d Flashcards
(50 cards)
Katkaisuentsyymit
tunnistavat DNA-molekyylistä tietyn sekvenssin, jonka kohdalta ne katkaisevat molekyylin. Liittäjäentsyymien avulla liitetään toisiinsa eri alkuperää olevia DNA-molekyylejä (kuvassa sininen ja punainen DNA).
CRISPR-menetelmä
CRISPR-tekniikassa käytetään Cas-entsyymiä, johon liitetään keinitekoisesti valmistettu opas-RNA. Tämä tunnistaa DNA:sta halutun kohdan, tunnistussekvenssin. Tunnistuksen jälkeen Cas-entsyymi katkaisee DNA:n. Solu korjaa itse katkoksen, ja sen seurauksena kyseisen kohdan geeni voi vaurioitua. Katkaisukohtaan voi liittyä myös kokonaan uutta, soluun tuotua DNA:ta
vastin-dna valmistaminen
käänteiskopoijoientsyymi valmistaa lähetti rna:lle vastin dna:juosteen
lähetti rna-hajoitetaan
dna-juosteen pariksi rakennetaan toinen dna-juoste
entsyymi
käyttö
proteaasit
DNA:n sisältämien proteiinien hajotus DNA:ta puhdistettaessa
RNA-polymeraasit
Rakentavat RNA-molekyyliä RNA-nukleotideista
DNA-polymeraasit
Rakentavat DNA-molekyyliä DNA-nukleotideista
Katkaisu- eli restriktioentsyymit
Katkaisevat DNA-molekyylin jokaiselle entsyymille tyypillisestä kohdasta
Liittäjä- eli ligaasientsyymit
Liittävät DNA-molekyylien päät toisiinsa
Cas-entsyymi
Katkaisee DNA-molekyylin opas-RNA:n ohjaamana
Käänteiskopioijaentsyym
kopioivat RNA:n emäsjärjestyksen vastin-DNA:ksi, cDNA:ksi
vertaile seuraavia käsitepareja. Mainitse sekä yhdistäviä että erottavia tekijöitä.
DNA – cDNA
Katkaisuentsyymi – Cas-entsyymi
Katkaisuentsyymi – liittäjäentsyymi
- DNA – cDNA
DNA:n ja cDNA:n eli komplementaarisen DNA:n molekyylirakenne on täysin sama. Molemmat koostuvat kaksoisjuosteesta, joissa esiintyvät samat neljä emästä sekä muut molekyylirakenteen osat.
Komplementaarista DNA:ta valmistetaan silloin kun tarvitaan geenejä, jotka eivät sisällä introneita. cDNA:ta valmistetaan lähetti-RNA:sta käänteiskopioija-entsyymin avulla, jolloin se ei enää sisällä alkuperäisen geenin introneita.
- Katkaisuentsyymi – Cas-entsyymi
Katkaisuentsyymi on solun käyttämä entsyymi, joka on erikoistunut katkaisemaan DNA-juosteen tietystä kohtaa sekvenssiä. Entsyymi toimii aina samalla tavalla, eikä sitä voi käytännössä muokata millään tavalla eri tarkoituksia varten. Erilaisia katkaisuentsyymejä käytetään DNA:n muokkaamiseen eri tilanteissa geenitekniikan työkaluna.
Cas9-entsyymin toimintaa voi muokata. Katkaisuentsyymiä ohjataan ns. opas-RNA:n avulla, ja tätä opas-RNA:ta voidaan laboratorio-olosuhteissa muokata halutulla tavalla. Katkaisukohta voidaan määritellä jopa yhden emäksen tarkkuudella.
- Katkaisuentsyymi – liittäjäentsyymi
Yhteistä näille entsyymeille on mm. se, että molemmat ovat bakteereissa ja arkeoneissa luontaisesti esiintyviä entsyymejä. Niille on myös ominaista se, että ne ovat erikoistuneet toimimaan muutaman nukleotidin mittaisten katkaisukohtien kohdalla. Tähän entsyymien ryhmään kuuluvat katkaisuentsyymit katkaisevat DNA-juosteen siten, että juosteen katkaisukohtaan jää yksijuosteinen sekvenssi, joka pyrkii pariutumaan emäspariperiaatteen mukaisesti peilikuvasekvenssin kanssa. Liittäjäentsyymit ovat erikoistuneet tällaisen “liimakohdan” viimeistelyyn.
Laita seuraavat käsitteet järkevään järjestykseen ja rakenna käsitteiden ympärille lauseita, joilla selität CRISPR:n toimintaperiaatteen.
Opas-RNA
Cas-entsyymi
Viruksen genomi
Bakteerien immuunipuolustus
Viruksen genomin katkaisu
Opas-RNA:n muokkaaminen
Bakteerien immuunipuolustus bakteerien omia viruksia, bakteriofageja, vastaan perustuu CRISPR-Cas9-menetelmään. Aikaisemmista virusinfektioista johtuen bakteerin perimässä on pätkiä viruksen genomista, ja näistä perimän osista valmistetaan transkriptiossa niin kutsuttu opas-RNA. Tämä opas-RNA liitetään Cas-entsyymiin, joka on katkaisuentsyymi. Opas-RNA ohjaa katkaisuentsyymin viruksen perimän tiettyyn kohtaan, ja viruksen DNA-molekyyli katkaistaan. Näin viruksesta tulee toimintakyvytön. Opas-RNA:ta voidaan myös muokata laboratoriossa halutun kaltaiseksi, jolloin sitä voidaan käyttää tarkkaan määritellyn DNA-molekyylin kohdan löytämiseen ja katkaisuun.
Eläinjalostus
Käyttää geeninsiirtoja eliöiden ominaisuuksien muokkaamiseen
Siirtogeeninen eliö
Useita uusia, toimivia geenejä, jotka ovat peräisin toiselta lajilta
Poistogeeninen eliö
Sisältää jopa useita geenejä, jotka eivät enää ole toimintakykyisiä
Insuliini
Voidaan tuottaa bakteerisolujen avulla lääkeaineeksi
Siirrettävä geeni
Voi olla alkuperäisen kaltainen tai muokattu
geenipyssy
Geenipolymorfismi tai geenivariantti on geenin eri versio tai muunnelma, joka esiintyy populaatiossa. Se voi aiheuttaa vaihtelua ominaisuuksissa,
koetin
Koetin on laite tai mittausväline, jota käytetään tietyn ilmiön, olosuhteen tai suureen arvon mittaamiseen, havainnointiin tai testaamiseen tarkoituksenmukaisesti.
Kasvin kloonaus
Otetaan esim. verson tai lehden osia, ja kasvatetaan näistä uusia kasviyksilöitä.
Eläimen kloonaus
Kloonattavan eläimen solu (tai sen tuma) siirretään tumattomaan munasoluun, ja tästä kasvatetaan alkio ja edelleen uusi yksilö.
Alkion kloonaus
Eläinalkio voidaan varhaisvaiheessa jakaa useaksi soluksi, joista jokaisesta voi kasvaa identtinen yksilö.
Tumallisen solun kloonaus
Solu jakautuu mitoottisesti ja tuottaa identtisen solujoukon.