d Flashcards

(50 cards)

1
Q

Katkaisuentsyymit

A

tunnistavat DNA-molekyylistä tietyn sekvenssin, jonka kohdalta ne katkaisevat molekyylin. Liittäjäentsyymien avulla liitetään toisiinsa eri alkuperää olevia DNA-molekyylejä (kuvassa sininen ja punainen DNA).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

CRISPR-menetelmä

A

CRISPR-tekniikassa käytetään Cas-entsyymiä, johon liitetään keinitekoisesti valmistettu opas-RNA. Tämä tunnistaa DNA:sta halutun kohdan, tunnistussekvenssin. Tunnistuksen jälkeen Cas-entsyymi katkaisee DNA:n. Solu korjaa itse katkoksen, ja sen seurauksena kyseisen kohdan geeni voi vaurioitua. Katkaisukohtaan voi liittyä myös kokonaan uutta, soluun tuotua DNA:ta

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

vastin-dna valmistaminen

A

käänteiskopoijoientsyymi valmistaa lähetti rna:lle vastin dna:juosteen

lähetti rna-hajoitetaan

dna-juosteen pariksi rakennetaan toinen dna-juoste

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

entsyymi

A

käyttö

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

proteaasit

A

DNA:n sisältämien proteiinien hajotus DNA:ta puhdistettaessa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

RNA-polymeraasit

A

Rakentavat RNA-molekyyliä RNA-nukleotideista

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

DNA-polymeraasit

A

Rakentavat DNA-molekyyliä DNA-nukleotideista

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Katkaisu- eli restriktioentsyymit

A

Katkaisevat DNA-molekyylin jokaiselle entsyymille tyypillisestä kohdasta

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Liittäjä- eli ligaasientsyymit

A

Liittävät DNA-molekyylien päät toisiinsa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Cas-entsyymi

A

Katkaisee DNA-molekyylin opas-RNA:n ohjaamana

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Käänteiskopioijaentsyym

A

kopioivat RNA:n emäsjärjestyksen vastin-DNA:ksi, cDNA:ksi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

vertaile seuraavia käsitepareja. Mainitse sekä yhdistäviä että erottavia tekijöitä.

DNA – cDNA
Katkaisuentsyymi – Cas-entsyymi
Katkaisuentsyymi – liittäjäentsyymi

A
  1. DNA – cDNA

DNA:n ja cDNA:n eli komplementaarisen DNA:n molekyylirakenne on täysin sama. Molemmat koostuvat kaksoisjuosteesta, joissa esiintyvät samat neljä emästä sekä muut molekyylirakenteen osat.

Komplementaarista DNA:ta valmistetaan silloin kun tarvitaan geenejä, jotka eivät sisällä introneita. cDNA:ta valmistetaan lähetti-RNA:sta käänteiskopioija-entsyymin avulla, jolloin se ei enää sisällä alkuperäisen geenin introneita.

  1. Katkaisuentsyymi – Cas-entsyymi

Katkaisuentsyymi on solun käyttämä entsyymi, joka on erikoistunut katkaisemaan DNA-juosteen tietystä kohtaa sekvenssiä. Entsyymi toimii aina samalla tavalla, eikä sitä voi käytännössä muokata millään tavalla eri tarkoituksia varten. Erilaisia katkaisuentsyymejä käytetään DNA:n muokkaamiseen eri tilanteissa geenitekniikan työkaluna.

Cas9-entsyymin toimintaa voi muokata. Katkaisuentsyymiä ohjataan ns. opas-RNA:n avulla, ja tätä opas-RNA:ta voidaan laboratorio-olosuhteissa muokata halutulla tavalla. Katkaisukohta voidaan määritellä jopa yhden emäksen tarkkuudella.

  1. Katkaisuentsyymi – liittäjäentsyymi

Yhteistä näille entsyymeille on mm. se, että molemmat ovat bakteereissa ja arkeoneissa luontaisesti esiintyviä entsyymejä. Niille on myös ominaista se, että ne ovat erikoistuneet toimimaan muutaman nukleotidin mittaisten katkaisukohtien kohdalla. Tähän entsyymien ryhmään kuuluvat katkaisuentsyymit katkaisevat DNA-juosteen siten, että juosteen katkaisukohtaan jää yksijuosteinen sekvenssi, joka pyrkii pariutumaan emäspariperiaatteen mukaisesti peilikuvasekvenssin kanssa. Liittäjäentsyymit ovat erikoistuneet tällaisen “liimakohdan” viimeistelyyn.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Laita seuraavat käsitteet järkevään järjestykseen ja rakenna käsitteiden ympärille lauseita, joilla selität CRISPR:n toimintaperiaatteen.

