Genetikk Flashcards

1
Q

Syndrom

A

Ulike utviklingsavvik med felles årsak

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Sekvens

A

Årsak —> A —> B —> C…
Kan være et ledd i et syndrom

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Robins sekvens

A

Årsak —> utviklingsforstyrrelse i skjelett —> liten hake og plassproblemer i munn —> tunge presses opp i gane —> U-formet ganespalte —> tunge presses ned i svelg —> ØLV-obstruksjon
83% er del av et syndrom - må derfor utredes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Oculocutan albinisme type 1

A

AR mutasjon i tyrosin kinase-gen
1A = nullmutasjon, mer alvorlig enn 1B
Melaninmangel
Påvirker optiske nervefibre - nystagmus, skjeling, redusert syn

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Retinoblastom

A

Mutasjon i begge Rb-gen - «two hits»-hypotese
AR arv med AD presentasjon med redusert penetranse

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Retinitis pigmentosa

A

Locusheterogenitet, «alle arveformer»
Unormal innlagring av pigment på retina

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Prelingual døvhet

A

50% arv, derav 80% AR, derav 50% GJB2-mutasjon

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Otosklerose

A

Postlingual døvhet, ung voksen, progressiv
Polygen/AD med redusert penetrans?
25% sannsynlig at barn får det (empirisk)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Waardenburgs syndrom type 1

A

AD mutasjon i PAX3 (fosterutvikling)
Heterogen presentasjon, locusheterogenitet
Nevrogent hørselstap, pigmentforandringer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Jervell-Lange-Nielsens syndrom

A

AR mutasjon i Na-kanal
Lang QT-tid-syndrom —> syncope, plutselig død
Døvhet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Usher syndrom

A

AR, 3 typer
Prelingualt nevrogent hørselstap
Retinitis pigmentosa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Epigenetikk

A

Metylering —> inaktivering - foster!
Kromatin-remodellering
Micro-RNA binder mRNA

Imprinting: histon-modifisering inaktiverer mors/fars gen
1, 6, 7, 11, 13, 14, 15, 16, 18, 19, 20
Uniparental disomi: begge kromosomer er fra 1 forelder - konsekvenser hvis imprinting-kromosom
Prader-Willi-syndrom: har ikke paternelt kromosom 15 —> moderat utviklingshemming, spesiell atferd, hypotoni og undervekt i nyfødt, overspising senere, kortvokst, —> GH
Angelmann syndrom: mangler maternelt kromosom 15 —> alvorlig utviklingshemming, mangler språk, ataksi, epilepsi
Russel Silvers syndrom: mangler paternelt kromosom 11 —> mangler IGF2 —> kortvokst, skjelettforandringer, trekant-ansikt
Beckwith-Wiedemanns syndrom: mangler maternelt kromosom 11 —> mye IGF2 —> overvekst m.m.

Tumorceller gir gjerne hypermetylering —> økt onkogen aktivitet (benign —> malign)
Histon deacetylase-hemmer motvirker hypoacetylering av histoner —> mindre tumorsuppressor-aktivering

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Ehler Danlos’ syndrom

A

Klassisk type:
Forstyrret kollagen type 5
Locus heterogenitet
Hypermobil, brede arr, overstrekkbar hud

Vaskulær type:
Forstyrret kollagen type 3
Stram ansiktshud, spiss nese, dyptsittende/utstående øyne, redusert levetid

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

(Isolert) supravalvulær aortastenose

A

Mutasjon i elastin-gen (ELN)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Williams syndrom

A

AD
Mikrodelesjon bl.a. med elastin-gen (ELN)
Psykisk utviklingshemming, karakteristisk atferd, karakteristiske ansiktstrekk, hyperkalsemi

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Marfans syndrom

A

AD med redusert penetrans
Variabel ekspressivitet - kvalitativt og kvantitativt, pleiotropi
FBN1-mutasjon —> fibrillin-dysfunksjon (et elastisk fiber)
Fibrillin 1 er et «lager» for TGF-b, mutasjon —> økt frigjøring —> økt vekst av rørknokler + skjelettforandringer
Lang og tynn, høy gane, lange fingre, linseluksasjon, skjelettmalformasjoner, utvider aortarot

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Pleiotropi

A

Variant/mutasjon i 1 gen påvirker fenotype i flere organer/organsystemer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Allelisk heterogenitet

A

Flere varianter i 1 gensekvens - f.eks kan FBN1-mutasjoner gi 8 ulike sykdommer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Locus heterogenitet

A

Mutasjon i mange ulike gener kan gi 1 sykdom

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Cutis laxa type 1A

A

Locusheterogenitet
Mutasjon i fibulin type 5-gen (FBLN5, et elastisk fiber)
Løs/hengende hud

