Struttura del DNA Flashcards
Quali sono le regole di Chargraff?
- La composizione in basi del DNA varia da una specie all’altra 2. Le molecole di DNA isolate da tessuti diversi hanno uguale composizione 3. La composizione del DNA non si modifica con l’età e con lo stato nutrizionale 4. In tutte le molecole di DNA la somma dei residui purinici è uguale alla somma dei residui pirimidinici
Caratteristiche struttura a doppia elica
Elica destrorsa Giro completo ogni 34 Å, dm 20 Å Distanza 2 coppie di basi adiacenti: 3,4 Å 10 bp per ogni giro d’elica Disposizione antiparallelo delle catene polinucleotidiche A-T 2 legami H G-C 3 legami H
Differenza tra solco maggiore e solco minore? Da cosa sono determinati?
Le molecole di ribosio si posizionano sullo stesso lato, determinando un’asimmetria dell’elica Solco maggiore: 22 Å, più atomi donatori o accettori di H, interazione con proteine (α-elica) Solco minore: 12 Å
Da cosa è determinata la stabilità dell’elica?
Basi (idrofobe) all’interno, gruppi fosfato (idrofili) all’esterno La repulsione tra i gruppi fosfato è controbilanciata tra i legami H tra le basi e l’interazione di Staking (impilamento tra basi, legami H deboli tra anelli aromatici)
Cos’è il twist?
È l’angolo tra due nucleotidi in rapporto all’asse dell’elica
Cos’è il roll?
È l’inclinazione formata in base alle forze di repulsione tra le due coppie di nucleotidi rispetto all’asse di appagamento AT o GC
Cos’è il tilt?
È l’angolo che si forma per repulsione, rispetto alla posizione dello scheletro zucchero-fosfato
Forma tautomerica della citosina
(foto)
Quali sono le caratteristiche della forma A?
Elica destrorsa; “tarchiata”, con solco maggiore stretto e profondo e solco minore molto lungo e poco profondo. Difficilmente assunta da DNA a doppia elica, assunta in vivo da RNA o filamenti DNA + RNA
Quali sono le caratteristiche della forma B del DNA?
Forma canonica; destrorsa, molto compatta, no spazi vuoti. Lunga e sottile
Quali sono le caratteristiche della forma Z?
Elica sinistrorsa; “magra ed allungata”; si forma in vitro, tipica delle regioni ricche in G:C; legame guanina-deossiribosio SIN, mentre nella forma B è in ANTI
Quali sono le tipologie di sequenze?
- Ripetuta in modo diretto (tandem) - Ripetuta in modo speculare - Palindromica
Com’è fatta la tripla elica?
C’è un terzo filamento di pirimidine con polarità invertita rispetto alla sequenza pirimidinica canonica; si inserisce nel solco maggiore, il filamento purinici forma legami H con le pirimidine canoniche e appaiamenti di Hoogsteen con le non canoniche
Cosa sono i quartetti di G?
4 sequenze di G disposte in parallelo, due con orientamento 5’ -> 3’ in una direzione e 2 nella direzione opposta. Le 4 G si affacciano all’esterno della struttura, legami H tra loro, appaiamenti di Hoogsteen, struttura presente nei telomeri eucariotici
Com’è fatta la struttura cruciforme?
(foto) Tipica delle sequenze invertite e palindromiche. DNA a doppio filamento.
Qual è la struttura della timina?
Qual è la struttura della citosina?
Qual è la struttura dell’uracile?
Qual è la struttura dell’adenina
Qual è la struttura della guanina?
Qaul è la struttura del deossiribosio?
Qual è la struttura del ribosio?
Quali sono le forme tautomeriche della guanina?
Quali sono le forme tautomeriche della citosina?
