intro à la génétique Flashcards
1
Q
def génotype
A
Information portée par le génome
2
Q
def phénotype
A
Ensemble des caractères observables
d’une cellule ou d’un organisme.
3
Q
De quoi résulte le phénotype ?
A
Du génotype et de l’enviro
4
Q
Qu’est ce qu’un locus ?
A
C’est la position physique d’un gène sur un chromosome.
5
Q
Que signifie le locus 7q31.2 ?
A
Chromosome 7, bras long (q), région 3, bande 1, sous-bande 2.
6
Q
Où est localisé le gène CFTR ?
A
locus 7q31.2
7
Q
Quel terme faut-il utiliser pour désigner une modification dans une séquence d’ADN ?
A
Variant ou variation
8
Q
Que signifie un variant en génétique ?
A
Un changement dans une séquence d’ADN par rapport à la référence, sans préjuger de sa pathogénicité.
9
Q
V ou F ?
Pour designer des modifications de la molécule d’ADN, le terme de mutation et polymorphisme peut être utilisé
A
Faux
on utilise plutot variant ou variation
10
Q
Qu’est-ce qu’un allèle ?
A
C’est une version d’une séquence d’ADN à un locus donné.
11
Q
Que signifie homozygote ?
A
Présence de deux allèles identiques à un même locus.
12
Q
Que signifie hétérozygote ?
A
Présence de deux allèles différents à un même locus.
13
Q
Quelle est la différence entre hétérozygote simple et composite ?
A
Simple : un allèle normal et un muté ; composite : deux allèles mutés mais différents.
14
Q
Que signifie hémizygote ?
A
L’allèle est présent en un seul exemplaire, comme sur le chromosome X chez l’homme.
15
Q
Quand dit-on qu’un allèle est dominant ?
A
Lorsqu’il détermine le phénotype même en présence d’un allèle différent.
16
Q
Que signifie le génotype AB si A est dominant ?
A
Le phénotype sera celui de l’allèle A.
17
Q
Dans le cas d’un allèle récessif, que faut-il pour qu’il s’exprime ?
A
Il doit être présent en deux exemplaires (génotype BB).
18
Q
Qu’est-ce que l’hétérogénéité allélique ?
A
C’est le fait qu’un même gène puisse être impliqué dans plusieurs maladies selon le type d’anomalie.
ET
Une même maladie peut être causée par plusieurs gènes
différents
19
Q
Donnez deux exemples d’hétérogénéité allélique.
A
Le gène RET :
Perte de fonction → maladie de Hirschsprung
Gain de fonction → cancer médullaire de la thyroïde
Et
L’ostéogenèse imparfaite : elle peut être causée par plusieurs gènes, avec transmission autosomique dominante, récessive ou liée à l’X.
20
Q
a
comment représente-t-on un homme non atteint dans un arbre généalogique ?
A
carré blanc
21
Q
Quel symbole désigne une femme atteinte ?
A
cercle noir
22
Q
sur un arbre géné: Comment indique-t-on une personne décédée ?
A
Un symbole barré d’une diagonale.
23
Q
arbre géné:
Qu’est-ce que le cas index ?
A
L’individu chez qui la maladie a été identifiée en premier dans la famille.
24
Q
Arbre géné: Comment est notée une grossesse en cours ?
A
losange en pointillé.
25
arbre géné:
Que signifie un demi-remplissage du symbole (moitié noire) ?
hétérozygote pour une affection récessive
26
Comment est représentée une femme conductrice pour une affection liée à l’X ?
cercle avec un point noir central.
27
Arbre géné:
Comment représente-t-on une union entre individus non apparentés ?
Par un trait horizontal simple entre les deux symboles
28
Comment note-t-on une union entre apparentés ?
Par un trait horizontal double.
29
Comment indique-t-on une union précédente ?
Par un trait barré en diagonale.
30
Comment note-t-on une filiation ?
Par un trait vertical descendant d’une union.
31
Comment sont représentés les jumeaux ?
