intra bio mol (2) Flashcards

1
Q

sens de la polymérase

A

5’ vers 3’ TOUJOURS

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2
Q

combien d’origine de réplication ont les procaryotes

A

1 seul

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3
Q

combien d’origine de réplication ont les eucaryotes

A

plusieurs

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4
Q

Vrai ou faux, l’origine de réplication fait partie du réplicateur

A

Vrai

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5
Q

séquence propice à une origine de réplication

A

A-T

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6
Q

les deux sites de l’origine de réplication

A

9 mères et 13 mères

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7
Q

à quoi sert le site 9 mère

A

seul site spécifique de fixation
socle pour le complexe d’initiation

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8
Q

à quoi sert le site 13 mère

A

riche en A-T; lieu de séparation initiale du brin

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9
Q

3 roles des protéines initiatrices

A
  • identifier ORI et s’y lier
  • recruter protéines essentielles à la formation du complexe initiateur AVEC HÉLICASES
  • (chez les procaryotes) commencer la séparation des brins
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10
Q

chez les procaryotes, quel protéine lie spécifiquement le site 9 mère

A

DnaA

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11
Q

Vrai ou faux, chez les eucaryotes ORI est toujours à partir d’une même séquence définie

A

Faux, chez les procaryotes seulement

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12
Q

les sites 9 mères et 13 mères peuvent ils fonctionner indépendamment

A

Non, toujours liés
9 mères permet fixation socle/ protéine initiatrice
13 mères est ou l’ouverture initiale se fait

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13
Q

quel est l’équivalent de la protéine initiatrice chez l’eucaryote

A

le complexe de reconnaissance de l’ORI (ORC)

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14
Q

role du ORC

A

RECONNAITRE

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15
Q

est ce que l’ORC entame ouverture des brins

A

NON jamais, ne fait que RECONNAITRE

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16
Q

séquence de départ défini de l’ORC

A

non

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16
Q

est ce que l’ORC peut se lier au site sans que l’ADN s’ouvre

A

OUI, attend la confirmation des check-points

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16
Q

séquence idéale (ORC)

A
  • sans nucléosomes
  • riche en AT ou ilots CpG
  • séquence/ structure particuliere
  • régions impliquées dans initiation de la transcription
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17
Q

Les ORC sont elles ouvertes/ déclenchées simultanément

A

Non, ouverture séquentielle

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17
Q

role de la topoisomérase

A

réduire la tension en clivant et reparant les noeuds

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18
Q

role hélicase

A

séparer les brins complémentaires d’ADN

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19
Q

role SSB

A

maintien la stabilité des brins ouverts par l’hélicase (empeche repliement sur eux-même et formation tete épingle)

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20
Q

fonctionnement de l’hélicase

A

6 s-u; lie toutes ATP et brins, fonctionne en continue très grande efficacité, pore centrale ou passe l’ADN

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21
Q

comment fonctionne les 6 s-u de l’hélicase

A

elles fonctionnent en décalée (hydrolyse l’ATP décalé)

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22
Q

les liaisons des SSB sont elles fortes ou faibles

A

faibles, car la polymérase doit etre en mesure des retirer, juste assez fortes pour empecher liaison sur elle meme

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23
Q

les deux types de topoisomérase

A

1: clive 1 brin
2: clive 2 brins

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24
Q

ou se situe la topoisomérase sur le brin

A

toujours devant la fourche de réplication afin d’empecher les cassures causées par la tension accumulée lors de la séparation des brins

25
Q

lorsque les hélicases ont ouverts les brins (oeil de réplication) qu’arrive til ensuite

A

recrutement des primases (ARN polymérase) par les hélicases

26
Q

pourquoi l’ARN polymérase initie la polymérisation et non une ADN poly

A

car la ADN ne peut pas commencer de novo; nécessite une amorce présentant un 3’ OH libre

27
Q

qu’arrive til au ribonucléotides insérés par ARN poly

A

seront remplacés par des désoxyribonucléotides

28
Q

role du poseur d’anneau

A

guide la polymérase et l’encourage à poursuivre plus longtemps son travail (empêche de s’éloigner et de se dissocier trop tôt)

