II - Le basi molecolari (struttura e funzione dei geni) Flashcards

1
Q

Qual è il diametro delle due emieliche del DNA?

A

20 angstrom

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Quale tipo di mutazione può variare con la trasmissione alle generazioni successive?

A

Mutazione dinamica

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Quali sono le mutazioni puntiformi meno frequenti?

A

Le mutazioni che causano guadagno di funzione

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Un cambio nucleotidico nella regione codificante può avere un effetto patogenetico solo se…

A

Nessuna delle risposte (è presente in più del 2% della popolazione, causa la sostituzione di un aa nel prodotto genico, causa un frameshift)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Con quale meccanismo un miRNA può causare una malattia genetica in caso di mutazioni nella sequenza di legame al miRNA sul gene bersaglio?

A

La mutazione può alterare il preesistente sito di legame del miRNA o può creare un nuovo sito di legame del miRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Il trattamento della cromatina con basse concentrazioni di DNasi I permette di determinare…

A

Lo stato di attività trascrizionale della cromatina

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Quale funzione svolgono le topoisomerasi nella replicazione del DNA?

A

Rompono legami fosfodiesterici

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Una megabase è…

A

Un’unità di misura corrispondente ad un milione di basi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

L’inserzione o la delezione di un nucleotide nella regione codificante di un gene può provocare…

A

Tutte le risposte (alterazione della trascrizione, arresto prematuro della sintesi proteica, scivolamento della cornice di lettura, alterazione del meccanismo di splicing)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Mutazione ‘g.IVS33+2T > A’ indica…

A

La sostituzione di una timina con un’adenina in posizione +2 dell’introne 33

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Una mutazione che porta all’assenza di una proteina può…

A

Tutte le risposte (colpire la sequenza codificante della proteina nel gene corrispondente, essere una mutazione non-senso, comportare un deficit enzimatico)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Affermazione ERRATA. I miRNA…

A

Sono piccole molecole di RNA che regolano l’espressione genica mediante il loro legame alla regione 3’ codificante

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

La fosforilazione in Ser5 del CTD…

A

Segue una cinetica pressoché complementare alla fosforilazione della Ser2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Quale delle seguenti affermazioni riguardanti l’emoglobina e la mioglobina è errata?

A

Nessuna delle risposte
(emoglobina adulta è formata da due catene alfa e due beta, mioglobina ed emoglobina hanno differente affinità per O2, il legame dell’ossigeno al ferro del gruppo eme è influenzato da variazioni di pH, CO2 e 2,3-Bisfosfoglicerato, la curva di saturazione dell’emoglobina con l’O2 è una curva sigmoide ed indica una cooperatività positiva)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Il mediatore trascrizionale umano…

A

A seconda della sua composizione in subunità, può mediare sia l’attivazione che la repressione trascrizionale

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Quale delle seguenti proprietà può essere associata ai vettori virali adeno-associati utilizzati per la terapia genica?

A

Potenziale integrazione sito-specifica

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Il complesso P-TEFb attiva la trascrizione…

A

Fosforilando la CTD della RNA polimerasi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Le mutazioni del gene CYP21A2 responsabili della iperplasia congenita surrenale sono generate mediante…

A

Conversione genica durante la mitosi e crossing-over ineguale durante la meiosi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

La mutazione a1 annulla la funzione del gene A . Tuttavia, la mutazione b1 nel gene B riattiva la funzione di A . Questo è un esempio di…

A

Soppressione intragenica

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Come avviene il “targeting” per l’ubiquitinazione?

A

In alcuni casi dopo modifica post-sintetica della proteina bersaglio

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

I microsatelliti sono altamente polimorfici perché…

A

Causano errori nella replicazione del DNA dovuti ad appaiamenti fuori registro tra lo stampo e il DNA neosintetizzato

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Una mutazione puntiforme di un gene su un autosoma di un genitore si trasmetterà…

A

Alla metà dei figli

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

La sequenza di un filamento di DNA è 5’-TCGATC-3’. La sequenza complementare sarà…

A

5’-GATCGA-3’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Quale dei seguenti rapporti quantitativi si riscontra in una doppia elica di DNA?

A

T = A

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Che cos’è un gene epistatico?

A

Un gene che regola l’espressione di altri geni

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Quali dei seguenti sono stati trovati solo in organismi contenenti mRNA policistronici?

A

Mutazioni polari

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Il sito di riconoscimento da parte dell’endonucleasi Ava I è CPyCGPuG, dove Py è una qualsiasi pirimidina e Pu è una qualsiasi purina. Qual è la distanza media attesa, in coppie di basi, tra i siti di taglio di Ava I in una sequenza random di DNA?