Par des lignes obliques issues du même point d’union, avec :
trait horizontal = dizygotes
trait vertical commun = monozygotes
“?” = type inconnu
32
Qu’est-ce qu’une maladie monogénique ?
Une maladie causée par un seul gène, avec **peu d’influence de l’environnement.**
33
inverse de monogénétique
multifacorielles
34
Les maladies monogéniques sont-elles rares ou communes ?
rare
35
Qu’est-ce qu’une maladie multifactorielle ?
Une maladie due à une interaction entre prédisposition génétique et facteurs environnementaux.
36
Les maladies multifactorielle sont-elles rares ou communes ?
Communes
37
Les altérations génétiques sont-elles suffisantes seules pour provoquer une maladie multifactorielle ?
Non, elles sont insuffisantes à elles seules.
38
Comment appelle-t-on les variants impliqués dans les maladies multifactorielle ?
facteurs de susceptibilité ou de prédisposition.
39
Que signifie “maladie familiale”
maladie qui touche plusieurs membres d’une même famille sans suivre un mode de transmission mendélien.
40
Citez trois exemples de maladies multifactorielle.
Obésité, hypertension artérielle, diabète de type 2.
41
Qu’est-ce que l’agrégation familiale ?
C’est l’observation d’une fréquence plus élevée d’une maladie dans une même famille que dans la population générale.
42
Quelle est la forme statistique de la répartition des caractères multifactoriels dans la population ?
Une distribution gaussienne (courbe en cloche).
43
Comment définit-on un état “pathologique” dans une maladie multifactorielle ?
Par un seuil au-delà duquel le risque de complications augmente.
44
Quelle est la nature du paramètre “glycémie à jeun” ?
C’est un paramètre continu à héritabilité multifactorielle, distribué selon une loi gaussienne.
45
Quand considère-t-on la glycémie comme “pathologique” ?
Lorsque le risque de complications liées à l’hyperglycémie est augmenté.
46
Quel est le seuil de glycémie à jeun associé à un doublement du risque de complications ?
1,26 g/L.
47
Qu’est-ce qu’un effet de seuil dans les maladies multifactorielle ?
La maladie ne se manifeste que si un certain seuil de facteurs de risque est dépassé.
48
Citez des exemples de maladies multifactorielle à seuil.
Fente labiale, spina bifida.
49
Comment varie le risque de récurrence dans les maladies multifactorielle ?
C’est un risque moyen, qui varie selon les familles.
50
De quoi dépend le risque de récurrence ?
Le nombre d’apparentés atteints.
Du degré de parenté
51
Donne un ex dont le risque de récurrence dépend du degré de parenté
Spina bifida
52
Donne un ex dont le risque de recurrence augmente avec le nombre d'apparentés atteints
fente labiale ou labio-palatine
53
V ou F
le risque de récurrence pour une maladie multifactorielles peut être différent selon le sexe ?
Vrai
54
Quelle maladie multifactorielle est 6 fois plus fréquente chez les filles ?
La luxation congénitale de hanche.
55
3 pts a retenir sur le risque de récurrence
-Augmente avec le nombre d'apparentés atteints
-Dépend du degré de parenté
-Peut être différent selon le sexe
56
Quelle est la définition d’une maladie rare ?
incidence est inférieure à 1 sur 2 000.
57
Quelle proportion de la population est concernée par une maladie génétique rare ?
Environ 5 %, soit 1 personne sur 20.
58
Combien de personnes sont concernées par une maladie rare en France ?
Environ 3 millions.
59
Combien existe-t-il de maladies génétiques rares environ ?
Environ 8 000
60
En dehors des gènes codants, quelles autres structures peuvent être impliquées dans une maladie génétique ?
Les régions régulatrices non codantes, l’ADN mitochondrial
mécanismes épigénétiques.
61
Qu’est-ce qu’une anomalie chromosomique ?
altération du **nombre** ou de la **structure** des chromosomes.
62
Citez deux types d’anomalies chromosomiques de nombre.
Polyploïdies et aneuploïdies.
