ENCODE 2

Question 1

¿Cuántas regiones se mapearon con unión de proteínas a ADN?

Answer 1

119 regiones

Question 2

¿Cuántos tipos de células se analizaron con CAGE-Seq?

Answer 2

72 tipos de células

Question 3

¿Cuántas secuencias específicas de factores de transcripción se identificaron?

Answer 3

87 secuencias

Question 4

¿Qué porcentaje del genoma tiene regiones de unión a proteasas?

Answer 4

8.1%

Question 5

¿Qué es FACTORBOOK?

Answer 5

Catálogo de sitios de unión a factores de transcripción

Estudio en los patrones de sitios de unión de factores de transcripción

Question 6

¿Para qué ayudan los sitios de unión a factores de transcripción?

Answer 6

Explorar propiedades de la cromatina

Question 7

¿Qué histona se evalúa en la unión H3K27me3?

Answer 7

Histona H3

Question 8

¿Qué modifica la trimetilación de lisina 27?

Answer 8

Epigenética de la histona H3

Caracterización de regiones intergénicas y definición de un gen

Question 9

¿Qué se caracteriza en este punto?

Answer 9

Regiones intergénicas y definición de gen

Question 10

¿Qué tipo de modelos se realizaron para explorar interacción cromatina-promotores?

Answer 10

Modelos de predicción

Question 11

¿Qué aspectos modelan los predictores?

Answer 11

Modificaciones de histonas y promotores

Question 12

¿Cuáles son los dos tipos de promotores encontrados?

Answer 12

Islas C-G y caja TATA

Question 13

¿Cuál es más frecuente, isla C-G o caja TATA?

Answer 13

Isla C-G (menos cantidad de caja TATA)

Question 14

¿Qué técnica se usó para identificar sitios de inicio de transcripción?

Answer 14

CAGE-seq

Question 15

¿Qué característica tienen los RNAs asociados?

Answer 15

Menos de 200 nucleótidos

Question 16

¿Qué se descubrió y caracterizó en la metilación de DNA?

Answer 16

Enhancers

Question 17

¿Qué tipo de conexiones se estudiaron a lo largo del genoma?

Answer 17

Conexiones 3D

Question 18

¿Qué se caracterizó junto con la red topológica?

Answer 18

Machine learning en genómica

Question 19

¿Qué busca entender la variación del DNA?

Answer 19

Impacto de la información funcional

Question 20

¿Dónde se estudió el impacto de la selección evolutiva?

Answer 20

Regiones funcionales