Cromosomi e cromatina Flashcards

(31 cards)

1
Q

Cosa sono i cromosomi?

A

Strutture superiori nelle quali è organizzato il materiale genetico di qualsiasi organismo

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Q

Quali sono le caratteristiche del genoma di E.coli?

A

1 solo cromosoma circolare, 4x10^6 pb, si trova a livello del nucleoide

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3
Q

Quali sono le caratteristiche del genoma umano?

A

Corredo diploide, 23 coppie di cromosomi (6 x 10^9) pb)

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4
Q

Cosa è il quoziente di compattamento?

A

Il rapporto tra la lunghezza del DNA e le dimensioni dl compartimento nel quale è contenuto

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5
Q

Struttura elicoidale dei genomi virali

A

Tipici dei virus filamentosi (es. TMV, virus a mosaico del tabacco). A livello di strutture a forcina dell’RNA che fungono da forca di replicazione si ha l’assemblaggio di unita di RNA identiche, vengono sintetizzate le subunita proteiche che si dispongono a formare l’elica attraverso un avvolgimento elicoidale alla faccia interna del nucleo

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6
Q

Genoma struttura cava virus

A

Tipica dei virus icosaedrici come fago T4 o fago lambda. Si forma un piccolo involucro proteico che si converte a testa vuota, attraverso un processo di traslocazione viene introdotto il DNA, che viene poi tagliato in corrispondenza dei siti e una volta ottenuti i genomi lineari completi si verifica un processo di condensazione interno dei capsidi
La rigidita del DNA a doppia elica rende complessi i processi di traslocazione e condensazione per cui e necessaria l’ATP

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7
Q

Dove sono ancorati i genomi batterici?

A

Nel nucleosoma (superficie interna membrana)

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8
Q

Come e` fatto il cromosoma batterico?

A

Unico cromosoma circolare con centinaia di anse, ognuna delle quali costituisce un dominio indipendente e mantiene un grado di superavvolgimento diverso per impedire la propagazione di eventi di rotazione della molecola

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9
Q

Cosa e` la cromatina?

A

Complesso di DNA, proteine istoniche e non istoniche

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10
Q

Cosa e` l’eucromatina?

A

Struttura poco condensata della cromatina e difficilmente visibile

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11
Q

Cosa e` l’eterocromatina?

A

Struttura altamente condensata e piu` distinguibile della cromatina, si divide in costitutiva e facoltativa

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12
Q

Eterocromatina facoltativa

A

Regioni con capacita` codificante esplicata solo in alcune condizioni (es. corpo di Barr)

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13
Q

Eterocromatina costitutiva

A

Sempre compatta, regioni di genoma non codificanti, funzione strutturale

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14
Q

Cosa sono i cromosomi a spazzola?

A

Coppie bivalenti meiotiche, costituite da cromosomi omologhi e tenuti insieme nei chiasmi. Hanno un asse centrale dal quale sporgono le anse, con materiale cromosomico estruso estruso in un’organizzazione piu compatta

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15
Q

Cosa sono i cromosomi politenici?

A

Si originano quando le replicazioni cromosomiche non sono seguite da segregazioni: i cromatidi fratelli originati rimangono affiancati per formare fasci di fibre

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16
Q

Perche le estremita delle molecole lineari sono estremamente stabili nel tempo?

A
  • degradazione da parte delle esonucleasi
  • impossibilita` di replicare i primi nucleotidi per mancanza di un innesco
  • i siti di controllo riconoscono le rotture ed attivano apoptosi
  • le estremita` dei cromosomi rotte sono appiccicose e propense a legare altre molecole di DNA
17
Q

Quai strutture risolvono il problema dell’instabilita delle estremita di molecole lineari?

18
Q

Attraverso quali meccanismi i telomeri conferiscono stabilita` ai cromosomi?

A
  • sintesi di nuove unita` ripetitive
  • proteine TRF1 e TRF2 che riconoscono e legano la sequenza telomerica, proteggendo DNA cromosomico
  • struttura t-loop delle estremita`
  • quartetto di G
19
Q

Cosa è il nucleosoma?

A

È l’unità base della cromatina, costituita da un tratto di DNA ed un ottamero istonico

20
Q

Da cosa è costituito l’ottamero istonico?

A

1 tetramero con 2 H2A + 2 H2B e un tetramero con 2 H3 e 2 H4

21
Q

Struttura lisina

22
Q

Struttura arginina

23
Q

Come è strutturato il nucleosoma?

A

Il core è costituito dall’ottamero istonico (forma cilindrica), attorno al quale la doppia elica di DNA compie quasi due giri
H3 e H4 centrali, H2A e H2B sopra e sotto
H1 che interagisce con DNA linker (maggiore adesione DNA)
le code n-terminali degli istoni, non impiegate nell’ottamero, sporgono all’interno

24
Q

Come varia la struttura del DNA al crescere dell’impacchettamento?

A

fibra 10 nm = collana di perle
fibra 30 nm = solenoide
ansa cromatinica 100-400 nm
cromosomi

25
Cosa è lo scaffold nucleare?
Struttura proteica, costituita da topo 2 e proteine smc, che permette la compattazione delle anse cromatiche
26
Come può essere il posizionamento in fase dei nucleosomi?
intrinseco (regioni DNA curvo) estrinseco (impedimento in un determinato punto) traslazione (contatto ottamero dna sulla stessa faccia) rotazionale
27
Quali sono le possibili modificazioni post-traduzionali?
Acetilazione, metilazione, fosforilazione, ubiquitinazione, sumoilazione, ADP-ribosilazione
28
Cosa è l'HAT?
La famiglia delle acetiltransferasi
29
Cosa determinano le modificazioni post tradizionali degli istoni?
perdita basicità degli aa
30
Cosa sono i cromodomini?
Moduli proteici che riconoscono le lys metilate
31
Cosa sono i bromodomini?
Moduli proteici che riconoscono lys acetilate