3.1 Flashcards
(26 cards)
DNA-polymeraasientsyymi
on entsyymi, joka vastaa DNA-juosteiden kopioinnista kaikissa soluissa. Liittää nukleotidit oikeassa järjestyksessä vanhan juosteen pariksi. Käytetään myös geenitekniikassa (PCR:ssä).
Aluke
on PCR:ssä DNA:n kahdentamisen aloitukseen tarvittava lyhyt yksijuosteinen, keinotekoisesti valmistettu DNA-molekyyli.
Aluke
on PCR:ssä DNA:n kahdentamisen aloitukseen tarvittava lyhyt yksijuosteinen, keinotekoisesti valmistettu DNA-molekyyli.
Agaroosigeeli
on huokoinen kiinteä aine, jonka huokoset ovat täynnä nestettä. Rakenteesta johtuen suuremmat liikkuvat kappaleet kohtaavat suurempaa kitkaa kuin pienemmät kappaleet.
miten monistetaan DNA:ta
Tutkijoiden tarvitsemaa DNA:ta voidaan monistaa nopeasti polymeraasiketjureaktion. Monistamisen jälkeen on alkuperäisen näytteen kanssa identtistä DNA:ta riittävästi tutkimuskäyttöön.
Monistaminen aloitetaan käyttämällä synteettisiä alukkeita, yksijuosteisia DNA-molekyylejä, jotka kiinnittyvät sekvenssin ohjaamana emäspariperiaatteen mukaisesti haluttuun kohtaan DNA:n juostetta.
Lisäksi tarvitaan vapaita DNA-nukleotideja, joista voidaan rakentaa uutta juostetta.
PCR:n toiminta perustuu tarkasti säädeltyihin lämpötilasykleihin, jolloin DNA-näyte ja reaktioissa tarvittavat komponentit reagoivat halutulla tavalla. (denaturointi)
Entsyymi rakentaa mallin mukaan alukkeiden merkitsemästä sekvenssistä uuden juosteen mallin vierelle.
Sekvensointi tarkoittaa
tarkoittaa DNA:n emäsjärjestyksen selvittämistä. Uusimmilla menetelmillä ihmisen perimän sekvensointi voidaan tehdä alle vuorokaudessa.
millä eri tavoin voidaan soveltaa PCR
Esimerkiksi isyystutkimus, oikeuslääketiede ja perinnöllisten sairauksien tutkimus ovat hyötyneet mahdollisuudesta monistaa DNA:ta tehokkaasti ja edullisesti. J
suuri vaikeus PCR:ssä
suurin heikkous on DNA-polymeraasin suhteellisen korkea virhemäärä, kun se kopioi DNA:ta.
Reaaliaikainen PCR
Reaaliaikainen PCR eroaa tavallisesta PCR:stä vain tulosten analysoinnissa. Reaaliaikaisessa PCR:ssä käytetään yksijuosteisesta DNA:sta koostuvia koettimia, jotka ovat fluoresoivalla aineella leimattuja.
1.aluke ja koetin kiinnityvät kopijoitavaan DNA:han
2.DNA-polmeraasi kiinnittyy alukkeeseen ja alkaa valmistaa uuttaa DNA-juostetta
3.Kun DNA-polymeraasi osuu koettimeen, koetin irtoaa ja hajoaa, jolloin siinä oleva väriaine aktivoituu.
Sekvensointimenetelmät
eli DNA:n emäsjärjestyksen selvittämiseen käytetyt menetelmät ovat kehittyneet nopeasti.
DNA-sirun avulla etsitään näytteestä tiettyjä geenejä
DNA- eli biosirut ovat pienikokoisia lasi- tai muovilevyjä, joiden pinnalle on sijoitettu erillisiin kammioihin jopa tuhansia koettimia.
Yksinkertaisimmillaan sirun avulla tutkitaan, sisältääkö DNA-näyte tietyn geenin tai alleelin vai ei.
