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Genetics > Final - Recombinaison homologue > Flashcards

Final - Recombinaison homologue Flashcards

1
Q

Quel processus permet l’échange du matériel génétique entre les gènes alléliques?

A

La recombinaison génétique

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2
Q

Que permet la recombinaison génétique (2)?

A
  • L’introduction et la stabilisation de nouvelles informations génétiques dans une cellule réceptrice
  • Le réassortiment d’une série de nucléotides le long d’une molécule d’acide nucléique
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3
Q

Quelles sont les trois grandes catégories de recombinaison génétique?

A
  • La recombinaison homologue
  • La recombinaison à des sites spécifiques
  • La recombinaison illégitime
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Q

Que permet la recombinaison homologue?

A

Permet l’échange de matériel génétique entre deux molécules d’ADN homologues

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5
Q

Que produit la recombinaison homologue?

A

Des séquences mixtes, dérivées partiellement d’un parent et partiellement de l’autre parent.

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6
Q

Pourquoi le mécanisme de la recombinaison homologue est très précis?

A

Puisqu’il n’y a ni perte, ni gains de nucléotides lors de l’échange des brins

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7
Q

Pourquoi la recombinaison est très généralisée et efficace chez les procaryotes?

A

Puisque lorsque deux molécules homologues sont présentes dans une cellules, la recombinaison représente la règle plutôt que l’exception.

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8
Q

Quel est le mécanisme de la recombinaison à des sites spécifiques?

A

La recombinaison se produit à des sites spécifiques sur le chromosome, au moyen de très courtes régions homologues entre le donneur et la cible.

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9
Q

Que permet la recombinaison illégitime?

A

La recombinaison entre deux molécules complétement différentes, qui ne montrent aucune homologie de séquence.

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10
Q

Pourquoi la recombinaison génétique est importante (5)?

A
  • Le mélange des gènes lors de la méiose
  • Le réarrangement des gènes
  • L’activation des gènes lors du développement
  • L’intégration des virus et des transposons
  • La réparation de l’ADN
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11
Q

Décrivez la recombinaison homologue

A

Série d’interactions entre 2 séquences d’ADN largement homologues présentes sur 2 différentes molécules ou sur 1 même molécule, qui produit des séquences mixtes dérivées partiellement d’un parent et partiellement de l’autre parent.

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12
Q

Quelles sont les deux caractéristiques de la recombinaison homologue?

A
  • Précision (pas de gain, pas de perte de nucléotides)
  • Efficacité
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13
Q

Quels sont les sujets d’étude de deux aspects de la recombinaison homologue?

A
  • changements structuraux dans les molécules d’ADN
  • enzymes de la recombinaison
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14
Q

Quelles sont les trois voies de recombinaison?

A
  • recBCD
  • recE
  • recF
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15
Q

Comment est initié le modèle de Holliday?

A

Les brins correspondants de deux molécules double-brins homologues s’alignent, puis 1 des 2 brins sont coupés. Les extrémités libres des brins coupés se croisent pour s’associer avec l’autre extrémité libre des brins.

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16
Q

Quel est le phénomène de migration du modèle de Holliday?

A

Les brins d’ADN sont alors liés de façon covalente et le point de croisement peut alors se déplacer dans l’une ou l’autre direction.

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17
Q

Quels types de recombinants peuvent être générés par la structure de Holliday?

A
  • La coupure des brins qui n’ont pas été impliqués dans la recombinaison génère un ADN dont les extrémités ont été échangées (échange).
  • La coupure des brins qui sont impliqués dans la recombinaison provoque l’échange d’un segment simple-brin homologue (morceau).
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18
Q

Quels sont les trois étapes du mécanisme du modèle de Holliday?

A
  1. Formation de la structure de Holliday
  2. Déplacement de la structure de Holliday et échange des brins
  3. Résolution de la structure de Holliday
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19
Q

Comment sont formées les régions hétéroduplexes?

