Vecka 3 - Översikt cellens organisation, proteintransport mitokondrien (Kreuger) Flashcards
Vad innebär topologiskt ekvivalenta områden?
Detta gäller ffa sekretoriska och endocytotiska vägen.
Två områden som är topologiskt ekvivalenta, är det om molekylen som transporteras mellan områdena inte korsar ett membran på vägen. (Packas istället in i en vesikel)
Ex. Sekretion: Från ER –> GOLGI –> ECM
Vad är cristae i mitokondrien?
Membranveckningarna av det intre mitokondriemembranet.
På vilken plats och vilken organell startar proteinsyntesen i cellen?
I cytoplasman med ribosomer.
Vad är en signalsekvens och vilken av dem kommer ut först från …….? Vilka av dessa är med i det färdiga proteinet?
En signalsekvens är ett specifikt aminosyra motiv som på den nyproducerade aminosyrakedjan som kommer ut från ribosomen. Först kommer N ut, sedan intern, sedan C-terminal.
Dessa motiv känns igen av specifika receptorer, och därmed kan ett protein lokaliseras till en given plats.
N-terminalen kommer att klyvas bort av signalpeptidaser
Vilka 3 olika sätt kan proteiner transporteras på inom cellen?
- Nukleär transport. Sker mellan cellkärna och cytoplasma
- Vesikulär transport. Sker mellan organeller och organeller - ECM
- Transmembran transport. Är hur proteiner transporteras in till ER, mitokondrier och peroxisomen.l
Vad kännetecknar signalsekvenser för proteiner som ska in till mitokondriens matrix?
Vad heter denna med ett specifikt namn?
N- terminalen har positivt laddade aminosyror, ex arginin och lysin. Dessa aminsoryor är blandade med icke laddade aminosyror i N-terminalen –> dem positiva aa hamnar på en sida av alfa-helix, medan dem icke laddade hamnar på andra sidan om alfa helixen.
Sekvens binder importreceptor på mitokondriens yttre membran. (TOM o TIM)
När signalsekvensen är pos och icke laddad, heter den amfipatisk/amfifil signalpeptid.
Beskriv hur ett protein transporteras in till matrix i mitokondrien
Nyckelord. TOM, TIM23, signalpeptidas, veckning.
HSP70 specifikt kommer i annat flashcard.
- Proteinets signalpeptid binder till importreceptor TOM-complexet bed N-terminalen
- I det inre mitokondriemembranet finns TIM23 komplex, som tillsammans med HSP70 kommer att ta in proteinet i matrix. Matrix är neg laddat, därför kommer signalsekvensen in lätt. Sedan hjälper även HSP70 till.
- TOM och TIM23 gör en kanal för proteinet.
- I matrix klyvs sedan signalpeptiden bort med signalpeptidas.
- Slutgiltig veckning sker sedan av proteinet.
Vad står TOM och TIM för?
Translocase of the inner/outer membrane.
Vad är HSP70? När används denna? Vilka energikrävande steg finns i processen som relateras till HSP70.
HSP70 är en chaperron som håller ett nysyntetiserat protein oveckat genom att binda denna i cytosolen. Finns också ett mitokondriellt HSP70.
- När cytosoliskt HSP70 ska släppa krävs ATP.
- När HSP ska binda krävs ATP
- När mitokondriellt HSP70 ska ändra konfirmation för att dra in proteinet i matrix. Drar mekaniskt in proteinet.
Vad krävs för att proteiner ska kunna transponeras in till mitokondrien mer än signalsekvens?
Dem måste vara oveckade!
Beskriv hur proteinimporten till peroxisomen sker.
Nyckelord Pex, Signalsekvens.
- C-terminalens aa är signalsekvensen.
- Dessa binder till receptor i cytosolen PEX5
- PEX 5 binder receptor i membranet, PEX14
Proteinet translokeras in.
- Konfirmationsändring sker, gör att protein + PEX5 translokeras in i peroxisomen. Dem släpper arandra.
- PEX5 translokeras ut till cytosolen igen.
Var i cellen finns
a) HSP70
b) HSP60
c) HSP90
a) mitokondrien, cytosol, ER
b) mitokondrien, cytosol
c) cytosol
Varför är det dåligt med felveckade proteiner?
Sämre funktion hos proteinet
De kan binda andra proteinet och skapa stora aggregat, som då stör signalvägar i cellen och är toxiska.
Vid värmechock i kroppen kan en chaperron binda till proteiner i cytosol, mitokondrie och ER, för att stabilisera dem. Vad händer detta chaperron bundit till proteinet, och vad heter chaperronet.
- HSP70 är normalt sett bundet till HSF1.
Värmechock
- Proteinet binds till HSP70, HSF1 går in i cellkärnan
- I cellkärnan verkar den som en transkriptionsfaktor tillsammans genom att dem oligomeriserar vid DNA.
- mRNA transkriberas –> translateras –> mer HSP70
Avstängning ökad produktion
4. HSP70 som producerats i stor mängd åter, binder tillslut till HSF1 i cytosolen istället för proteiner när det inte finns några fler proteiner att binda längre –> Därmed kommer inget fritt HSF1 finnas kvar i cytosolen tillslut. –> minskad produktion HSP70
mRNA bryts sedan ner också.
Vad är HSP60? Beskriv hur proteiner kan binda in där, för att sedan bli “bra” igen. Nämn inget om GroES Cap, kommer i annat flashcard.
En chaperron som är en dubbel tunna, mitokondrie och cytosol. Varje tunna kan ta hand om ett protein.
När ett protein inte är rätt veckat kan hydrofoba sekvenser exponeras. I tunnan finns det också hydrofoba sekvenser i sin binding site. Proteinet binds in. I tunnan finns sedan hydrofila sekvenser som hjälper till att dra ut dem hydrofila sekvenserna och vecka proteinet rätt.
