LAMBDA Flashcards

1
Q

Lambda est le phage _____ le plus étudié à ce jour et a servi comme modèle pour étudier des processus de ____ .

A

tempéré

régulation complexes.

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2
Q

La famille ____ est classifiée dans l’ordre Caudovirales

A

Siphoviridae

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3
Q

caudovirales : ( _____ ( contractile ) , ____ (extensible) , _____ )

A

myoviridae

podoviridae

siphoviridae

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4
Q

Les caractéristiques partagées par les virus de la famille Siphoviridae comprennent:

  • des virions aux queues _____
  • l’assemblage ____ de la tête et la queue du virion
  • la différenciation entre les genres dans la famille par l’organisation du génome, les mécanismes d’empaquetage de l’ADN et par ____
A

minces, longues, flexibles et non-
contractiles

séparé

la présence ou l’absence d’une ADN polymérase virale

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5
Q

Le virion de λ est constitué d’une tête icosaédrique isométrique d’environ ___ de diamètre et d’une longue queue flexible et non contractile d’environ ___ de long, possédant des ___ à son extrémité.

A

55 nm

150 nm

fibres ( PAS AUSSI COMPLEX QUE CHEZ MYOVIRIDAE )

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6
Q

Le génome de λ a ~ ____ pb d’_____

A

48 000

ADNdb linéaire

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7
Q

Le génome a de petites extrémités cohésives sb (12 nt de long)
Ces extrémités sont_____ , ce qui permet à la molécule linéaire de _______

A

complémentaires en séquence

se circulariser par appariement de bases

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8
Q

Le génome de λ code pour plus de ___ gènes

A

70

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9
Q

Il existe des groupes distincts impliqués dans

A

la synthèse de la tête et celle de la queue,
dans la lysogénie
la réplication de l’ADN
la lyse des cellules

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10
Q

La régulation des gènes est facilitée par _____ et par la ____

A

leur regroupement

coordination de la transcription à partir des mêmes promoteurs

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11
Q

λ infecte E. coli dans un processus en deux parties:

  1. _____ se lient à la protéine de la membrane externe ____
  2. la protéine ___ , située à l’extrémité de la queue, se lie à la protéine membranaire externe ___
    - il n’y a que cette seconde interaction qui soit essentielle pour qu’il y ait infection
    - la capside reste attachée à l’extérieur de la cellule après l’infection
A

les fibres latérales de la queue

OmpC

gpJ

LamB

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12
Q

DÉTAIL DE LENTRÉE DE LADN PAS BIEN COMPRIS
Néanmoins, il semblerait que ____ se
réorganisent pour faciliter le passage de l’ADN dans la cellule et que la protéine ____ («tape measure protein») ___ est injectée dans la cellule et est essentielle pour le succès de l’injection de l’ADN

A

les protéines à l’extrémité de la queue

étalon de la queue

gpH

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13
Q

Immédiatement après l’injection, ____

Les deux extrémités sont ensuite liées de façon covalente par l’enzyme ____ DE ____

A

les
extrémités cohésives (cos) se lient pour circulariser le génome

ADN ligase de l’hôte

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14
Q

La transcription du génome de λ est catalysée par ____

A

l’ARN polymérase

dépendante de l’ADN de la cellule hôte

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15
Q

17-18

A

OK

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16
Q

La transcription est initiée par l’ARN polymérase aux promoteurs
____ qui aboutit à la transcription des gènes ___ ET ___

A

précoces immédiats PL et PR

N et cro

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17
Q

La protéine N est un facteur ____ qui modifie l’ARN polymérase de façon à ce qu’elle ____

A

d’anti-terminaison de la transcription

se lie à travers les terminateurs et dans les gènes précoces plus loin sur les opérons contrôlés par les promoteurs PL et PR

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18
Q

______ joue un rôle clé pour déterminer si le virus déclenchera le cycle lytique ou lysogénique

A

La protéine cII

19
Q

La protéine cII joue un rôle clé pour____

A

déterminer si le virus déclenchera le cycle lytique ou lysogénique

20
Q

La protéine cII joue un rôle clé pour déterminer si le virus déclenchera le cycle lytique ou lysogénique
Si la concentration de cII est suffisamment élevée, la transcription du gène _____