A

1,024

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Quale di questi rapporti viene comunemente utilizzato come definizione di risoluzione in un esperimento di spettrometria di massa?

A

M /D M

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Quali dei seguenti codoni è considerato una tripletta leader?

A

ATG

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Si selezioni l’affermazione errata. Un promotore…

A

E’ un sito di legame al DNA di proteine con funzione di repressori

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Un allele mutato codifica una proteina di maggiore lunghezza rispetto a quella codificata dall’allele normale. Questo può essere dovuto a…

A

Tutte le risposte (duplicazione in frame della regione codificante, inserzione, mutazione in un codone di stop, mutazione in un sito di splicing)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Affermazione NON corretta. Le ligasi…

A

Legano le sequenze finali di un DNA a doppio filamento, ma non l’RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Il ruolo causativo di un gene-malattia è più probabile quando…

A

Si identificano mutazioni di tipo non-senso

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

Quale delle seguenti proprietà può essere associata ai vettori retrovirali utilizzati per la terapia genica?

A

Potenziale mutagenesi inserzionale

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

L’effetto del mosaicismo sulla ricorrenza…

A

E’ difficilmente prevedibile

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

Geni con hot-spot di mutazioni possono essere dovuti a…

A

Presenza di sequenze ripetute

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

Per un determinato carattere X-linked nell’uomo sono noti 12 diversi alleli. Quanti alleli diversi può possedere un maschio?

A

1

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

Le inserzioni o le delezioni del DNA…

A

Causano frameshift

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

Quale delle seguenti famiglie polimorfe è contenuta dentro il DNA altamente ripetuto?

A

Famiglia alfoide

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

I geni modificatori…

A

Sono particolari gruppi di geni che modifcano l’espressione di un carattere semplice

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

L’esclusione allelica…

A

Tutte le risposte (è l’espressione di uno solo dei due alleli di un gene, può essere dovuta all’inattivazione del cromosoma X, può essere dovuta al fenomeno dell’imprinting)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

Se due loci sono in linkage…

A

Devono essere anche in linkage disequilibrium

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

Quale delle seguenti proteine non è implicata nel controllo del ciclo cellulare?

A

p10

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

Il processo del capping è mediato da…

A

RNA Pol II fosforilata in Ser5 della CTD

45
Q

Un paziente ha una mutazione da A a G in un gene (A e G sono sottolineate, le prime tre basi corrispondono al codone d’inizio). La sequenza normale è ATGCTGTGCCGTATGAAAAGACCAATCAA A GAAGTTCCGTTACAAACCTCATAGA. La sequenza del paziente è ATGCTGTGCCGTATGAAAAGACCAATCAA A TAAGTTCCGTTACAAACCTCATAGA. Quale sarà la conseguenza di questa sostituzione nucleotidica?

A

Una mutazione non-senso

46
Q

Duplicazioni geniche possono portare a…

A

Anomalo appaiamento tra cromatidi fratelli

47
Q

L’eterocromatina costitutiva…

A

E’ la porzione di cromatina permanentemente condensata in tutti i tessuti e tutti gli stadi di sviluppo di un organismo

48
Q

Mutare la “seed region” di un sito bersaglio di un microRNA…

A

Ne inibisce la funzionalità

49
Q

Quali, tra i seguenti tipi di sequenze, sono presenti nei centromeri dei cromosomi eucariotici?

A

Sequenze ripetute in tandem

50
Q

La regolazione più importante nell’espressione di un gene avviene

A

A livello trascrizionale

51
Q

Qual è l’unità di misura della distanza genetica tra geni localizzati sullo stesso cromosoma?

A

Centimorgan

52
Q

Quale delle seguenti affermazioni sull’appaiamento complementare delle basi NON è corretta?

A

Le purine si appaiano sempre con purine e le pirimidine con pirimidine

53
Q

I motivi a “leucine zipper” (cerniere di leucine) sono importanti perché sono…

A

Un motivo strutturale di molte proteine che legano il DNA

54
Q

Un cambio di nucleotidico nella regione codificante può avere un effetto patogenetico solo se…

A

Nessuna delle risposte (causa la sostituzione di un aa nel prodotto genico, è presente in più del 2% della popolazione, causa un frameshift)

55
Q

Le transversioni rispetto alle transizioni…

A

Sono 2vv più frequenti

56
Q

Quali patologie genetiche sono caratterizzate dalla presenza del fenomeno dell’anticipazione?

