tema 9 Flashcards

1
Q

¿por qué es complicada la purificación?

A
  • debido a la complejidad de los organismos y al alto contenido de proteínas y otras sustancias que pueden contener en un tejido/organismo
  • debido al hecho de que las enzimas pueden formar agregados con otras moléculas
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2
Q

¿qué hay que plantearse a la hora de extraer y purificar una enzima?

A
  1. elección del material de partida: extracto celular, tejido, órgano
  2. método de ruptura celular adecuado
  3. disponer de un ensayo enzimático adecuado
  4. técnica separativa:
    - cromatográfica: filtración/intercambio iónico/afinidad
    - solubilización/insolubilización: precipitación por salado/cambio de disolvente
  5. eliminación del contaminante:
    - filtración molecular
    - diálisis
  6. criterio de pureza: dependiendo del objetivo, tener una purificación mayor o menor
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3
Q

define purificación

A

aplicación de técnicas separativas hasta quedarnos con la enzima en la que estamos interesados, separándola de las demás debido a sus características físico-químicas distintivas

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4
Q

¿para qué hay que disponer de un ensayo enzimático apropiado en el proceso de purificación?

A

para emprender la purificación es necesario tener un ensayo enzimático que nos determine la actividad de la enzima; ya que esta actividad es proporcional a la concentración de la enzima

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5
Q

características de un ensayo enzimático para una purificación

A
  • fácil de realizar, más importante que el hecho de que sea fiable o preciso
  • que sea reproducible, que se realice siempre bajo las misma condiciones, que sea comparativo
  • el sustrato debe de ser económico, estable y usarse bajo condiciones de saturación, para que la velocidad sea independiente de la [S] y proporcional a la [E]
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6
Q

¿cómo debe de ser la fuente de la enzima para la purificación?

A

la actividad enzimática/[E] varía en los distintos organismos y en los distintos tejidos de un mismo organismo
- elegir la fuente donde sea más abundante
- la fuente debe de ser lo más fresca posible
una buena elección de la fuente facilita mucho la extracción y la purificación

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7
Q

clasificación de las enzimas según su localización

A
  • en solución verdadera: permanecen en solución dentro de la estructura celular cuando son eliminados los componentes particulados (citoplasma, medio extracelular)
  • asociadas a estructuras celulares: en solución dentro de una estructura celular o asociadas al material lipoproteíco insoluble (mitocondrias, núcleo o peroxisoma)
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8
Q

técnicas para obtener un homogeneizado

A
  • homogeneización mecánica: tejido animal/vegetal MUY blando
  • homogeneización sónica: bacterias/levaduras/eritrocitos
  • homogeneización térmica: bacterias/eritrocitos/cultivos celulares
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9
Q

homogeneización mecánica

A
  • homogeneizador Potter-Elvehjem: cilindro con un embolo con las paredes esmeriladas; el simple rozamiento del tejido con las paredes produce si disolución
  • homogeneizador de aspas: mediante fuerza mecánica se rompe los tejidos
  • homgeneizador de paletas: se introduce la muestra en una bolsa y esta en una caja donde la bolsa es golpeada hasta su homogeneizado
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10
Q

homogeneización sónica

A

el choque de ondas sónicas/ultrasónicas produce un cambio de presión de miles de atmósferas
se hace uso de sonicadores
- homogeneizador tipo sonda: maquina que produce una onda y la transmite mediante una sonda
- homogeneizador baño sonizador: baño de laboratorio termostatizado cuyas paredes producen ondas

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11
Q

homogeneización térmica

A

se somete a la muestra a ciclos rápidos de congelación/descongelación. cuando el agua se congela pasa a ser cristales que dañan a las células
- ultracongeladores: congeladores que alcanzan los -80ºC
- nitrógeno líquido: alcanza hasta -195.8Cº

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12
Q

para las enzimas intracelulares, ¿qué hay que hacer antes de la rotura?

A

hay que resuspender a las células en un medio de extracción para asegurar la protección de la actividad enzimática

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13
Q

características del medio de extracción

A
  • baja Tª
  • soluciones tamponadas, con fuerza iónica adecuada
  • adición de agentes protectores: inhibidores de proteasas, protectores de grupos funcionales
  • componentes que faciliten la liberación de la enzima: detergentes
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14
Q

¿cómo conseguimos concentrar nuestra enzima a partir del homogeneizado?

A

mediante centrifugaciones diferenciales, a partir de las cuales obtenemos distintas fracciones

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15
Q

esquema de centrifugación diferencial + velocidades de centrifugación

A

600-900 xg/ 10-15 min
8 000-10 000 xg/ 20-30 min
105 000 xg/ 60 min

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16
Q

¿cuál es el requerimiento indispensable antes de proceder a la purificación?

A

que el extracto de enzima sea soluble
si tras la centrifugación diferencial se ha elegido el sobrenadante donde la enzima son solubles no hay que hacer nada; en cambio, si se elige la parte donde las enzimas son insolubles se procede a su solubilización mediante el uso de detergentes
esto es porque necesitamos que la enzima esté en una fase móvil para la purificación

17
Q

técnicas de purificación

A

(a) cromatografía
- en capa fina
- en columna:
- de exclusión molecular/filtración de gel
- de intercambio iónico
- afinidad
(b) diálisis y ultrafiltración

18
Q

define cromatografía

A

técnica separativa según las características físico-químicas diferenciales, es la técnica más usada

19
Q

esquema cromatografía en capa fina

A

en desuso

20
Q

esquema cromatografía en columna

A
21
Q

tipos de cromatrografía en columna

A

según del material del que esté empapada la columna:
- de exclusión molecular/filtración de gel
- de intercambio iónico
- de afinidad

22
Q

esquema cromatografía en columna de exclusión molecular/filtración de gel

A
23
Q

esquema cromatografía en columna de intercambio iónico

A
24
Q

esquema cromatografía en columna de afinidad

A

usada en los últimos estadíos de purificación
un ejemplo sería el uso de anticuerpos

25
Q

diálisis características

A
  • membrana de celofán
  • pasiva
  • difusión en equilibrio
  • poro de 6-14 kD
  • separación de moléculas x tamaño
  • últimos pasos
26
Q

ultrafiltración características

A
  • membrana porosa polimérica
  • activa
  • difusión forzada por presión: las moléculas no difunden sino que pasan a la fuerza
  • poros de 0,5-100 kD
  • separación de moléculas x tamaño
  • últimos pasos
27
Q

criterios de homogeneidad

A

en cada paso de la purificación debemos hacer un ensayo enzimático para determinar el éxito de la purificación
se usa la AEE como criterio de purificación, debe aumentar a medida que avanzamos con la purificación

28
Q

define rendimiento

A

cómo de eficaz ha sido la purificación

29
Q

define grado de purificación

A

cuantas veces más pura tengo la enzima con respecto al primer paso de purificación, debe de aumentar

30
Q

¿qué hacemos después de terminar una purificación?

A

se investiga la homogeneidad de la muestra mediante otros métodos analíticos:
- electroforesis
- cromatografía líquida
- focalización isoeléctrica

31
Q

¿cómo sabemos que hemos terminado de purificar?

A
  • si hemos alcanzado nuestro objetivo de purificación
  • cuando la AEE no aumenta de un paso de purificación a otro
32
Q

ver electroforesis y cromatografía líquida

A