Elektroforeesi
Elektroforeesi perustuu siihen, että negatiivisesti varautuneet DNA-molekyylit kulkeutuvat näytekaivoon pipetoidusta liuoksesta sähkökentässä kohti positiivista napaa.
koetin
Ebola on vakava virusperäinen tartuntatauti, joka aiheuttaa korkeaa kuumetta, verenvuotoja ja muita vakavia oireita. Tauti leviää tartunnan saaneiden eritteiden ja veren kautta. Ennaltaehkäisyssä keskeistä on kontaktien välttäminen sairaiden kanssa ja hyvä hygienia. Ei ole täyttä parannuskeinoa, mutta rokotteita ja tukitoimia, kuten nesteytystä, käytetään oireiden lievittämiseen.
cDNA
cDNA (complementary DNA) on DNA:n kopio, joka syntetisoidaan RNA:sta (ribonukleiinihappo). Tämä kopio tehdään käyttäen RNA-molekyylejä vastaavia emäsjärjestystä vastakohtaisia emäksiä, jolloin saadaan kaksoisjuosteinen DNA-molekyyli. cDNA:ta käytetään usein geenien ilmentymisen tutkimuksessa ja manipuloinnissa sekä bioteknologiassa.
biosiru
Biosiru on pieni siru, joka sisältää kiinnitettyinä DNA- tai RNA-molekyylejä. Sitä käytetään geenien ilmentymisen ja proteiinien tutkimuksessa. Sirulla olevat molekyylit auttavat tunnistamaan ja mittaamaan geneettisiä ominaisuuksia, kuten geenien aktiivisuutta ja proteiinien vuorovaikutuksia.
geeniaktiviteetti
Geeniaktiviteetti biologiassa viittaa siihen, kuinka voimakkaasti ja milloin tietty geeni tuottaa ja ilmentää proteiinia tai muuta toiminnallista tuotetta. Se kuvaa geeniin liittyvien prosessien aktiivisuutta ja säätelyä soluissa tai kudoksissa. Geeniaktiivisuus voi vaihdella eri olosuhteissa ja ympäristötekijöiden vaikutuksesta. Tutkimalla geeniaktiviteettia voidaan ymmärtää, miten geenit säätelevät eliöiden toimintaa ja vaikuttavat ominaisuuksiin, kuten kehitykseen, terveyteen ja sairauksiin.
rinnakkaissekvensointi
- sekvensoitavan genomin kopioita
- genomi pilkotaan useiksi lyhyiksi jaksoiksi, jotka sekvenssoidaan erikseen
3.päällekkäisten sekvenssien avulla jaksot järjestetään oikeaan järjestykseen.
4.lopullinen sekvenssi
Vektori
on geeniteknikassa käytettävä geeninkuljetin, esimerkiksi plasmidi tai jokin muokattu virus.
Plasmidi
on pieni rengasmainen DNA-molekyyli, joka kahdentuu itsenäisesti. Se sisältää yleensä muutamia geenejä. Plasmideja on bakteereilla, arkeoneilla ja hiivoilla. Biotekniikassa plasmideja hyödynnetään geeninsiirroissa.
Yhdistelmä-DNA:ssa
on liitettynä yhteen kahden tai useamman eri lajin DNA-jaksoja
Vastin-DNA eli cDNA
(komplementaarinen DNA) on RNA-molekyylin emäsjärjestyksen perusteella rakennettu DNA-molekyyli.
Plasmidi
on pieni rengasmainen DNA-molekyyli, joka kahdentuu itsenäisesti. Se sisältää yleensä muutamia geenejä. Plasmideja on bakteereilla, arkeoneilla ja hiivoilla. Biotekniikassa plasmideja hyödynnetään geeninsiirroissa.
Eksoni
on geenin jakso, joka sisältää informaatiota. Siinä on ohje proteiinin aminohappojärjestyksen yhtä jaksoa varten. Tumallisten geeneissä on yleensä peräkkäin useita eksoneita, ja niiden välissä introneita.
Geenikirjastoissa säilytetään eliöiden geenejä
Genomikirjastot ja eksomikirjastot
Haluttu DNA-juoste etsitään kirjastosta koettimen avulla.