A

Malattie da espansione di triplette nucleotidiche

57
Q

Quali dei seguenti sono stati trovati solo in organismi contenenti mRNA policistronici?

A

Mutazioni polari

58
Q

Una mutazione non-senso in un gene ha come probabile conseguenza…

A

L’interruzione prematura della traduzione della proteina

59
Q

In un esperimento di cromatografia ad esclusione molecolare…

A

Gli analiti sono separati in base alle loro dimensioni e forma

60
Q

Mutazione ‘g.IVS33+2T > A’ indica…

A

La sostituzione di una timina con un’adenina in posizione +2 dell’introne 33

61
Q

L’esperimento di Avery ha dimostrato che il principio trasformante…

A

E’ un pezzo di cromosoma batterico

62
Q

Una megabase è…

A

Un’unità di misura corrispondernte ad un milione di basi

63
Q

La sequenza di eventi maturativi di APP che porta alla produzione del peptide beta-amiloide è…

A

Taglio in beta > taglio in gamma

64
Q

La differenza minima fra gli alleli di un gene è costituita da…

A

Una coppia di basi

65
Q

Quale delle seguenti proprietà può essere associata ai vettori retrovirali utilizzati per la terapia genica?

A

Potenziale mutagenesi inserzionale

66
Q

Mutazioni del gene di tau…

A

Non sono mai state riscontrate nell’Alzheimer familiare

67
Q

Quale delle seguenti emoglobine è presente in un soggetto normale?

A

HB A2

68
Q

Affermazione falsa. Uno pseudogene processato…

A

E’ trascritto normalmente e codifica una proteina identica a quella del gene d’origine

69
Q

Quale dei seguenti è un tipo di ubiquitinazione delle proteine?

A

Monoubiquitinazione, importante per la trascrizione genica

70
Q

Uno studio è stato condotto su una linea cellulare di mammifero che ha un tempo di duplicazione di 12 ore. Queste cellule sono state sincronizzate in G1 e poi marcate per 36 ore con BrdU (un analogo della timina che aumenta la densità del DNA in cui viene incorporato). Alla fine del periodo di marcatura, il DNA cromosomico è stato isolato dalle cellule e la sua densità analizzata mediante centrifugazione in gradiente di cesio cloruro. Quale dei seguenti pattern ci si aspetta di osservare? (H = heavy, pesante; L = light, leggero)

A

25% HL, 75% HH

71
Q

Con quale meccanismo un miRNA può casusare una malattia genetica in caso di mutazioni nella sequenza di legame al miRNA sul gene bersaglio?

A

La mutazione può alterare il preesistente sito di legame del miRNA o può creare un nuovo sito di legame del miRNA

72
Q

Mutazione ‘c.G1444 > A’ indica…

A

La sostituzione di una ‘G’ in posizione 1444 del cDNA

73
Q

Quale dei seguenti rapporti tra basi è sempre uguale ad 1 nel DNA a doppia elica?

A

(A+G)/(C+T)

74
Q

Che cosa si intende per “histone mark”?

A

Una modifica che marca alcuni amminoacidi delle code istoniche

75
Q

Gli enzimi di restrizione Msp I e Hpa II riconoscono la stessa sequenza, CGCG, ma Msp I la taglia sempre, mentre Hpa II non la taglia se è metilata. Se si estrae il DNA da uno dei seguenti tipi cellulari, lo si taglia con ognuno dei due enzimi e lo si esamina per Southern blot, ibridizzando con una sonda molecolare per la b-globina, in quale di essi i due enzimi daranno probabilmente le stesse bande?

A

Cellule eritroidi

76
Q

Due peptidi di identica struttura chimica, ma che differiscono nello loro composizione isotopica, mescolati in un rapporto di concentrazione di 1:1, generano in uno spettro di massa:

A

Due segnali m/z di pari intensità

77
Q

Come funziona la struttura gerarchica dell’ubiquitinazione?

A

Ci sono pochi “ubiquitin-activating enzymes” e circa 1000 “ubiquitin-protein ligases”

78
Q

Che cos’è un marcatore genetico?

A

Un polimorfismo del DNA

79
Q

Cos’è l’RNA eterogeneo?

A

RNA messaggero presente nel nucleo

80
Q

Le regioni ipersensibili alla digestione con DNasi I che sono state trovate nei geni degli eucarioti che si stanno esprimendo sono generalmente localizzate in corrispondenza delle:

A

sequenze regolatrici a monte dei promotori

81
Q

Le dinamiche di assemblaggio del complesso di pre-inizio, ricostruite mediante esperimenti EMSA

A

Richiedono la successione ordinata di eventi che coinvolgono fattori basali della trascrizione e RNA polimerasi II

82
Q

Si scelga l’affermazione non corretta. Le ligasi

A

legano le sequenze finali di un DNA a doppio filamento, ma non l’RNA

83
Q

Quale delle seguenti affermazioni non è corretta?

