אפיגנטיקה וסרטן

Question 1

מהם שלושת סוגי האפיגנקטיה?

Answer 1

דנ”א מתילציה

מודיפיקציה כימית על היסטונים.

רנ”א לא מקודד.

Question 2

כיצד מתווך הקשר בין מנגנוני אפיגנטיקה לבין סרטן?

Answer 2

באמצעות שינוי שעתוק או תרגום של גנים.

עליה באי יציבות גנומית

Question 3

על איזה נקולאוטיד מתרחשת מתילציה של דנ”א?

Answer 3

על ציטוזין

Question 4

DNMT3

Answer 4

אנזים המצבע מתילציה דה- נובו- על דנ”א לא ממותל.

Question 5

DNMT1

Answer 5

אחראי על שמירת מתילציה של דנ”א בעת חלוקות דנ”א.

Question 6

מי אחראי על מחיקת המתילציות?

Answer 6

TET

Question 7

מה עושה מתילציה של דנ”א?

Answer 7

השתקה של גנים, דיכוי של כרומטין.

Question 8

לאחר ביצוע מתילציה יש זיהוי שלו על ידי?

Answer 8

MBD,
הדבר מהווה פלטפורמה לגיוס חלבונים נוספים.

Question 9

איפה דנ”א עובר מתילציה?

Answer 9

CpG אי-
במצב רגיל אין מתילציה, ולכן עובר שעתוק.

גופני גנים-
עוברים מתילציה ומונעים התחלת שעתוק מאצע גן.

אלמנטים טרנפוזומליים-
עוברים מתילציה אינטנסיבית, כך שלרוב לא פעילים.

Question 10

מהו המקור של
Transposable elements

Answer 10

דנ”א ויראלי שעבר אינטגרציה לגנום האנושי לאורך האבולוציה.

Question 11

מה קורה כאשר הגנים שמקודדים ל-Transposable elements
משועתקים?

Answer 11

הם יכולים לעבור רברס טרנקריפציה חזרה לדנ”א

לעבור אינטגרציה למקום אחר בגנום.

Question 12

מהן ההשלכות של
Transposable elements

Answer 12

יצירה של גן חדש-
אם נכנס לכרומטין פעיל ופתוח.

מחיקה של גן-
כאשר הורס את מסגרת הקריאה

יצירה של שבר בדנ”א-
בזמן האינטגרציה לתוך הגנום.

Question 13

איך ה-
Transposable elements
שרדו לאורך האבולציה?

Answer 13

לטווח הארוך- מהווים מאגר של רצפים המאפשרים לנו להתפתח.

לטווח הקצר- חשובים לבקרה על ביטוי גנים בתנאי סטרס.

Question 14

מה קורה למתילציה של דנ”א בסרטן?

Answer 14

באופן כללי-
מתרחש היפומתילציה בסרטן
אזורים שלרוב ממותלים במצב רגיל- כעת לא יהיו.

פרומוטרים של אזורי
TS-
עוברים
היפר מתילציה.

Question 15

למה מוביל המצב החדש של המילציה המתרחשת בסרטן?

Answer 15

לכאוס
לחוסר יציבות גנומית.

Question 16

נוקלאוזום

Answer 16

8
היסטונים שעוטפים 150
נוקלאוטידים.

Question 17

3 מתילציות
על ליזין 4
ביהסטון 3

Answer 17

מוביל פרומוטור פעיל

Question 18

3 מתילציות
על ליזין 36
ביהסטון 3

Answer 18

מלמד על גופי גנים

Question 19

3 מתילציות
על ליזין 27
ביהסטון 3

Answer 19

מרקר לכרומטין סגור, אזורים לא פעילים בגנום.

Question 20

אצטילציה
על ליזין 27
ביהסטון 3

Answer 20

מרקר לאזורים רגולטורים אקטיבים- אינהנסורים

Question 21

מה ניתן לעשות על סמך הפרופילים הגנים של המודיפיקציות?

Answer 21

ניתן למפות את הגנום

Question 22

כלל אצבע- אצטלציה של היסטונים-

Answer 22

מתווכת אקטיבציה של שעתוק

Question 23

מי כותב את האצטליציה?

Answer 23

HAT

Question 24

מי קורא את האצטליציה?

Answer 24

BET

Question 25

מי מוחק את האצטליציה?

Answer 25

HDAC

Question 26

מה מתילציה של היסטונים עושה?

Answer 26

יכולה לאקטב או לעכב

Question 27

מה מתרחש בלוקמיות?

Answer 27

הגן MLL עובר טרנסלוקציה והוא מאבד את היכולת לעשות מתילציה לליזין 4. מצד שני מגייס את DOT1L שעושה מתילציה בליזין 79. כך נוצר אלל אחד מוטנטני ואלל אחד תקין. ויש אקטיבציה כפולה. שגורמת להפעלה של גני HOX. שהיא מונעת התמיינות של תאי דם לתאים בוגרים.

Question 28

מה התפקיד של miRNA?

Answer 28

עיכוב של תרגום- באמצעות חלבון RISC על ידי קישור לרנ"א וחסימה פיזית של הריבוזום. עיכוב תרגום- על ידי דגרדציה של miRNA קישור ל- TLR קישור לפרומוטורים של גני מטרה וגורם לאקטיבציה או עיכוב של גנים

Question 29

מה ההקשר בין miRNA וסרטן מסוג CLL?

Answer 29

ב-50% מהחולים יש מחיקה בכרומוזום 3, באיזורים המקודדים ל- miRNA בשם MIR 15\16 המהווים גנים של TS. הדבר הזה גורם לכך שגן BCL2 לא מבוקר שהוא אנקוגן. מוביל לכך שיש שרידות של תאים שאמורים לעבור אפופטוזיס.

Question 30

בתור מה משמש miR155?

Answer 30

כאונקוגן- בסרן השד כטומר סופרסור- במלנומה

Question 31

miR155 כאונקוגן

Answer 31

מתבטא בסרטן השד. מעכב את תרגום הרנ"א של VHL כך שכמות החלבון יורדת. תפקידו של VHL היא לעכב את VEGF. עיכוב של המעכב גורם ל- עליה ברמות ה- VEGF ומתרחש אנגיוגנזה.

Question 32

miR155- כטומר סופרסור

Answer 32

מעכב את חלבון SKI. תפקידו של SKI הוא לעכב את RB. ולכן פה הוא מונע את העיכוב על RB

Question 33

מה התפקיד של lncRNA

Answer 33

סיגנל רגולטורי- משעותק באינהנסור, ושולט על הסיגנל הרגולטורי מכמה מקומות שונים. Dicoy- משמש כפתיון של חלבונים. קושר חלבונים שנקשרים לדנ"א ומונע מהם לעבור אקטיבציה. מנחה חלבונים לאתר קישור. יוצר תשתית על ידי גיוס של כמה חלבונים רגולטורים לאותו מקום.

Question 34

HOTAIR

Answer 34

lncRNA. גן אונקוגני המעודד סרטן. הוא קשור חלבונים מעכבים שמעכבים את HOXD. HOXD- חלבון אנטי גרורתי. הדבר גורם להפעלת גרורות.

Question 35

PTEN1

Answer 35

lncRNA. הוא TS. נמחק בהרבה סוגי סרטן. הוא סופח אליו חלבונים שאמורים לעכב את PTEN. ובכך מונע עיכוב של PTEN.

Question 36

דור 1- תרופות אפיגנטיות

Answer 36

עיכוב של DNMT. עיכוב מתילציה. מטרתה- למנוע מתילציה על ה- TS. כדי שנוכל לעודד אפופטוזיס.

Question 37

תרופה של דור 1-

Answer 37

Vidaza – DNMT inhibitor. יש מולקולה שהיא אנלוגית לציטידין. היא מתחרה על האתר הפעיל של DNMT אך היא לא עוברת מתילציה. כך מתרחש עיכוב של מתילצית הדנ"א.

Question 38

בעיה - דור 1

Answer 38

היא לא ספציפית, תמנע מתילציה כללית על הדנ"ע. לכן יש הרבה תופעות לוואי.

Question 39

תרופות דור 2

Answer 39

תרופות שמעכבות DNMT תרופות שמעכבות את HDAC

Question 40

תרופות שמעכבות את HDAC

Answer 40

HDAC מבצע דה- אצתילציה. מעכבים את המעכב. ובכך גורמים להפעלה של גנים מסוג TS.

Question 41

דור 3

Answer 41

DNMT בשילוב עם עימונותרפיה, כימותרפיה, וטרגט טראפי

Question 42

דור 4

Answer 42

טרגוט של מולקולות ספציפיות.| readers writers מולקולות קטנות.

Question 43

pinometostat

Answer 43

דור -4. טרגט לכותבים DOT1L inhibitor DOT1L - מתיל טרנספראז המגויס ל- MLL הסרטני. מפחית מתילציה על ליזין 79 בהיסטון 3.

Question 44

Tazemetostat

Answer 44

דור -4. טרגט לכותבים EZH2 inhibitor. EZH2 - מבצע מתילציה על ליזין 27 בהיסטון 3. ובכך מעכב TS. מעכבים את המעכב.

Question 45

ODM-207

Answer 45

דור 4- טרגט לקוראים. BRD4 inhibitor. BRD4 הוא סוג של BET- קורא אצטילציה. ישנם אונקוגנים התלוים ב- BRD4. כאשר מעכבים את BRD4, הדבר מעכב את הגידול.

Question 46

miRNA in cancer therapy

Answer 46

הוא מספיק קטן ויכול להיכנס לתאים. miRNA עיכוב- התרופה מונעת קישור של ה- miRNA לקומפלקס RISC. miRNAחיקוי- לחקות TS שהלכו לאיבוד בסרטן.