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Loeys-Dietz’ syndrom

A

Forstyrrelser i TGF-b-signalering
«Mer alvorlig Marfan»
Aortaaneurisme —> disseksjon særlig thorakalt, strukturelle avvik i arterier og skjelett, ganespalte, vevsskjørhet

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Oslers sykdom

A

TGF-b-signalvei forstyrres av genproduktene fra Osler-gener i fosterliv —> endret bindevevsvekst
Hereditær hemorrhagisk telangiektasi
Locusheterogenitet
Aldersavhengig penetranse
AV-malformasjoner

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Polycystisk nyresykdom

A

AD forstyrrelse i TGF-signalvei
Locusheterogenitet - PKD1/2
Må kontrollere store arterier fordi cyste-akkumulering i nyrer og evt. lever —> hypertensjon —> aneurisme

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Cystisk fibrose

A

Monogen sykdom - CFTR (Cl-kanal)
70% har mutasjonen dF508, gir alvorlig sykdom
AR
Noe genotype-fenotype-korrelasjon
Mucus bygges opp utenfor celle fordi Cl- ikke pumpes ut av cellen
GI: slimpropp, kronisk malabsorpsjon
Progredierende lungesykdom - vanligste dødsårsak

Nyfødtscreening —> svettetest —> genetisk test

Persontilpasset medisin: mot genprodukter

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Farmakogenetikk
Farmakokinetikk: variasjon i absorpsjon, distribusjon, metabolisme (enzymer), eliminasjon Farmakodynamikk: variasjon i reseptorer og andre målskiver
26
Arvelig kreft
AD arv med redusert penetrans - «two hits»-hypotese Mutasjon i celledelingsregulering, tumorsuppressor-gener, DNA-reparasjonsgener, proto-onkogen 5-10% av kreft Genetisk testing: avklare årsak og risiko, tidlig diagnostikk og forebygging, forbedret behandling Ved prediktiv testing skal man få genetisk veiledning først, under og etter, må rekvireres av genetisk avdeling Familiær kreft: flere i samme familie med samme type kreft, ikke funnet genfeil som årsak, 15-20% av kreft 70-80% av kreft er sporadisk
27
Arvelig brystkreft
Moderat-høy penetrans, variabel ekspressivitet Ikke sjeldent med fenokopier i en «syk» familie, grunnet høy prevalens i befolkningen generelt BRCA1: bryst og eggstokk, tumor-suppressorgen BRCA2: bryst og eggstokk + prostata + pancreas, tumor-suppressorgen Årlig MR + mammografi fra 25år, profylaktisk mastektomi, årlig UL gynekologisk fra 30år, profylaktisk salpingo-ooforektomi, årlig PSA-måling fra 40år med redusert grense for prostata-biopsi (30mikrogram/mL) Bilateral mastektomi + kjemoterapi (spesiell type ved BRCA), PARP-inhibisjon ved eggstokk ved BRCA PTEN: bryst, thyroidea, nyre, livmor, benigne neoplasier… Cowden syndrom Årlig UL thyroidea fra 10år, årlig mamma fra 25år, årlig UL livmor fra 30år TP53: bryst, sarkom, leukemi, binyrebark, hjerne… Li Fraumeini syndrom Årlig MR mamma fra 20år, profylaktisk operasjon, «sarkomspesialist»-konsultasjon, koloskopi annenhvert år fra 30år, årlig PSA fra 40år, årlig barneonkolog PALB2: mindre risiko enn de andre, men mer aggressiv hvis får Årlig mamma fra 25år, profylaktisk operasjon Familiær brystkreft: årlig mammografi fra 40-60år
28
Fenokopi
Fenotype til «genetisk frisk» person matcher den ved en genetisk sykdom F.eks en person uten BRCA-mutasjon får brystkreft
29
Arvelig tarmkreft
Høy penetrans Variabel ekspressivitet Gentest: panel med høyrisiko-gener, evt. 1 gen ved kjent familie-mutasjon Pleiotropi, locus heterogenitet Lynch syndrom/HNPCC: Mismatch-reparasjonsgener (MLH1, MSH2, MSH6, PMS2, EPCAM) —> økt risiko for at polypp blir malign Sjelden de novo Coloskopi årlig fra 25år, UL transvaginalt fra 30år, PSA fra 40år, hematuri fra 40år FAP: APC-gen Fenotype avhenger av hvor i genet mutasjonen sitter - start og slutt gir færre polypper og senere debut Ca. 30% er de novo Får hundrevis av polypper i colon, kreft fra ungdomstid Tett oppfølging med coloskopi, fjerne deler av colon MutYH-assosiert polypose: Base excision repair, AR Polypose hos voksne Årlig koloskopi fra 20år Familiær tarmkreft: koloskopi hvert 5. år fra 40år
