Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

ToD > Kortfrågor molekylärbiologi > Flashcards

Kortfrågor molekylärbiologi Flashcards

0
Q

Vilken del av den dubbelsträngade DNA-helixen binder vanligtvis transkriptionsfaktorer till?

A

Major groove.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
1
Q

Var i en gen hittar man oftast TATA-boxen?

A

25-30 nukleotider uppströms om transkriptionsstartplatsen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Ange ett strukturellt motiv som man kan hitta i DNA-domänen hos aktivatorer av transkription? (x3)

A

Helix-turn-helix.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vad heter den DNA-sekvens till vilken en repressor binder?

A

Operator.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vad är mediatorns huvudsakliga uppgift?

A

Länkar de generella transkriptionsfaktorerna till de genspecifika transkriptionsfaktorerna som reglerar genuttryck.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad är och gör en insulator?

A

Det är DNA-sekvenser som delar in kromosomerna i oberoende domäner och motverkar enhancers från att verka på promotorer i närliggande domäner.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vilken typ av RNA bildas då RNA-polymeras II transkriberar DNA? (x2)

A

mRNA. (?)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vilken del av RNApol II fosforyleras av TFIIH vid initiering av transkription? (x3)

A

CTD-svansen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vilken är den första modifikationen som sker på pre-mRNA

A

5’-capping, d.v.s. lägga till en 7-metylguanosincap i mRNA:ts 5’-ände.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Vad är spliceosomen uppbyggd av?

A

snRNA och proteiner (5snRNA i komplex med snRNP).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Vad gör SR-proteiner? (x2)

A

Styr spliceosomen till korrekt splicesite och rekryterar U1 och U2.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Ge två exempel/varianter på alternativ splicing, d v s händelser som leder till förändrar bortklippning av intron.

A

Exonskipping, alternative splicesite.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vad kallas det RNA som ligger före och efter open reading frame i ett mRNA?

A

5’-UTR före och 3-‘UTR efter.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hur kan proteinet IRE-BP (aconitas) påverka mRNA-stabilitet?

A

IRE-BP är vid låga järnkoncentrationer ett aktivt RNA-bindande protein, som stabiliserar mRNA och därigenom tillåter järnupptag. Vid höga järnkoncentrationer destabiliserar aktivt aconitas mRNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vad gör P-bodies? (x3)

A

Decapping och degradering av mRNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Vilken aminosyra kodar startkodonet AUG för? (x2)

A

Metionin.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vilken initieringsfaktor för med sig initierings-tRNA till ribosomer?

A

eIF2.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Vad kallas den mekanism som gör att ribosomen kan binda till mRNA-molekyler utan hjälp av initieringsfaktorer? (x2)

A

Internal recognition. (Cap-independent initiation, t ex IRES).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Vilken enzym kopplar rätt aminosyra till rätt tRNA-molekyl?

A

Aminoacyl-tRNA-syntetaser.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Vad utför aminoacyl-tRNA-syntetaser för funktion?

A

Kopplar rätt aminosyra till rätt tRNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Vad binder till stoppkodon i translationen?

A

eRF1 tillsammans med eRF3.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Vad har S6-kinaset för funktion? (x2)

A

Kontrollera translation genom att fosforylera det ribosomala proteinet S6 på lilla subenheten vilket möjliggör translationen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Vad kännetecknar signalpeptiden för intransport i det endoplasmatiska retiklet? (x2)

A

Det är en sekvens bestående av 5-10 hydrofoba aminosyror på N-terminalen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Hur styrs syntesen av sekretoriska proteiner till det endoplasmatiska retiklets yta?

A

SRP binder till proteinets signalpeptid och guidar det till ER.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Var äger den kvävebundna (N-linked) glykosyleringen rum? (x2)

A

I rough endoplasmatiska retiklet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Vilken typ av proteiner veckar aktivt oveckade proteiner?

A

Chaperoner (chaperoniner)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Vad innebär “unfolded protein response”?

A

Det aktiveras av BiP som svar på ackumulering av oveckade proteiner i endoplasmatiska retiklet. Generell inhibition av proteinsyntes, ökat uttryck av chaperoner, ökad degradation av mRNA som koder för protin som deltar i den sekretoriska vägen, ökad proteasomaktivitet och, om det är otillräckligt, apoptos.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Vad är amyloid för något?

A

Felveckade protein som bildat olösliga fibrösa proteinaggregat.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Vad utför proteasomen för funktion?

