Régulation allostérique, mécanismes d'inhibition + cofacteurs enzymatiques Flashcards

1
Q

Où se fait généralement les enzymes allostériques dans les voies métaboliques

A

À la première étape

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Q

Expliquer les deux types d’influence de la liaison d’un substrat sur une enzyme allostérique

A

Positive : influence la conformation de la protéine, favorise la conformation R qui veut avidement lier le substrat
Négative : influence la conformation de la protéine, favorise la conformation T qui n’est pas favorable à la liaison du substrat

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3
Q

Donner un exemple d’effecteurs allostériques de la glycolyse

A

ATP avec PFK 1

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4
Q

Est-ce que les eff. allo. peuvent influencer le Vmax et le Km

A

Certainement, fait une courbe sigmoide

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5
Q

Expliquer le principe de la coopérativité

A

La liaison du premier ligand influence la liaison du 2ème ligand. Peut être de la coopérativité négative ou positive

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6
Q

Comment est-ce que la coopérativité influence la sensibilité d’une enzyme

A

Elle la rend plus sensible aux faibles variations de concentration du substrat

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7
Q

De quelle façon le couple enzyme substrat évolue-t-il pour optimiser la régulation ?

A

En adaptant le fonctionnement de l’enzyme en présence du substrat ou en modifiant la concentration de substrat dans le milieu

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8
Q

Expliquer les trois types d’inhibiteur brièvement

A

Compétitif : compétitionne avec le substrat pour se lier au site de liaison (souvent analogue chimique)
Incompétitif : L’inhibiteur lie le complexe enzyme substrat
Non-compétitif : L’inhibiteur se lie au complexe enzyme substrat ou juste à l’enzyme (pas besoin du changement conformationel pour se lier)

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9
Q

Comment sont affectés Km et Vmax dans chaque type d’inhibiteur

A

Compétitif : Vmax ne change pas, Km : Augmente
Incompétitif : Vmax diminue, Km diminue
Non-compétitif : Vmax diminue, Km ça dépend du type de non-compétitif

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10
Q

Quelle est la différence entre un inhibiteur non-compétitif pur et mixte ?

A

Pur : l’affinité (Ki) pour l’enzyme seule et l’enzyme+substrat est égale, Km reste inchangé puisque les k1 et k-1 sont diminués de la même façon.
Mixte : l’affinité (Ki) n’est pas égale pour les deux, il peut donc diminuer ou augmenter selon Ki et Ki’

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11
Q

Qu’est-ce qu’un inhibiteur irréversible? donner un exemple ?

A

L’inhibiteur se lie de façon covalente à l’enzyme et l’inactive complètement
L’aspirine

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12
Q

Quelles sont les utilités physio/médicales des inhibiteurs ?

A

Utilisée pour déterminer les mécanismes d’actions des enzymes
Utilisées comme médicament ou anti-poison

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13
Q

De quelles façons est-ce que les cofacteurs participent à la réaction enzymatique ?

A

Pour transporter ou compléter un substrat
Pour accepter un substrat
Comme composant de la structure de l’enzyme

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14
Q

De quelle nature peuvent être les cofacteurs et de quelle nature ne sont-ils pas ?

A

Ions ou des molécules minérales
Molécules organiques synthétisées par la celluule

Ils ne sont pas des protéines

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15
Q

Comment se nomme le complexe apoenzyme + cofacteur

A

Holoenzyme

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16
Q

Quelles sont les deux grandes familles de cofacteurs ?

A

Ions métalliques + Coenzymes

17
Q

Quelles sont les deux sous-familles de coenzymes et leur type de lien

A

Cosubstrats (liens faibles)
Groupes prosthétiques (forts)

18
Q

Vrai ou Faux, les coenzymes sont toujours régénérés à la fin d’une réaction enzymatique

A

Faux, les liaisons faibles (cosubstrats) ne sont pas régénérés à la fin, mais les liaisons fortes (groupes prothétiques), oui

19
Q

Décrire le fonctionnent des cosubstrats et donner un exemple général

A

Leur rôle est de transporter temporairement un groupement chimique, ils sont donc impliquer dans deux réactions consécutives (chargement/déchargement)

Les vitamines

20
Q

Quelle vitamines servant de coenzymes sont essentielles à plusieurs réactions ? donner 2 exemples

A

Les vitamines B NAD+ et NADP+ et la coenzyme A