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BIOMOL.T1.TRANSCRIPCIÓN Y PROCESAMIENTO DEL RNA Flashcards

1
Q

El acoplamiento de transcripción y traducción permite una regulación fina

A

FALSO
Ambos procesos están acoplados en procariotas.
En eucariotas el desacoplamiento debido a la separación espacial (núcleo-citoplasma) permite la maduración del mRNA lo que permite un mayor control

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Q

El desacoplamiento de transcripción y traducción permite una regulación fina

A

VERADERO

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3
Q

El tRNA transfiere aminoácidos de forma inespecífica para el proceso de traducción

A

FALSO
Lo hace de forma específica

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4
Q

En los ribosomas, el rRNA realiza el papel catalítico mientras que las proteínas realizan la función estructural

A

FALSO
El rRNA también tiene un papel estructural

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5
Q

El rRNA es una parte estructural y catalítica de los ribosomas

A

VERDADERO

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6
Q

El RNA es un intermedio estable de vida media corta que se sintetiza a partir de un molde de DNA para traducirse posteriormente a proteína

A

FALSO
Todos los RNAs se sintetizan a partir de un molde del DNA, pero el mRNA es el único que se traduce a proteína
Además, la vida media del mRNA es, en efecto, corta, lo que significa que es inestable.

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7
Q

La RNA polimerasa lee la cadena molde en dirección 3’ a 5’

A

VERDADERO

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8
Q

La RNA polimerasa cataliza la formación de enlaces fosfodiéster 5’ a 3’ dando lugar a una cadena de RNA complementaria a la cadena codificante

A

FALSO
Da lugar a una cadena de RNA complementaria a la cadena molde

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9
Q

En la RNA polimerasa procariota, las subunidades alfa y beta tienen una afinidad genérica por el DNA, pero es la subunidad sigma la que asegura la especificidad reconociendo al promotor

A

VERDADERO

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10
Q

En la RNA polimerasa eucariota, las subunidades alfa y beta tienen una afinidad genérica por el DNA, pero es la subunidad sigma la que asegura la especificidad reconociendo al promotor

A

FALSO
Es la RNA polimerasa procariota

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11
Q

En la RNA polimerasa procariota, la subunidad beta interacciona con el DNA mientras que la beta prima lo hace con los rNTPs

A

FALSO
La subunidad beta prima interacciona con el DNA mientras que la beta lo hace con los rNTPs

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12
Q

Además de mRNA, la RNA polimerasa II cataliza la síntesis de otros RNAs como el rRNA

A

FALSO
RNA polimerasa I: en el nucleol, cataliza la síntesis de rRNAs
RNA polimerasa II: cataliza la síntesis de mRNAs, miRNA, siRNA i algunos snRNAs
RNA polimerasa III: cataliza la síntesis de tRNAs, otros rRNAs i snRNAs

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13
Q

Las RNA polimerasas eucariotas están formadas por 12 subunidades, de las cuales 5 son no homólogas a ninguna subunidad procariota pero comunes entre las tres polimerasas eucariotas

A

VERDADERO

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14
Q

La RNA polimerasa es una enzima dependiente de DNA que no necesita primer (cebador), pues sintetiza la cadena de RNA de novo

A

VERDADERO

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15
Q

Una vez la primasa ha sintetizado un cebador de RNA, la RNA polimerasa II completa la transcripción del mRNA de forma absolutamente procesiva

A

FALSO
La RNA polimerasa no necesita primer, inicia la transcripción completamente de novo

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16
Q

El OH del extremo 3’ de la cadena de RNA naciente ataca el PO4 α (interno) del rNTP entrante, formando el enlace fosfodiéster y liberando un pirofosfat o

A

VERDADERO

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17
Q

Cuanto más fuerte es un promotor más se parece a la secuencia consenso, por lo que la subunidad sigma tiene más afinidad por la secuencia y se ancla más fuerte, ralentizando la transcripción

A

FALSO
Una mayor afinidad de la subunidad sigma por el promotor estabiliza la unión, lo que permite que de tiempo a que se ensamble toda la maquinaria y por tanto la tasa de transcripción sea mayor