A

Bien que les chromosomes soient homologues, différents allèles sont présents dans la population, avec des séquences légèrement différentes.

La recombinaison homologue génère des régions d’hétéroduplexes contenant ces gènes et qui présentent quelques mésappariements.

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20
Q

Quelles évidences génétiques ont validées le modèle de Holliday (4)?

A
  • Après la méiose, les 4 chromosomes haploïdes sont complets
  • La recombinaison est réciproque
  • Des régions hétérologues sont formées
  • À la même fréquence, on observe les « morceaux » et les « échanges »
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21
Q

Quelles évidences physiques ont validées le modèle de Holliday (3)?

A
  • Observation de la forme « chi »
  • Le point de crossing-over est visible
  • Les structures « chi » ne sont retrouvées que dans les bactéries RecA+
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22
Q

Quelle structure est formée par la recombinaison de deux génomes circulaires homologues?

A

La formation de co-intégrats

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23
Q

Comment se forme les structures de co-intégrats?

A

D’après le modèle de Holliday, une coupure simple brin est effectuée dans les 2 génomes.

Les brins coupés envahissent l’autre génome et une structure d’Holliday est formée.

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24
Q

Quelle est la structure d’un co-intégrat?

A

Les deux brins non-impliqués dans la recombinaison sont clivés, pour observer la formation d’un large cercle.

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25
Q

Quelle est la structure de cercles recombinants?

A

Les brins impliqués dans la recombinaison sont clivées, pour observer la formation de deux petits cercles.

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26
Q

Quelles sont les différences entre la structure de Holliday et les observations scientifiques (2)?

A
  • La présence de “boucle en forme D”
  • La formation de recombinants non réciproques.
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27
Q

Comment est initiée la structure du modèle de Meselson-Radding?

A

Le processus de recombinaison est initiée par une coupure simple brin dans un seul des brins d’ADN

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28
Q

Que génère la césure dans le modèle de Meselson-Radding?

A

La césure génère une extrémité 3’-OH qui sert d’amorce à la synthèse de nouvel ADN en utilisant le brin complémentaire comme matrice.

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29
Q

Comment se déroule la formation de la boucle D dans le modèle de Meselson-Radding?

A

L’extrémité du brin déplacée est libre et peut envahir l’autre duplex d’ADN, se pairer au brin complémentaire et ainsi provoquer le déplacement du brin homologue, créant la boucle D.

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30
Q

Que permet la dégradation de la boucle D dans le modèle de Meselson-Radding?

A

Ceci crée une extrémité qui permet sa liaison au brin qui se réplique. Ceci crée la structure de Holliday.

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31
Q

Comment est résolue la structure de Holliday dans le modèle de Meselson-Radding?

A

La structure de Holliday peut migrer et finalement être résolue par la coupure des brins impliqués ou non-impliqués dans la recombinaison.

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32
Q

Quels sont les deux processus impliquées dans le modèle de Meselson-Radding?

A

Ce modèle a une étape de recombinaison qui est couplée à la réplication de l’ADN.

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33
Q

Que montraient les études du modèle double-brin de la levure?

A

Un ADN portant une délétion pouvait se recombiner et être réparé durant le processus, ne pouvaient pas être expliquées par ces modèles et ont conduit au modèle du bris double-brin.

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34
Q

Comment est initiée la recombinaison dans le modèle double-brin de la levure?

A

Dans ce modèle, la recombinaison est initiée par une coupure double-brin dans une des molécules d’ADN.

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35
Q

Comment est élargie la coupure de l’ADN double brin dans le modèle double-brin de la levure?

A

Par des exonucléases

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36
Q

Comment est formée la boucle D dans le modèle double-brin de la levure?

A

L’extrémité 3’-OH d’un des brins envahira l’autre duplex d’ADN

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37
Q

Que permet la réplication de l’ADN dans le modèle double-brin de la levure?

