Vecka 4 - GTP-bindande proteiner - signalering Flashcards

1
Q

Vad har G-proteiner alla gemensamt?

A

Dem har en endogen GTPas aktivitet som gör att dem kan hydrolysera GTP till GDP och därmed inaktiveras.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Vad står G-protein för?

A

GTP-bindande protein

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vilka delar av ett trimert GTPas finns?

Vilken av dessa har en GTPas-aktivitet?

A
  • Receptor (GPCR)
  • G- protein (GTPas) (alfa)
  • alfa är GTP-bindande och har ett lipidankare

Beta och gamma sitter ofta ihop, men alfa släpper vid signalering.

  • beta
  • gamma (har lipidankare)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Nämn

a) subtyper av alfa-protein er i ett trimert G-protein
b) vad dem har för effektor
c) vilken annan “effektor” kan alfa-subenheter påverka?

A

a) alfa-s
- stimulerar
- adenylcyklas –> cAMP ökar

alfa-i

  • inhiberande
  • adenylcyclas –> cAMP minskar

alfa-q

  • aktiverar Fosfolipas (PLC beta) (PLC beta aktiveras av GPCR, medan PLC gamma aktiveras av RTK)
  • PI-signalering –> calcium

c) jonkanaler

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Varför kallas receptorn för 7-TM? Annat namn för receptorn?

Vilken temrinal är extracellulär och intracellulär?

A

Den har 7 st hydrofoba sekvenser i sin aminosyrasekvens som sitter i plasmamembranet

Receptorn kallas även GPCR!

Intracellulärt är C-terminalen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vilka olika ligander kan binda till trimera GPCR?

5 st

A
  1. fotoner
  2. kemokiner (ligand som aktiverar leukocyter)
  3. hormoner
  4. glutamat, Calcium
  5. katekolaminer (små ligander)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vad har egentligen själva receptorn för funktion på G-proteinet i en trimer G-protein?

Vad händer när …… bundit till ….. med dem andra subenheterna?

A

Genom ligandbindning ändras konformationen i receptorns intracellulära del. Detta inducerar att byta ut GDP till GTP i alfa-subenheten.

När alfa bundit GTP, dissocierar den från beta och gamma.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vilka 4 principiella effektorer har vi?

Och deras second messengers?

Gällande trimera G-proteiner.

A
  1. Adenylcyclas - cAMP nivå
  2. Fosfolipas beta - PI klyvning.
  3. Jonkanal - jonflöde
  4. cGMP-fosfodiesteras - cGMP nivå
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Beskriv signalering med G-protein och Adenylcyclas.

Nyckelord alfa i, alfa s, PKC

A
  1. GPCR binder ligand
  2. alfa-subenheten, s eller i, binder GTP och aktiverar Adenylcyclas som är ett enzym vid plasmamembranet.
  3. Adenylcyclas gör om ATP till cAMP –> cAMP binder till inaktivt PKA
  4. PKA regulatoriska delar faller bort
  5. PKA kan sedan fosforylera många proteiner som går in i cellkärnan
  6. Påverkan av transkription
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Beskriv PLC-beta signalering.

Nyckelord calcium

A
  1. GPCR binder agonist
  2. alfa-subenheten Gq, kommer binda GTP.
  3. Denna aktiverar PLC-gamma vid plasmamembranet . Beta/gamma reglerar också Plc-gamma
  4. PLC-gamma klyver PIP2 till DAG + IP3
  5. IP3 kommer sätta sig på receptor på ER –> calcium ut
  6. DAG aktiverar PKC
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Hur blir det cellulära svaret med EN aktiverad GPCR trimer?

Nyckelord PKA

A

Signalen amplifieras. Detta eftersom att ett GPCR kan aktivera flera G-proteiner, som i sin tur kan aktivera flera Adenylcyclas, som i sin tur kan frisätta mycket cAMP som i sin tur kan aktivera PKA.

PKA kan fosforylera många olika protiener dessutom

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vad är uppgiften för beta och gamma subenheten i ett trimert G-protein.

