Chromosomes Flashcards
1
Q
1865
A
découverte lois de l’hérédité,
2
Q
1880
A
hérédité a un lien avec le noyau de nos cellules
étude de cellules végétales: “filaments”
3
Q
1888
A
“chromosomes” Waldeyer
4
Q
1902
A
théorie chromosomique de l’hérédité
5
Q
1910
A
chromosomes = support des gènes
6
Q
1953
A
découverte de la structure en db hélice de l’ADN
7
Q
1955
A
1er compte exact des chr. humains
8
Q
1879
A
“chromatine”, Flemming
9
Q
cellules somatiques
A
diploïdes
23 paires de chr 2n =46 homologues
10
Q
gamètes
A
haploïdes
23 chromosomes n=23
11
Q
mégacaryocytes
A
polyploïdes par phénomène d’endomitose >2n
12
Q
taille ADN humain
A
6.10^9 pb → x 0,34nm 2m ADN/ noyau → x 50.10^12 cellules 10^14 m ADN/ indivdu
génome humain = 3,2M pb
13
Q
centromère
A
- 1/ chr
- nécessaire à la ségrégation
- formé hétérochromatine
- ADN alpha satellite:
répété: monomère de 171 pb organisés en HOR (high order repeat) + CENP-B Box (17pb) assemblage kinetochore
14
Q
télomères
A
- séquence TTAGGG répétée en tandem (50pb à 30 kpb)
- linéaire ou en boucle (ext 3’ protubérante 30-100pb)
- assurent protection des extrémités des chr linéaires (raccourcissement télomère à chaque division)
- prot télomériques: TRF1, TRF2, TIN2, TPP1, POT1
- altération des télomères contribue à l’instabilité chromosomique
15
Q
mise en évidence chromosomes
A
- culture cellulaire
- ajout mitogène (PHA)
- culture 37ºC pendant 72h
- arrêt cellules en métaphase (colchine)
- rupture cellulaire (solution saline hypotonique)
- fixation alcoolique des prot (éthanol/méthanol)
- coloration (Giemsa)/ traitement
16
Q
caryotype
A
- classe par taille décroissante
- en fnct position du centromère
- marquage spé
17
Q
position du centromère
A
indice centromérique
p/ p+q
18
Q
chr métacentriques
A
p = q
1,2,3 (A)
16 (E)
19,20 (F)
19
Q
chr submétacentriques
A
p < q bras court nettement + petit 4,5 (B) 6-12 (C) 17,18 (E) X (C)
20
Q
chr acrocentriques
A
p «_space;q
bras court quasi inexistent
13,14,14 (D)
21,22 (G)
21
Q
marquages spécifiques
A
- dénaturation enzymatique (trypsine) + Giemsa (G)
- dénaturation thermique 87ºC + Giemsa (R)
bandes claires: GC
bandes foncées: AT - dénaturation au baryum (C)
- nitrate d’argent (NOR) → 5 paires chr acrocentriques: bras courts porteurs d’ADNr formant la région org nucléolaire (NOR)
22
Q
structure génome: tailles
A
ADNdb ~ 2nm filaments de chromatine ~ 11nm nucléo-filaments ~ 30nm chromatine interphasique ~ 300nm condensé en fibres de 700nm chromosome métaphasique ~ 1400 nm
23
Q
structure filament de chromatine
A
nucléosomes = 146 bases d’ADN + 8 prot histones = 11nm
ocatmère d’histones: 2H2A, 2H2B, 2H3, 2H4
+ ADN internucléosomique
+ histone H1
+ prot non-histones
24
Q
ADNdb
A
nucléotides
25
chromatine
chromatine dispersée = fibre nucléosomique = euchromatine
chromatine dense = fibre sclénoïde = hétérochromatine
26
épigénétique
histones portent des domaines N-terminaux
| selon la nature des grp sur domaines N-ter: condensation ou décondensation de la chromatine
27
marque épigénétique qui régule ouverture de la chromatine
acéthylation
place pour les facteurs de transcription
di-nucléotide CpG → forment ilots
ilots non méthylés → euchromatine/ transcription
28
marque épigénétique qui régule fermeture de la chromatine
ilots CpG méthylés → hétérochromatine/ silence
29
modif domaine N-ter des histones
- acéthylation
- méthylation
- phosphorylation
- ubiquitination
30
modif histone H3
- méthylaton activatrice lysine K4
- acéthylation activatrice lysine K9
- méthylation inactivatrice lyse K27
- phosphorylation activatrice sérine S28
31
méthylation ADN (ilots CpG)
cytosine en 5-méthyl-cytosine
ilot CpG méthylés ou non
transmise
32
modification des histones
marque épigénétique régulant fermeture/ ouverture de la chromatine
réversible
33
hétérochromatine
ADN réplication tardive
gènes non transcrits
localisation à la périphérie du noyau
34
euchromatine
gènes transcrits
| au centre du noyau
35
org nucléaire des chromosomes interphasiques
```
téritoires chromosomiques
densité des gènes d'un chr est corrélée
à sa localisation nucléaire
petits chr au centre et grands en périph
voisins variables
```
36
chr X
156 Mb
862 gènes codants prot
761 pseudogènes (inactifs au sein du génome, codent pas pour prot fonctionnel)
351 gènes codant ARN
PAR
region homologue
37
chr Y
59Mb
60 gènes codants des prot
361 pseudogènes
44 gènes codant ARN
PAR
region homologue
SRY (bras p)
38
2X chez femme
inactivation d'un chr X chez femme contribue à l'eq du dosage des gènes de l'X entre la F et l'H
inactivation aléatoire Xp ou Xm
(Marie Lyon 1961)
chr 1: méthylation aléatoire du promoteur (chez F et H) → actif
chr 2: ARN Xist va tapisser chrX → inactif
39
inactivation aléatoire d'un chr X chez F
1. propagation bidirectionnelle cis ARN Xist
2. remodelage de la chromatine:
- réplication tardive de l'ADN dans le chr X inactif (fin phase S) → asynchronisme de réplication entre les 2 X
- recrutement de complexes répressifs (macro histones H2A)
- modif histone H3 et H4 (méthylation, désacétylation)
- méthylation des ilots CpG de l'ADN
→ extinction transcription
40
inactivation du chr X = stable et clonale
inactivation aléatoire
mosaïcisme des tissus somatiques
ex chat calico
pour certaines pathologies syndromes - importants en fnct du chr X inactif
41
ségrégation chromosomique
mitose (bioriented)
meiose:
I reductionnelle (syntelic)
II équationnelle (bioriented)
42
anomalies chromosomiques
- de nombre
| - de structure
43
ex anomalies de nmbr
- trisomie 21: 1/700
- trisomie 13: 1/9000 non compatible avec la vie
- trisomie 18: 1/5000
- trisomie XXY: 1 homme/ 800 Syndrome de Klinefelter
- monosomie X: 1/5000 Syndrome de Turner
44
ex anomalies de structures
- délétion 5p = 5p syndrome/ cri du chat
- délétions → chr en anneau
- inversion péricentrique/ paracentrique
- isochromes
monocentrique: division transversale du centromère
dicentrique
→ syndrome Pallister Killian
- translocation roberstonienne
- translocation réciproque
