Cromosomi e cromatina Flashcards
(31 cards)
Cosa sono i cromosomi?
Strutture superiori nelle quali è organizzato il materiale genetico di qualsiasi organismo
Quali sono le caratteristiche del genoma di E.coli?
1 solo cromosoma circolare, 4x10^6 pb, si trova a livello del nucleoide
Quali sono le caratteristiche del genoma umano?
Corredo diploide, 23 coppie di cromosomi (6 x 10^9) pb)
Cosa è il quoziente di compattamento?
Il rapporto tra la lunghezza del DNA e le dimensioni dl compartimento nel quale è contenuto
Struttura elicoidale dei genomi virali
Tipici dei virus filamentosi (es. TMV, virus a mosaico del tabacco). A livello di strutture a forcina dell’RNA che fungono da forca di replicazione si ha l’assemblaggio di unita di RNA identiche, vengono sintetizzate le subunita
proteiche che si dispongono a formare l’elica attraverso un avvolgimento elicoidale alla faccia interna del nucleo
Genoma struttura cava virus
Tipica dei virus icosaedrici come fago T4 o fago lambda. Si forma un piccolo involucro proteico che si converte a testa vuota, attraverso un processo di traslocazione viene introdotto il DNA, che viene poi tagliato in corrispondenza dei siti e una volta ottenuti i genomi lineari completi si verifica un processo di condensazione interno dei capsidi
La rigidita del DNA a doppia elica rende complessi i processi di traslocazione e condensazione per cui e
necessaria l’ATP
Dove sono ancorati i genomi batterici?
Nel nucleosoma (superficie interna membrana)
Come e` fatto il cromosoma batterico?
Unico cromosoma circolare con centinaia di anse, ognuna delle quali costituisce un dominio indipendente e mantiene un grado di superavvolgimento diverso per impedire la propagazione di eventi di rotazione della molecola
Cosa e` la cromatina?
Complesso di DNA, proteine istoniche e non istoniche
Cosa e` l’eucromatina?
Struttura poco condensata della cromatina e difficilmente visibile
Cosa e` l’eterocromatina?
Struttura altamente condensata e piu` distinguibile della cromatina, si divide in costitutiva e facoltativa
Eterocromatina facoltativa
Regioni con capacita` codificante esplicata solo in alcune condizioni (es. corpo di Barr)
Eterocromatina costitutiva
Sempre compatta, regioni di genoma non codificanti, funzione strutturale
Cosa sono i cromosomi a spazzola?
Coppie bivalenti meiotiche, costituite da cromosomi omologhi e tenuti insieme nei chiasmi. Hanno un asse centrale dal quale sporgono le anse, con materiale cromosomico estruso estruso in un’organizzazione piu compatta
Cosa sono i cromosomi politenici?
Si originano quando le replicazioni cromosomiche non sono seguite da segregazioni: i cromatidi fratelli originati rimangono affiancati per formare fasci di fibre
Perche le estremita
delle molecole lineari sono estremamente stabili nel tempo?
- degradazione da parte delle esonucleasi
- impossibilita` di replicare i primi nucleotidi per mancanza di un innesco
- i siti di controllo riconoscono le rotture ed attivano apoptosi
- le estremita` dei cromosomi rotte sono appiccicose e propense a legare altre molecole di DNA
Quai strutture risolvono il problema dell’instabilita delle estremita
di molecole lineari?
I telomeri
Attraverso quali meccanismi i telomeri conferiscono stabilita` ai cromosomi?
- sintesi di nuove unita` ripetitive
- proteine TRF1 e TRF2 che riconoscono e legano la sequenza telomerica, proteggendo DNA cromosomico
- struttura t-loop delle estremita`
- quartetto di G
Cosa è il nucleosoma?
È l’unità base della cromatina, costituita da un tratto di DNA ed un ottamero istonico
Da cosa è costituito l’ottamero istonico?
1 tetramero con 2 H2A + 2 H2B e un tetramero con 2 H3 e 2 H4
Struttura lisina
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Struttura arginina
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Come è strutturato il nucleosoma?
Il core è costituito dall’ottamero istonico (forma cilindrica), attorno al quale la doppia elica di DNA compie quasi due giri
H3 e H4 centrali, H2A e H2B sopra e sotto
H1 che interagisce con DNA linker (maggiore adesione DNA)
le code n-terminali degli istoni, non impiegate nell’ottamero, sporgono all’interno
Come varia la struttura del DNA al crescere dell’impacchettamento?
fibra 10 nm = collana di perle
fibra 30 nm = solenoide
ansa cromatinica 100-400 nm
cromosomi