Mycologie Flashcards

(43 cards)

1
Q

Cryptococcose : Taxonomie du parasite

A

Genre : Cryptococcus
Espèce : neoformans

3 variétés et 5 sérotypes en fonction des épitopes de la capsule polysaccharidique
- C. neoformans var.neoformans = sérotype D
- C. neoformans var.grubii = sérotype A
- C. neoformans var.gatii = sérotype B et C
- Hybride des stéréotypes A et D

C.neoformans (asexuée / anamorphose) possède aussi une forme sexuée ou téléomorphe appelée Filobasidiella neoformans

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2
Q

Cryptococcose : Morphologie

A
  • Levure bourgeonnante ronde de 3 à 8 um de diamètre, encapsulée, lipophile
  • Capsule mucopolysaccharide composée de glucoronoxylomannane, galactomannane, mannoprotéines
  • Pas de pseudomycélium
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3
Q

Cryptococcose : Épidémiologie et Transmission

A

Mycose cosmopolite opportuniste de l’immunodéprimé

C.neoformans var.neoformans (sérotype D), 2% des cas :
- Cosmopolite, Europe ++
- Saprophytes telluriques (fientes de pigeons, guano de chauve-souri), lait, fruits
- Transmission : inhalation de basidiospores aérolisés (reproduction sexuée), porte d’entrée cutanée traumatique possible, transmission inter humaine non établie
- Neurotropisme

C. neoformans var.grubii (sérotype A), 80% des cas :
- Cosmopolite, USA, Canada ++
- Saprophytes telluriques (fientes de pigeons, guano de chauve-souris), lait, fruits
- Transmission : inhalation de basidiospores aérolisés (reproduction asexuée) ou porte d’entre cutanée traumatique possible, transmission interhumaine non établie
- Neurotropisme

C.neoformans var.gattii (sérotypes B et C ) :
- Zones tropicales et subtropicales
- Saprophytes du sol, de l’air, et de l’eau, eucalyptus, caroubiers, pins d’Alep, fécès de Koala
- Transmission : porte d’entrée cutanée, transmission inter humaine non établie
- Dermotropisme > Neurotropisme

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4
Q

Cryptococcose : Facteurs favorisants et Physiopathologie

A

Facteurs favorisant :
- Lymphopénie CD4+ => Levure opportuniste
- Patients immunodéprimé VIH+
- Patient immunodéprimé VIH- (corticothérapie, hémopathie maligne, transplantation d’organes)
- Virulence de la souche (C.neoformans var.gattii est la plus virulente, sensibilité moindre aux antifongiques)
- Importance de l’inoculum

Inhalation de spores infestantes > atteinte pulmonaire > si déficit de l’immunité cellulaire > dissémination hématogène > localisation neuro-méningée préférentielle car neuro tropisme > Lésions inflammatoires diffuses (méningoencéphalite) et/ou granulomateuses (cryptococcome)

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5
Q

Cryptococcose : Différentes formes et cliniques

A

Cryptococcose pulmonaire : inaugural
- Chez IC : asymptomatique ou syndrome pseudo-grippal persistant, guérissant spontanément
- Chez ID : toux, douleurs thoraciques, hémoptysies, voire SDRA

Cryptococcose neuro-méningée :
- Par diffusion hémato-lymphatique à partir du foyer pulmonaire
- Début insidieux et progressif : fièvre résistante aux ATB, céphalées, vomissements,
- Syndrome méningé franc : raideur de la nuque
- HTIC avec NV
- Atteinte nerfs crâniens : paralysie faciale, troubles de la conscience, baisse de l’acuité visuelle
- Hydrocéphalie, cryptococcome neuroméningé expansif => mort

Cryptococcose cutanée :
- Secondaire, le plus souvent : témoin de la dissémination hématogène
- Rarement primitive par inoculation directe
- Lésions polymorphes : acnéiformes, pustuleuses, papuleuses, nodulaires, ulcéronécrotiques ou pseudo-molludcum contagiosum
- Localisation : visage, thorax, ailes du nez, extrémités des membres

