Cristallografia delle proteine_FASTAfile Flashcards

(42 cards)

1
Q

A che serve la cristallografia delle proteine?

A

55

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Q

Su che principio si basa la cristallografia delle proteine?

A

55

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3
Q

Cosa è la diffrazione? Quando avviene?

A

55

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4
Q

Cosa è l’interferenza? Perchè è importante nella cristallografia?

A

55

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5
Q

Raggi X perchè sono usati loro? Energia e lunghezza d’onda

A

55

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6
Q

Perchè uso i cristalli?

A

55

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7
Q

Cristallografia a raggi X, come avviene overview

A

55.1

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8
Q

Descrizione onda elettromagnetica

A

55.1

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9
Q

Differenza tra raggio primario e raggio secondario

A

56

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10
Q

Legge di Bragg, cosa indica?

A

56

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11
Q

Differenze tra spazio reale e spazio reciproco

A

56.1

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12
Q

Cosa non è noto per effettuare il passaggio tra spazio reciproco e spazio reale

A

56.1

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13
Q

Tecniche oltre la cristallografia a raggi X per studiare la struttura proteica

A

56.1

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14
Q

Passaggi fondamentali per la cristallizzazione delle proteine

A

57

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15
Q

Dove e come avviene la cristallizzazione di una proteina

A

57.1

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16
Q

Come si può velocizzare il processo di cristallizzazione?

A

57.1

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17
Q

Curva di solubilità di una proteina, zone della curva e relative funzioni

18
Q

Zona metastabile

19
Q

Zona labile

20
Q

Zona di precipitazione

21
Q

Osservazione del cristallo

22
Q

Come può avvenire la cristallizzazione proteina-ligando

23
Q

Soaking

24
Q

Co-cristallizzazione

25
Acquisizione del pattern di diffrazione, strumenti
58
26
Come faccio a disporre il cristallo nel diffrattomero/sincrotroni
58
27
Come identifico i punti importanti per la diffrazione?
58.1
28
Cosa è la lista di riflesso e come è strutturata
58.1
29
Differenza tra lastra di rilevazione di un sale e di una proteina e perchè
58.1
30
Risoluzioni spaziali ottimali e come le calcolo. Da cosa è influenzata la risoluzione spaziale?
58.1
31
Come la risoluzione spaziale è influenzata dal tipo di atomo che si considera?
58.1 56
32
Come la risoluzione spaziale è influenzata dalla temperatura?
58.1
33
A cosa serve la fasazione? Perchè è importante? Su che principio matematico si basa?
59
34
Metodi per la fasazione, overview
59.1
35
Metodi ab initio per la fasazione
59.1
36
Metodi per la fasazione con un dataset
59.1
37
Metodi molecular replacement per la fasazione, vantaggi e svantaggi di questo metodo
59.1
38
Come avviene l'affinamento di fase nella cristallografia?
60
39
Come avviene la costruzione del modello?
60
40
Affinamento del modello cristallografico, come avviene?
60
41
Differenza tra R-work e R-free, valori ottimali
60
42
Come avviene la validazione del modello cristallografico
60.1