BIOMOL.T4. PLEGAMIENTO, MODIFICACIONES, TRANSPORTE Y DEGRADACIÓN DE PROTEÍNAS

Question 1

El plegamiento, las modificaciones post-traduccionales, la unión a co-factores y el ensamblaje con otras subunidades proteicas vienen dictados por la propia secuencia de aminoácidos de la cadena polipeptídica

Answer 1

VERDADERO
Las características (polaridad, carga…) de los aminoácidos fomentan que interaccionen entre sí o con otras moléculas de la forma concreta en que lo hacen.

Question 2

La proteína se va plegando, formando puentes de hidrógeno y otras interacciones intracatenarias de manera co-traduccional, que conducen directamente a la conformación definitiva incluso antes de que la proteína sea liberada del ribosoma .

Answer 2

FALSO
Es cierto que la proteína se va plegando a medida que es sintetizada. Pero no adopta su plegamiento completo hasta que es liberada del ribosoma.
Además, a menudo no se forma directamente el plegamiento completo, si no que las chaperonas median la formación de una estructura intermediaria: el “glòbul fos”, que presenta un plegamiento parcial.

Question 3

A pesar de ser un proceso energéticamente favorable, (porque conduce a un estado de menor energía libre) el plegamiento de las proteínas requiere de la ayuda de chaperonas para dar con la conformación óptima y funcional

Answer 3

VERDADERO

Question 4

Las proteínas mal plegadas no suponen un problema más allá de no ser funcionales, pero se degradan para poder reutilizar sus aminoácidos

Answer 4

FALSO
Las proteínas mal plegadas no solo no son funcionales, si no que además suponen un peligro debido a su toxicidad (pueden formar agregados e interferir en la función celular) por eso son tan importantes los mecanismos de reparación y degradación

Question 5

Las chaperonas Hsp60 se unen co-traduccionalmente a las proteínas, junto a co-chaperonas, para favorecer su plegamiento dependiente de ATP

Answer 5

FALSO
Son las chaperonas Hsp70

Question 6

Las Hsp70 intentan volver a plegar proteínas que hayan plegado incorrectamente, priorizando la reparación a la degradación, que es siempre el último recurso

Answer 6

VERDADERO

Question 7

Las chaperoninas o chaperonas Hsp60 crean una cámara con las condiciones favorables para el correcto plegamiento co-traduccional de proteínas que están siendo sintetizadas

Answer 7

FALSO
Las chaperonas Hsp70 actúan de forma co-traduccional, pero las Hsp 60 actúan sobre proteínas ya sintetizadas pero no completamente plegadas o plegadas de forma errónea, es decir, actúan de forma post-traduccional.

Question 8

Las chaperoninas o chaperonas Hsp60 consumen ATP para fomentar el correcto plegamiento de proteínas mal plegadas o parcialmente plegadas evitando así la formación de agregados proteicos

Answer 8

VERDADERO

Question 9

Las chaperonas juegan un papel central en los procesos de plegamiento, corrección de errores conformacionales y degradación de las proteínas

Answer 9

VERDADERO

Question 10

Los amiloides o agregados insolubles de proteínas mal plegadas que al acumularse causan enfermedades neurodegenerativas se forman por interacción entre hélices alfa

Answer 10

FALSO
Se forman por entrecruzamientos beta, es decir, interacciones entre láminas beta

Question 11

Una vez sintetizadas, las proteínas pueden ser fragmentadas por proteólisis o modificadas mediante la adición covalente de grupos químicos a las cadenas laterales de los aminoácidos

Answer 11

VERDADERO

Question 12

Las modificaciones post-traduccionales consisten en la adición de grupos químicos estrictamente inorgánicos (como fosfatos o hidroxilos) a las cadenas laterales de los aminoácidos

Answer 12

FALSO
Si bien pueden añadirse muchos grupos inorgánicos, hay muchas modificaciones post-traduccionales que suponen la adición de moléculas orgánicas: glicosilación, SUMOilación, lipidación…

Question 13

El conjunto de modificaciones post-traduccionales constituye todo un código simplemente modulando la función de las proteínas actuando como activadores o represores de su centro activo.