63
Citez les 6 anomalies chromosomiques de structure.
-Translocations roberstoniennes
- Translocations réciproques
- Délétions
- Duplications
- Inversions
- Insertions
64
Def polyploidie
C’est la présence de 3 (triploïdie) ou 4 (tétraploïdie) lots complets de chromosomes homologues.
65
Donnez un exemple de triploïdie.
69,XXX ou 69,XXY ou 69,XYY.
66
Quelles sont les causes possibles d’une triploïdie ?
n**on expulsion** du 2ème globule polaire
**deux spermatozoïdes fécondants**
**non-disjonction méïotique **avec spermatozoïde diploïde
67
Donnez un exemple de tétraploïdie.
92,XXYY.
68
Quelle est l’origine d’une tétraploïdie ?
Réplication de l’ADN sans division cellulaire.
69
Quelle est l’issue clinique des polyploïdies ?
fausse-couche ou un décès très précoce.
70
Def aneuploidie
Perte ou gain ne concernant qu’une paire de
chromosomes
71
Combien de chromosomes retrouve-t-on dans une aneuploïdie ?
Soit 45 (monosomie), soit 47 (trisomie).
72
Citez trois exemples de trisomies autosomiques.
Trisomie 21, trisomie 13, trisomie 18.
73
Citez deux exemples d’aneuploïdies gonosomiques.
Syndrome de Turner (45,X) et syndrome de Klinefelter (47,XXY).
74
Quel est la cause des aneuploidies ?
Non disjonction méiotique
75
Aneuploidie:
Que se passe-t-il en cas de non-disjonction en méiose I ?
Les chromosomes homologues ne se séparent pas → production de gamètes disomiques et nullisomiques.
76
Aneuploidie:
Que se passe-t-il en cas de non-disjonction en méiose II ?
Les chromatides sœurs ne se séparent pas → un gamète disomique, un nullisomique, deux normaux.
77
Quel est le FdR pple des aneuploidie ?
l'age maternel
78
Quelles sont les origines possibles des anomalies chromosomiques de structure ?
Elles peuvent être héritées ou apparaître de novo (accidentelles).
79
Qu’est-ce qu’une anomalie chromosomique équilibrée ?
Une réorganisation du matériel génétique sans perte ni gain, donnant un **phénotype normal.**
80
Quel peut être le risque des anomalies chromosomiques équilibrées ?
risque de désequilibre dans la descendance
81
Qu’est-ce qu’une anomalie chromosomique déséquilibrée ?
Une perte ou un gain de matériel génétique (trisomie partielle ou monosomie partielle).
82
Quels sont les effets d’une anomalie déséquilibrée ?
**Phénotype** **anormal** (malformations, déficience intellectuelle) ou **non-viabilité** (fausse-couche).
83
Les anomalies de structure peuvent-elles être récurrentes ?
Oui, certaines sont récurrentes et associées à des **syndromes microdélétionnels.**
84
Résumes en qlq mots les anomalies chromosomiques des structure
Peuvent être:
- Héritées ou accidentelles
- équilibrées
- déséquilibrées
- Récurrentes ou non
85
Quelles sont les causes exogènes des variants ponctuels ?
UV, radiations ionisantes, agents chimiques cancérigènes, intercalants, médicaments antitumoraux.
86
Quelle est la cause des maladies monogéniques mendéliennes ?
variants ponctuels de l'ADN
87
Quelles sont les causes endogènes des variants ponctuels ?
Radicaux libres, erreurs de recombinaison ou de réplication.
88
Citez quatre types de variants ponctuels.
Substitution, délétion, duplication, insertion, délétion-insertion, inversion
89
Qu’est-ce qu’une inversion en génétique ?
C’est le retournement d’un segment d’ADN au sein du gène (ex : c.4563_4567inv).
90
Quelle est la différence entre séquençage Sanger et séquençage haut débit ?
Le séquençage Sanger permet l’analyse détaillée d’un seul gène à la fois, tandis que le séquençage haut débit (NGS) permet l’analyse simultanée de plusieurs gènes ou de tout le génome.