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18
Q

Mutaciones en las secuencias consenso de los promotores pueden suponer una alteración e incluso una supresión de la transcripción génica

A

VERDADERO

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19
Q

La asimetría de la secuencia promotora (no palindrómica) establece cuál es la cadena molde y la dirección de transcripción

A

VERDADERO

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20
Q

DNase protection hace referencia a la capacidad de la RNA polimerasa de proteger los promotores de la actividad de nucleasas gracias a su elevada afinidad por estas secuencias

A

VERDADERO

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21
Q

Una vez la subunidad sigma ha reclutado al resto de subunidades de la RNA polimerasa se desprende para que pueda empezar la síntesis del RNA

A

FALSO
El RNA se empieza a sintetizar (se añaden unos 10-12 nucleótidos) antes de que se desprenda la subunidad sigma

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22
Q

La RNA polimerasa avanza añadiendo 50 rNTPs/s a la vez que va desenrollando y rebobinando el DNA

A

VERDADERO

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23
Q

En la terminación independiente de rho el factor de elongación NusA interacciona con la polimerasa y el hairpin para promover la terminación

A

VERDADERO

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24
Q

En la terminación independiente de rho se forma un hairpin por interacción entre Gs y Cs que favorece la disociación del mRNA respecto del DNA y la RNA polimerasa II

A

FALSO
La terminación independiente de rho tiene lugar en procariotas, en los que hay una única RNA polimerasa, la RNA polimerasa II es eucariota

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25
Q

En la terminación dependiente de rho, la secuencia de terminación consiste en repeticiones invertidas de GCs seguidas de Us

A

FALSO
Es la secuencia señal de la terminación INdependiente de rho

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26
Q

La proteína homohexamérica rho, gracias a su actividad helicasa, rompe el híbrido DNA-RNA sobre una secuencia rica en Cs llamada “rut”

A

FALSO
Rho reconoce la secuencia rut, por la que se une al tránscrito, y luego avanza hasta dar con la secuencia de terminación, que es dónde introduce el corte.

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27
Q

Gracias a su alta afinidad por rut, la proteína rho ejerce su actividad helicasa sin consumo de energía

A

FALSO
La actividad de rho es ATP-dependiente

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28
Q

Los poliribosomas son estructuras que permiten traducir varios tránscritos de mRNA de forma simultánea

A

FALSO
Se trata de varios ribosomas que se unen secuencialmente a un mismo tránscrito, traduciendo varias proteínas a partir de un solo mRNA

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29
Q

Aunque el grado de empaquetamiento debido a histonas es el mismo para el material genético procariota y eucariota, este último se encuentra más inaccesible a la maquinaria de transcripción debido a su localización en el núcleo

A

FALSO
La compactación del DNA eucariota es bastante superior a la procariota debido a que el cromosoma bacteriano, aunque presenta proteínas de anclaje, no está unido a histonas

30
Q

Las histonas, clave para la regulación transcripcional y su modulación, constituyen la base molecular de la epigenética

A

VERDADERO

31
Q

La CAAT box y la Pribnow box se corresponden con las secuencias consenso de los promotores procariotas

A

FALSO
CAAT es una secuencia eucariota.
Los promotores procariotas cuentan con:
La Región -35 (TTGACA)
La Pribnow box, a -10 (TATAAT)

32
Q

Situado, -25 del inicio de transcripción, TATA box es uno de los core promoters eucariotas más frecuentes

A

VERDADERO

33
Q

Compartimentos GC y/o CAAT box son necesarios, además de la Hogness box, para que haya una tasa basal de transcripción de genes eucariotas

A

VERDADERO

34
Q

Además de repressors e insulators, encontramos enhancers como CAAT box entre las secuencias reguladoras distales

A

FALSO
CAAT es unna secuencia proximal

35
Q

Los GTFs requeridos por la RNA polimerasa II funcionan de forma colectiva como lo hace la subunidad sigma procariota

A

VERDADERO

36
Q

La unión de TBP a la TATA box genera una distorsión física en el DNA que sirve como señal para reclutar factores adicionales como TFIIA

