Tschwori VL6: Antibiotika II - Resitenzen und horizontaler Gentransfer Flashcards

1
Q

Was beinhaltet der erste bekannte Supererreger?

A
  • mcr-1 Gen in E. coli
  • mcr-1 verursacht resistenzen gegen colistin: Notfall Medizin für Patienten mit multi-drug Infektionen
  • das mcr-1 Gen liegt auf einem plasmid, kann von bakterium zu bakterium wechseln
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2
Q

Was führte zur Entwicklung von resistenzen?

A
  • fehlschläge in der Entwicklung synthetischer Antibiotika
  • finden von neuen Antibiotika-> teuer und komplex
  • nicht rentabel für pharmazieunternehmen:
    1. Kurzes Patent
    2. Kurzer einsatzt, da nicht zur Behandlung von chronischen Krankheiten
    3. Entstehung von bacteria resistenzen
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3
Q

Wo kommen Antibiotika überall zum Einsatz?

A
  • humanmedizin
  • landwirtschaft/ pflanzenanbau/ fischzucht -> Nahrung
  • umwelt: Flüsse/ Seen/ Boden
  • pharmazieunternehmen
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4
Q

Mechanismen zum Erwerb von resistenzen?

A
  • DNA, die Antibiotikum resistenzgene beinhaltet, kann diese durch horizontalen Gentransfer einem empfänger transferieren über:
  • zell-zell Konjugantion
  • Transformation von nackter DNA ( auf Plasmid oder als lineare DNA , die tote Zellen verlässt)
  • Phagen vermittelte Transduktion
  • resistenzen können ebenfalls durch ‘de novo’ Mutation entstehen
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5
Q

Transposons

A
  • mobile genetische mobile Elemente:
  1. IS-Element:
    IR (inverted repeat sequenz) - transpositionsgen - IR
  2. Typ I einfaches transposon:
    IS (Insertion sequenz) - antibiotikaresistenz - IS
  3. Typ II zusammengesetztes transposon: transposase gen - resolvase gen
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6
Q

IS-Element

A

IR (inverted repeat sequenz) - transpositionsgen - IR

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7
Q

Typ I einfaches transposon

A

IS (Insertion sequenz) - antibiotikaresistenz - IS

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8
Q

Typ II zusammengesetztes transposon

A

transposase gen - resolvase gen - transposase - resistenzgen

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9
Q

Integrons

A

Mobile genetische Elemente mit resistenzgenen:

  • große, komplexe mobile Elemente, die viele verschiedene Antibiotikaresistenzgene Kassetten akzeptieren oder erfassen können
  • Integrons sind aus drei essentiellen Elementen zusammengesetzt, die zu exogene Gene führen:
    1. Gen, das integrase kodiert: Intl
    2. Primäre rekombinationsstelle: attl
    3. Starken promotor: Pc
  • zB vibrio cholerae besitzt ein super Integron mit über 150 genkasetten
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10
Q

Mobile genetische

Elemente mit resistenzgenen

A

Transposon

Integron

R Plasmid

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11
Q

R Plasmid

A
  • transferieren resistenzen und wachstumshemmer via Konjugantion
  • zB Plasmid R100 trägt resistenzgene gegen sulfonamide, Streptomycin, chloramphenicol, tetracyclin uvm
  • viele Module auf R Plasmid sind ebenfalls mobile genetische Elemente zB Tn10
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12
Q

Gentransfer via Konjugantion

A
  • über Sex-Pilus
    1. Plasmidtransfer: Donor->Plasmid -> empfänger
    2. Chromosomentransfer:Donor mit integriertem Plasmid überträgt dieses auf empfänger
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13
Q

Gentransfer via Transduktion

A
  • P22 Phagen DNA infiziert wirtszellen und macht UE-Komponenten für mehr Phagen
  • Dna wird in Kapsid-köpfe gepackt, mache kapside enthalten Wirt DNA
  • neue Phagen Ansammlung ist fertig
  • Zelle lysiert, Phagen verlassen diese
  • transduzierender Phage injeziet wirtsDNA in neue Zelle, wo es zu neukombinationen in Chromosomen kommen kann
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14
Q