Answer 13

FALSO
Las modificaciones post-traduccionales no solo varían el grado de actividad de las proteínas por activación o represión. Pueden modular sus niveles de actividad alterando su localización subcelular, su estabilidad o su capacidad de interacción con otras proteínas.

Question 14

Proteínas con funciones muy importantes (p.ej. el factor de transcripción p53) presentan muchos puntos susceptibles de ser modificados post-traduccionalmente, de manera que sus modificaciones se combinan, permitiendo una regulación muy fina.

Answer 14

VERDADERO

Question 15

Las proteínas tienen un destino predeterminado por una secuencia específica de reconocimiento para la maquinaria encargada de dirigirla a su localización

Answer 15

VERDADERO

Question 16

Las principales rutas de transporte de proteínas se dan entre el citoplasma y los orgánulos; entre el citoplasma y la cara citosólica de la membrana; y el transporte vesicular por vía del retículo endoplasmático - trans-Glogi-Network - vesículas)

Answer 16

VERDADERO

Question 17

La importación-exportación nuclear atravesando los complejos llamados importinas está regulado por las GTPasas llamadas Ran

Answer 17

FALSO
Las importinas no son los poros, si no los receptores que se unen a las secuencias de señal de importación nuclear (NLS) de las proteínas, y las guían en su transporte a través de los complejos de poro nuclear (NPCs).

Question 18

El gradiente de Ran-GTP / Ran-GDP que mantiene la direccionalidad del transporte nuclear se consigue gracias a la acción de las Ran-GAP del nucleoplasma (GTPase Activating Protein) y las Ran-GEF citoplasmáticas (Guanosine-nucleotide Exchangge Factor)

Answer 18

FALSO
Las Ran-GAP son citoplasmáticas, pues inducen la hidrólisis del Ran-GTP al salir al citoplasma. Esto impide que aumente la [Ran-GTP] en el citoplasma y permite que continúe saliendo del núcleo.
La Ran-GEF se encuentra en el núcleo, y se encarga de mantener elevados los niveles nucleares de Ran-GTP al intercambiar el GDP de las Ran-GDP que regresan al núcleo por GTP.

Question 19

Una vez en el núcleo, los receptores de importación unidos a la proteína con una NLS (Nuclear Localization Signal) interaccionan con Ran-GTP, liberando la proteína transportada al hacerlo.

Answer 19

VERDADERO

Question 20

En el núcleo, los receptores de exportación unidos a la proteína con una NES (Nuclear Export Signal) interaccionan con Ran-GTP, liberando la proteína transportada al hacerlo.

Answer 20

FALSO
Ran-GTP siempre media el transporte de los receptores desde el nucleoplasma al citoplasma. Si el receptor es de exportación, al salir del núcleo debe llevar consigo a la proteína que transporta. Por tanto, la interacción Receptor de exportación - Ran-GTP induce la unión de la proteína con NES al receptor

Question 21

El transporte de las proteínas con una señal de localización mitocondrial es co-traduccional, pues se mantienen desplegadas como proteínas precusoras mitocondriales durante el proceso, y solo adoptan su conformación como proteínas mitocondriales maduras una vez se encuentran en la matriz mitocondrial

Answer 21

FALSO
El plegamiento de la proteína y su síntesis (traducción) son procesos distintos. Es cierto que no adoptan la conformación final hasta que llegan a destino, pero se transportan de forma post-traduccional, pues ya han sido completamente sintetizadas previo al transporte.

Question 22

La secuencia señal de todas las proteínas precusoras mitocondriales es reconocida primero por TOM (Translocator of the Outer Membrane) y posteriormente por TIM (Translocator of the Inner Membrane)

Answer 22

FALSO
TIM solo interviene en el transporte si son proteínas destinadas a la matriz mitocondrial. Si quedan unidas a una de las membranas o en el espacio intermembrana solo interviene TOM.