Opas-RNA
Cas-entsyymi
Viruksen genomi
Bakteerien immuunipuolustus
Viruksen genomin katkaisu
Opas-RNA:n muokkaaminen

A

Bakteerien immuunipuolustus bakteerien omia viruksia, bakteriofageja, vastaan perustuu CRISPR-Cas9-menetelmään. Aikaisemmista virusinfektioista johtuen bakteerin perimässä on pätkiä viruksen genomista, ja näistä perimän osista valmistetaan transkriptiossa niin kutsuttu opas-RNA. Tämä opas-RNA liitetään Cas-entsyymiin, joka on katkaisuentsyymi. Opas-RNA ohjaa katkaisuentsyymin viruksen perimän tiettyyn kohtaan, ja viruksen DNA-molekyyli katkaistaan. Näin viruksesta tulee toimintakyvytön. Opas-RNA:ta voidaan myös muokata laboratoriossa halutun kaltaiseksi, jolloin sitä voidaan käyttää tarkkaan määritellyn DNA-molekyylin kohdan löytämiseen ja katkaisuun.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Eläinjalostus

A

Käyttää geeninsiirtoja eliöiden ominaisuuksien muokkaamiseen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Siirtogeeninen eliö

A

Useita uusia, toimivia geenejä, jotka ovat peräisin toiselta lajilta

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Poistogeeninen eliö

A

Sisältää jopa useita geenejä, jotka eivät enää ole toimintakykyisiä

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Insuliini

A

Voidaan tuottaa bakteerisolujen avulla lääkeaineeksi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Siirrettävä geeni

A

Voi olla alkuperäisen kaltainen tai muokattu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

geenipyssy

A

Geenipolymorfismi tai geenivariantti on geenin eri versio tai muunnelma, joka esiintyy populaatiossa. Se voi aiheuttaa vaihtelua ominaisuuksissa,

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

koetin

A

Koetin on laite tai mittausväline, jota käytetään tietyn ilmiön, olosuhteen tai suureen arvon mittaamiseen, havainnointiin tai testaamiseen tarkoituksenmukaisesti.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Kasvin kloonaus

A

Otetaan esim. verson tai lehden osia, ja kasvatetaan näistä uusia kasviyksilöitä.

22
Q

Eläimen kloonaus

A

Kloonattavan eläimen solu (tai sen tuma) siirretään tumattomaan munasoluun, ja tästä kasvatetaan alkio ja edelleen uusi yksilö.

23
Q

Alkion kloonaus

A

Eläinalkio voidaan varhaisvaiheessa jakaa useaksi soluksi, joista jokaisesta voi kasvaa identtinen yksilö.

24
Q

Tumallisen solun kloonaus

A

Solu jakautuu mitoottisesti ja tuottaa identtisen solujoukon.