Cryptococcose ostéo-articulaire :
- atteintes vertébrales, ostéolyse des os courts et plats = abcès froid ossifluents pseudo-tuberculeux => fissuration
- pas d’atteintes articulaires

Cryptococcose disséminées :
- Toutes les viscères : ganglions, rate, foie, moelle osseuse, prostate => stade terminal du SIDA

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6
Q

Cryptococcose : Diagnostic

A

URGENCE
Contexte évocateur : atteinte pulmonaire + neuro-méningée +/- cutanée
Révélateur stade SIDA : VIH+ avec LT CD4 < 50/mm3

Diagnostic mycologique direct sur LCR = diagnostic de certitude :

1-Centrifugation du LCR :
- Examen direct du culot coloré à l’encre de Chine = Levures rondes, halo clair
- Surnageant = recherche de l’Ag capsulaire circulant (GXM) par immunochromatographie. Meilleure sensibilité, spécificité ++, rapide
Titrage si la recherche qualitative est positive = estimer la charge fongique

2-Culture sur gélose :
- Milieu Sabouraud + chloramphénicol et/ou gemtamicine sans cycloheximide à 37°C
- Milieu Sabouraud + chloramphénicol et/ou gemtamicine sans cycloheximide à 30°C
- Hémoculture
* 2-5 J pour sérogroupes A et D / 21J pour sérogroupes B et C : à conserver 1 mois
* Colonies blanches-beiges, bombées, lisses, brillantes, muqueuses à bords nets
* ED microscopie optique : blastopores unicellulaires ronds

3- Identification :
- Auxanogramme (aérobiose), zymogramme (anaérobiose)
- Spectrométrie de masse MALDI TOF

4- Antifongigramme

5- Bilan d’extension : Biopsies tissulaires, ED sur LBA, sang, urines

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7
Q

Cryptococcose : Prise en charge

A

Traitement d’induction : EN URGENCE
Amphotéricine B liposomale + 5-Fluorocystine IV pendant 2 semaines

Traitement de consolidation :
Fluconazole PO forte posologie - pendant 6-8 semaines

Traitement d’entretien :
Fluconazole PO en prophylaxie secondaire jusqu’à ce que :
- Les LT CD4+ > 200/mm3 pendant 6 mois
- ou les LT CD4+ > 100/mm3 et la charge virale est indétectable

Mesures associées :
PEC VIH+ = antirétroviraux, minimum 4 semaines après le début des antifongiques (sinon risque de SRIS Syndrome de Reconstitution Immune)

Suivi biologique : LCR => Négativation des cultures et de l’antigène circulant + suivi des toxicité des AF (STP, fonction rénale, NFS)

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8
Q

Pneumocystose : Nom du parasite, Généralités

A

Pneumocystis jirovecii

  • Champignon, Fungi, Ascomycètes
  • Micro-organisme unicellulaire, eucaryote, atypique
  • Apparenté aux levures
  • NON CULTIVABLE !!!
  • Absence d’ergostérol dans la membrane = résistance naturelle à l’amphotéricine B et les azolés
  • Paroi très riche en 1,3-ß-D-glucane
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9
Q

Pneumocystose : Cycle évolutif

A

Forme infectante = asque mature > Libération d’ascospores dans les alvéoles pulmonaires > transformation des ascospores en trophozoïtes et adhésion aux pneumocytes de Type I
Prolifération > Inflammation > Hyperplasie pneumocytes 1 > épaississement interstitiel + infiltrat > Hypoxie

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10
Q

Pneumocystose : Épidemiologie

A
  • Ubiquitaire de répartition cosmopolite
  • Strictement humain
  • Agent opportuniste du sujet lymphopénique :
    * CD4+ < 200/mm3 ou < 15% des lymphocytes => inaugurale stade SIDA +++
    * Patients greffés, sous immunosuppresseurs, corticothérapie, hémopathies malignes…
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11
Q