A

Più del 20% del genoma umano è costituito da sequenze codificanti

84
Q

Le mutazioni nella TATA box sono caratterizzate da tutte queste proprietà, tranne una. Quale?

A

Causano la totale assenza del messaggero

85
Q

Un plasmide è…

A

Un elemento genetico a replicazione autonoma

86
Q

L’effetto del mosaicismo sulla ricorrenza…

A

E’ difficilmente prevedibile

87
Q

I trasposoni possono…

A

Tutte le risposte (interrompere la sequenza genica in arrivo, interrompere la sequenza genica da cui provengono, interrompere il frame di lettura)

88
Q

In un esperimento di cromatografia ad esclusione molecolare…

A

Gli analiti sono separati in base alle loro dimensioni e forma

89
Q

L’esperimento di Hershey e Chase con il batteriofago T4 dimostrò che…

A

Nel DNA di T4 è contenuta tutta l’informazione per riprodurre le particelle virali

90
Q

La maggior parte delle forme familiari di Alzheimer è dovuta a mutazione del gene di…

A

Presenilina 1

91
Q

Una mutazione puntiforme di un gene su un autosoma di un genitore si trasmetterà…

A

Alla metà dei figli

92
Q

Come funziona la struttura gerarchica dell’ubiquitinazione?

A

Ci sono pochi “ubiquitin-activating enzymes” e circa 1000 “ubiquitin-protein ligases”

93
Q

Il trattamento della cromatina con basse concentrazioni di DNasi I permette di
determinare…

A

Lo stato di attività trascrizionale della cromatina

94
Q

Con quale meccanismo un miRNA può casusare una malattia genetica in caso di mutazioni
nella sequenza di legame al miRNA sul gene bersaglio?

A

La mutazione può alterare il preesistente sito di legame del miRNA o può creare un nuovo sito
di legame del miRNA

95
Q

La mobilità di un frammento di DNA all’interno di un gel elettroforetico dipende principalmente dalla sua…

A

Lunghezza

96
Q

Che cos’è il paradosso di Levinthal?

A

Un paradosso che, teoricamente, valuta il numero di eventi necessari per il folding di una
proteina

97
Q

Per quale delle seguenti patologie genetiche è possibile la diagnosi prenatale?

A

Tutte le risposte (emofilia, fibrosi cistica, distrofia muscolare, talassemia)

98
Q

Gli studi di Griffith su Streptococcus pneumoniae provarono che…

A

Il DNA è il materiale genetico dei batteri

99
Q

La mutazione R356W del gene CYP21A2 cade nel dominio deputato…

A

Al legame con la reduttasi

100
Q

Il principio trasformante purificato da Avery e collaboratori risultò resistente all’azione
di…

A

Tutte le risposte (tripsina, ribonucleasi, chimotripsina)

101
Q

Le mutazioni del gene CYP21A2 responsabili della iperplasia congenita surrenale sono
generate mediante…

A

Conversione genica durante la mitosi e crossing-over ineguale durante la meiosi

102
Q

Il principio trasformante purificato da Avery e collaboratori risultò sensibile all’azione di…

A

Desossiribonucleasi

103
Q

Le regioni ipersensibili alla digestione con DNasi I che sono state trovate nei geni degli
eucarioti che si stanno esprimendo sono generalmente localizzate in corrispondenza delle…

A

Sequenza regolatrici a monte dei promotori

104
Q

Che cos’è un gene epistatico?

A

Un gene che regola l’espressione di altri geni

105
Q

Un aumento del rischio di Alzheimer sporadico è associato ai polimorfismi del gene di…

A

ApoE

106
Q

Quale dei seguenti accoppiamenti tra ceppi di E. coli potrebbe risultare in una elevata
frequenza di trasferimento di geni cromosomici?

A

Hfr × F-

107
Q

Il sito di riconoscimento da parte dell’endonucleasi AvaI è CPyCGPuG, dove Py è una
qualsiasi pirimidina e Pu è una qualsiasi purina. Qual è la distanza media attesa, in coppie
di basi, tra i siti di taglio di AvaI in una sequenza random di DNA?

A

1,024

108
Q

Dove si trova il locus AZF?

A

Sul cromosoma Y

109
Q
A