Genetisk variation og mutationer

Question 1

Redegøre for mekanismer for hvorledes nye mutationer opstår mutationer.
Forklare hvor hyppigt nye variationer/mutationer opstår og hvor hyppige sekvensvariationer er i det humane genom
Redegøre for mekanismer for patogenese af mutationer
Forklare betydningen af højpenetrante mutationer i forhold til hyppige svagt disponerende variationer Beskrive det
humane genom projekt og 1000 genom projektet.
Beskrive hvordan software, databaser og funktionelle analyser kan bruges til at afgøre om sekvensvariationer er sygdomsdi- sponerende.

Question 2

Overordnede mekanismer for mutationers opståen:

Answer 2

• DNA replikationsfejl
  ○ Ofte i forbindelse med celledeling
  
  • DNA rekombinationsfejl
    ○ Ofte i forbindelse med meiose
  • Spontane mutationer
  • DNA skader som følge af:
    ○ UV stråling
    ○ Kemikalier
    Inkomplet DNA repair af ovenstående

Question 3

mekanismer Base substitutioner

Answer 3

• Transitioner er hyppigere end transvertioner
  • Hvis der sker substitutioner mellem 2 puriner eller 2 pyrimidiner kaldes det transition.
  • Hvis der substitutioner mellem puriner og pyrimidiner kaldes det transversion.

Transition er mest hyppigt, C -> T
G → A transition er også ret typisk

Question 4

Deletioner og insertioner

Answer 4

Deletioner/insertioner/dynamiske mutationer sker som følge af fejl i replikation

1) Hvis der et sted i DNA er et repeatsekvens, kan der ved replikation ske fejl så der bliver et for meget eller for lidt
2) Fejlen kan ske ved at den streng der er ved at blive syntetiseret "hopper" af templatestrengen kortvarigt, hvilket gør at der bliver tilføjet et ekstra repeatsekvens… dette kaldes backward slippage → insertion
3) Fejlen kan omvendt også ske, hvis template strengen kortvarigt "hopper" væk fra den nysyntetiserede streng kortvarigt, hvilket gør der bliver sprunget et repeatsekvens over… dette kaldes forward slippage → deletion

Question 5

Dynamiske mutationer

Repeats, som bliver længere og længere for hver ny generation.

Question 6

Større rearrangementer

* Deletioner/insertioner/kromosom rearrangementer som følge af skæv rekombination

Ved rekombination, kan der være flere steder på kromosomerne der minder om hinanden.
* Derfor kan kromosomerne blive linet op forkert.
* Dette kan alt afhængigt af hvilke steder der er blev linet op sammen, enten føre til deletion eller duplikation

Dette kan også ske selvom kromosomerne ikke er homologe.
Dette vil føre til translokationer