Vecka 3 - Den sekretoriska vägen (Kreuger) Flashcards
(28 cards)
Vilket COP protein finns på vesiklar som ska transporteras till
a) ER
b) golgi
Vesiklar som ska från ER till Golgi har COP 2 hölje proteiner
Vesiklar som ska transporteras till ER från Golgi hat COP 1 hölje protiener
Vad är ett vesikulärt kluster?
Vad kopplas alltid till dessa för transporten ska va möjlig?
Det är fuserade sekretoriska vesiklar som transporteras från ER till golgi.
Motorproteiner är kopplade till klustrerna (och enskilda vesiklar). T.ex. Kinesin.
Vad är kinesin och hur är den kopplad mellan vesikel och mikrotubuli?
Kinesin är ett motorprotein som vandrar längs mikrotubuli och binder till en kinesinreceptor på vesikeln som ska transporteras.
Hur aktiveras SAR1? Vad är detta för något?
Vad binder SAR1 när den är aktiv?
Nyckelord transport, Guanosine, Cargo
Sar1 är ett protein som är viktig vid vesikelbildning och transport från ER till golgi. (kommer initiera bildning av COP 2 vesikel)
Sar1 aktiveras med ett Sar-1 GEF som sitter i ER-membranet.
- Sar1-Gef gör att Sar1 tappar affinitet för GDP som den är bunden till i inaktivt stadium.
- Sar1-GTP som är cytosoliskt med GDP, fäller då ut en amfifilisk helix som kan binda till ER-membranet
- I sin tur binder SAR1
- Sec23. Sec 23 binder i sin tur:
- Sec24 i cytosolen, som i sin tur lägger sig på membranet i ER
- Sec24 binder därefter cargoreceptors extrcellulära del som sticker ut i ER-membranet.
Vad är en GEF?
Guanine exchange factor. Det är ett protein som byter ut GDP mot en GTP.
Vad är en GAP?
GTPas activation protein. Detta är ett protein som underlättar fosfatasaktivitet av ett GTPas som t.ex. SAr1
Vad är ett GTPas?
Ett protein som har en inneboende fosfatas aktivitet. Den hydrolyserar ett bundet GTP till en GDP och Pi.
Vad är Sec 23 och 24?
Nyckelord Vesikeltransport, ER–> golgi
Det är adaptorproteiner. Dem binder till Sar1-GTP - Sec23 - Sec24 - cargoreceptor extracellulär-.
Vad krävs för att ett GTPas ska kunna aktiveras?
En GEF som byter ut GDP så att GTPas kan binda in ett GTP som finns i cytosolen.
Vad är ett GDI?
Vad är GDF?
GDP dissociation inhibitor. Detta protein inhiberar ett GTPas att släppa sin GDP —> förblir inaktiv
GDF = GDI displacement factor. Denna inhiberar GDI. –> GTPas kan bli aktivt.
Vad händer med ett GTPas konformation när den aktiveras av att binda GTP?
Den fäller ut en amfifilisk helix som kan interagera med andra proteiner.
Vad är inre och yttre COP2-hölje?
Vad heter dem uttre COP2 proteinerna?
Det inre COP2-höljet består av Adaptorproteinerna SEC23 och 24 + Sar1 GTP
Det yttre COP2 höljet är proteiner som i sin tur binder till det yttre höljet ->
- Sec13/31
Vad händer när COP2 höljet bildas runt en cargomolekyler?
Vad händer med COP2 höljet när den når målmembranet?
ER-membranet kommer böjas av och sedan avknoppas från ER-membranet –> vesikel har bildats.
När Vesikeln når målmembranet destabiliseras höljet och faller isär.
Vad är en exitsignal? Varför behövs den?
Hur ser en exitsignal ut? allmänt.
Gäller protein som ska lämna ER –> Golgi
En sekvens i ett protein som ska binda till en cargoreceptor intracellulärt. Denna behövs för att cargoreceptorn ska kunna binda till cargo-proteinet.
En exitsignal består av
sur aa- valfri aa - sur aa
Ibland vill ER ha tillbaka protiner som den har skickat till Golgi.
Hur kan ER få tillbaka dessa proteiner?
Nyckelord ER-retentionssignal,
Proteiner som ska tillbaka från Golgi till ER, märks med en KDEL-signal i ER. Denna KDEL-signalpeptid på proteinet binder till en KDEL-receptor i Golgi.
KDEL-receptorn binder extracellulärt till COP1-höljeproteiner som då knoppar av vesikeln och tar den tillbaka till ER.
Hur kan en KDEL-receptor släppa sin last i ER? Vilken mekanism gör det möjligt?
I ER är pH högre än i Golgi. Denna lägre koncentration av vätejoner kommer att ändra affiniteten för KDEL-peptiden och då släpps proteinet i ER-lumen.
Vilka aminosyror är en KDEL? Vad är en KDEL?
Nyckelord 4 st.
Lysin-Aspartat-glutamat-leucin.
Lyasglule
Vilka proteiner styr var vesikelfusion ska ske specifikt med målet?
Bara nämn dem.
- Rab-proteiner
- Fosfoinositider (annan föreläsning)
- Även glykosylering av proteiner i golgi kan vara en adresslapp.
Vad är ett RAB-protein? Vad binder den till?
Det är ett GTPas. Detta protein reglerar vesikelns mål i en sekretorisk väg, de är specifika för olika organeller.
Rabproteinet binder till specifik Rab-effektor på målmembranet.
T.ex. en vesikel ska från golgi till ECM (exocytos), då är Rab 8 proteinet som är adresslappen.
Beskriv hur ett protein märkt med en Rab binder till sitt målmembran.
Nyckelord snare.
- Rab-GTP sitter bundet på vesikeln.
- Denna Rab-GTP binder Rabeffektor på målmembranet. Då förs vesikeln närmre membranet.
- På vesikeln finns ett långt protein som heter v-SNARE som sticker ut. Denna kommer binda till t-SNARE som sticker upp i målmembranet. När dem kramar varandra så dras vesikeln mekaniskt mot membranet -> fusion -> cargo släpps ut.
Vad är Mannos 6 fosfat receptorn?
Detta är en receptor i transgolgi som binder en glykosylering (mannos-6-fosfat) som görs i golgi, på ett protein.
Mannos6 fosfat är en glykosylering som sker i golgi, på hydrolaser (proteiner) som ska transporteras till lysosomer (först via tidig endosom).
Beskriv hur ett lysosomalt protein färdas från ER till golgi till lysosomen.
Nyckelord mannos, endosomer
- Proteinet kommer in till golgi. Där kommer det ske en modifiering av proteinet genom att en den får en N-länkad acetylglucosamin, och ytterst en Mannosenhet.
- Mannos-6-fosfat kommer att binda till till receptor i transgolgi.
- Vesiklarna packas in i CLatrincoat.
- Transportvesikel till endosomer. I endosomen finns ett lägre pH som gör att proteinet släpper från receptorn. m6P receptorn återvinns genom att skickas tillbaka till golgi. Vidare färd sedan till lysosomen med protienet.
Vilken adresslapp leder till att vesiklar hamar i lysosomer?
Mannos-6-P
Vad är skillnaden på konstitutiv och reglerad sekretion?
Konstitutiv sekretion är en sekretion som sker i alla celler lite hela tiden, till plasmamembrane. House keeping funktion.
t.ex. plasmamembranproteiner och lipider.
Reglerad: t.ex. vesiklar som väntar vid ett plasmamembran på en signal innan fusion med plasmamembranet. Är en del av cell-cellkommunikation.