29
Q

comment on pose l’anneau

A

le poseur d’anneau hydrolyse ATP ce qui provoque ouverture anneau et son installation

30
Q

Un anneau lié à une polymérase peut il être lié par un poseur d’anneau

A

Non, pas après sa liaison à l’ADN polymérase

31
Q

quelles sont différentes ADN pol

A

procaryotes
- Pol I
- Pol III
eucaryotes
- Pol delta
- Pol epsilon
- Pol alpha

32
Q

deux types de réparation de l’ADN effectuée sur eucaryotes par Pol delta et epsilon

A
  • réparation excision base (BER)
    ou de nucléotide (NER)
33
Q

role Pol I

A

soutient Pol III (répare, change ARN en ADN)

34
Q

role Pol III

A

polymérise brin procaryotes (est la principale)

35
Q

role Pol delta

A

synthèse brin DISCONTINU et réparation NER, BER

36
Q

role Pol epsilon

A

synthèse brin CONTINU et réparation BER, NER

37
Q

role Pol alpha

A

change ARN en ADN (site de l’amorce)

38
Q

comment l’ADN poly sait si la liaison est bonne

A

la rapidité des liens H et la stabilisation, sinon retire le nucléotide et cherche le bon 1/4

39
Q

est ce que l’ADN poly distingue les rNTP des dNTP

A

oui, exclusion stérique, le OH sur ribose distingue du H

40
Q

d’ou provient l’énergie de l’ADN polymérase

A
  • bris liaison alpha/ beta- gamma (phosphodiester)
  • bris liaison beta/ gamma (phosphoester)
41
Q

ADN polymérase (3) parties de la main

A
  • paume (site catalyseur)
  • doigts (expose un nucléotide à la fois)
  • pouce (maintient)
42
Q

décrit le brin continu

A

dans le meme sens que la polymérase

43
Q

décrit le brin discontinu

A

sens inverse de la polymérase
(fragments okazaki)

44
Q

réplisome avance dans quel sens

A

dans le sens de la fourche (malgré caractère anti-parallèle de l’ADN)

45
Q

les deux polymérases travaillent dans quel sens

A

5’ vers 3’

46
Q

définie holoenzyme

A

enzyme associée à des partenaires qui favorisent son activité
ex: polymérase avec son anneau coulissant

47
Q

quelles protéines forment l’holoenzyme du pol III

A

les 3 polymérases avec leur anneau et poseur d’anneau

48
Q

comment se nomme le complexe holoenzyme et autres protéines

A

réplisome

49
Q

Vrai ou faux, si 3 polymérases, elles fonctionnent toutes en même temps

A

Faux, 2 en même temps l’autre chill

50
Q

comment se nomme la boucle qui permet à la polymérase de polymériser dans les deux sens

A

la boucle ADNsb

51
Q

lorsque la polymérase se détache, reste elle liée au réplisome

A

oui, permet de recommencer la synthèse plus rapidement

52
Q

les 3 polymérases des eucaryotes

A

delta, epsilon, alpha

53
Q

qu’est ce qui retire les ARN de l’amorce

A

RNase H

54
Q

la RNase H retire tout?

A

non sauf le dernier

55
Q

qui retire le dernier RNase H

A

exonucléase 5’

56
Q

qui remplace ARN par ADN

A

pol I chez bact. et pol alpha chez eucaryotes

57
Q

role ADN ligase

A

former liaisons phosphodiesters

58
Q

les étapes du retrait de l’amorce

A
  • pol I/ pol alpha
  • exonucléase 5
  • ADN poly
  • ligase
59
Q

Vrai ou faux, lors de l’insertion d’une erreur, si la polymérase ne la voit pas en y revenant elle peut y revenir plus tard

A

faux, never

60
Q

La distribution des histones se fait elle de façon égale?

A

Non, inégale “distributive inheritance”

61
Q

Comment savons nous ou remettre les histones

A

les H3-H4 s’associent au réplisome et se réattache au meme endroit, les dimères H2 s’ajoutent ensuite

62
Q

Les extrémités 3’ OH des chromosomes peuvent-ils être répliqués

A

Non= télomères/ télomérase (section répétitives aux extrémités)