A

int qui code pour l’enzyme intégrase sera augmentée

21
Q

___ catalyse l’intégration du génome du phage dans le chromosome de la cellule hôte, établissant ainsi la lysogénie

A

L’intégrase

22
Q

Le gène cII augmente également la transcription du gène ___ codant pour ____ qui ____

A

cI

la protéine répresseur λ

réprime la transcription de tous les gènes à l’exception du sien

23
Q

La protéine répresseur λ permet la transcription de ___ , car elle active ___ , tout en inhibant ___

A

son propre promoteur PRMcI

PL et PR

24
Q

Rappel: une forte concentration de cIl est nécessaire pour ___

A

permettre à la lysogénie de continuer

25
Cependant, cII est dégradée par ____ , à moins qu’elle ne soit protégée par la protéine de phage ___ , qui est produite en même temps que cII
l'enzyme hôte HflB cIII
26
L'intégration du génome du phage dans le chromosome de l'hôte se fait en un site appelé ____
«site de fixation» att
27
Un prophage est formé par ____ ENTRE SITE ___
une recombinaison site-spécifique entre le site d'attachement du phage (attP) et le site bactérien (attB)
28
23 imag
ok
29
La recombinaison est catalysée par | l'intégrase, mais nécessite également
le facteur d'intégration de l’hôte («Integration Host Factor (IHF)»)
30
À la suite de l'intégration, le génome λ circulaire devient linéaire
ok
31
Si cII n’est pas suffisamment protégée par cIII contre la dégradation, la concentration d'une autre protéine virale appelée ___ va augmenter Cro inhibe la transcription de ___ , diminuant _____
Cro cIII et cI diminuant encore la quantité de cIl et du répresseur λ
32
Note: cI code pour
répresseur λ
33
En plus de la répression de cI et cIII, Cro ____ ainsi que ____
augmente sa propre synthèse celle des protéines Q
34
Lorsque la protéine Q est à une concentration suffisamment élevée, elle _____
active les gènes requis pour le cycle lytique
35
Lorsque l'ADN de l'hôte est endommagé, l'enzyme de réparation d’ADN («DNA repair enzyme») ___ est produite Rec A incite ____ , en ____ et, finalement, en réduisant la concentration de répresseur λ dans la cellule
Rec A le répresseur λ à se cliver réduisant la transcription de cI
36
La faible concentration de répresseur λ conduit à la transcription de____ Le gène xis code pour la protéine ___ l’excisionase redirige l'intégrase, pour _____ , libérant le prophage du chromosome de l'hôte
xis, int et cro excisionase recréer les sites attP et attB
37
la _____ est synthétisé et active la trnscription des genes quon a besoin pour cycle lytique
protéine Q
38
La transcription des gènes tardifs débute___ après le début de l'infection du promoteur PR '
10 minutes
39
Les gènes tardifs réglementés par Q comprennent des gènes ___ et ____ qui ____
O et P régulent la réplication de l'ADN du phage
40
La réplication de l'ADN du phage est mise en oeuvre par la _____ et est dirigée vers l'origine de réplication du phage par ___ et ___ La réplication est ___ Le résultat de la réplication est la production de ____
machinerie de réplication de l'hôte O et P bidirectionnelle initialement mais est convertie ensuite en un mode de cercle roulant unidirectionnellement concatémères multi- génomiques
41
image 31
ok
42
Au cours de l'emballage, l'ADN est injecté dans la procapside et clivé par une nucléase aux sites cos, libérant l'ADN du concatémère
ok
43
Lorsque les concentrations de la protéine ____ sont suffisamment élevées, la protéine perfore la membrane cellulaire La protéine__, une ____ , est maintenant en mesure d'accéder à ____ et de la dégrader Enfin, les protéines ___ et ____ forment____ qui ____ , permettant aux phages de se libérer de la cellule
S105 holine R endolysine la couche de peptidoglycane Rz et Rz1 un complexe spannin («spannin complex») perturbe la membrane externe