A

Bryter ned ubikvitinmärkta proteiner.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Hur märks proteiner ut för destruktion i proteasomen?

A

De ubikvitineras m h a E1, E2 och E3.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Vilket protein snörper av sekretoriska vesiklar från membran?

A

Dynamin.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Vad har små GTP-bindande proteiner för roller i vesikulär transport?

A

Coatrekryterande GTPaser kontrollerar uppbyggandet och isärplockandet av coats. Rab-proteinet är ett GTPas som genom hydrolys ger energi till fuseringen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Vilken är receptorn för lysosomala proteiner (i golgiapparaten)? (x2)

A

Mannos-6-fosfatreceptorn (MPR).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Vad innebär “cisternal maturation model”?

A

Vesiklar från ER fuserar med varandra och formar en cistern vid cis-Golgisidan, vilken progressivt mognar och rör sig genom golgi när nya cisterner formas vid cis-sidan.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

I vilken del av mRNA:t sitter signalen för transport till rätt del av cellen?

A

I 3’-ändan.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

Vad sker med proteiner som har transporterats in i mitokondriens matrix?

A

Presekvensen klyvs bort av MPP och proteinet veckas av matrix-Hsp70-chaperoner.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

Vad kännetecknar signalpeptiden för intransport till mitokondriens matrix?

A

Den är amfipatisk, d v s både laddad och icke-polär.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

Vilket protein binder den nukleära lokalisationssignalen för transport av proteiner in i cellkärnan? (x2)

A

Importin.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

Vad innebär parakrin signalering?

A

När en cell uttrycker en ligand som binder till en närliggande cells receptor.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

Vad innebär autokrin signalering?

A

Att cellen som utsöndrar signalmolekylen också är målet för signalmolekylen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

Nämn en intracellulär sekundär budbärare som tillhör kolhydratfamiljen.

A

IP3.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

Vilken signalväg aktiveras av cytokinreceptorerna? (x2)

A

Jak/STAT.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

Vilken signalväg aktiverar TGFbeta-receptorn?

A

SMAD-vägen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

Vad gör GEF respektive GAP i samband med G-proteinsignalering?

A

GEF aktiverar G-protein genom att stimulera frisättningen av GDP för att tillåta inbindandet av GTP. GAP inaktiverar G-protein genom att stimulera hydrolys av GTP till GDP.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

CREB är en viktig transkriptionsfaktor. Vilka intracellulära budbärare aktiverar CREB? (x2)

A

PKA och CaM-kinas. (Även S6-kinas, MSK1 och MSK2).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

Vad gör koleratoxinet?

A

ADP ribosylerar Gs-alfa som blir kontinuerligt aktiv, vilket ökar cAMP-halten hundrafaldigt.

46
Q

Vilken intracellulär budbärare aktiverar proteinkinas A? (x2)

A

cAMP.

47
Q

Vad har mTOR för funktion?

A

mTORC2 fosforylerar och aktiverar PKB (Akt), medan mTORC1 reglerar cellstorlek.

48
Q

Vilka faktorer behövs för att proteinkinas C ska aktiveras? (x2)

A

Ca2+, DAG och en IP3.

49
Q

Vad gör inositoltrifosfat (IP3) för något?

A

Signalerar frisättandet av kalcium från intracellulära lager.

50
Q

Vad gör PTEN-fosfataset?

A

Defosforylerar PIP3, vilket motverkar aktiviteten hos PI3-kinas och Akt/PKB.

51
Q

Vad binder SH2-domäner till?

A

Fosforylerat tyrosin.

52
Q

Vilken proteindomän binder fosforylerat tyrosin?

A

SH2.

53
Q

Vad binder SH3-domäner till?

A

Prolinrika sekvenser.

54
Q

Vilken proteindomän är det som kan binda till prolinrika sekvenser?

A

SH3.

55
Q

Vad binder pleckstrin homology-domänen till? (x2)

A

Fosfoinositider.

56
Q

Vilken proteindomän binder till fosfoinositider?

A

Pleckstrin homology-domänen.

57
Q

Vad gör homeodomänproteiner?

A

Medverkar i regleringen av genuttryck i samband med morfogenes och utveckling.

58
Q

Vilka signalvägar aktiveras av receptortyrosinkinaset?

A

PI3K/PKB, (PI3K/PKC), Ras/MAP-kinas.

