mol 2

Question 1

De quel sens le nouveau brin est-il synthétisé? La lecture du vieux brin?

Answer 1

Le nouveau brin est synthétisé 5’ vers 3’,
la lecture du vieux brin se fait 3’ vers 5’.

Question 2

Qu’est-ce qu’une origine de réplication?

Answer 2

Le site spécifique ou commence la séparation des deux brins et la réplication (séquence riche en A:T).

Question 3

Combien y a-t-il d’ori pour les procaryotes? Pour les eucaryotes?

Answer 3

Une seule pour les procaryotes
Plusieurs centaines pour les eucaryotes

Question 4

Qu’est-ce qu’un réplicateur?

Answer 4

Ensemble complet des séquences suffisantes pour permettre
l’initiation de la réplication.(Eucaryotes)
ORI fait parti du réplicateur

Question 5

Qu’est-ce que le site 9-mère?

Answer 5

liaison de la protéine initiatrice (nommée DnaA chez e.coli).
o Seule protéine spécifique de séquence dans l’initiation de la réplication.
o Socle pour l’assemblage du complexe d’initiation.

Question 6

Qu’est-ce que le site 13-mère?

Answer 6

Sites « 13-mère » : lieu de la séparation initiale des brins. Séquences riches en paires
de nucléotides A:T.

Question 7

Quelles sont les 3 fonctions des protéines initiatrices?

Answer 7

 Trouver et lier l’ORI
 Recrutement des autres protéines
nécessaires à la réplication
(formation d’un complexe d’initiation
avec les hélicases)
 Chez certains organismes
(procaryotes) ouvrir
la double hélice à l’ORI

*Chez les procaryotes, DnaA lie
spécifiquement les sites 9-mère.
Lorsque DnaA est liée à l’ATP, la
protéine interagit aussi avec un site
13-mère, ce qui permet de séparer
les brins d’ADN et d’exposer une
région monocaténaire.

Question 8

Qu’est-ce que l’initiateur chez les eucaryotes?

Answer 8

L’initiateur est un complexe de six protéines, appelé le complexe de reconnaissance de l’origine de réplication (ORC)

Question 9

Quels sont les motifs structurels pour la reconnaissance de l’origine de réplication chez les eucaryotes?

Answer 9

Des séquences riches en AT ou en
ilots CpG,
 Une structure d’ADN particulière,
 Des régions libres de nucléosomes,
 Des régions impliquées dans
l’initiation de la transcription.

Question 10

Qu’est-ce que la topoisomérase?

Answer 10

enzyme
qui lie l’ADNds devant la
fourche de réplication et
réduit la tension

Question 11

Qu’est-ce que l’hélicase?

Answer 11

enzyme en forme
d’anneau qui entraîne la
séparation des brins en brisant
les liaisons H. Utilise l’ATP.

Question 12

Que font les protéines fixatrices d’ADN
monocaténaire (protéines SSB)?

Answer 12

Stabilisent les 2 brins séparés de l’ADN
matrice jusqu’à la synthèse des
nouveaux brins complémentaires. Empêche formation liens H

Question 13

Que se passerait-il sans les protéines fixatrices d’ADN?

Answer 13

la formation d’épingles
par appariement de nucléotides
complémentaires dans le même
brin d’ADN. La formation d’épingles
bloquerait la réplication.

Question 14

Comment fonctionne hélicase?

Answer 14

 Hydrolyse ATP pour son déplacement.
 Entraîne la séparation des brins
 Haute processivité (longueur d’ADN dénaturé
avant de se détacher)

Question 15

Qu’est-ce qui force la séparation des brins d’ADN lors de la réplication?

Answer 15

Chaque sous-unité possède une boucle agrippant la
charpente d’un nucléotide (sucre-P). Oblige l’ADN à
passer dans le pore central de l’enzyme

Question 16

Quels sont les 2 classes de topoisomérase?

Answer 16

Topoisomérase I et topoisomérase II

Question 17

Que fait la topoisomérase I

Answer 17

coupe et ressoude un
des brins d’ADN

Question 18

Que fait la topoisomérase II?

Answer 18

coupe et ressoude
les deux brins d’ADN

Question 19

Qu’est-ce qu’un oeil de réplication et que possède-t-elle à chaque extrémités?

Answer 19

À chaque origine de réplication, il y a formation d’un œil de réplication par les
hélicases qui ouvrent la double hélice d’ADN. Une fourche de réplication à chaque
extrémité d’un œil de réplication est le siège de l’élongation des nouveaux brins d’ADN.

Question 20

Que fait la primase?

Answer 20

ARN polymérase consacrée à la
fabrication de courtes amorces ARN (5 à 10
nucléotides) en face d’une matrice d’ADN
monocaténaire.