A

La réplication de l’ADN permettra de réparer et de compléter la région manquante.

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38
Q

Vrai ou faux? Des études chez la levure ont montré qu’un ADN portant une délétion ne pouvait se recombiner et être réparé entièrement durant le processus de recombinaison.

A

Faux, ceci ne pouvait pas être expliqué par les modèles de recombinaison précédents et a conduit au modèle du bris double-brin.

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39
Q

Combien de copies sont contenues dans le génome de la levures après la recombinaison?

A

Deux copies des gènes a-d, séparées par l’ADN du plasmide.

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40
Q

Quelle est l’intégration théorique de la recombinaison entre le génome de levure et un plasmide qui contient les gènes homologues a et d?

A

Après la recombinaison, une copie des gènes a-d a subit une délétion.

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41
Q

Quelle est l’intégration observée de la recombinaison entre le génome de levure et un plasmide qui contient les gènes homologues a et d?

A

Après la recombinaison, les deux copies des gènes a-d sont intactes

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42
Q

Comment est initiée la recombinaison dans le modèle du bris double-brin?

A

Dans ce modèle, la recombinaison est initiée par une coupure double-brin dans une des molécules d’ADN

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43
Q

Combien d’étape de réplication implique le modèle du bris du double-brin?

A

Ce modèle implique 2 étapes de réplication de l’ADN.

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44
Q

Combien de structure d’Holliday sont générées par le modèle du bris double brin?

A

Ce modèle génère deux structures de Holliday.

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45
Q

Vrai ou faux? Les structure d’Holliday du modèle du bris double brin sont résolues de façon dépendante permettant la formation de plusieurs molécules recombinantes différentes.

A

Faux, elles sont résolues de manière indépendante.

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46
Q

Quels processus sont apparents dans les modèles Meselson-Radding et bris double-brin (2)?

A
  • La région générée lors de la réplication de l’ADN montre une recombinaison non-réciproque puisqu’un des brins est perdu et remplacé par réplication.
  • Après la formation de la structure de Holliday, il y a migration de la structure sur des distances plus ou moins grandes. Ce déplacement génère une région dans laquelle la recombinaison est réciproque puisqu’elle est causée par un déplacement de brins existants.
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47
Q

Pour quels processus la recombinaison homologue est nécessaire chez les procaryotes (3)?

A
  • La réparation des cassures bicaténaires de l’ADN
  • Le redémarrage des fourches de réplication bloquées
  • La recombinaison de l’ADN chromosomique avec de l’ADN qui entre dans les cellules lors de l’infection par un bactériophage ou lors de la conjugaison.
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48
Q

Quels sont les trois étapes de la recombinaison homologue chez les procaryotes?

A
  • Initiation (recBDC, topoisomérase, recA)
  • Migration (ruvAB)
  • Résolution (ruvC)
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49
Q

Comment est initiée la recombinaison chez les procaryotes?

A

La recombinaison est initiée par des complexes enzymatiques (ex. recBCD) qui créent des régions d’ADNsb. La protéine recA reconnait ces sites et sert alors de matrice pour pairer les chromosomes et permettre l’échange des brins par la formation de la structure de Holliday.

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50
Q

Comment la jonction de Holliday est reconnue lors de la recombinaison chez les procaryotes?

A

La jonction de Holliday est reconnue par les protéines ruvA et ruvB qui permettent le déplacement rapide de la jonction et par ce fait l’allongement de la région recombinée.

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51
Q

Comment la jonction de Holliday est clivée lors de la recombinaison chez les procaryotes?

A

N’importe quand après sa formation, la jonction de Holliday peut être reconnue et clivée par la protéine ruvC, libérant ainsi les deux chromosomes.

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52
Q

Comment les activités d’appariement et d’échange de brins de recA peuvent être observées in vitro?

A

En utilisant de simples substrats d’ADN

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53
Q

Quels sont les propriétés importantes des activités d’appariement (3)?