Pneumocystose : Transmission

A

Transmission interhumaine ou de source extérieure
Voie aérienne : inhalation d’asques (ou kystes) matures aéroportés

Contamination dans l’enfance +++
Portage asymptomatique possible chez l’immunocompétent

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12
Q

Pneumocystose : Clinique

A

Pneumocystose pulmonaire (=Urgence diagnostique et thérapeutique)
=> Pneumopathie aiguë hypoxémiante fébrile :
- Triade : fièvre + toux sèche + dyspnée
- Cyanose (hypoxie)
- Absence de sueurs nocturnes
- Radio pulmonaire : infiltrats alvéolo-interstitiels diffus bilatéral “en verre dépoli”

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13
Q

Pneumocystose : Diagnostic

A

Prélèvement respiratoire : LBA
Alternatives : expectorations induite, aspiration bronchique, biopsie pulmonaire

1- Examen direct : centrifugation + 2 colorations ou 1 coloration et 1 technique d’immunofluorescence directe
- Coloration MGG : observation formes trophiques, ascospores disposés en rosettes
- Coloration Gomori-Grocott (imprégnation argentique), Musto ou bleu de Toluidine : observation des asques en amas
- IFD : Ac monoclonal spécifique + fluorescéine : mise en évidence asques fluorescents

2- Biologie moléculaire : référence
- PCR en temps réel : recherche ADN de P.jirovecii
- Sensible, spécifique, VPN+++

3- Recherche Ag circulant : 1,3-ß-D-glucane sérique
- Marqueur d’infection fongique invasive => pan fongique
- Sensible, non spécifique

DD : cryptococcose, tuberculose, pneumopathies bactériennes et virales

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14
Q

Pneumocystose : PEC

A

URGENCE THÉRAPEUTIQUE

Traitement curatif, antifongique : 1ère intention
- Cotrimoxazole PO ou IV 3 semaines
- Alternatives : Clindamycine/Primaquine, Pentamidine, Atovaquone

Traitement symptomatique :
- Corticothérapie PO ????? A VÉRIFIER
-Si la PaO2 < 70 mmHg

Sujet VIH+ : Antirétroviraux 2-3 semaines après le début de l’antifongique (risque de Sd inflammatoire de reconstitution immunitaire)

Surveillance clinico-biologique :
- Efficacité : PaO2, négativation LBA, amélioration clinique
- Tolérance : EI

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15
Q

Pneumocystose : Prophylaxie

A

Collective : isolement protecteur des patients hospitaliers positifs

Individuelle du sujet VIH+ :
- Prophylaxie primaire si CD4+ < 200/mm3 ou < 15% des lymphocytes : Cotrimoxazole PO ou Pentamidine, Atovaquone, Dapsone
- Prophylaxie secondaire : idem
- Arrêt du ttt si reconstitution immunitaire (CD4+ > 200 /mm3 pendant 3 mois)

Individuelle du sujet non-VIH :
- Prophylaxie primaire systématiquement ??? chez tt le monde ?? vaccins ?? A vérifier
- Pendant 6 mois si post-transplantation

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16
Q

Candidose : Nom, Taxonomie, structure

A

Candida albicans
Champignon non filamenteux, Fungi, Ascomycetes, Saccharomycetales

Blastospores : formes unicellulaires, ovalaires, non pigmentés, non capsulés = levures
Reproduction asexuée par bourgeonnement uni ou multipolaire
Pseudomycélium + Mycélium vrai

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17
Q

Candidose : Épidémiologie

A

Cosmopolite, ubiquitaire
Commensale chez Homme et animaux (digestif, respiratoire, génital)
4ème agent de septicémies
Fréquent +++
Possible forme opportuniste

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18
Q

Candidose : Contamination

A
  • Voie endogène : prolifération des espèces commensales > Formes non-invasives
  • Voie exogène : implantation de matériel étranger (sonde, cathéter) > formes invasives
19
Q

