Genetique 11A: déficience intellectuelle

Question 1

la déficience intellectuelle est caractérisée par un fonctionnement intellectuel ??? et par l’existence concomitante de limitations dans ??? sphères suivantes: communication, autonomie, habiletés sociales, santé et sécurité, utilisation des ressources sociales, apprentissage scolaire, loisirs et travail

Answer 1

sous la normale
2 ou plus

Question 2

pour être considéré comme de la déficience intellectuelle, le tout doit survenir à quel âge

Answer 2

avant 18 ans

Question 3

prévalence de la déficience intellectuelle:
- prédite sur base statistique
- observée dans pays d’occident

Answer 3

2,3%
1-3%

Question 4

vrai ou faux, la déficience intellectuelle est le problème socio-économique le plus important dans les pays d’occident

Answer 4

vrai
(coûts les plus importants pour le diagnostic + coût de la vie estimé à 1M par individu en Europe/Amérique du Nord)

Question 5

décrit les causes de DI

Answer 5

20% facteurs environnementaux
50% causes génétiques identifiées
reste = probablement causés par facteurs génétiques

Question 6

est-ce que retard global de développement et DI sont synonymes

Answer 6

non
ce ne sont pas tous les enfants avec un retard de développement qui développeront une DI
retard global de développement est le terme utilisé plus tôt dans la vie quand on ne sait pas encore s’il s’agit d’une DI

Question 7

compare le IQ d’une déficience légère, modérée ou sévère

Answer 7

légère = 55-70
modérée = 40-55
sévère = plus petit que 40

Question 8

qu’est-ce qui différencie la forme syndromique ou la forme non-syndromique d’une DI

Answer 8

syndromique = présence d’anomalies structurales ou métaboliques additionnelles
non-syndromique = aucune anomalie additionnelle

Question 9

décrit l’overlap qui existe entre la DI, l’épilepsie et l’autisme

Answer 9

70% des autistes présentent une DI
20% des autistes sont épilepsiques
20% des sujets avec DI sont épileptiques

Question 10

quelle est la corrélation entre épilepsie et DI

Answer 10

plus la DI est sévère, plus le risque d’épilepsie est grand

Question 11

compare les 3 modèles génétiques des désordres du neuro-développement

Answer 11

mendélien = mutation de novo sur un individu ayant un effet important
oligogénétique = mutations de novo des 2 côtés de la parenté de l’individu atteint qui présente 2 mutations rares à effet modéré
polygogénique = multitude de variation communes ancestrales ayant un petit effet qui sont transmises à l’individu affecté

Question 12

vrai ou faux, les conditions fréquentes comme la DI ou l’epilepsie ont des cibles mutationnelles très restraintes (soit 1 ou 2 gènes)

Answer 12

faux, elles ont des cibles mutationnelles très grandes (comme 1000+ pour la DI) ce qui explique la fréquence dans la population même si chaque mutation est rare

Question 13

de quelles manières sont identifiables les mutations affectant le nombre de copies (CNV)
ces mutations sont elles plus souvent transmises ou de novo

Answer 13

5% identifiables au caryotype
14% identifiables par hybridation génomique sur micropuces

majorité des cas = de novo mais pas exclusivement

Question 14

que peut-on dire par rapport aux mutations ponctuelles liées au chromosome X par rapport à la DI

Answer 14

+ de 100 gènes sur chromosome X associés à DI
10% des cas de DI chez les garçons sont expliqués ainsi
ex.: syndrome du X fragile = cause monogénique la plus fréquente de DI

Question 15

les mutations ponctuelles autosomiques liées à la DI sont elles plutôt récessives ou dominantes

Answer 15

les deux

Question 16

on estime qu’il y a plus de ??? gènes associés à la DI dont la grande majorité sont des gènes ???

Answer 16

800
autosomiques

Question 17

le génome diploïde humain contient environ ??? nucléotides ce qui correspond à environ ??? mutations de novo
les régions codantes (exome) représentent environ ?% du génome et donc chaque humain a ? mutation de novo dans son exome

Answer 17

6 milliards
60
2%
1,2

Question 18

que peut-on dire sur le taux de mutation des sites CpG

Answer 18

il est 10 fois plus grand

Question 19

décrit les taux de mutations par génération:
- variations de structure (CNV de grande taille)
- variations de structure (CNV petite ou moyenne taille)
- insertions et délétions de 1 à 20 nucléotides
- SNV (variations non-sens/faux sens)

Answer 19

1-2%
16%
3 par individu environ
60-70 par individu

Question 20

vrai ou faux, tous les SNV sont des SNP

Answer 20

faux, tous les SNP sont des SNV mais le contraire n’est pas vrai

Question 21

le séquencage de nouvelle génération se fait en ? jour(s) et coute ? $ CAN

Answer 21

1
1500

Question 22

vrai ou faux, le séquencage de l’exome permet de détecter virtuellement toutes les mutations

Answer 22

faux, le séquencage du génome le permet
l’exome ne représente que 2% du génome même si il représente environ 85% des mutations associées aux maladies

Question 23

présentemment, quelle est la faiblesse de l’exploration génomique pour le génome entier

Answer 23

expansion de triplets

Question 24

comment peut-on identifier des mutations de novo par l’étude de cas unique

Answer 24

séquencage en trio pour identifier les mutations de novo (maman, papa et cas-index)
si absents dans maman et papa = mutation de novo

Question 25

qu’a pu nous révéler le séquencage de l’exome en trio pour l’exploration des enfants avec DI sévère inexpliquée

Answer 25

excès de mutations de novo (moyenne de 2 par cas-index plutôt que 1)
excès de mutations délétères de novo (missense)

Question 26

une fraction importante des cas de DI serait causée par des ??? touchant ??? gène(s)

Answer 26

mutations de novo
1 seul