Beskriv hur det regleras vid hjärmuskelkontraktion.

Nyckelord acetylkolin

A
  • stabiliserar komplexet med alfa.
  • men kan också signalera till viss del, t.ex. genom att reglera kaliumkanaler.

Vid kaliumkanaler är det gamma-subenheten som sätter sig på en kaliumkanal och öppnar den, när en GPCR binder en Accetylkolin i hjärtmuskeln.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Hur kan desensibilisering ske av en GPCR?

Hint: Vilken aminosyra påverkas? Homo och hetero

A

Homolog desensibilisering
- den egna receptorns aktivering, leder också till sin egen inaktivering.

Heterolog
- Receptor A aktivering, leder till Receptor B inaktivering

1 är både Hetero och Homo

  1. Är homo
  2. En GPCR som signalerar och aktiverar PKA. PKA fosforylerar även serin på C-terminalen på GPCR —> interaktion med G-protein förhindras trots liganbindning
    - ej specifik fosforylering.
  3. GPCR kinase (GRK). Forsforylerar specifik GPCR på c-terminalen
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vad är arrestin?

Nyckelord desensibilisering

A

En PKA som fosforylerar serin på en GPCR c-terminala del, kommer binda arrestin som är ett protein –> invaginering eller/och degradering.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hur är ett monomert GTP-as uppbyggt?

A
  • bara en alfa-enhet som binder GDP eller GTP
  • inneboende GTPas förmåga
  • har ett lipidankare
  • aktiveras av GPCR.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vilket cellulärt svar leder Ras till?

A
  1. celldelning
  2. neuronal differentiering
  3. cancer –> epenkymala celler
17
Q

Vilket cellulärt svar ger Rab och ARF?

A

Intracellulär vesikeltransport.

18
Q

Vilket cellulärt svar ger Ran?

A

Nukleär transport

19
Q

Vilket cellulärt svar ger Rho?

A

Reglerar cellmigration och aktinfilament.

20
Q

Nämn dem olika monomera GTPaserna

A
  1. Ran
  2. Rho
  3. Ras
  4. Rab
  5. ARF
21
Q

Vilka proteiner kan påverka aktivering och inaktivering av monomera GTPaser?

A

GAP –> katalyserar hydrolys av GTP, inaktivering

GEF –> hjälper till med aktivering (ta bort GDP)

22
Q

Vilket GTPas är ibland muterat och en orsak till cancer?

Vilken aktivitet har GTPaset då? ökad eller minskad.

Vilka cancerformer är den vanligt muterad?

A

Monomert GTPas Ras. Den påverkar bla MAP-kinasvägen som leder till proliferation.

  • minskad GTPas aktivitet!
  • i pancreascancer står mutationer för 95 % av fallen
  • i carcinom 10-15 %
23
Q

Beskriv hur Ran reglerar import av ett protein till cellkärnan.

A
  1. I cellkärnan finns Ran-GDP. Den aktiveras med en GEF
  2. Binder då importreceptor och åker ut i cytoplasman
  3. GAP finns i cytoplasman och kommer katalysera hydrolys av Ran-GTP till Ran- GDP.
  4. Då släpper Importreceptor och hämtar ett protein, medan Ran-GDP åker in själv till cellkärnan.
24
Q

Beskriv hur Ran reglerar export av protein från cellkärnan.

A
  1. Ran-GTP i cellkärnan (har “aktiverats” mha en GAP)
  2. Ran-GTP binder exportreceptor och exportprotein
  3. Åker ut i cellkärnan —> GAP katalyserar där hydrolysen till GDP –> Ran-GDP
  4. Komplexet dissocierar och proteinet hamnar i cytoplasman. Importreceptorn åker in till cellkärnan igen själv.
25
Q

Jämför cellkärna och cytoplasma. I vilket utrymme finns mest GAP respektive GEF för Ran?

A

Cytoplasma mest GAP (Ran-GDP)

Cellkärna mest GEF