Cours synchrone 1 : Structure des acides aminés

Question 1

Comment appelle-t-on les molécules qui ont un comportement acide et base ?

Answer 1

Molécule amphotérique

Question 2

Quelle est la configuration chirale standard des acides aminés et quel AA fait exception ? + truc pour le sens

Answer 2

L, la glycine parce qu’il a deux H
CORN (L)
Co-R-N

Question 3

Quelle partie de l’AA détermine ses propriétés ?

Answer 3

La chaine latérale

Question 4

Nommer les 9 AA non polaires + dire dans ma tête les particularités

Answer 4

Glycine
Alanine
Valine
Leucine
Isoleucine
Méthionine (S)
Proline (Cycle avec l’amine du carbone alpha)
Phénylalanine (Cycle aromatique)
Tryptophane (Cycle aromatique + cycle avec un amine)

Question 5

Nommer les 6 AA polaires non chargés + dire dans ma tête les particularités

Answer 5

Asparigine (Amide)
Glutamine (Amide +1)
Tyrosine (Cycle aromatique + alcool)
Cystéine (S)
Serine (Alcool)
Thréonine (Alcool + 1)

Question 6

Nommer les 3 AA polaires chargés positivement + dire dans ma tête les particularités

Answer 6

Lysine (NH3+)
Arginine (Nh,NH2, NH2+)
Histidine (Cycle avec deux azotes)

Question 7

Nommer les 2 AA polaires chargés négativement + dire dans ma tête les particularités

Answer 7

Acide aspartique (COO-)
Acide glutamique (COO- + 1)

Question 8

Où se situe la chaine latérale des AA hydrophobe dans la molécule ?

Answer 8

À l’intérieur pour minimiser la surface de contact avec le solvant, donc ils n’intéragissent pas avec l’eau

Question 9

De quels groupements sont principalement composées les chaines latérales des AA hydrophobes?

Answer 9

C + NH

Question 10

De quels groupements sont principalement composées les chaines latérales des AA polaires non-chargés ?

Answer 10

OH
SH
NH2

Question 11

Où se situe les chaines latérales des AA polaires non-chargées et pourquoi ?

Answer 11

Extérieur majoritairement pour faire des ponts H avec le solvant ou intérieur si pont H possible avec la molécule

Question 12

Quel AA peut perdre ou gagner un proton dépendamment du pH? quel est le nom du groupement ?

Answer 12

Histidine (le groupement imidazole)

Question 13

À quel pH les AA polaires chargés sont chargés?

Answer 13

À pH physiologique

Question 14

Que représente le pka

Answer 14

Le pH où la qte d’acide et de base conjuguée est égale

Question 15

Comment nomme-t-on autrement le point isoélectrique et que représente t-il?

Answer 15

Zwitterion
pH où l’AA est électriquement neutre

Question 16

Quelle est la formule pour le point isoélectrique des diacides et dibasiques ?

Answer 16

pI= (pKa2+ pKa3)/2 si dibasique
pI=(pKa1+pKa2)/2 si diacide

Question 17

Où se trouve approximativement le pKa des carboxyles du carbone alpha et des amines du carbone alpha ?

Answer 17

autour de 2 pour les carboxyles
autour de 10 pour les amines

Question 18

Quel est le pka de la chaine latérale de la cystéine ?

Answer 18

8,4

Question 19

Quel est le pka de la chaine latérale de la tyrosine ?

Answer 19

10,5

Question 20

Quel est le pka de la chaine latérale de l’acide aspartique ?

Answer 20

3,9

Question 21

Quel est le pka de la chaine latérale de l’acide glutamique ?

Answer 21

4,1

Question 22

Quel est le pka de la chaine latérale de la lysine ?

Answer 22

10,5

Question 23

Quel est le pka de la chaine latérale de l’arginine

Answer 23

12

Question 24

Quel est le pka de la chaine latérale de l’histidine ?

Answer 24

6,0

Question 25

Où se situe généralement le lien peptidique ?

Answer 25

Entre le carboxyle et l’amine des carbones alpha

Question 26

Dans quel ordre nomme-t-on une protéine ?

Answer 26

de l’extrémité n terminale à l’extrémité c terminale