59
Q

Hur stängs receptortyrosinkinassignaleringen av?

A

Fosfataser inaktiverar snabbt tyrosinkinaserna.

60
Q

Vad gör SOS (son-of-sevenless) i receptortyrosinkinassignaleringen?

A

Stimulerar guaninnukleotidutbyte, vilket resulterar i bildandet av det aktiva Ras-GTP-komplexet.

61
Q

Hur aktiveras Ras vid receptortyrosinkinasaktivering?

A

Genom att SOS binder in och stimulerar utbytet av GDP mot GTP bundet till Ras.

62
Q

Vad aktiverar det monomera G-proteinet Ras för signaleringskaskad?

A

MAP-kinasvägen.

63
Q

Vad gör scaffold-proteiner i den intracellulära signaleringen? (x2)

A

Hjälper till att moterka crosstalk mellan parallella MAP-kinasmoduler.

64
Q

Namnge två “early response genes”.

A

C-fos, c-myc, c-jun.

65
Q

Vad är de ungefärliga kalciumkoncentrationerna på utsidan och insidan av en cell?

A

1 mM extracellulärt, 0,1 microM intracellulärt.

66
Q

Hur stor är den ungefärliga vilopotentialen i en elektriskt exciterbar cell? (x2)

A

-70 mV.

67
Q

Vilken jon bestämmer oftast storleken på vilopotentialen i en elektriskt exciterbar cell?

A

Kalium.

68
Q

Vad är en pyrimidin? (x2)

A

En heterocyklisk aromatisk ring, vars derivat är cytosin, tymin och uracil.

69
Q

Vilken nukleotid basparar A med i DNA och vilken nukleotid basparar U med i RNA? (x2)

A

A basparar med T (tymin) i DNA och U basparar med A (adenin) i RNA.

70
Q

Vilken del av den dubbelsträngade DNA-helixen binder vanligtvis histoner till?

A

Minor groove (helst nukleotiderna AA, TT, TA).

71
Q

Vilka kovalenta modifieringar sker vanligtvis på histoner? (x3)

A

Acetylering/deacetylering, metylering, fosforylering.

72
Q

Hur många histonproteiner ingår i en nukleosom? (x2)

A

8.

73
Q

Vilka histonproteiner ingår i en nukleosom? (x2)

A

H2A, H2B, H3, H4.

74
Q

Vad är “CG-rich islands”?

A

Begränsade genomiska områden som innehåller en hög frekvens av baserna cytosin och guanin.

75
Q

Vad menas med att DNA-replikationen är semi-konservativ? (x2)

A

Att en modermolekyl bildar två dottermolekyler som var och en har en gammal och ny DNA-sträng i sig.

76
Q

Vad gör ett topoisomeras?

A

Tvinnar upp och tillbaka DNA-kedjan vid t ex DNA-replikation.

77
Q

Vad måste ske direkt innan DNA-polymeraset kan binda till origin of replication?

A

Primas måste binda och syntetisera en primer. cdc6 och cdt1 måste fosoryleras och släppa från DNA.

78
Q

Vilken DNA-reparationsmekanism reparerar tymin-tymin-dimerer? (x2)

A

Nucleotide excision repair (NER).

79
Q

Ge två exempel på tillfällen då homolog DNA-rekombination äger rum i cellen.

A

Vid reparation av dubbelsträngsbrott i DNA samt under meiosen.

80
Q

Vad är cDNA?

A

Komplementärt DNA (utan introner) som bildas när omvänt transkriptas katalyserar en reaktion där RNA omvandlas till DNA.

81
Q

Hur är telomerer uppbyggda? (x2)

A

Av tusentals korta repeterande nukleotidsekvenser i linjära kromosomers ändar.

82
Q

Vad är en haplotyp? (x2)

A

En kombination av alleler (DNA-sekvenser) vid olika platser (loci) på kromosomen som överförs tillsammans.

83
Q

Vad gör ett restriktionsenzym?

A

Klyver DNA specifikt, d v s vid en särskild sekvens av baspar.

84
Q

Vad är ett Hollyday junction?

A

En mobil korsning mellan fyra DNA-strängar vid homolog rekombination.

85
Q

Vad gör enzymet DICER?

A

Klyver dsRNA och miRNA till korta, dubbelsträngade RNA-fragment (siRNA).

86
Q

Vad är siRNA?

A

Kort, dubbelsträngat RNA involverat i bl a RNA-interference (RNAi) som stör genuttrycket.

