Expression et purification des Protéines Flashcards

(34 cards)

1
Q

C’est quoi l’avantage de l’isolation de protéines de tissus animaux

A

protéine native, modifications post-traductionnelles, pas cher

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Q

que sont les limites de l’isolation de protéines de tissus animaux

A

sources limitées, petite quantité de protéines spécifiques et pas d’étiquettes

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3
Q

Que sont les étapes de l’isolation de protéines de tissus animaux

A

localisation d’une source, prélever l’organe optimal, homogénéiser les tissus et purifier la protéine

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4
Q

Que sont les étapes de l’expression de protéines dans la bactérie

A

construction de vecteur, sélection avec antibiotique, culture et induction de la protéine et purifier et analyser

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5
Q

C’est quoi l’avantage de l’expression de protéines dans la bactérie

A

Beaucoup de protéine pas cher, rapide culture et expression, vecteurs d’expression différentes et l’expression de protéines marquées est facile

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6
Q

que sont les limites de l’expression de protéines dans la bactérie

A

pas de modifications post-traductionnelles ou ponts disulfures, pas bon pour les protéines membranaires et différents codons chez la bactérie

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7
Q

Que sont les étapes de l’expression de protéines dans la levure

A

construction de vecteur, sélection avec acide aminé, cultiver et induction et purifier et analyser

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8
Q

C’est quoi l’avantage de l’expression de protéines dans la levure

A

Beaucoup de protéines et pas cher, pont disulfures et modification post-traductionnelles, expression de protéine marquées

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9
Q

que sont les limites de l’expression de protéines dans la levure

A

moins rapide, différents codons, pas bonne pour la protéine glycosylées

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10
Q

Que sont les étapes de l’expression de protéines chez l’insecte

A

construction de vecteur, identification et amplification de baclovirus, cultiver et infection de cellules et purifier et analyser

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11
Q

Que sont les avantages de l’expression de protéines chez l’insecte

A

ponts disulfures et modification post-traductionnelles, bon pour protéines glycosylées, vecteur avec His-tage et GST-tag et meilleures codon

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12
Q

Que sont les limites de l’expression de protéines chez l’insecte

A

pas rapide, moins de protéines, milieux spéciaux et production de protéines marquées difficile

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13
Q

Que sont les étapes de l’expression dans les cellules humaines

A

construction de vecteur, production de vecteur, cultiver et transfection de cellules et purifier et analyser

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14
Q

Que sont les avantages de l’expression dans les cellules humaines

A

Ponts disulfures, modifications post-traductionnelles et protéines membranaires, Les protéines contaminantes ne sont pas immunogènes, Vecteurs production avec His-tag et Codons parfaits- meilleur choix pour les très grosses protéines humaines

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15
Q

Que sont les désavantages de l’expression dans les cellules humaines

A

pas rapide, moins de protéines besoin d’un fermenter, milieux spéciaux et production de protéines marquées est impossible

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16
Q

Que sont les étapes de la purification à 3 étapes

A

capturer:isoler et concentrer, purifier: retirer grosses impuretés et polir: retirer petites impuretés

17
Q

Que sont les agents chaotropiquess

A

le guanidinium et l’urée

18
Q

qu’est ce qui arrive durant la précipitation saline de protéines

A

commence avec fraction soluble, la concentration de sulfate d’ammonium augmente, centrifuge et resurpendre le culot, répétition jusqu’à 80-90%, electrophorèse, puis resurpendre

19
Q

que sont les types de chromatographie

A

FPLC/pression moyenne et HPLC/ pression haute

20
Q

C’est quoi l’élution linéaire

A

un tampon, protocole facile, pas cher, mais séparation moins efficace

21
Q

C’est quoi l’élutionpar gradient

A

plusieurs tampon, protocole compliqué, cher et séparation efficace

22
Q

Comment fonctionne la détection par ultraviolets

A

La loi de beer-Lambert relie la quantité d’absorption de la radiation à la nature des espèces absorbantes

23
Q

où est ce que les groupes amide absorbent dans l’ultaviolet

A

en bas de 250 nm

24
Q

où est ce que les acides aminés aromatiques absorbent dans l’ultaviolet

A

au dessus de 250 nm

25
C'est quoi le principe de base de la chromatographie d'affinité
une liaison spécifique entre une protéine et une résine qui est réversible où on exploite une propriété biochimique unique de la protéine d'intérêt
26
Quand est la chromatographie d'affinité utilisé
durant les deux premières étapes de purification
27
Que sont les protéines de fusion pour la chromatographie d'affinité
glutathione-S-transférase (GST) et Attache-(His)
28
Que sont les ligands pour la chromatographie d'affinité
glutathione et nickel
29
Que sont les étapes de la chromatographie d'affinité
Étape d'équilibration, de liaison, puis d'élution
30
Que sont les avantages de la fusion de GST pour la chromatographie d'affinité
augmente solubilité des protéines, purification facile et édition facile
31
Que sont les désavantages de la fusion de GST pour la chromatographie d'affinité
grosse étiquette, purification n'est pas possible avec dénaturants et GST forme un dimère
32
Pourquoi doit ton avoir un site de coupure
il est parfois essentiel de cliver la protéine de fusion
33
Que sont les avantages de la fusion de la poly-histidine pour la chromatographie d'affinité
purification facile avec résine de nickel, édition facile avec un petit ligand, purification possible avec dénaturants et petite étiquette
34
Que sont les désavantages de la fusion de la poly-histidine pour la chromatographie d'affinité
augment la formation de corps d'inclusion, purification n'est pas possible avec antioxydants, pas bon pour purification de protéines qui lient des métaux de transition