Epigenetik Flashcards
Vad är epigenetik?
Cellens minne (genfunktion) som inte direkt beror av den genetiska koden (ACTG)- påverkar utveckling av sjukdom.
Vad är DNA förpackade i? I vilka former finns dessa?
Kromatin
Finns i två former:
• Heterokromatin= kompakt hoptvinnat DNA
DNAutan gener centromerer, telomerer, delar av Y-kromosomen Innaktiva gener
• Eukromatin
Gener som transkriberas
Epigenetiska modificiering/märke/kod, hur fungerar denna kod?
• Den epigenetiska märke/koden är skriven med ett alfabet av
post-translationella modifieringar av histoner och metylering av
DNA(arvsmassan)
reglerar konformation/ tillgängligheten för transkription faktorer.
Vad är HATs och HDACs?
HAT - histonacetyltransferas kan acetylera lysiner i histonernas N-‐svansar
HDAC - histondeacetylas kan deacetlyera dem
Vad påverkar Histonacetylering? (HDAC)
Histonacetylering påverkar kromatinets packningsgrad
– Hypo-acetylerade histoner => TFs har svårt att komma åt DNA
– Hyper-acetylerade histoner => DNA mer tillgängligt för transkription
Vart kommer DNA metyleringmönstret ifrån?
DNA metyleringmönstret ärvs vid celldelning
Vad är imprinting?
För de flesta gener ärver vi två funktionella kopior-‐en från mamman och en från pappan. I motsats till imprintade gener där vi ärver endast en
funktionell kopia. Beroende på vilken gen är antingen kopian från mamman
eller kopian från pappan epigenetiskt avstängd.
Avstängningsprocessen sker vanligtvis genom metylgupper som säts på när ägget eller spermiern bildas.
De epigeneiska taggarna på imprintade gener är normalt kvar hela
organismens liv. Dock blir de utraderade och nya epigenetiska mönster
bildas när ägg och spermier bildas.
Vissa gener är alltid imprintade i ägg och andra är alltid imprintade i
spermier.
Imprinting-‐tystnadaven genkopia genom epigenetisk mekanism.
Imprinting är nödvändig för normal utveckling, hur?
• Inkorrekt imprinting kan medföra att en individ får två aktiva
kopior eller två inaktiva kopior.
-Detta kan leda till allvarliga utvecklingsskador, cancer och
andra problem.
Exempel på sjukdomar som beror av felaktig imprinting
- Prader-Willi syndrom •Symptom inkluderar inlärningssvårigheter, korta individer, ätstörningar (obesity) och övervikt . • Individerna saknar genaktivitet som normalt kommer från fadern. •Sker när pappans gen saknas eller när det är två maternella kopior
Vad gör Igf2-genen?
Den mänskliga Igf2 genen är imprintad (chr 11).
Igf2 genen kodar för e n hormon som stimulerar tillväxt under embryonal och fetal utveckling. Metylering tystar normalt den maternella
IGf2 genen. En DNA mutation eller en epimutation
(metylmärke saknas) kan aktivera den vilket resulterar i två aktiva kopior.
Beckwith-‐Wiedemann Syndrome (BWS)
orsakas av aktivering av den maternella
Igf2 genen i ägget eller under embrional utveckling.
Barn med BWS har många olika symptom, den mest
synliga är storväxt. De har också ökad risk för
cancer, speciellt under barndomen.
Varför sker inte jungrufödelse i däggdjur?
Imprinting är anledningen varför parthenogenesis (“virgin birth”)
inte händer i däggdjur. Två hela kvinnliga genom kan inte producera avkomma på grund av imprintade gener.
Till exempel, embryot behöver faderns Igf2 gen eftersom mammans
kopia är imprintad och inaktiv.
Vad innebär maternally respektive parternally imprint?
Maternally är när en specifik gen endast har ärvts från pappa
Parternally är samma fast från mamman
