 100x opnieuwe gedaan. Het verschil tussen de beta’s = within beta is gecorrigeerd voor family effects = lager effect in within = bewijs passive-ge correlations

Question 8

[Chapter 4] Welke alternatieven heb je overwogen en waarom heb je die verworpen?,

Question 9

[Chapter 4] Hoe heb je de degelijkheid gewaarborgd (bv. validiteit, betrouwbaarheid, robuustheid)?,

Question 10

[Chapter 4] Zou deze methode gerepliceerd kunnen worden?,

Question 11

[Chapter 4] Wat zijn de belangrijkste bevindingen?,

Answer 11

klein effect morng -> dep en RA dep en health. Trendmaar geen sig gene-environment correlation

Question 12

[Chapter 4] Hoe interpreteer je deze resultaten?,

Question 13

[Chapter 4] Were the results expected?,

Answer 13

Unexptect within/between results: The results showed the opposite: the beta for the within-family analysis was bigger compared to the between-family analysis. This could mean that the association between one’s genetic predisposition of being a morning person and actually being a morning person becomes stronger when we remove the effect of the family environment === removed family environment = more room for biological rhythm? with is inline with our research question in the REtirement paper (chapter 5). But very large CI so we cant say this for sure and needs replication in a bigger sample.

Question 14

[Chapter 4] Heb je gevoeligheidsanalyses of robuustheidscontroles uitgevoerd?,

Answer 14

sensitiviteits analyse was ook unexpected: voorspeeld niet de alle of alleen de sleep items, maar meer specifiek depressieve en cognitieve items. Niet te snel interpreteren, want niet statistisch getoetst of de itemspredictie van elkaar verschilde, maar als het zo is, dan heeft het CR misschien niet alleen via slaap een effect of depressie, maar ook direct via depressieve gevoelens.

Question 15

[Chapter 4] Hoe zou iemand anders je bevindingen kunnen verifiëren?,

Question 16

[Chapter 4] Wat zijn de theoretische of praktische implicaties?,

Question 17

[Chapter 4] Wat zijn mogelijke alternatieve verklaringen?,

Answer 17

Misschien inderdaad geen effect van cr of wb (zie enlightenme later), of niet krachtige genoeg PRS nog

Question 18

[Chapter 4] Wat zijn de beperkingen van deze studie?,

Answer 18

PRS morning ness is net anders gemeten, of de sample van de gwas was anders dan onze sample qua man/vrouw/ age verdeling/measure

Question 19

[Chapter 4] Hoe kunnen deze beperkingen je conclusies beïnvloeden?,

Question 20

[Chapter 4] What would you do differently next time?,

Question 21

[Chapter4] Wat zijn de belangrijkste conclusies?,

Answer 21

slechts begin van PGS in mental health, dus ga vooral verder. Cr en depressie via speciale items?

Question 22

[Chapter 4 Hoe draagt dit artikel bij aan het bredere vakgebied?,

Question 23

[Chapter 4] Wat zijn de volgende stappen of openstaande vragen?,

Answer 23

als de PGS sterker zijn: do MR om te kijken naar de direction of causation: misschien beinvloed WB morningness?

Question 24

[Chapter 4] Kan dit leiden tot een nieuwe onderzoekslijn of toepassing?,

Answer 24

Studies naar gezins effecten op CR. Voorstudies die correlatie laten zien tussen partners, komt dat door assortative mating (biologsich soort zoekt soort), of komt dat door samen wonen? Kijk naar de perceived CR is een gezin (ouders met kinderen) en kijk of je geneticshe effect (transmited pgs) kan onderscheiden van non-transmitted pgs (parentenviornment effect0.

Question 26

Explain within family vs between family + bootstrapping.

Answer 26

Verschllende PRS gebruikt met andere cut of waarde voor de genetische varianten: alle variaten is hoge p, streng op variaten is lage p = exploratieve aard van de studie. Between vs within person model runt de analyses in de between sample = between beta. + in de within sample (allemaal twins uit het zelfde huishouden = correctie voor familieomstandigheden en assortaitve mating en leeftijd). Gebootstraps dus 100x opnieuwe gedaan. Het verschil tussen de beta's = within beta is gecorrigeerd voor family effects = lager effect in within = bewijs passive-ge correlations

Question 27

Mendelian randomization?

Question 28

Assortative mating?

Answer 28

in pgs prediction might cause inflated effect, because part of the signal comes from AM/social/environmental similarity

Question 29

Covariates: seks, age, ag2 (why), PCS

Answer 29

age^2 to control for non-linear effects of age

Question 30

No effect wb (also not in enlightenme), or PGS too weak?

Question 31

Transmitted/non-transmitted model

Question 32

Powerissue

Answer 32

Within family analysis.