A

FALSO
Recluta factores adicionales como TAF; TFIIA es un GTF que estabiliza las uniones de TBO y TAF con el DNA

37
Q

TFIIH es una proteína multifuncional que cataliza el desenrollamiento de la doble cadena de DNA y fosforila la cola carboxi-terminal de la RNA polimerasa II

A

FALSO
TFIIH es un complejo multiproteico, no una proteína multifuncional

38
Q

La subunidad quinasa de TFIIH fosforila el extremo 3’ del tránscrito de mRNA, lo que es esencial para la transición a la elongación

A

FALSO
Fosforila la cola carboxi-terminal de la RNA polimerasa II

39
Q

Durante la formación del complejo de pre-iniciación, el GTFs TFIIF recluta la helicasa TFIIH para dar comienzo a la transcripción

A

FALSO
TFIIF rectulta la RNA polimerasa II
TFIIH es reclutado por TFIIE

40
Q

Gracias a la intervención de todos los GTFs de forma secuencial y ordenada en la formación del PIC (Complejo de Pre-Iniciación) se consigue optimizar la tasa de transcripción

A

FALSO
Los GTFs son necesarios para una taasa basal de transcripción, pero realmente in vivo el inicio de la transcripción es mucho más complejo, incluyendo FTs distales (enhancers…)

41
Q

TFIID facilita la unión de TFIIA y TFIIB que contribuyen a estabilizar el PIC (complejo de pre-iniciación) y a facilitar el reclutamiento de la RNA polimerasa II vía TFIIF

A

VERDADERO

42
Q

El patrón dinámico de metilación de los residuos de Ser y Pro del dominio carboxi-terminal de la RNA polimerasa II permite regular el proceso de transcripción

A

FALSO
Los residuos de Ser y Pro se fosforilan, no se metilan

43
Q

Las fosforilaciones del CTD (dominio carboxi-terminal) de la RNA polimerasa II permiten liberar algunos GTFs. Estos en ocasiones permanecen en el promotor para iniciar una nueva transcipición

A

VERDADERO

44
Q

La cola CTD (carboxi-terminal domain) fosforilada recluta factores que permiten desacoplar la transcripción del pre-mRNA de su maduración

A

FALSO
La cola CTD fosforilada recluta factores para el procesamiento y maduración del RNA que tendrán lugar de forma íntimamente acoplada en espacio y tiempo a la transcripción

45
Q

Una vez fuera del nucleoide, el mRNA maduro se identifica en el citoplasma por su 5’-cap, una larga cola poliA y la ausencia de secuencias no codificantes (itrones)

A

FALSO
El mRNA solo es procesado y madurado en eucariotas, el nucleoide es un “orgánulo no membranoso” procariota

46
Q

El procesamiento del mRNA tiene lugar de manera en parte co- y en parte post-transcripcional

A

VERDADERO

47
Q

La función del 5’-cap es proteger el mRNA de la degradación por parte de endonucleasas 5’, muy abundantes en el citoplasma

A

FALSO
Protege del ataque de exonucleasas 5’

48
Q

Además de una función de protección frente a la degradación por exonucleasas, el 5’cap añadido co-transcripcionalmente juega un papel importante en el inicio de la traducción

A

VERDADERO

49
Q

Una fosfatasa, una guanil transferasa y una metil transferasa catalizan la adición del 7-metil-GTP al mRNA mediante la formación de un enlace 3’ a 5’

A

FALSO
Se incorpora mediante un enlace 5’ a 5’

50
Q

Durante la adición del 5’-cap, también se metilan los -OH en posición 2’ de los 2 primeros nucleótidos

A

VERDADERO

51
Q

Una vez se llega a las secuencias AAUAAA y una región rica en Us o GUs el pre-mRNA es escindido del DNA. Tras esto se añade la cola poliA de forma post-transcripcional

A

VERDADERO

52
Q

Cuando la RNA polimerasa sintetixa las secuencias de escisión, los complejos CstF y CPSF se unen a la cadena molde para catalizar la escisión del tránscrito

