omix Flashcards
(45 cards)
Omiks nedir?
Bir organizmadaki tüm moleküler yapıların (genler, proteinler, metabolitler vb.) bütüncül incelenmesi.
Omiks teknolojilerinin amacı nedir?
Biyolojik sistemleri sistem düzeyinde anlamak için yüksek verimli veri üretimi.
Sistem biyolojisi nedir?
Genler, proteinler ve metabolitlerin entegre analizle matematiksel modellenmesi.
Genomik neyi inceler?
Bir organizmanın tüm DNA’sını (genomunu).
Transkriptomik neyi inceler?
Bir hücrede ifade edilen tüm RNA moleküllerini.
Proteomik neyi inceler?
Bir hücrede ifade edilen tüm proteinlerin yapısını ve işlevini.
Metabolomik neyi inceler?
Bir hücredeki tüm küçük moleküllerin (metabolitlerin) profilini.
Lipidomik neyi inceler?
Bir hücredeki tüm lipid moleküllerini.
Epigenomik neyi inceler?
DNA dizisi değişmeden gen ifadesini etkileyen kimyasal modifikasyonları.
Mikrobiyomik neyi inceler?
Bir ortamda yaşayan mikroorganizma topluluklarının genetik materyalini.
İnsan Genomu Projesi neyi başardı?
İnsan genomunun tüm nükleotid dizisini belirledi.
İnsan genomunda protein kodlayan gen oranı nedir?
Yaklaşık %1.
İnsan genomundaki gen sayısı neden az şaşırttı?
Basit organizmalarla benzer sayıda gen bulundu.
İnsan ve şempanze genomları arasındaki fark ne kadardır?
Yaklaşık %1.
Neandertal genleri hangi özelliklerle ilgilidir?
Cilt, iskelet, metabolizma ve bilişsel işlevler.
Sanger dizileme nedir?
Dideoksinükleotidlerle DNA dizisini belirleyen klasik yöntem.
Yeni Nesil Dizileme (NGS) avantajları nelerdir?
Hızlı, ucuz ve paralel dizileme yapar.
NGS’nin kullanım alanları nelerdir?
Genomik, transkriptomik, epigenomik analizler.
RNA-Seq ne için kullanılır?
Gen ifade düzeylerini ve alternatif splicing’i analiz eder.
qRT-PCR ne için kullanılır?
RNA ekspresyon düzeylerini doğrulamak.
Mikrodizi (Microarray) neyi tespit eder?
Genetik varyasyonlar, gen ekspresyonu ve kopya sayısı değişiklikleri.
Kütle Spektrometrisi (MS) hangi omikslerde kullanılır?
Proteomik, metabolomik, lipidomik.
2D-Gel Elektroforez ne yapar?
Proteinleri izoelektrik nokta ve moleküler ağırlığa göre ayırır.
Western Blot ne için kullanılır?
Spesifik proteinlerin tespiti ve miktar analizi.