A
  • La complémentarité des séquences entre les deux ADN partenaires
  • Une région d’ADNsb sur au moins l’une des 2 molécules
  • La présence d’une extrémité d’ADN dans la région de complémentarité
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54
Q

Quelle condition doit être respectée pour la recombinaison catalysée par recA d’un cercle simple brin et d’un ADN linéaire double brin?

A

La séquence à l’extrémité 3’ du duplex est complémentaire à la séquence du cercle.

55
Q

Comment est initiée la recombinaison homologue recA dépendante de la bactérie?

A

La recombinaison est initiée par le complexe protéique recBCD (hélicase, nucléase).

56
Q

Comment est effectuée la recombinaison homologue recA dépendante de la bactérie?

A

La recombinaison est effectuée par la protéine recA (échange des brins) (topoisomerase).

57
Q

Comment est résolue la recombinaison homologue recA dépendante de la bactérie?

A

La recombinaison est résolue par le complexe protéique ruvABC (migration, résolution).

58
Q

Comment est formé le complexe recBCD?

A

Le complexe recBCD est formé des produits des gènes recB, recC et recD.

59
Q

Comment le complexe recBCD initie la recombinaison?

A

Le complexe “entre” dans l’ADN double-brin par une extrémité et migre de façon unidirectionnelle sur l’ADN.

60
Q

Quel est le rôle du complexe recBCD lors de sa migration dans la recombinaison?

A

Lors de sa migration, le complexe enzymatique sépare les brins d’ADN localement pour produire des régions simple-brins. Ces ADNsb sont dégradés par les activités nucléasiques de recBCD.

A la rencontre d’une séquence chi (GCTGGTGG), recBCD cesse la dégradation du brin ayant une extrémité 3’. Cet ADNsb est alors tapissé de la protéine recA (aidée par recBCD), ce qui initie la recombinaison.

61
Q

Quel élément est essentiel au complexe recBCD pour amorcer le déroulement de l’ADN?

A

Une extrémité double brin libre, qui est normalement absente du chromosome bactérien circulaire.

62
Q

Comment sont produites les extrémité double brin libre à partir d’ADN circulaire chez les procaryotes pour qu’elles soient couplées au complexe recBCD?

A

Elles sont produites au cours des opérations de recombinaison provoquées par la transformation bactérienne, la conjugaison et la transduction induite par les phages.

Elles apparaissent aussi lors de l’inactivation de fourches de réplication.

63
Q

Quelles sont les fonctions de recBCD (4)?

A
  • Hélicase de l’ADN unidirectionnelle
  • Exonucléase ATP-dépendante
  • Endonucléase ATP-stimulée
  • Endonucléase à un site spécifique
    (5’ GCTGGTGG 3’)
64
Q

Quels sont les différences dans les activités de recB, de recC et de recD?

A
  • RecB est une hélicase 3’ → 5’ qui possède également un domaine nucléolytique multifonctionnel.
  • RecC reconnait les sites chi.
  • RecD est une hélicase ADN 5’ → 3’.
65
Q

Dans quels complexes rec sont dirigés les deux extrémités des brins coupés?

A

Le brin 3’ est dirigé vers recB alors que le brin 5’ est dirigé vers recD.

66
Q

Quel est le résultats du passage des deux brins au niveau du site nucléolytique du recB?

A

Le brin 3’ monocaténaire émerge au niveau du site nucléolytique de recB. Il en résulte la digestion efficace et progressive de ce brin.

Le brin 5’ passe également par le site nucléolytique de recB mais moins efficacement .

67
Q

Comment l’activité de recBCD est altérée lors de la rencontre d’un site chi?

A

recC reconnait la séquence chi et s’y fixe fortement: l’extrémité 3’ est piégée et ne peut plus avancer vers de site de dégradation. Ceci empêche sa coupure et permet la dégradation facilitée du brin 5’.

68
Q

Quel extrémité est recouverte par recA?