87
Q

Vilken är den viktigaste signaleringsvägen för inträde i G1-fasen?

A

MAP-kinasvägen.

88
Q

När kommer första checkpointen i cellcykeln? (x2)

A

Restriction point i slutet av G1.

89
Q

Vilken uppgift fyller SCF och när utför den denna funktion?

A

Kontrollerar cellcykelövergångarna G1/S och G2/M genom att ubikvitinera protein.

90
Q

Ange tre produkter som aktivt E2F ger transkription av? (x2)

A

CyklinA, cyklinE, E2F, myc.

91
Q

Vad händer när pRB (retinoblastomproteinet) fosforyleras av G1-cyklin/cdk (cyklin D/cdk4)?

A

Det dissocierar från E2F som sedan börjar transkribera sina målgener.

92
Q

Vilka två kinaskomplex är huvudsakligen ansvariga för fosforylering av Rb-proteinet?

A

Cdk4,6/cyklinD följt av Cdk2/cyklinE.

93
Q

Vilket kinas aktiveras av ATR om oreplikerat DNA kvarstår när M-fasen annars är redo att starta för att förhindra att M-fasen verkligen initieras?

A

Chk1-

94
Q

För att M-cyklin/cdk (B-cyklin/cdk1) ska bli fullt aktivt måste åtminstone en aminosyra defosforyleras. Vilket fosfatas är i huvudsak ansvarigt för detta?

A

CDC25.

95
Q

Vad sker under profas i en vanlig mitos? (x2)

A

Kromosomkondensation, kärnmembranupplösning, spolkroppsbildning.

96
Q

Vad händer då caspaser aktiveras i samband med apoptos? (x3)

A

En kaskaskaskad påbörjas, där kaspaser klyver andra prokaspaser till aktivera kaspaser, vilket leder till att cellstrukturen förstörs och cellen dör.

97
Q

Hur hämmar IAP-proteiner apoptos? (x3)

A

Genom att binda kaspaser och därmed hindra att de aktiveras.

98
Q

Vilka proteiner ingår i apoptosomen? (x2)

A

Cytokrom c (cyt c), Apaf-1 och prokaspas 9.

99
Q

Vilken proteinfamilj kontrollerar mitokondriens frisättning av pro-apoptotiska faktorer? (x4)

A

Bcl2-familjen.

100
Q

Vad är en nukleol? (x3)

A

En icke-membranbunden struktur av proteiner och nukleinsyror som finns i cellkärnan.

101
Q

Vad är ett ribozym?

A

Ett enzym där RNA står för den katalytiska aktiviteten istället för proteinet.

102
Q

Nämn de intracellulära filamentsystemen.

A

Mikrofilament (aktinfilament), intermediära filament, mikrotubuli.

103
Q

Ge exempel på proteiner som bygger upp mikrotubuli, mikrofilament och intermediärfilament.

A

Mikrotubuli (tubulin, dynein, kinesin), mikrofilament (aktin), intermediärfilament (laminin, keratin).

104
Q

Vilken cellskelettstruktur är det som börjar vid centrosomen (MTOC) och sprider sig därifrån ut till olika delar av cellen?

A

Mikrotubuli.

105
Q

Vad gör kinesin och dynein?

A

Medierar (anterograd respektive retrograd) transport (av ex organeller) längs mikrotubuli.

106
Q

Vilka egenskaper hos ett protein avgör hur det separeras på tvådimensionell polyakrylamidgelelektrofores? (x2)

A

Hur stort proteiner är och dess laddning.

107
Q

Med vilka två metoder kan man studera ett proteins veckning?

A

Equilibrium unfolding och protein-NMR-spektroskopi.

108
Q

Vad studerar man med Western blotting-tekniken?

A

Proteiner.

109
Q

Vad mäter man med Northern blotting-tekniken?

A

Genuttryck genom detektion av mRNA.

110
Q

Nämn en teknik som mäter huruvida en transkriptionsfaktor har blivit aktiverad eller ej. (x2)

A

DNA-mikroarray.

111
Q

Vad är expressionsvektorer?

A

Plasmider som skapats för att producera stora mängder mRNA som effektivt kan translateras till protein i den transfekterade cellen.

112
Q

Vad är en transgen mus? (x2)

A

En mus som blivit genetiskt modifierad genom geninsättning, genborttagning eller genutbyte.

ToD (29 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions