Vragen Dirk Smit Flashcards
(5 cards)
Explain terms cluster coefficient (c) and L. Explain the connectedness in your network. Sex? Age?
Global clustering coefficient how many clusters there were in the general network = 0.32 = medium connected (0-1). Klopt omdat de meeste nodes met een aantal andere nodes connected waren, maar lang niet met allemaal.
Local clustering coefficient = how often individual nodes were part of a tight cluster or alone = 0-0.38 = nodes alone and nodes medium part of tight cluster. 0=dep2, .38=swl. sex neight naar negatieve kant: expecation: vrouwen rapporteren eerder negatieve gevoelens dan mannen ivm stigma. For wb eerder naar de high clustered nodes kijken = centrality indicies Strength. zelfde afstand tussen pos/neg = even belangrijk voor beide kanter - doe nw vergelijking in andere doelgroepen. Eenzaamheid?
MR voor mijn phenotypes:
MR is een methode om causaliteit te schatten, mbv PRS (= natuurlijk experiment met randomisatie). Bij prs studie prsmorn -> happ vinden we nu niets nog 1x testen (ook hoge mulltiple testing correction). uitlsuiting: independent factor = snps/prs morningness -> exposure = morningness -> outcome WB. + correctie voor pleiotrophy using genomicSEM (want Jones vond wel een genetic correlation). of in enlightenme: PRSmorng-> morng -> wb (te klein sample). Wel: prsWB -> wb -> light exposure!
Leg uit hoe epigentica een rol kan spelen in jouw phenotypes?
epigenetica = studie van genexpressie, dus het aan/uitzetten van genen, door histone mod, dna methylatie. aantal studies naar op cr: Zeitgebers (eten, light) kunnen effect hebben op genen die betrokken zijn bij het CR(bij bmal/cry/per1/2/3) en dat heeft vervolgens effect op CR phase amplitude. Mogelijke studie: kijk of light expousre effect heeft op epigenetics of clock genes + ook op WB. verwachting: geen effect op WB - te complext met te veel kleine effecten van miljoen kleine snps.
Small-world networks? why did not do h2 of networks?
small-worldness = netwerk waarbij je met zo min mogelijk stappen van een node naar elke andere node kan gaan - wat impliceert dat elke node met elke node verbonden is = hoge clustering. H2 wilde we doen obv tweelingen en twin corrleaties. maar kon toen nog niet
How does light work in the brain:
light -> retina -IpCPG cells -> hypothalamus -> SCN ->synchronoyseert interne klok -> met extern signaal -> stuurt dan signalen naar ander clocken eg pijnappelklier (melatonine), cortisol (nieren) , temperatuur, slaap/waak in hersenstam en slaapcentra, metabole (insuline, eetlust).