A

La queue 3’ monocaténaire sera recouverte de recA pour initier la recombinaison.

69
Q

Quels sont les deux mécanismes de translocation de recBCD?

A
  • Lors de l’hydrolyse de l’ATP, les deux hélicases se déplacent uniformément le long de l’ADN, déroulant le duplex au fur et à mesure.
  • Si les moteurs se déplacent indépendamment et à des vitesses inégales, alors un mécanisme de translocation bipolaire expliquerait la génération des intermédiaires de déroulement en queues de boucle d’ADN monocaténaire qui ont été observés par microscopie électronique. La sous-unité RecD est le moteur le plus rapide.
70
Q

Quel extrémité peut rejoindre plus rapidement recA?

A

Les sous-unités RecA rejoignent les sous-unités déjà présentes et le font plus rapidement du côté 3’ de l’ADN.

71
Q

Quelle est la conséquence de la polarité d’assemblage de RecA?

A

Les molécules avec extensions 3’ sont efficacement recouvertes de RecA, alors que les molécules monocaténaires en 5’ ne servent pas de substrats pour l’assemblage du filament.

72
Q

Quelle est la disposition des molécules d’ADN homologues lors de la réaction d’échange des brins médiée par recA?

A

Les molécules d’ADN homologues sont appariées à l’intérieur de l’hélice formée de molécules de recA.

73
Q

Combien d’hélice sont formées lors de a réaction d’échange des brins médiée par recA?

A

La molécule d’ADN recombinante forme une hélice à 3 brins.

74
Q

Que force la rotation du filament recA autour de son axe lors de la réaction d’échange des brins médiée par recA?

A

La rotation du filament recA autour de son axe force l’ADN duplex à s’embobiner avec le filament recA.

75
Q

Comment se fait l’échange de 2 brins lors de la réaction d’échange des brins médiée par recA?

A

L’échange de 2 brins se fait grâce à la formation d’une structure de Holliday.

76
Q

Décrivez RecA?

A

RecA est la protéine centrale de la recombinaison homologue, membre d’une famille d’enzymes appelées les protéines échangeuses de brins.

77
Q

Quelle est la fonction des protéines échangeuses de brins ?

A

Ces protéines catalysent l’appariement des molécules homologues de l’ADN.

78
Q

Quelle est la forme active de recA?

A

La forme active de recA est un filament protéine-ADN.

79
Q

Que fait la protéine RecA avec l’ADN simple-brin?

A

La protéine RecA reconnaît l’ADN simple-brin et s’y polymérise pour former un filament hélicoïdal.

80
Q

Où se déroulent les réactions d’association et de recombinaison de l’ADN?

A

Dans le filament hélicoïdal

81
Q

Quelle condition doit être respectée pour le recouvrement de l’ADN par recA?

A

La protéine recA peut donc recouvrir l’ADN simple-brin ou encore l’ADN double-brin lorsque celui-ci contient un gap simple-brin qui permet d’initier la polymérisation.

82
Q

Quelle condition doit être respectée pour permettre la fixation d’une deuxième molécule d’ADN double-brin nu par recA?

A

Le premier brin d’ADN est fixé dans la crevasse le long du filament.

83
Q

Comment la protéine RecA permet-elle l’échange des brins homologues?

A

Elle permet d’abord le déplacement des brins pour permettre l’appariement des régions homologues, puis l’ouverture de l’ADN double-brin et l’échange des brins.

84
Q

Comment le filament de RecA se forme-t-il?

A

Les sous-unités de RecA lient l’ADN de façon coopérative, et le filament croît par l’addition de sous-unités RecA dans le sens 5’ vers 3’.

85
Q

Qu’est-ce qui explique la nécessité de régions monocaténaires dans les substrats soumis à un échange de brins?

A

La liaison et l’assemblage de recA sont beaucoup plus rapides avec l’ADNsb qu’avec l’ADNdb.