91
Quelle est la prévalence des maladies monogéniques mendéliennes dans la population ?
Entre 0,5 % et 1,5 %.
92
Quelle proportion des maladies monogéniques mendéliennes sont à transmission autosomique dominante ?
70%
93
Quelle proportion des maladies monogéniques mendéliennes sont à transmission autosomique récessive ?
25%
94
Quelle proportion des maladies monogéniques mendéliennes sont liées au chromosome X ?
5%
95
autosomique récessif
ex mucoviscidose
FdR: consanguinité, pop à risque ?
96
97
Mode de transmission : Autosomique dominant
Risque pour III-13 d’être atteint : 50 %
Exemple de maladie : Maladie de Huntington
98
là jsp a toi de me dire mdrr j'aurai dit autosomique récessif mais pas sur le reste jsp à toi de m'expliquer
99
Déf pénétrance
Pourcentage de sujets porteurs de la variation
génétique et exprimant la maladie
100
Cites les facteurs à l’origine d’une pénétrance incomplète :
⌐ âge jeune (pour les maladies à révélation tardive),
⌐ facteurs génétiques modificateurs,
⌐ facteurs environnementaux,
⌐ facteurs stochastiques
101
Quelle est la différence entre pénétrance incomplète et expressivité variable ?
La pénétrance incomplète concerne l’absence ou la présence de la maladie, tandis que l’expressivité variable concerne la variabilité de la présentation clinique.
102
Qu’est-ce que l’expressivité variable ?
Variation de la sévérité ou de la nature des symptômes chez les individus atteints d’une même maladie génétique.
103
Qu’est-ce que la pseudodominance dans l’hérédité autosomique récessive ?
C’est le phénomène où une maladie récessive semble se transmettre de manière dominante en raison d’une union entre un sujet atteint (aa) et un hétérozygote (Aa).
104
Quels facteurs favorisent la pseudodominance ?
**Fréquence** élevée d’**hétérozygotes** dans la population ou **consanguinité** sur plusieurs générations.
105
Pourquoi la transmission semble-t-elle verticale sur l’arbre généalogique ?
Parce que l’union entre un malade et un hétérozygote donne un risque de transmission de 50 %, comme pour une affection dominante.
106
Pénétrance incomplète chez le parent
Ou
Variant de novo chez l’enfant
107
Qu’est-ce qu’un variant de novo ?
C’est une mutation génétique qui apparaît pour la **première fois** chez un individu, n’étant **pas héritée** des parents.
108
Quelle est la différence entre un variant de novo homogène et un variant en mosaïque ?
Le variant homogène est présent dans toutes les cellules, tandis que le variant mosaïque est présent seulement dans certaines cellules.
109
Quelle est la différence entre un variant de novo homogène et un variant en mosaïque ?
Le variant homogène est présent dans toutes les cellules, tandis que le variant mosaïque est présent seulement dans certaines cellules.
110
Comment se forme un variant de novo homogène ?
Par une modification gamétique (mutation survenue dans le spermatozoïde ou l’ovocyte **avant la fécondation)**, affectant toutes les cellules de l’individu.
111
Comment se forme un variant en mosaïque ?
Par une** modification post-zygotique** (mutation apparaissant après la fécondation), n’affectant qu’une partie des cellules.
112
Quel est l’impact clinique d’un variant en mosaïque par rapport à un variant homogène ?
Le variant en mosaïque peut entraîner une atteinte partielle ou moins sévère selon le pourcentage de cellules touchées.
113
FdR de l'apparition de variant de novo
l'âge paternel qui augmente
114
Pourquoi les variants de novo gamétiques sont-ils plus fréquents avec l’âge paternel ?
En raison de l’accumulation des erreurs de réplication dans les cellules germinales au fil des divisions spermatocytaires.
115
Qu’est-ce que le mosaïcisme somatique ?
Présence de cellules avec des génotypes différents dans les tissus somatiques d’un même individu.