Candidoses superficielles : clinique

A

Bon pronostic, fréquentes
Prolifération espèce commensale endogène

FDR : Lymphopénie ++, modification de la flore (ATB), Physiologie (âge, grossesse), diabète, obésité (plis cutanés)

≠ Formes :
Candidoses oro-pharyngées :
- Muguet buccal ou forme pseudomembraneuse : dépôts blanchâtres
- Forme érythémateuse anthropique
- Forme hyperplasie ou pseudo-tumorale + perlèches
FDR : VIH+, Prothèse dentaire, corticoïdes, anticancéreux, hyposialie (diminution de la production de salive), diabète

Candidoses génito-urinaires :
- vuvlo-vaginite, leucorrhées blanchâtres en “lait caillé), hormone-dépendante : prurit, brulures vulvaires, dyspareunies, érythème vuvlaire, oedème
FDR : diabète, contraception, grossesse, ATB large spectre
- Blanite chez homme
- Cystite
- Pyélonéphrite

Candidoses cutanées :
- Intertrigos grands et petits plis
FDR : macération, humidité, diabète, obésité, irritations
- Candidose anale

Candidoses digestives :
- Œsophagienne : dysphagie : SIDA +++ (LTCD4+ < 150/mm3)
- Intestinale

Candidose unguéales ou onychomycose à Candida :
-Périonyxis : inflammatoire + onyxis secondaire > envahissement latéral
(!≠ onyxis à dermatophytes > envahissement distal)

20
Q

Candidoses invasives : Clinique

A

Mortalité ++
Infections opportunistes, nosocomiales
FDR : neutropénie +++, altération des barrières naturelles, modifications de la flore, physiologie

Candidémies :
- Candidose systémique
- Une ou plusieurs hémocultures +
- Fièvre persistante malgré ATB

Candidoses disséminées :
- Candidose profonde
- Dissémination hématogène + atteinte > 2 sites non contigus
- Lésions cutanées, manifestations oculaires

Candidoses hépato-splénique :
- Forme disséminée chronique
- Contexte : aplasie après allogreffe CSH ou chimiothérapie > Hépato-splénomagélie fébrile
- Syndrome de restauration immunitaire

21
Q

Candidose : Diagnostic

A

1- Examen direct : microscopique
Pour les ongles, squames, hémocultures + : État frais w/ coloration au noir de Chlorazole + réactif éclaircissant (potasse, lactophénol) > mise en évidence de blastopores +/- bourgeonnants

Pour écouvillon, muqueuse : état frais > mise en évidence de blastopores

Pour tous : Coloration MGG, GRAM, Gomori-Grocott, fluorochrome > lecture MO > mise en évidence blastopores et filaments (vrai + pseudomycélium)

2- Culture
> Colonies blanches / crémeuses, rondes
Milieu spécifique de Sabouraud + ATB (chloramphénicol +/- gemtamicine) + cycloheximide :
- Pour candidose non invasive : incubation 24-72h, à 27-30°C
- Pour candidose invasive : Hémoculture + : incubation 24-72h à 35°C

3-Identification
- Spectrométrie de masse (MALDI-TOF) > rapide, précise
- Milieu chromogènes > coloration bleue-verte
- Test rapide : agglutination particules de latex sensibilisées
- Galeries d’identification (auxanogramme, zymogramme)

4- Étude de la sensibilité aux antifongiques
Si échecs thérapeutiques, candidoses invasives ++
=> CMI

5- Recherche antigènes circulants
Chez sujets à risques, dans les candidoses invasives
> Mannane : polysaccharide de paroi spécifique de Candida
> 1,3ß-D-glucanes : polysaccharide paroi fongique, marqueur précoce d’une infection fongique invasive, non spécifique

22
Q

Candidoses superficielles : Traitements

A

Candidose oropharyngée :
- Antifongique local 1-3 semaines : Nystatine / Amphotéricine B/ Miconazole / Bain de bouche / Antiseptique
- Formes sévères : Fluconazole PO 1-3 semaines