86
Q

Quelle est la nécessité de régions monocaténaires dans les substrats soumis à un échange de brins?

A

La liaison et l’assemblage de RecA sont beaucoup plus rapides avec l’ADN simple-brin qu’avec l’ADN double-brin.

87
Q

Quelle est la particularité de l’extrémité 3’ du brin d’ADNsb lors du recouvrement par RecA?

A

L’extrémité 3’ du brin d’ADNsb est celle qui est le plus efficacement recouverte de recA.

88
Q

Quelle est la condition pour initier l’échange des brins par RecA?

A

Lorsqu’une des deux molécules d’ADN a une extrémité 3’-OH libre.

89
Q

Quelle structure est utilisée pour étudier la recombinaison?

A

L’utilisation de cercles et de molécules linéaires homologues.

90
Q

Quelle découverte a permis l’utilisation de cercles et de molécules linéaires homologues.

A

La recombinaison est initiée par une extrémité 3’-OH libre et qu’elle ne tolère pas les régions non-homologues.

91
Q

Décrivez les deux conformations de recA.

A

La protéine recA peut adopter deux conformations distinctes en fonction de son interaction avec l’ADN : une conformation à haute affinité et une conformation à basse affinité.

92
Q

Quelle est la différence entre la haute et basse affinité de recA pour l’ADN?

A

Haute affinité: + ATP, 18 nt/tour, 19° rotation, 5.1Å entre les nucléotides.

Basse affinité: + ATP, 30 nt/tour, 34° rotation, 3.4Å entre les nucléotides.

93
Q

Combien de nucléotides sont associés à un recA en présence d’ATP?

A

1 recA/3 nt

94
Q

Décrivez la structure de l’ADN dans le filament recA.

A

L’ADN dans le filament recA est fortement étiré, avec une distance moyenne entre 2 bases de 0,5 nm au lieu de 0,34 nm.

95
Q

Que se passe-t-il lors de la liaison de recA à l’ADN?

A

Lors de la liaison de recA, la longueur de la molécule d’ADN est multipliée par environ 1,5.

96
Q

Où se déroule la recherche de séquences d’ADN homologues et les échanges de brins?

A

Dans le filament recA.

97
Q

Décrire le complexe recA-ADN.

A

Le complexe recA-ADN est composé de monomères de recA alternativement formant une hélice avec 12 monomères sur 2 tours.

98
Q

Que montre une vue en microscopie électronique du complexe recA-ADN?

A

En microscopie électronique, on observe des molécules d’ADN recouvertes totalement ou partiellement par recA.

99
Q

Que montre une vue perpendiculaire à l’axe de l’hélice formée par le filament de protéines?

A

Une vue perpendiculaire montre 12 monomères de recA constituant 2 tours d’hélice.

100
Q

Qu’observe-t-on dans une vue parallèle à l’axe de l’hélice du complexe recA-ADN?

A

Dans une vue parallèle, on voit 1 tour d’hélice avec la position des 6 monomères de recA.

101
Q

Comment se forme la structure de Holliday lors du cycle d’interaction entre recA et l’ADN?

A

L’échange des brins permet la formation de la structure de Holliday.

102
Q

Que se passe après l’hydrolyse de l’ATP lors du cycle d’interaction entre recA et l’ADN?

A

Les molécules recA sont libérées et libres de se réassocier à de l’ADNsb.

103
Q

Décrivez le modèle proposé du pairage et de l’échange des brins dans le filament recA.

A

Le filament recA peut contenir 1, 2, 3 ou 4 brins d’ADN, avec les filaments contenant 1 et 3 brins étant les plus courants pour la recombinaison.

104
Q

Combien de sites distincts de liaison à
l’ADN comporte le filament recA?

A

La structure du filament recA contient deux sites distincts de liaison à
l’ADN:

  • un site primaire qui fixe l’ADNsb
  • un site secondaire qui peut être occupé par l’ADNdb
105
Q

Pourquoi l’ADN lié au site secondaire du filament recA est transitoirement ouvert et testé?