A

FALSO
Ambos factores se unen al propio tránscrito

53
Q

La unión de CstF y CPSF a las secuencias de escisión del tránscrito promueve el reclutamiento de factores adicionales así como la escisión del pre-mRNA respecto del complejo de transcripción

A

VERDADERO

54
Q

Una vez escindido el pre-mRNA, la polimerasa continúa transcribiendo hasta llegar a un codón de stop, que induce la disociación de dicha polimerasa

A

FALSO
La RNA polimerasa continúa transcribiendo, pero como el RNA no cuenta con 5’-cap su degradación contribuye a la disociación de la polimerasa

55
Q

PAP (Poli-A Polimerasa añade la cola de poliA a partir de ATP sin necesidad de primer o de cadena molde

A

VERDADERO

56
Q

La totalidad de los genes eucariotas incluyen secuencias no codificantes eliminadas durante el splicing: los intrones

A

FALSO
Hay genes que no presentan intrones, como los de las histonas

57
Q

A diferencia de los exones, los intrones son secuencias muy largas y heterogéneas que no codifican para ninguna proteína

A

VERDADERO

58
Q

La aparición de isoformas proteicas ha sido posible gracias al splicing alternativo, que consiste en eliminar diferentes intrones de un mismo gen para dar lugar a distintos tránscritos

A

FALSO
Los intrones siempre son eliminados, lo que varía es si se procesan o no todos los exones

59
Q

El ataque nucleófilo del 2-OH de la A del sitio de ramificación al fosfato del punto de corte 3’ supone la formación del lariat intermedio

A

FALSO
El 2-OH de la A del sitio de ramificación ataca al fosfato del punto de corte 5’

60
Q

Tras dos ataques nucleofílicos consecutivos de OHs a fosfatos el intrón forma un lariat y los exones que lo flanqueaban quedan unidos

A

VERDADERO

61
Q

Los microRNAs con actividad ribozimática del spliceosoma están asociados a proteínas, formando snRNPs (snurps) en el núcleo del complejo.

A

FALSO
Las snRNPs estñan constituidas por 7-10 proteínas y 1 de los 5 snRNAs (NO microRNAs) que forman parte del complejo

62
Q

Las snRNPs reconocen los splicing sites gracias a la complementariedad entre estos y el snRNA

A

VERDADERO

63
Q

U1 snRNP reconoce el punto de corte 5’, mientras que U2AF y BBP reconocen el punto de corte 3’

A

FALSO
U”AF y BBP reconocen el sitio de ramificación

64
Q

En el complejo de snRNPs U4/U6-U5, U4 se escinde de U6 debido a interacciones con el centro activo del spliceosoma

A

VERDADERO

65
Q

El splicing tiene lugar in vivo gracias a que la actividad ribozimática de los snRNAs es independiente de ATP

A

Falso, los reordenamientos RNA-RNA requieren del consumo de ATP

66
Q

La homogeneidad de los intrones es esencial durante el ensamblaje de la maquinaria de splicing, pues esta permite la unión de hnRNPs cerca de los puntos de corte

A

FALSO
Los intrones son secuencias heterogéneas (hnRNP stands for heterogeneous nuclear riboproteins)

67
Q

La unión de proteínas SR a secuencias específicas que promueven la maduración (Exonic Splicing Enhancers, ESE) ayudan a reclutar a snRNP U1 y U2AF

A

VERDADERO

68
Q

La A del sitio de ramificación de los intrones actuales deriva por mutación de la G de los primeros intrones que sustituyeron su actividad autocatalítica por la maquinaria del spliceosoma

A

FALSO
Los intrones que son eliminados mediante spliceosoma evolucionaron a partir de intrones auto-catalíticos que presentaban A y formaban un lariat.
Es cierto que existen intrones autocatalíticos con G en el sitio de ramificación que no forman un lariat, pero no son un “antepasado” de nuestros intrones

69
Q

El mRNA maduro se caracteriza por su patrón de proteínas asociadas, algunas de las cuales (los receptores de de transporte/exportación nuclear) interaccionan con los complejos de poro nuclear (NPCs), permitiendo la salida del mRNA al citoplasma

A

VERDADERO

70
Q

¡Tú puedes!

A

VERDADERO

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