Genaustausch via Transformation

A
  • transformierende DNA aus Donor Zelle wird mittels DNA bindende protein in wirtszelle geschleust
  • kompetenzspezifisches ssDNA bindeprotein bindet einzelstrang und nuclease spaltet die DNA von außen
    und fügt sie in das bakterielle Chromosom
  • RecA Protein vermittelt homologe rekombination
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15
Q

Resistenzmechanismen der Bakterien

A
  • hindern das Erreichen des Antibiotikums durch undurchdringliche barriere und EffluxPumpen
  • Modifikation/Schutz des Ziels: resistenzen mutation
  • Modifikation des Antibiotikums: Inaktivierung
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16
Q

Undurchdringliche Barriere als Resistenzmechanismus

A

äußere Membran von gram-negativen Bakterien ist eine Barriere für amphipathische Komponenten

  • multi-drug-resistence (MDR)-Pumpe presst jegliche Substanzen heraus, die die äußere Membran durchdringen
  • Die innere Membran beschränkt das Eindringen von hydrophilen Substanzen-> perfekte Barriere
17
Q

Haupttypen von bakteriellen EffluxPumpe?

A
  • am meisten vertreten:
    MFS (major facility superfamily) Pumpen (normalerweise auf Plasmiden): Tetracyclin (Tet) und chloramphenicol (Cml) Transporter
  • SMR (small multidrug resistance): biocide (Smr/Qac) und aminoglykoside (EmrE) resistenz
  • MATE (multidrug and toxic compound extrusion): fluoroquinolon resistenz (Nor)
  • RND (resistance-nodulation-cell division): multi-drug (aminoglykoside, fluoroquinolon,beta-lactame, microlide)
  • ABC: macrolid-spezifische (MacABC in E. coli), multi-drug zB ethidium Promise (LmrA)
18
Q

MFS Pumpen, gegen Was?

A

(normalerweise auf Plasmiden)

Tetracyclin (Tet) und chloramphenicol
(Cml) Transporter

19
Q

SMR Pumpe

Gegen was?

A

biocide (Smr/Qac) und aminoglykoside (EmrE) resistenz

20
Q

MATE Pumpe

Gegen Was?

A

fluoroquinolon resistenz (Nor)

21
Q

RND Pumpe

Gegen Was?

A

multi-drug (aminoglykoside, fluoroquinolon,beta-lactame, microlide)

22
Q

ABC Pumpe

Gegen Was?

A

macrolid-spezifische (MacABC in E. coli), multi-drug zB ethidium Promise (LmrA)

23
Q

Resistenzmechanismus: Modifikation/ Schutz des Ziels

A
  • zielseiten Mutation:
    Zb Mutation topoisomerase Gen überträgt fluoroquinolon resistenz in viele spezies/ Mutation in PBP überträgt beta-lactam-resistenzen
  • zielseitenschutz:
    Erytromycin ribosom methylase (erm) Familie methyliert 16s rRNA und veränderte medizinbinfung-seite, verhindert Bindung von macroliden
24
Q

Resistenzmechanismus: Modifikation des Antibiotikums

A
  • Inaktivierung durch Hydrolyse des Antibiotikums: beta-lactamase
  • Inaktivierung durch Modifikation des Antibiotikums:
    1. Chloramphenicol-Acetyltransferase 2. Phosphorylierung/ Acetylierung/ Nucleotidylierung von aminoglykosiden
25
Q

Worin steckt die Hoffnung für die Entdeckung neuer Antibiotika?

A
  • Genom Forschung:
    von interessanten Mikroorganismen wird das Genom sequenziert
    -> bioinformatische Auswertung und Identifikation von kryptischen BGCs
  • Aktivierung von stummen biosynthetischen Gen clustern:
  • > variierende wachstumsbedingung
  • > Technik von transkriptionmaschinerie und translationmaschinerie
  • > Manipulation von globalen Regulatoren
  • > epigenetische pertubation
  • > Manipulation wegsspezifischer Regulatoren
  • > Mutanten Selektion
  • > strukturverbesserung
  • > heterologe expression
  • > iChip für mikrobielle kultivierung
  • neue ökologische Nischen