A

Pour sa complémentarité avec l’ADNsb du site primaire

106
Q

Que se passe-t-il une fois qu’une région de complémentarité de bases est identifiée dans le filament recA?

A

recA catalyse la formation d’un complexe stable entre les deux molécules d’ADN, formant une molécule de jonction.

107
Q

Quelle est la composition de la molécule de jonction formée dans le filament recA?

A

RecA et de 3 brins d’ADN, et contient généralement plusieurs centaines de paires de bases d’ADN hybride.

108
Q

Comment se déroule l’échange des brins dans le filament recA?

A

L’ADN au site primaire est apparié à son partenaire complémentaire dans l’ADN lié au site secondaire, provoquant la rupture d’un ensemble de paires de bases et la formation d’un nouvel ensemble identique.

109
Q

Expliquez le rôle du filament recA dans le processus d’échange des brins.

A

Le filament recA reste préférentiellement lié à l’ADN produit par l’échange de brins, facilitant ainsi le processus d’échange et de recombinaison.

110
Q

Décrivez la formation des triples-brins.

A

En plus des liaisons hydrogènes normalement retrouvées pour la liaison des paires de bases G:C et A:T, des liaisons hydrogènes supplémentaires permettent la liaison d’une troisième base et la formation stable d’une triple hélice.

111
Q

Décrivez le rôle de l’activité ATPasique de la protéine recA in vivo.

A

Elle hydrolyse l’ATP pour obtenir de l’énergie nécessaire à la recherche d’homologie et au jumelage de brins d’ADN lors du processus de recombinaison.

Les mutants ATP montrent le phénotype recA.

112
Q

Quels sont les effets de l’activité ATPasique de la protéine recA ATP- in vitro?

A

L’échange des brins et une migration limitée sont possibles.

Cependant, une migration longue est rare, l’échange entre 4 brins est impossible, et la migration ne passe pas les régions hétérologues.

113
Q

Quelle est le rôle des protéines ruvABC dans le modèle de l’association des protéines ruvABC à l’ADN?

A

La migration et la résolution de la recombinaison est effectuée par les protéines ruvABC.

114
Q

Décrivez le rôle RuvA dans le processus de résolution de la recombinaison.

A

RuvA est nécessaire pour reconnaître et fixer la structure de Holliday. De plus, elle permet le positionnement de ruvB sur cette structure.

115
Q

Décrivez le rôle RuvB dans le processus de résolution de la recombinaison.

A

RuvB permet alors la migration de la jonction de Holliday.

116
Q

Décrivez le rôle RuvC dans le processus de résolution de la recombinaison.

A

RuvC est une nucléase qui coupe l’ADN recombiné et libère ainsi les deux duplex d’ADN.

117
Q

Décrivez le processus de recombinaison in vitro décrit dans l’expérience du modèle de l’association des ruvABC à l’ADN.

A

La recombinaison in vitro implique la jonction de deux molécules homologues, un cercle double brin (avec une région simple brin qui permet l’initiation de la recombinaison) et une molécule linéaire radioactive.

118
Q

Quelles formes d’ADN sont produite après l’expérience du modèle de l’association des ruvABC à l’ADN?

A

Des formes linéaires monomériques et dimériques de même qu’une forme circulaire sont les produits de la recombinaison.

119
Q

Que se passe-t-il en présence de recA lors de la recombinaison in vitro?

A

En présence de recA, la recombinaison s’effectue, avec une forme intermédiaire observée en 10 minutes et la conversion en produit final observée 25 minutes après le début de la réaction.

120
Q

Comment l’ajout des protéines ruvA et ruvB affecte-t-il la vitesse de la réaction de recombinaison in vitro?

A

L’ajout des protéines ruvA et ruvB accélère la réaction, la forme finale apparaissant en moins de 15 minutes.