Question 21

Pourquoi faut-il une primase pour faire la synthèse de l’ADN?

Answer 21

Toutefois, toutes les ADN polymérases ont
besoin d’une amorce présentant un 3’-OH libre.
Elles ne peuvent pas commencer la synthèse
d’un brin de novo.

Question 22

Que font les poseurs d’anneaux coulissants?

Answer 22

Il reconnaissent l’amorce ARN et installe un anneau coulissant et une ADN polymérase

Question 23

Comment fonctionne le poseur d’anneaux coulissant

Answer 23

Se lie à l’ATP et peut ouvrir l’anneau coulissant en le liant. Le poseur d’anneau et
l’ADN polymérase
compétitionnent pour
le site de liaison.
Une fois lié à la
polymérase, l’anneau
ne peut pas être lié de
nouveau par le poseur
d’anneau.

Question 24

Que fait l’anneau coulissant?

Answer 24

Lie à l’ADN au niveau de l’amorce, s’associe
ensuite avec la polymérase et glisse avec elle.
 Permet de maintenir l’ADN polymérase sur le
brin matrice

Question 25

Quel est l'avantage de l'anneau coulissant?

Answer 25

’empêche de s’éloigner. Augmente la processivité de la polymérase !

Question 26

Que fait l'adn polymérase?

Answer 26

Ajoute des dNTP à l’extrémité 3’-OH d’un brin déjà formé selon la complémentarité des bases azotées.

Question 27

Quelles sont les ADN polymérase des procaryotes?

Answer 27

ADN polymérase I (ADN Pol I)--> Substitution des amorces ARN, réparation de l’ADN. Fonction exonucléase 5’ L’ADN polymérase III (ADN Pol III) Réplication du chromosome

Question 28

Quelles sont les ADN polymérases des eucaryotes?

Answer 28

1. ADN Pol δ -->Synthèse du brin discontinu de l’ADN ; réparation par excision de nucléotides (NER) et réparation par excision de base (BER) (Chap.4) 2. l’ADN Pol ε -->Synthèse du brin continu de l’ADN, NER et BER (Chap.4) 3. l’ADN Pol α -->Synthèse des amorces pendant la réplication de l’ADN

Question 29

Le site actif de l'ADN polymérase enregistre quoi?

Answer 29

Il enregistre l'aptitude du nucléotide entrant à former une paire A:T ou G:C Si pas les bonnes base, nucléotide s'en va et pas de polymérisation

Question 30

À quoi est dû la distinction des rNTP et des dNTP de l'ADN polymérase?

Answer 30

Cette discrimination est due à l’exclusion stérique des rNTPs du site actif de l’ADN polymérase

Question 31

Que fournit l'énergie nécessaire à l'ajout des nucléotides?

Answer 31

1)la rupture du lien avec le premier P pour former le lien phosphodiester avec la chaîne naissante 2) la rupture du lien du pyrophosphate libéré par la pyrophosphatase (Pi + Pi)

Question 32

Quels sont les 3 domaines de l'ADN polymérase?

Answer 32

1. la paume: site catalytique et vérification de l’appariement via le sillon mineur 2. les doigts: plient l’ADN matrice pour exposer un nucléotide à la fois et referment la main en cas du bon appariement dans le site catalytique 3. le pouce: aide à maintenir le tout ensemble en s’attachant à la charpente sucre-phosphate. Joue un rôle dans la processivité de l’enzyme.

Question 33

Le site catalytique de la paume est formé de quoi?

Answer 33

SITE CATALYTIQUE formé d’ions métalliques qui permettent de favoriser l’interaction entre l’amorce et le nouveau nt (A) et stabiliser le pyrophosphate produit (B)

Question 34

Qu'est-ce que le réplisome?

Answer 34

Les ADN polymérases travaillant sur chacun des brins à polymériser sont maintenues ensemble via le complexe de réplicatio

Question 35

Dans quel sens avance le réplisome?

Answer 35

Dans le sens de la fourche de réplication

Question 36

Quelles sont les caractéristiques du brin continu?

Answer 36

Brin qui peut être synthétisé en continu par l’ADN polymérase qui avance en même temps et dans la même direction que la fourche de réplication. Nécessite une amorce.

Question 37

Quelles sont les caractéristiques du brin discontinu?

Answer 37

La synthèse du nouveau brin antiparallèle est plus complexe. La polymérase se déplace sur le brin matrice 3' → 5‘, s’éloigne de la fourche de réplication en synthétisant un court fragment d’ADN (fragments d’Okazaki). Au fur et à mesure que l’œil de réplication s’agrandit, la synthèse d’un nouveau fragment démarre. Plusieurs amorces

Question 38

Les fragments d'Okazaki sont-ils plus courts ou plus longs chez les eucaryotes ou les procaryotes?