116
Qu’est-ce que le mosaïcisme germinal ?
Présence de cellules mutées uniquement dans la lignée germinale (ovules ou spermatozoïdes), sans affecter les cellules somatiques.
117
Comment différencier le mosaïcisme somatique du mosaïcisme germinal ?
Le mosaïcisme somatique affecte les cellules du corps (tissus variés), tandis que le mosaïcisme germinal est limité aux cellules reproductrices.
118
A VERIFIER LES REPONSES: Mode de transmission : Liée à l’X dominante
Risque pour IV-6 : 50 %
Exemple de maladie : Incontinentia pigmenti, Syndrome de l’X fragile
119
A verifier les réponses : Mode de transmission : Liée à l’X dominante
Risque pour IV-9 : 50 %
Exemple de maladie : Incontinentia pigmenti, Syndrome de Rett
Facteur modifiant la pénétrance : Inactivation aléatoire de l’X (lyonisation)
120
Qu’est-ce que l’inactivation de l’X chez la femme ?
121
À quel stade embryonnaire se met en place l'inactivation de l'X ?
Au stade **blastocyste**, environ 5 à 7 jours après la fécondation.
122
Pourquoi parle-t-on d’inactivation aléatoire de l’X ?
Car l’inactivation peut toucher soit l**'X paternel,** soit **l'X maternel** dans chaque cellule, de manière **aléatoire**.
123
Pourquoi l'inactivation de l'X est-elle dite clonale ?
Parce que toutes les cellules issues d'une même **cellule mère conservent le même chromosome X inactivé **(soit paternel, soit maternel).
124
Quel est le pourcentage de gènes de l’X qui échappent à l’inactivation ?
Entre 15 % et 30 % des gènes de l'X restent actifs.
125
Quels gènes de l’X échappent souvent à l’inactivation ?
Les gènes de la région pseudoautosomique.
126
Qu’est-ce qu’un biais d’inactivation de l’X ?
C’est une inactivation préférentielle d’un chromosome X dans plus de 80 % des cellules, présente chez environ 10 % des femmes.
127
Quels sont les trois profils d’inactivation de l’X chez la femme ?
1) Inactivation aléatoire non biaisée (50/50),
2) Biais d'inactivation de l'X paternel (20/80),
3) Biais d'inactivation de l'X maternel (80/20).
128
Quelle proportion des femmes présente une inactivation aléatoire non biaisée de l’X ?
90%
129
Quelle est la proportion de femmes présentant un biais d’inactivation de l’X maternel ou paternel ?
Environ 5 % des femmes pour chaque type de biais (X maternel ou X paternel).
130
Comment l'inactivation biaisée de l’X influence-t-elle l'expressivité phénotypique d’une maladie liée à l’X ?
Si l’X porteur de la mutation est majoritairement inactivé, la femme est asymptomatique ; sinon, elle peut présenter des symptômes mineurs ou sévères selon le pourcentage d’activation.
131
Quelles sont les conséquences phénotypiques d'une inactivation biaisée en faveur de l'X muté ?
La femme présentera une forme plus sévère de la maladie, bien que cela reste rare.
132
Quelle est la différence entre l'expression d'une maladie autosomique dominante et récessive ?
*Dominant* : La maladie s'exprime chez les individus **hétérozygotes** (un seul allèle muté suffit).
*Récessif* : La maladie s'exprime uniquement chez les individus **homozygotes** ou **hétérozygotes composites** (les deux allèles sont mutés ou différents mais pathogènes).
133
Donnez trois exemples de maladies autosomiques dominantes.
Neurofibromatose de type 1
Achondroplasie
Hypercholestérolémie familiale
134
Donnez trois exemples de maladies autosomiques récessives.
Mucoviscidose
Hémochromatose
Phénylcétonurie
135
Comment se distribue une maladie autosomique dominante dans une famille ?
Transmission verticale, touche les deux sexes.
136
Comment se distribue une maladie autosomique récessive dans une famille ?