121
Q

Quel est le rôle de l’ajout des protéines ruvA, ruvB et ruvC dans l’expérience de recombinaison in vitro?

A

L’ajout des protéines ruvA, ruvB et ruvC conduit à l’apparition d’une forme finale linéaire dimérique, montrant que ruvC coupe l’intermédiaire de recombinaison pour former les produits finaux.

122
Q

Quel sont les processus qui nécessite la recombinaison homologue chez les eucaryotes (5)?

A
  • La réparation de l’ADN (cassures bicaténaires)
  • Le déblocage des fourches de réplication bloquées
  • L’alignement des chromosomes homologues durant la méiose
  • Le maintien de l’intégrité du génome durant la méiose
  • La redistribution des gènes entre les chromosomes, ce qui assure une variation des ensembles de gènes transmis à la génération suivante
123
Q

Quel est le rôle de la recombinaison homologue lors de la méiose?

A

Lors de la première division nucléaire de la méiose, les chromosomes homologues dupliqués doivent s’apparier et s’aligner au centre de la cellule par recombinaison homologue.

124
Q

Pourquoi la recombinaison doit être exécutée avant la première division nucléaire?

A

Pour permettre aux chromosomes de s’aligner et de se séparer.

125
Q

Quelle est la conséquence de la recombinaison méiotique lors de la méiose?

A

La recombinaison méiotique conduit fréquemment à des crossing-over entre gènes appartenant aux deux chromosomes homologues parentaux.

126
Q

Quel est le rôle de spo11 lors de la recombinaison homologue chez les eucaryotes?

A

Ce gène code pour une protéine qui introduit des coupures double-brin dans l’ADN chromosomique pour initier la recombinaison. Les coupures ont lieu exactement au moment où les chromosomes homologues commencent à s’apparier.

127
Q

Quel est le rôle de mrx lors de la recombinaison homologue chez les eucaryotes?

A

Ce complexe enzymatique est une ADN nucléase multimérique.

Il reconnait les sites de coupures par spo11 et les réaménage en régions monocaténaires nécessaires à l’assemblage des protéines de type recA (mais version eucaryote).

Il dégrade brin d’ADN à partir des extrémités 5’, ce qui donne au brin complémentaite une partie ADNsb avec extrémité 3’.

128
Q

Quel est le rôle de dmc1 lors de la recombinaison homologue chez les eucaryotes?

A

Dmc1 n’est exprimé que dans les cellules qui entrent en méiose. C’est un homologue de recA.

129
Q

Quel est le rôle de Rad51 lors de la recombinaison homologue chez les eucaryotes?

A

Rad51 est une autre protéine homologue à recA, mais elle est exprimée aussi bien dans les cellules en division mitotique que celles en division méiotique.

130
Q

Comment sont formés les foyers de recombinaison chez les eucaryotes?

A

Plusieurs autres protéines sont retrouvées dans les complexes protéines-ADN qui forment les foyers de recombinaison.

131
Q

Comment est initiée la recombinaison méiotique chez les eucaryotes?

A

La recombinaison méiotique est initiée par une coupure bicaténaire d’un des chromosomes homologues par la protéine spo11.

132
Q

Quel est le rôle du complexe Mrx lors de la recombinaison homologue chez les eucaryotes?

A

Le complexe Mrx est alors responsable de la résection des brins terminés par un 5’ au site de coupure, ce qui génère de l’ADNsb qui se termine par une extrémité 3’.

133
Q

Quel est le rôle des protéines échangeuses de brin Dmc1 et Rad51 lors de la recombinaison homologue chez les eucaryotes?

A

Les protéines échangeuses de brin Dmc1 et Rad51 s’assemblent alors sur les queues d’ADNsb.

134
Q

Quels sont les mécanismes impliquées dans la reconnaissance homologue chez la levure (2)?

A
  • Les longs ARN non-codants (IncARN)
  • La mobilité chromosomique

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