Cours 4, partie 1 : épigénétique Flashcards
Toutes les cells ont exactement la même info génétique, sauf…?
lymphocytes T
Une cell embryo doit se différencier en _________ ou en __________ des gènes. Ceux qui sont inactivés doivent l’être de façon ________.
- activant
- inactivant
- permanente
Qu’est-ce qui permet aux cancers de devenir de + en + agressifs (évolution clonale)?
Mécanismes épigénétiques défectueux permettant d’activer gènes normalement inactifs et inactiver gène normalement actifs (ex. P53).
Nomme les 2 gènes très IMP qu’il faut savoir qui ont une empreinte parentale, et dire quelle est l’empreinte.
- IGF2 : empreinte maternelle (donc mat inactivé)
- H19 : empreinte paternelle (donc pat désactivé)
Les modifs épigénétiques de la chromatine contrôle la __________ et sont caractérisées par 4 principes fondamentaux.
1) chromatine altérée sans modif de __________.
2) doit être __________ à la descendance.
3) ces marques doivent être _________ dans les cells de l’embryon précoce (avant blastocyste : gènes d’empreinte parentale = exception)
4) après le blastocyste, les cells de l’embryon recommencent à ________.
- transcription
- séq d’ADN
- transmise
- effacées
- marquer leur chromatine
Les marques d’épigénétique peuvent se faire en 4 niveaux : lesquels (et dire si l’impact est local ou a lieu sur plsrs gènes).
1) méthylation des cytosines de l’ADN : local
2) altération (désacétylation) des histones : local
3) prots Polycomb (Pc) et Trithorax (TTX) : plsrs gènes
4) structure du nucléosome : plsrs gènes
La méthylation des cytosines de l’ADN a comme effet d’___________ la _________. Ceci se fait par l’enzyme __________ (____). Une fois qu’une cytosine est méthylé, c’est transmis aux _________ de la cell. Ce sont les _______________ (______) qui recrutent le DNMT, méthylant les cytosines qui sont _________. Ceci, à lui seul, peut empêcher la transcription (en empêchant le reconnaissance de gènes), mais les C méthylées vont aussi recruter __________, des (grosses/petites) prots qui empêchent la liaison de __________. Les MeCP recrutent, à leur tour, _________. Ainsi, la méthylation de l’ADN contrôle ____________.
- inhiber
- transcription
- DNA-méthyle-transférase
- DNMT
- descendantes
- facteurs de transcription inhibiteurs
- FT-I
- directement suivies d’une guanine (G)
- MeCP (methyl-cytosine-binding protein)
- grosses
- facteurs de transcription activateurs
- l’enzyme HDAC (histone désacétylase)
- l’acétylation des histones
Explique le fctionnnement de la transmission des méthylations des cytosines.
1) ADN méthylé = dénaturé (en ssDNA)
2) ADN polymérase transforme les ssDNA en dsDNA (ayant un brin neuf non méthylé)
3) le DNMT reconnaît cytosine méthylée et méthyle le brin complémentaire.
Est-ce que le MeCP sert juste à empêcher la reconnaissance de gènes en s’attachant aux Cmet? Explique (quel chromo? effets sur gars et filles)
NON : essentiel pour dév de l’embryon aussi. Situé sur chr X : mutations de MeCP = svt létale pour gars et cause le syndrome de Rett chez fille
Syndrome de Rett…
a) cause
b) chez qui?
c) phénotype
a) mutation MeCP
b) filles (car mutation mortel chez gars)
c)
- dév normal pendant 1 an
- retard mental progressif
- neurodégénérescence progressive
** Rappel
Rôle de H1
Contrôler struct 3D de l’ADN en se liant à l’endroit où l’ADN n’est pas enroulé sur le nucléosome.
Histone hypoacétylée = ? acétylations
Histone hyperacétylée = ? acétylations
- 1 acétylation et moins
- 3 acétylations et plus
Que fait l’acétylation des histones
L’acétylation des histones altère leur structure 2aire et 3aire : plus il y a d’acétylations, plus la configuration ressemble à celle de l’euchromatine.
Les a.a. peuvent être acétylés, méthylés, phosphorylés et/ou ubiquitinés afin de…?
contrôler la façon dont nucléosomes interagissent avec ADN
Est-ce que les modifications des histones qui contrôlent la transcription (ex. acétylation, méthylation, phosphorylation, ribose, ubiquitine, biotine, sumo, etc.) fait comme la méthylation des C et se transmet aux cells filles?
Oui! (mais c’est mal compris)
Rôles de Pc et TTX
Pc : inactive transcription
TTX : active transcription (ttX… il active eXpress!)
Quel est le lien entre les prots Pc et TTX et le code d’histones?
Ces prots sont généralement recrutées par histones spécifiques modifiées (code d’histones), et peuvent aussi modifier le code d’histones.
De quelle façon la structure des nucléosomes joue un rôle dans l’expression des gènes?
Les topoïsomérases peuvent faire glisser ADN pour exposer ou cacher les promoteurs
Comment est-ce que l’ADN des spermatozoïdes échappe à l’effet des topoïsomérases?
Il est enroulé autour de protamines (pas d’histones), donc plus serré. Par contre, cet ADN ne peut être transcrit, donc se défait après fécondation pour s’associer aux histones.
Le lien entre ARN et épigénétique pré-transcriptionnel…
______ peut inhiber transcription, car se lie à la séq __________, où il recrute _________ qui va méthyler les _____ adjacents. Cette modification (est transmise/n’est pas transmise) à toute la descendance, sans présence subséquente de _______.
- dsRNA
- d’ADN complémentaire
- enzyme Met1
- CG
- est transmise
- dsRNA
V/F?
On peut entrer dans le cycle d’inhibition de la transcription mais, quel que soit le point d’entrée, on active tous les autres mécanismes. Il s’agit d’une double-assurance : lorsqu’il est décidé d’inactiver un gène, ce gène est irrémédiablement inactivé.
V!