25
geenin kloonaus
Bakteereihin siirretään toisen eliön geenejä esim. plasmidivektoreilla, ja tietyn geenin saanutta bakteeria kasvatetaan suuria määriä
26
Katkaisu­- eli restriktioentsyymejä
käytetään DNA‐juosteen katkaisemiseen tietyn sekvenssin kohdalta. Liittäjä- eli ligaasientsyymejä käytetään DNA­-juosteiden vapaiden päiden liittämiseksi yhteen. Molempia käytetään yhdistelmä‐DNA‐tekniikoissa.
27
Geelielektroforeesissa
erotellaan DNA‐paloja niiden molelyylikoon perusteella, agaroosigeelissä sähkövirran avulla. Koska DNA:ssa on negatiivisesti varautuneita fosfaattiryhmiä, DNA‐palat kulkevat elektroforeesissa kohti plusnapaa. Pienemmät DNA‐palat kulkeutuvat geelissä nopeammin kuin isommat palat.
28
DNA:n emäsjärjestyksen eli sekvenssin määrittäminen/sekvenssointi
voidaan tehdä DNA‐palasista erilaisilla menetelmillä, yleisimmin kuitenkin sekvensointilaitteella.
29
plasmidivektori
Geenejä voidaan siirtää bakteereihin plasmidivektorien avulla. Bakteerit ottavat luontaisesti tietyissä elinkaaren vaiheissa sisäänsä plasmideja, jotka kahdentuvat itsenäisesti bakteerien jakautuessa. Näin geenejä voidaan myös monistaa nopeasti
30
polymeraasiketjureaktio (PCR-reaktio)
DNA:ta voidaan monistaa polymeraasiketjureaktion (PCR) avulla. Siinä vuoroin korkeaa ja matalaa lämpötilaa käyttämällä saadaan DNA:n kaksoiskierre avautumaan, jolloin kuumien lähteiden bakteereista eristetty DNA‐polymeraasientsyymi rakentaa alkuperäisen emäsjärjestyksen perusteella uuden käänteisen DNA‐kopion. Kun lämpösykliä toistetaan useita kertoja, kasvaa uuden DNA:n määrä eksponentiaalisesti.
31
fluoresoiva DNA-koetin
fluoresoiva DNA‐koetin, joka sisältää etsittävän, mutatoituneen geenin DNA‐jakson, tarttuu emäspariperiaatteen mukaan DNA‐näytteen vastaavaan sekvenssiin. Näin voidaan etsiä mitä tahansa geenejä DNA-juosteesta.
32
Valintajalostus
Seulotaan ominaisuuksiltaan parhaimmat yksilöt jatkamaan suku
33
Risteytysjalostus
Hedelmöitetään kaksi erilaista perunayksilöä toisillaan, jolloin jälkeläisille saadaan kummankin vanhemman hyviä ominaisuuksia.
34
Heteroosi
Perimässä olevien geenien erilaiset alleelit lisäävät yksilöiden elinvoimaa.
35
Solukkoviljely
Kasvatetaan runsaasti uusia keskenään samanlaisia yksilöitä hormoni- ja ravinneliuoksessa.
36
Jalostusarvostelu
Kertoo, kuinka kannattavaa eläinyksilöä on käyttää seuraavien sukupolvien siittämiseen.
37
Keinohedelmöitys
Erilaisia keinoja, joilla voidaan auttaa hedelmöityksen tapahtumista. Jalostuksen kannalta tärkeää on, että sukusolujen luovuttajien ei tarvitse olla samassa paikassa.
38
1.Listaa kolme syytä, miksi kasveja ja eläimiä halutaan jalostaa. 2. Mainitse, mitä haittoja jalostuksesta on ihmiselle ja jalostettavalle lajille.
1. Jalostus kohdistuu myös tuotettavan materiaalin laatuun, jolloin voidaan tuottaa ravinteikkaampaa ravintoa tai kestävämpiä materiaaleja. Jalostus kohdistuu myös eliöiden kauneusseikkoihin, mikä ei ole ihmisen elämän kannalta välttämätöntä. 2.hajottaja ihmisille ja lajille. Jalostus on yleensä pitkälle vietyä suuntaavaa valintaa, mikä liian pitkälle vietynä voi aiheuttaa terveyshaittoja.
39
Symbioosi
Kaksi eliölajia elää pysyvässä fysiologisessa suhteessa, esim. toinen laji toisen sisällä; kyseessä voi olla mutualistinen tai loissuhde
40
Kemosynteesi
Reaktio, jossa hapetus-pelkistysreaktioista saatavan energian avulla rakennetaan glukoosia hiilidioksidista ja vedystä
41
Kromosomi ja plasmidi
Rengasmaisia DNA-molekyylejä, joissa bakteerin geenit sijaitsevat
42
Bakteriofagi
Virus, joka infektoi bakteereja
43
Syanobakteeri
Fotosynteesiin kykeneviä bakteereita
44
Antibiootti
Lääkeaineita, joilla hoidetaan bakteerien aiheuttamia infektiotauteja
45
rekombinaatio
horisontaalinen geeninsiirto
46
konjugaatio
molekyylit sitoutuvat toisiinsa muodostaen uuden yhdisteen.
47
bakteerin transformaatio
prosessi, jossa bakteerit ottavat ympäristöstään ulkoista DNA-materiaalia. Tämä voi tapahtua, kun ympäristöön vapautuu fragmenttejä toisten bakteerien hajonneista soluista.
48
bakteerin transduktio
ilmiö, jossa bakteerille siirtyy geneettistä materiaalia bakteriofagin eli bakteerille tyypillisen viruksen välityksellä. Tämä tapahtuu, kun virus tarttuu bakteeriin, replikoi itsensä ja viruksen rakenteelliset osat sisältävät vahingossa bakteerin omia DNA- tai RNA-fragmentteja.
49
. jos tulee kuva
Kuvasarja esittää bakteerin lisääntymistä kahtia jakautumalla. Kyseinen lisääntymistapa on suvuton ja sen seurauksena syntyy klooni eli samanlaisten bakteerien joukko. Ennen jakautumista bakteerin kromosomin ja plasmidin on kahdennuttava (kopiot molemmista).
50
Miksi bakteereissa tapahtuvat mutaatiot tulevat niin helposti näkyviin?
aploidian ja yksisoluisuuden takia mutaatioiden vaikutus tulee bakteereilla helpommin näkyviin kuin tumallisilla monisoluisilla eliöillä.