Question 23

El transporte de proteínas al retículo endoplasmático se produce de forma co-traduccional, pues el complejo SRP (Signal Recognition Particle) estanca la traducción hasta que la unión del polipéptido al translocador de membrana induce la disociación de SRP y su receptor respecto del ribosoma y el polipéptido

Answer 23

VERDADERO

Question 24

De forma genérica, las proteínas que son transportadas al retículo endoplasmático tienen este orgánulo como destino final

Answer 24

FALSO
El retículo endoplasmático es un orgánulo implicado en la biosíntesis y el posterior transporte de proteínas por la vía de transporte vesicular (fusión de vesículas del RE al cis-Golgi y finalmente distribución de estas desde el trans-Golgi)

Question 25

Las proteínas con señales de transporte al retículo endoplasmático generalmente son proteínas de endomembranas, de membrana plasmática, o de secreción (tanto regulada como constitutiva)

Answer 25

VERDADERO
Pues del RE parten, vía transporte vesicular, hasta el Trans Golgi Network, que las dirige a su destino final

Question 26

Durante su transporte desde el cis hasta el trans-Golgi las proteínas sufren modificaciones post-traduccionales dirigidas por secuencia que, una vez en el trans-Golgi, sirven como señales de localización que permiten el sorting/distribución correcto

Answer 26

VERDADERO

Question 27

Entre las modificaciones post-traduccionales que se pueden producir en el aparato de Golgi se incluyen modificaciones de GTPasas para su localización en la membrana plasmática.

Answer 27

VERDADERO

Question 28

En el proteasoma, la actividad desplegasa y los centros catalítcos se encuentran en cuatro anillos heptaméricos que constituyen un cilindro

Answer 28

FALSO
El proeasoma presenta 4 anillos heptaméricos con las actividades cataíticas y, además, 2 estructuras hexaméricas que reconocen e insertan los sustratos en el cilindro gracias a su actividad desplegasa

Question 29

Las proteínas anómalas que deben ser degradadas proteolíticamente se marcan de manera específica por multi-ubiquitinizaciones para que el proteasoma las reconozca.

Answer 29

FALSO
Las proteínas para degradación se marcan por poli-ubiquitinización (múltiples ubiquitinas unidas a 1 misma lisina)
La mono-ubiquitinizaciones o multi-ubiquitinizaciones (1 sola ubiquitinización de varios residuos de Lys) son señales con otras finalidades.

Question 30

En el proceso de poli-ubiquitinización, E1 y E2 interaccionan con la ubiquitina, por lo que hay pocos tipos de estas enzimas. En cambio E3 reconoce los sustratos a marcar, y ha de presentar especificidad por diversas señales específicas, y por ello hay muchos tipos distintos.

Answer 30

VERDADERO

Question 31

Algunos fármacos antitumorales como Bortezomib o Carfilzomib porque son activadores proteasomales a los que las células tumorales son particularmente sensibles

Answer 31

FALSO
Son inhibidores proteasomales, y las células tumorales son especialmente sensibles a la inhibición del protasoma, lo que supone que acumulen proteínas mal plegadas, cosa que induce en ellas la apoptosis por UPR (Unfolded Protein Response)

Question 32

La principal diferencia entre los sistemas Calpaína y Caspasa con respecto al proteasoma es que estos inducen proteólisis (cortes en puntos específicos), y no la degradación proteica (destrucción completa de la proteína como hace el proteasoma

Answer 32

VERDADERO

Question 33

La calpaína es una cisteína-proteasa citosólica que participa induciendo procesos como la proliferación y la muerte celular ante disminuciones del Ca2+ intracelular

Answer 33

FALSO
La calpaína se activa ante un aumento del Ca2+ intracelular

Question 34

Las caspasas iniciadoras tienen actividad proteolítica tanto sobre si mismas como sobre otras caspasas.

Answer 34

VERDADERO
Se activan por auto-proteólisis y una vez activas pueden proteolizar las caspasas ejecutoras de la apoptosis

Question 35

La alta especificidad de las hidrolasas ácidas lisosomales permite una degradación altamente selectiva de moléculas captadas por endocitosis o bien procedentes de procesos de autofagia

Answer 35

FALSO
Los lisosomas son centros catabólicos que realizan una digestión celular general e inespecífica.

Question 36

Respira y relaja el cuerpo, lo vas a hacer muy bien

Answer 36

VERDADERO