Transmission horizontale, touche les deux sexes.
137
Quel est le risque de récidive pour une maladie autosomique dominante ?
1/2 dans la descendance du malade
138
Quel est le risque de récidive pour une maladie autosomique récessive ?
1/4 dans la fraterie du malade
139
Quelle est la principale caractéristique génétique des maladies autosomiques dominantes ?
Variants de novo et mosaïcisme.
140
Quelle est la principale caractéristique génétique des maladies autosomiques récessives ?
Influence de la consanguinité
141
Quelle est la différence de pénétrance entre les hommes et les femmes pour les maladies liées à l'X ?
Les hommes ont généralement une pénétrance complète (hémizygotes), tandis que la pénétrance chez les femmes dépend du profil d'inactivation de l'X (faible à complète).
142
Pourquoi les hommes sont-ils plus souvent atteints par les maladies liées à l'X ?
Les hommes sont hémizygotes pour l'X (un seul X), donc toute mutation sur ce chromosome s'exprime directement.
143
Donnez deux exemples de maladies liées à l'X avec une pénétrance faible chez les femmes et complète chez l'homme
-Myopathie de
Duchenne
-Hémophilie A et B
144
Maladie de Fabry
et
Syndrome de l’X
Fragile
penetrance chez l'H et la F ?
femme moyenne
homme complète
145
Donnez un exemple de maladie liée à l’X avec une pénétrance élevée chez la femme
-Incontinentia
Pigmenti
146
Donnez 2 ex de maladie liée à l’X avec une pénétrance complète chez les femmes.
-**PCDH19** (épilepsie et déficience intellectuelle)
-**EFNB1** (syndrome craniofrontonasal)
147
Quelles sont les caractéristiques communes aux maladies liées à l’X ?
-Pas de transmission père-fils de la variation
-Homme transmet le variant à toutes ses filles
-Femme transmet le variant à 50% de ses enfants (garçon ou fille)
148
Qu’est-ce que l’interférence cellulaire chez les hommes hémizygotes pour certaines maladies liées à l’X ?
C’est le phénomène par lequel les hommes hémizygotes restent asymptomatiques en raison d'une compensation cellulaire (ex: PCDH19).
149
Pourquoi l’expressivité et la pénétrance chez les femmes sont-elles variables pour les maladies liées à l’X ?
En raison de l’inactivation aléatoire de l’un des deux chromosomes X (lyonisation).
150
Pourquoi certaines maladies liées à l’X touchent-elles principalement les femmes ?
Lorsque la maladie est létale chez les hommes (ex: Incontinentia pigmenti), seuls les embryons féminins survivent.
151
Quelle est la particularité des maladies liées à l’X avec une pénétrance complète chez les femmes ?
Ces maladies, comme le syndrome craniofrontonasal (EFNB1), se manifestent uniquement chez les femmes en raison d'une interférence cellulaire chez les hommes hémizygotes, qui les rend asymptomatiques.
152
Pour chaque arbre donne le mode de transmission
153
Qu’est-ce que l’hérédité non mendélienne ?
C’est un mode de transmission génétique qui ne suit pas les lois classiques de Mendel, incluant des phénomènes comme l’**anticipation**, la **transmission maternelle** et les** biais parentaux.**
154
Qu’est-ce que l’anticipation génétique dans l’hérédité non mendélienne ?
C’est l’augmentation de la **sévérité** ou la **précocité** d’une maladie génétique à travers les générations.
155
Donnez un exemple de maladie présentant de l’anticipation.
La maladie de Huntington, où la sévérité augmente avec la génération en raison d'une expansion de triplets.
156
Qu’est-ce que la transmission maternelle dans l’hérédité non mendélienne ?
C’est la transmission exclusivement par la mère, souvent observée dans les maladies mitochondriales.
157
Pourquoi la transmission mitochondriale est-elle toujours maternelle ?
Parce que les mitochondries proviennent exclusivement de l’ovocyte, les spermatozoïdes n’apportant que l’ADN nucléaire.
158