30
Stille mutasjon
Punktmutasjon gir ingen endring i proteinets oppbygning (f.eks TTC og TTT gir lysin)
31
Nonsense mutasjon
Punktmutasjon gir et ikke-funksjonelt produkt som nedbrytes i cellen
32
Missense mutasjon
Punktmutasjon medfører endret aminosyre Konservativ: lite betydning for funksjon Non-konservativ: endret funksjon
33
Det sentrale dogmet
DNA —> mRNA —> protein
34
Frameshift
1 bokstav forsvinner —> leses av helt feil
35
Sammensatt heterozygot
Ulik mutasjon på gen fra mor og far, kan gi AR sykdom
36
Heteroplasmi
Det er flere mitokondrier i hver celle, ved mutasjon i mitokondrie-DNA har ikke nødvendigvis alle mitokondriene i cellen mutasjonen - forholdet mellom syke og friske er viktig mtp. utvikling av sykdom
37
Hyperfenylalanin/fenylketonuri/Føllings
AR Feil i fenylalanin hydroksylase Redusert nedbrytning av fenylalanin —> opphopning, mindre dopamin Diettrestriksjon
38
Isovaleriansyremi
Svikt i 1 enzym —> opphopning av flere toxiske derivater av enzymets metabolitt —> organisk aciduri, toxisk encephalopati Proteinrestriksjon + karnitin- og glycin-tilskudd Nyfødt-screening
39
Kearns-Sayre-syndrom
Mitokondriell stoffskiftesykdom mt-DNA-delesjon Affiserer først energikrevende organer (øyemuskler, hjertet, retina…)
40
Lang QT-tid syndrom
Mutasjon i ionekanal-gener (redusert K-kanal-funksjon —> lang repolarisering, økt Na-kanal-funksjon —> lang tid før repolarisering starter) Haploinsuffisiens (for få funksjonelle kanaler) Dominant negativ effekt: dysfunksjonelle kanaler ødelegger for de normale i en tetramer Medisinsk Idiopatisk Gir forlenget repolarisering, arytmi, kan utløse Torsade de Pointes-arytmi (vf), plutselig død 25% har normal EKG i hvile Romano Ward-syndrom: kun symptomer fra hjertet, «vanlig» lang QT-tid-syndrom Jervell-Lange-Nielsens syndrom: AR, lang QT + medfødt døv LQT1: utløses av stress, debut rundt 10år LQT2: utløses av stress, senere debut LQT3: utløses i hvile, alvorligere, sjeldnere Flere andre typer Ikke konkurranseidrett, forsiktig med svømming og kaldt vann, unngå plutselige lyder ved hvile, obs ved elektrolyttforstyrrelser (oppkast, feber…), unngå visse legemidler, oppfølging under graviditet Evt. b-blokker, defibrillator
41
Katekolaminerg polymorf ventrikkeltachycardi (CPVT)
RYR2-mutasjon (Ca-regulering) Ca. 40% de novo Adrenergt utløst arytmi Debut 8år, 80% får symptomer før 40år Kan få b-blokker eller ICD
42
Brugada syndrom
Mutasjon i SCN5A-gen (25%) —> asymptomatisk, alvorlig arytmi Økt risiko med økende alder (motsatt av lang qt) Unngå noen medisiner, unngå høy feber, ikke svømme uten tilsyn, unngå kaldt vann, unngå elektolytt-forstyrrelser, forsiktig med stimulantia Bra med fysak Årlig vurdering
43
Hypertrofisk kardiomyopati
Genetisk (10%), belastning på hjertet (hypertensjon, klaffesykdom…), idrettshjerte Særlig septum og ventrikler får uorganiserte muskelceller + fibrose Arytmi, plutselig død
44
Dilatert kardiomyopati
Genetisk (10%), infarkt, myocarditt, alkohol/dop, autoimmun, hormonelt… Redusert ventrikkelkontraksjon (EF< 40%, «hjertesvikt»)
45
ARVC (arytmogen høyresidig ventrikkel-kardiomyopati)
Defekt desmosom-funksjon —> myocyttdød, inflammasjonsrespons, erstattes av fett og arrvev Særlig høyre ventrikkel Kan utløses/forverres av fysak
46
Mendelsk arvegang
Et gen er enten dominant eller recessivt
47
Multifaktoriell arvegang
Egenskaper/sykdom skyldes flere genetiske sårbarhetsvarianter + miljø Finner allelene også hos mange friske
48
Risikovariant
Oftest i ikke-kodende områder, regulerer genuttrykk --> kvantitative proteinforskjeller, påvirker alternativ genspleising, immun-dysregulering Kan være mål for behandling
49
Terskelmodell
