Cromosomi e cromatina

Question 1

Cosa sono i cromosomi?

Answer 1

Strutture superiori nelle quali è organizzato il materiale genetico di qualsiasi organismo

Question 2

Quali sono le caratteristiche del genoma di E.coli?

Answer 2

1 solo cromosoma circolare, 4x10^6 pb, si trova a livello del nucleoide

Question 3

Quali sono le caratteristiche del genoma umano?

Answer 3

Corredo diploide, 23 coppie di cromosomi (6 x 10^9) pb)

Question 4

Cosa è il quoziente di compattamento?

Answer 4

Il rapporto tra la lunghezza del DNA e le dimensioni dl compartimento nel quale è contenuto

Question 5

Struttura elicoidale dei genomi virali

Answer 5

Tipici dei virus filamentosi (es. TMV, virus a mosaico del tabacco). A livello di strutture a forcina dell’RNA che fungono da forca di replicazione si ha l’assemblaggio di unita di RNA identiche, vengono sintetizzate le subunita proteiche che si dispongono a formare l’elica attraverso un avvolgimento elicoidale alla faccia interna del nucleo

Question 6

Genoma struttura cava virus

Answer 6

Tipica dei virus icosaedrici come fago T4 o fago lambda. Si forma un piccolo involucro proteico che si converte a testa vuota, attraverso un processo di traslocazione viene introdotto il DNA, che viene poi tagliato in corrispondenza dei siti e una volta ottenuti i genomi lineari completi si verifica un processo di condensazione interno dei capsidi
La rigidita del DNA a doppia elica rende complessi i processi di traslocazione e condensazione per cui e necessaria l’ATP

Question 7

Dove sono ancorati i genomi batterici?

Answer 7

Nel nucleosoma (superficie interna membrana)

Question 8

Come e` fatto il cromosoma batterico?

Answer 8

Unico cromosoma circolare con centinaia di anse, ognuna delle quali costituisce un dominio indipendente e mantiene un grado di superavvolgimento diverso per impedire la propagazione di eventi di rotazione della molecola

Question 9

Cosa e` la cromatina?

Answer 9

Complesso di DNA, proteine istoniche e non istoniche

Question 10

Cosa e` l’eucromatina?

Answer 10

Struttura poco condensata della cromatina e difficilmente visibile

Question 11

Cosa e` l’eterocromatina?

Answer 11

Struttura altamente condensata e piu` distinguibile della cromatina, si divide in costitutiva e facoltativa

Question 12

Eterocromatina facoltativa

Answer 12

Regioni con capacita` codificante esplicata solo in alcune condizioni (es. corpo di Barr)

Question 13

Eterocromatina costitutiva

Answer 13

Sempre compatta, regioni di genoma non codificanti, funzione strutturale

Question 14

Cosa sono i cromosomi a spazzola?

Answer 14

Coppie bivalenti meiotiche, costituite da cromosomi omologhi e tenuti insieme nei chiasmi. Hanno un asse centrale dal quale sporgono le anse, con materiale cromosomico estruso estruso in un’organizzazione piu compatta

Question 15

Cosa sono i cromosomi politenici?

Answer 15

Si originano quando le replicazioni cromosomiche non sono seguite da segregazioni: i cromatidi fratelli originati rimangono affiancati per formare fasci di fibre

Question 16

Perche le estremita delle molecole lineari sono estremamente stabili nel tempo?

Answer 16

• degradazione da parte delle esonucleasi
• impossibilita` di replicare i primi nucleotidi per mancanza di un innesco
• i siti di controllo riconoscono le rotture ed attivano apoptosi
• le estremita` dei cromosomi rotte sono appiccicose e propense a legare altre molecole di DNA

Question 17

Quai strutture risolvono il problema dell’instabilita delle estremita di molecole lineari?

Answer 17

I telomeri

Question 18

Attraverso quali meccanismi i telomeri conferiscono stabilita` ai cromosomi?

Answer 18

• sintesi di nuove unita` ripetitive
• proteine TRF1 e TRF2 che riconoscono e legano la sequenza telomerica, proteggendo DNA cromosomico
• struttura t-loop delle estremita`
• quartetto di G

Question 19

Cosa è il nucleosoma?

Answer 19

È l’unità base della cromatina, costituita da un tratto di DNA ed un ottamero istonico

Question 20

Da cosa è costituito l’ottamero istonico?

Answer 20

1 tetramero con 2 H2A + 2 H2B e un tetramero con 2 H3 e 2 H4

Question 21

Struttura lisina

Answer 21

Foto

Question 22

Struttura arginina

Answer 22

Foto

Question 23

Come è strutturato il nucleosoma?

Answer 23

Il core è costituito dall’ottamero istonico (forma cilindrica), attorno al quale la doppia elica di DNA compie quasi due giri
H3 e H4 centrali, H2A e H2B sopra e sotto
H1 che interagisce con DNA linker (maggiore adesione DNA)
le code n-terminali degli istoni, non impiegate nell’ottamero, sporgono all’interno

Question 24

Come varia la struttura del DNA al crescere dell’impacchettamento?

Answer 24

fibra 10 nm = collana di perle
fibra 30 nm = solenoide
ansa cromatinica 100-400 nm
cromosomi

Question 25

Cosa è lo scaffold nucleare?

Answer 25

Struttura proteica, costituita da topo 2 e proteine smc, che permette la compattazione delle anse cromatiche

Question 26

Come può essere il posizionamento in fase dei nucleosomi?

Answer 26

intrinseco (regioni DNA curvo)
estrinseco (impedimento in un determinato punto)
traslazione (contatto ottamero dna sulla stessa faccia)
rotazionale

Question 27

Quali sono le possibili modificazioni post-traduzionali?

Answer 27

Acetilazione, metilazione, fosforilazione, ubiquitinazione, sumoilazione, ADP-ribosilazione

Question 28

Cosa è l’HAT?

Answer 28

La famiglia delle acetiltransferasi

Question 29

Cosa determinano le modificazioni post tradizionali degli istoni?

Answer 29

perdita basicità degli aa

Question 30

Cosa sono i cromodomini?

Answer 30

Moduli proteici che riconoscono le lys metilate

Question 31

Cosa sono i bromodomini?

Answer 31

Moduli proteici che riconoscono lys acetilate