Answer 38

Procaryotes.

Question 39

L’ADN Polymérase holoenzyme (fait parti du réplisome)

Answer 39

Liaison de 2-3 ADN polymérases + leur anneau coulissant via le complexe de protéines y

Question 40

Que forme le brin discontinu?

Answer 40

Une boucle d'ADNsb (recouverte par les SSB)

Question 41

Autres constituants (protéines) du réplisome?

Answer 41

-Liaison de l'hélicase à ADN Pol II holoenzyme: augmente la vitesse de séparation des 2 brins (10X) -Interaction faible entre l'hélicase et la primase

Question 42

Qu'est-ce qui détermine la longueur des fragments d'Okazaki?

Answer 42

Interaction faible entre l’hélicase et la primase; la force de ces interactions détermine la longueur des fragments d’Okazaki (plus interaction est forte, plus les fragments seront petits).

Question 43

Comment remplace-t-on l'amorce ARN par des désoxyriobonucléotide?

Answer 43

1)RNase H dégrade les hybrides ARN-ADN et retire tous les nucléotides de l'amorce, sauf le dernier 2)Exonucléase 5': retire le dernier nt 3) ADN polymérase: comble la brèche 4)ADN ligase: attache ensemble 2 fragments d'ADN en formant une liaison phosphodiester entre 2 nucléotides ****Chez les procaryotes, l’ADN POL I possède une fonction exonucléase 5’ (permet d’enlever rNt ou dNt situé immédiatement en amont du site de synthèse).

Question 44

Que fait RNase H

Answer 44

La RNASE H dégrade les hybrides ARN/ADN. Retire tous les nucléotides de l’amorce, excepté le dernier (ne peut couper que le lien entre 2 rNt).

Question 45

Que fait exonucléase 5'

Answer 45

Une EXONUCLÉASE 5’ retire ce dernier nucléotide.

Question 46

Que fait ADN polymérase?

Answer 46

L’ADN polymérase comble la brèche

Question 47

Que fait l'ADN ligase?

Answer 47

L’ADN LIGASE attache ensemble deux fragments d’ADN en reformant une liaison phosphodiester entre deux nucléotides adjacents

Question 48

Comment les polymérase on un taux bas d'erreur?

Answer 48

L'ajout d'un nt incorrect induit un ralentissement de la catalyse donc la polymérase clive le lien retire le nt Donc, la réplication de l'ADN postréplicative qui permet de taux d'erreurs

Question 49

Que se passe-t-il avec nucléosome?

Answer 49

Tasser et déplacer Ensuite réassembler 1. On maintient les H3 et H4 au réplisome 2. recrutement pas anneaux coulissant 3. assemblage complet avec de nouveaux H2A- H2B 4. Transfert des marquers post-traductionnel sur histones

Question 50

Que se passe-t-il si on laisse une brèche dû au retrait de la dernière amorce du brin discontinu? Solution:

Answer 50

ceci résulte un raccourcissement progressif du chromosome à chaque génération cellulaire. Enzyme télomérase qui s'occupe de répliquer les bouts

Question 51

Est-ce que l'extrémité 3' d'un chromosome linéaire peut être répliqué?

Answer 51

non

Question 52

Qu'est-ce que la télomérase?

Answer 52

La télomérase est une ribonucléoprotéine (RNP), ayant une activité polymérase.

Question 53

Que fait la télomérase?

Answer 53

Permet d'allonger l'extrémité 3'OH du brin qui servait de matrice lors de la réplication Cette élongation pourrait servir de brin matrice pour la formation du brin complémentaire crée séquences répétitives complémentaires à sa propre matrice à 3' : télomères

Question 54

de quoi sont composés les télomères humains?

Answer 54

Les télomères humains sont composés d’environ 10-15kb de la répétition 5'GGTTAG'3

Question 55

Que permettent les séquences laissées simple brin par la télomérase?

Answer 55

Ces séquences sont reconnues par des protéines protectrices et permettent la formation d'une boucle

Question 56

Comment se sépare les chromosomes circulaire après la réplication?

Answer 56

Cette séparation est assurée par une ADN topoisomérase de type II --> Coupe et passe les molécules au travers de la coupure

Question 57

Quelles sont les fonctions des topoisomérases chez les eucaryotes?

Answer 57

1. Les topoisomérases I et II sont utilisées pour réduire la tension formée par l’avancée des fourches de réplication. 2. La convergence des fourches de réplication forme des caténanes (twist dans adn) qui doivent être résolues.