Antall sårbarhetsfaktorer over et gitt nivå --> sykdom En klar grense mellom syk og frisk Teoretisk
50
Kronisk inflammatoriske sykdommer
Multifaktoriell årsak: ulikheter i individers immunsystem - 20-40% forklares av genetikk Kronisk inflammasjon (autoimmun sykdom, IBD m.m.) fordi immunsystemet ikke er nøye regulert og ikke nedreguleres etter at skade er fikset Multiple gensegmenter + somatisk rekombinasjon og hypermutasjon gir BCR- og TCR-diversitet --> økt resistens i individ HLA-diversitet i befolkningen gir økt resistens i befolkningen Noen HLA er assosiert med sykdom, andre beskytter IBD: 5-23% har affiserte familiemedlemmer Søsken: gjentakelsesrisiko = søskenrisiko/befolkningsrisiko - Chrons = 25-42x risiko i fht. normalbefolkning, UC = 4-15 > 30% livstidsrisiko hvis begge foreldre har IBD > 240 risikoloci Sannsynligvis interaksjoner mellom immunsystem, mikrobiom, kostholdsmetabolitter og miljø
51
Risikoestimering ved multifaktoriell sykdom
Empirisk risikoestimering for utvikling av sykdom - ser på andre affiserte familiemedlemmer og utregner risiko deretter, særlig søskenrisiko Særlig økt risiko hvis: >1 familiemedlem, nære familiemedlemmer, alvorlig fenotype hos proband, kjønnet som sjeldnest blir rammet er affisert Søskenrisiko = (prevalens av sykdom i generell befolkning)^2 Tvillingstudier for å finne arvelighet: MZ > DZ konkordansrate --> genetisk, MZ < 100% --> miljøfaktorer tilstede, MZ > 100% --> arv med påvirkning av miljø Arvelighet = h = 2(c_MZ - c_DZ) Begrensninger ved prediksjon: mangler info om risikoalleler, miljøfaktorer, interaksjoner, epigenetikk...
52
Arvelig Alzheimer med tidlig debut
Genetisk heterogenitet
53
Duchenne og Becker muskeldystrofi
X-bundet dystrofingen-mutasjon Allelisk heterogenitet, variabel ekspressivitet Duchenne: frameshift --> mangler dystrofin Symptomer før 5år, rullestol innen 13år Becker: redusert/forkortet dystrofin --> dårligere funksjon Rullestol innen 16år, hjerte-muskelsykdom
54
Trinukleotid-repetisjonssykdom
Utvidet trinukleotid-repetisjon --> sykdom Ofte gir flere repetisjoner mer alvorlig sykdom
55
Huntington
Trinukleotid-repetisjonssykdom, antisipering AD med aldersrelatert penetrans (men 100%) Huntingtin-opphopning har toxisk effekt på nervecellen Antall repetisjoner --> debutalder Psykiatriske symptomer kommer ofte før motoriske
56
Antesipering
Arvelig sykdom blir mer alvorlig med hver generasjon Ofte pga. økende antall trinukleotid-repetisjoner - ustabil triplett-ekspansjon
57
Dystrofia myotonica 1
Trinukleotid-repetisjonssykdom i DMPK-gen Lett forøkt --> katarakt Mer forøkt --> klassisk dystrofia myotonica Sterkt forøkt --> kongenitt dystrofia myotonica Myotoni, muskelsvakhet, glatt muskel
58
Arvelige ataksier
Genetisk heterogenitet Ataxia telangiectasia: feil i DNA-reparasjon, telangiektasier "hvor som helst" - økt risiko for cerebellum-skade (ataksi) + immunsvikt + kreft
59
Spinal muskelatrofi
AR Mutasjon i SMN1 Bedre klinikk ved flere SMN2-kopier Spinraza: økt produksjon av SMN2-genprodukt som "erstatter" SMN1 sin funksjon, forhindrer progresjon tidlig i forløp
60
Bioteknologiloven
Ikke under 16år med mindre behandling kan forhindre/redusere helseskade Prediktive/presymptomatiske tester må ha genetisk veiledning og skriftlig samtykke Diagnostiske tester trenger ikke skriftlig samtykke og kan rekvireres av "hvem som helst" Kun relevante gener (genpanel) testes for å unngå utilsiktede funn Hele sekvensen lagres --> kan tas opp senere Noen steder lagres alle sekvenser i et kvalitetsregister for å sammenligne og kartlegge sjeldne varianter Hensikt med genetisk undersøkelse: info om arveegenskaper, diagnostikk, prediktivt/presymptomatisk, bærertilstand, rettsmedisinsk (kjønn, identifikasjon...) Genterapi kan kun brukes til behandling/forebygging av sykdom, ulovlig hvis medføre endring i kjønnsceller