Candidose œsophagienne :
- Antifongique : Fluconazole 2-4 semaines

Candidose génito-urinaire :
- Antifongique local : azolés : Butoconazole / Éconazole / Miconazole : 3J
- Traitement associé : Toilette intime avec savon alcalin + azolé crème 2-4 semaines

Candidose cutanée :
- Antifongique local crème : Azotés (Éconazole / Imidazole) ou ciclopiroxolamine 2-4 semaines
- Traitement associé : antiseptique, hygiène
- Prophylaxie : lutte contre facteur favorisant (macération, humidité, traitement anti-diabétique)

Candidose unguéale :
- Antifongique : jusqu’à repousse saine de l’ongle (~2 mois)
(Azolés, ciclopiroxolamine, amorolfine)
- Si échec thérapeutique : Fluconazole VO
- Traitements associés bains antiseptiques
- prophylaxie : séchage mains, orteils, traitements anti-diabétiques, limiter soins manucures

23
Q

Candidoses invasives : Traitements

A

Traitement probabiliste empirique, antifongique systémique :
- 1ère intention : Échinocandines (Caspofungine ou Micafungine)
- Dès que l’hémoculture est positive
- Alternative : Amphotéricine B
- Éviction des FDR, ablation cathéters

Puis à adapter en fonction de l’antifongigramme : Fluconazole, Amphotéricine B liposomal, voriconazole
Durée 14j après la dernière hémoculture positive ou disparition des symptômes

24
Q

Candidoses : Prophylaxie

A

Chimioprophylaxie primaire : Fluconazole (lors de neutropénies, sous chimiothérapie, greffes…)

