Clustering, modeling del farmacoforo, 3D-QSAR e fragment based_FASTAfile

Question 1

Differenza tra algoritmi di clustering e di regressione

Answer 1

26.1 38

Question 2

Principi su cui si basano algoritmi di clustering

Answer 2

38

Question 3

Fasi dell’analisi di clustering

Answer 3

38

Question 4

Come viene fatta e secondo che principi la scelta delle variabili per il clustering

Answer 4

38

Question 5

Def centroide

Answer 5

38

Question 6

Def centrotipo

Answer 6

38

Question 7

Def dimensionalità del cluster

Answer 7

38

Question 8

Def compattezza del cluster

Answer 8

38

Question 9

Come si misura la similarità molecolare all’interno di un cluster

Answer 9

38.1

Question 10

Tipi di criteri di raggruppamento

Answer 10

39

Question 11

Differenza tra metodi gerarchici agglomerativi e divisivi

Answer 11

39

Question 12

Tipi di criteri di raggruppamento gerarchici agglomerativi e differenze

Answer 12

39

Question 13

Metodi di raggruppamento non gerarchici, esempio e come funzionano

Answer 13

39

Question 14

Come è definito un farmacoforo?

Answer 14

40

Question 15

Perchè e come posso avere una cattiva regressione ma un buon clustering?

Answer 15

39.1

Question 16

Come avviene la mappatura del farmacoforo?

Answer 16

40

Question 17

Applicazione della mappatura del farmacoforo

Answer 17

40

Question 18

Cosa è il LUDI program e come viene utilizzato?

Answer 18

40

Question 19

Quale è il principale approccio di 3D-QSAR?

Answer 19

41

Question 20

Per cosa sta CoMFA? Che misura? Come lo fa?

Answer 20

41

Question 21

Come avviene l’allineamento di composti per CoMFA?

Answer 21

41.1

Question 22

Come avviene il calcolo di energia potenziale nell’analisi CoMFA? Su che leggi si basa il calcolo?

Answer 22

41.1

Question 23

A cosa serve la cross-validation? Come si fa?

Answer 23

42

Question 24

Cosa è la PRESS? Come si calcola?

Answer 24

42

Question 25

Differenza tra s^2PRESS e s^2

Answer 25

42

Question 26

Differenza tra q^2 e r^2

Answer 26

42

Question 27

Come si creano i contorni di mappa?

Answer 27

42

Question 28

Differenza tra drug design fragment based e High throwput screening

Answer 28

42.1

Question 29

Modifica della regola di Lepinski per il FBDD

Answer 29

42.1

Question 30

Caratteristiche che deve avere un frammento per poter essere usato per FBDD

Answer 30

42.1

Question 31

Cosa è la ligand efficiency? Perchè è importante? Monitoraggio?

Answer 31

42.1

Question 32

Formula ligand efficiency

Answer 32

42.1

Question 33

Workflow per FBDD

Answer 33

43

Question 34

Differenza tra fragment growing e fragment linking ed esempi

Answer 34

43.1 44

Question 35

Come avvengono gli screening biofisici per la detection di un frammento attivo? Metodi e differenze

Answer 35

43