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Flashcards in Fonctions des protéines Deck (62)
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1

Qu'est-ce que la structure primaire? secondaire? tertiaire? quaternaire?

-Primaire: : suite d’acides aminés
-Secondaires: réarrangement spatial conditionné par la séquence des acides aminés
exemples: hélice α et feuillet plissé β
-Tertiaire: conformation tridimensionnelle globale fonctionnalité de la protéine
-Quaternaire: union de deux protomères ou plus fonctionnalité de la protéine

2

Qu'est-ce que la myoglobine?

C'est une protéine fixatrice d'O2 du muscle de 153 AA avec un groupe prosthétique, l'hème.

3

Quelle est la structure tertiaire de la myoglobine?

Seulement des hélices alpha.

4

Qu'est-ce qu'un groupe prosthétique?

élément d’une protéine, essentiel à la fonction de la protéine, non constitué d’acides aminés, dont la synthèse est indépendante de la synthèse de la protéine

5

De quoi est composé l'hème?

Protoporphyrine IX + atome de Fer

6

De quoi est formé protoporphyrine?

-2 groupements vinyles (hydrophobes) tournés vers l'intérieur de la molécule (CH=CH2)
-2 groupements propionates (ionique et polaire) tournés vers le milieu aqueux (CH2-CH2-COO-)

7

Comment s'appelle la myoglobine sur laquelle l'O2 est fixée? et celle sans O2?

-Oxymyoglobine
-désoxymyoglobine

8

Sous quelle forme est le fer dans l'hème?

Fe++ (forme ferreux)

9

Comment est tenu en place le fer dans l'hème?

Par 5 axes de coordination:
-4 avec le N de la protoporphyrine
-1 avec un noyau imidazole de l'histidine-93

10

Comment se fixe l'O2 sur l'hème?

À l'aide d'un 6ième axe sur le Fer.

11

L'oxymyoglobine est-elle oxygénée ou oxydée?

Oxygénée.

12

En quoi se transforme le fe++ s'il est oxydé?

Fer ferrique (Fe3+)

13

Dans quel milieu s'oxyde facilement le fe++?

En solution. (rapide)

14

Dans quelles protéines est présent le Fe3+? Pour remplir quelle fonction?

- Cytochromes
-Réaction d'oxydo-réduction

15

Est-ce que l'hème peut fixer le CO2?

Oui.

16

Pourquoi est-ce qu'il s'agit de Fe++ au lieu de Fe+++ dans l'hemoglobine?

En solution, l'affinité de l'hème avec Fe+++ pour le CO2 est de 25 000 fois celle pour le O2. Tandis que l'hème avec Fe++ a une affinité pour le CO2 de 250 fois celle pour le O2. Donc, ça serait mortelle d'Avoir du Fe+++

17

Quelle quantité de l'hème est fixer au CO2?

1% des sites de fixation.

18

Qu'est-ce que l'affinité?

La force d'une interaction non covalente entre une macromolécule biologique, acide nucléique ou protéines, et un ligand qui se fixe sur un site à sa surface

19

Qu'est-ce que l'hémoglobine?

Une protéine de transport d'O2 présente dans les érythrocytes

20

De quoi est composé l'Hb?

-4 protomères : 2 alpha et 2 Beta. alpha: 141 AA beta: 146 AA
-1hème par protomère.
-Hb: 4% hème et 96% globine.

21

Quelle est la structure tertiaire de l'Hb? quaternaire?

Tertiaire: hélices alpha
Quaternaire: 4 protomères ensemble.

22

Comment est aussi appelé le tétramère alpha2beta2 ?

HbA

23

Quelle est la différence entre HbA et HbA2?

au lieu d'être alpha2beta2 c'est alpha2delta2 (delta: 146 AA dont 131 sont identiques à beta)

24

Quelle est la différence entre HbA et HbF(fœtal)?

C'est α2γ2 au lieu de α2β2
dont γ : 35 acides aminés différents de β

25

Quelle est la différence entre HbA et HbE?

ζ2ε2
( ζ : 141 acides aminés, dont 57 différents de α)
( ε : 146 acides aminés, dont 34 différents de β)

26

Quand avons-nous du HbE, HbF et HbA/HbA2?

HbE apparaît dans la première semaine de vie et persiste jusqu’à 3 mois, et est remplacé par HbF qui persiste jusqu’à environ 6 mois post natal. HbA/A2 apparaît dès la naissance et remplace graduellement HbF

27

Est-ce que tous les types de Hb ont la même affinité pour l'O2?

Non, Leur affinité pour O2 change graduellement de haute à faible, permettant in utero une meilleure facilité d’échange de O2 de la mère à l’embryon / fétus.

28

Qu'est-ce qu'un ligand?

petite molécule se liant à une protéine par des interactions non covalentes
comme O2 sur Mb et Hb.

29

Quelle est l'équation de la courbe de saturation de la myoglobine?

Y= pO2/(pO2+Kdiss)

30

Quelle est la forme de la courbe de la saturation de la saturation de la myoglobine?

Hyperbole.