Lutte contre FDR : macération, diabète…

25
Dermatophytes : Taxonomie et Généralités
Tinea, mycoses superficielles Champignons filamenteux microscopiques, Fungi, Ascomycetes Grenre : Trichophyton, Microsporum Filaments septés arthrosporés Kératinophiles, kératolytiques Pathogènes stricts et obligatoires, cosmopolites
26
Dermatophytes : Épidémiologie et FDR
- Âge enfants ++ - Terrain : ID (corticothérapie, IS, chimiothérapie...) - FDR : Macération, humidité, traumatismes
27
Microsporum canis : Structure
Macronidies en quenouille ou en fuseau, paroi épaisse, échinulée, cloisonnée (6-12 logettes) + Microsporidies rares, piriformes, mycélium en raquette
28
Microsporum canis : Transmission
Zoonose Chat, chien Contact direct ou indirect (poils)
29
Microsporum canis : Clinique
Lésions peau glabre = Tinea corporis : - Épidermophyties circinées (herpès criciné) - Lésions en "cocarde", centrifuge Lésions cuir chevelu = Tinea capitis = teigne tondante microscopique : - Grandes plaques d'alopécie, squameuses - Lampe de Wood positive : fluorescence verte - Ecto-endothrix Foliculite = teigne des poils => Sycosis dermatophytique
30
Trichophyton mentagrophytes : Structure
Macronidies rares, en massue (3-6 logettes) Mycélium en angle droit, croix de Lorraine + Microconidies nombreuses, rondes, en buisson ou acladium
31
Trichophyton mentagrophytes : Transmission
Zoonose : lapin, hamster, cheval Contact direct ou indirect Tellurique : Plaies, traumatismes
32
Trichophyton mentagrophytes : Clinique
Lésion peau glabre =Tinea corrois = épidermophyties circinés (herpès circiné), lésion en "cocarde", centrifuge Lésions cuir chevelu = Tinea capitis = Teigne supputées, inflammatoires : - Placards ronds du cuir chevelu - Lésions cuir chevelu (kérion) et barbe (sycosis) - Lampe de Wood négative :pas de fluorescence - Ecto-endothrix Folliculine = teigne des poils = sycosis dermatophytique
33
Trychopthyton rubrum : Structure
Micronidies piriformes en caladium Macronidies exceptionnelles en sauçasse Mycélium fin et régulier, excroissances triangulaires
34
Trychophyton rubrum : Transmission
Anthrophile : transmission interhumaine Directe ou indirecte > Sol souillé par squames : salle de bain, piscines... > Objets souillés : peignes, vêtements
35
Trychophyton rubrum : Clinique
Lésions glabre = épidermophyties circinées, lésions en "cocarde", centrifuge Intertrigos : Grands plis, interdigito-palmaires (tinea cruris) , Interdigito-plantaires (tinea pedis) Lésions unguéales : onchomycoses (tinea unguium), onyxis sans périonyxis, parfois association à kératodermie, lésions disto-latérales Folliculites = teigne des poils => sycosis dermatophytique
36
Dermatophytes : Diagnostic
1-Examen direct : Lecture MO : > Peau/ongles : recherche de filaments mycéliens, hyalins septés > Cheveux / poils : recherche spores/ filaments mycéliens 2-Culture : Sabouraud : chloramphénicol + Gemtamicine + Cycloheximide 25-30°C + Sabouraud : Chlorampénicol + Gemtamicine sans cycloheximide 25-30°C + Borelli si suspicion de T. rubrum 25-30°C Si absence de pousse après 4 semaines = négatif 3- identification : aspect macroscopique + microscopique > M. canis : croissance rapide en 6J, colonies blanches étoilées, duvetées, pigment jaune/orangé > T. mentagrophytes : croissance rapide 4-6J, colonies blanches/crèmes poudreuses, pigment jaune/ brun > T. rubrum : croissance moyenne 8-10J, petites colonies blanches bombées, duveteuses, pigment rouge vineux/cocarde
37
Dermatophytes : Traitement
Dermatophytes cutanées : - Épidermophyties : Imidazolés crème (econazole) -2 semaines au moins Alternatives : Terbinafine PO (lésions étendues) Teignes : - Terbinafine VO + antifongique azolé topique 6-8 semaines jusqu'à guérison complète + raser les cheveux Alternative : ciclopiroxolamine Onyxis : - Amorolfine solution filmogène jusqu'à restitution totale de l'ongle main = 6 mois, pieds = 1 an - Si échec : Terbinafine VO
38
Dermatophytes : Prophylaxie
Lavage + séchage espaces inter-orteils, port de sandales Vêtements en coton Éviter les échanges de peignes, coupe-ongles, serviettes Maîtrise de la source de contamination Reprise rapide du traitement si récidive Désinfection régulière des douches/vestiaires communs
39
Aspergillose : Nom Taxonomie
Aspergillus fumigatus Champignon filamenteux, Fungi, Ascomycètes Moisissures Saprophyte, thermotolérant (jusqu'à 55°C) Émission de toxines nécrosantes + enzymes lytiques, mycotoxines
40
Aspergillus fumigatus : Cycle
- Tête aspergillaire = appareil producteur asexué - Émission des spores dans l'air > Germination sur substrat organique > Filaments mycéliens > Mycélium végétatif > Tête aspergillaire
41
Aspergillus fumigatus : Épidémiologie
Cosmopolite, ubiquitaire Opportuniste du sujet neutropénique
42
Aspergillus fumigatus : Transmission
Transmission indirecte, voie aérienne : inhalation de spores (conidies) environnementales Transmission directe : surinfection de plaies, brûlures, site opératoire, conduit auditif, cornée Pas de transmission interhumaine
43
Aspergillose : Traitement
Aspergillome simple : - Ttt chirurgical En complément : Voriconazole, Itraconazole Asthme aspergillaire : éviction allergène, anti-inflammatoires, bronchodilatateurs, mucolytiques Asthme bronchopulmonaire allergique : Corticothérapie + Antifongique (Itraconazole/Voriconazole) Alvéolite allergique extrinsèque : corticothérapie Aspergillose pulmonaire invasive : URGENCE Voriconazole IV puis relais VO jusqu'à guérison et disparition FDR Alternatives : Amphotéricine B liposomale, Isavuconazole, Échinocandines, Posaconazole