proteómica del cáncer

Question 1

Para identificar un proceso de enfermedad, es necesario evaluar …

Answer 1

• Perfil de expresión (proteomica, analizar cDNA por un microarreglo de RNA)
• Modificaciones postraduccionales
• Interacciones proteína-proteína
• Estructura proteica
• Función proteica

Question 2

La identificación de biomarcadores y patrones de expresión en el cáncer ha permitido estudiar…

Answer 2

• Prognosis del tumor
• Predicción
• Clasificación del tumor
• Identificación de potenciales respuestas

Question 3

procedimiento para estudiar muestras de cáncer

Answer 3

1) Extracción de la muestra (biopsia, fluidos corporales , etc.)

2) Preparación de las proteínas
I. Extracción de proteínas
II. Digestión de proteínas
III. Traslocación de proteínas

3) Espectrometria de masas (MALDI-TOF, cromatografia)

4) Análisis in silico (en bases de datos existentes)

5) Análisis de identificación y cuantificación

6) Data mining e interpretación (HeatMap)

Question 4

qué se busca en la progresión del cáncer?

Answer 4

se buscan perfiles de proteínas y diferencias en la distribución de estas en diferentes tejidos (análisis cuantitativos).

Question 5

Puntos más relevantes en el estudio del cáncer

Answer 5

Crecimiento celular descontrolado
Metástasis
Resistencia a fármacos

Question 6

Cómo se analiza el crecimiento celular descontrolado?

Answer 6

• Entender el microambiente en tejidos cancerosos (rutas metabólicas relacionadas con el
  crecimiento tumoral)
• Estudios de expresión diferencial entre un tumor y un tejido normal

Question 7

cómo son los estudios de metástasis?

Answer 7

• Estudios para encontrar una cascada de iniciación de la metastasis
• Se ha observado que se modifica la expresión del receptor de glucocorticoides
• Estos estudios permiten identificar moléculas relacionadas con la metastasis para frenar la progresión

Question 8

avances asociados a la resistencia a fármacos

Answer 8

Se ha descubierto que existen patrones de expresión proteicos específicos en la resistencia de
fármacos.
Esto puede ayudar a generar fármacos específicos contra estas proteínas clave.

Question 9

bases de datos útiles para proteómica de cáncer

Answer 9

El progreso de la investigación de CPTAC permitió la creación de otros programas:
* APOLLO
* ICPC
* GWAS
* Por caso-control

Question 10

APOLLO

Answer 10

“The Applied Proteogenomics OrganizationaL Learnings and Outcomes”
Busca unir el conocimiento de la investigación oncológica en el sistema de salud

Question 11

ICPC

Answer 11

“The International Cancer Proteogenomics Consortium”
Permite la cooperación de +10 asides para estudiar dx de cáncer en cada una de las poblaciones para intercambiar datos de dx efectivos