Cours 1 Flashcards
(32 cards)
Qu’est ce que la biochimie?
Science récente (fin du XIXème siècles)
La chimie de la matière vivante:
Description de la structure, de l’organisation et de la fonction des organismes en termes moléculaires
La biochimie s’étend des atomes constituant les molécules organiques, aux composés biochimiques permettant l’assemblage des biomolécules, telles les protéines, à la fonction de ces molécules dans le fonctionnement des cellules, des tissus et des organismes.
C’est quoi le CRISPR CAS?
les ciseaux moléculaires pour l’édition génétique
Il modifie le génome malade pour soigner le patient
Quels sont les principes fondamentaux du vivant?
ADN (transcription) - ARN (Traduction) - Protéines
Les molécules sont compartimenter par une membrane. Que fait cette membrane?
Régule les échanges entre intra et extra (échanges avec l’environnement)
Quelle age a la terre?
5 milliards d’années
Avec la découverte de la radioactivité, à la fin du XIXème siècle, l’estimation de l’âge de la terre est devenue possible. Le taux de désintégration de l’uranium-238 en Pb-206 peut être mesuré directement (à l’aide d’un compteur Geiger) et correspond à une demi-vie de 4,5 milliards d’années. L’âge d’une roche peut donc être estimé à partir de la mesure du rapport de masse entre ces isotopes d’uranium et de plomb dans la roche mère. Plusieurs estimations indépendantes utilisant différents isotopes ont donné des estimations similaires: que la terre aurait entre 4 à 5 milliards d’années.
Quel age a le plus vieux fossil de cyanobactéries
> 2,1-3,5 × 10*9 années
Quels étaients les Conditions sur la Terre prébiotique?
Atmosphère réductrice
Pas d’oxygène (O2): une atmosphère très réactive
Absence de molécules organiques complexes:
comment la vie a-t-elle pu apparaître?
Hypothèse d’Oparin & Haldane (1920)
Énergie + atmosphère prébiotique= molécules organiques complexes
C’est quoi L’expérience de Miller-Urey?
Miller (qui effectuait un doctorat sous la supervision de Urey) a reproduit l’atmosphère primitive de la Terre* en mélangeant certains gaz dans un récipient en verre, puis exposé le mélange à des décharges électriques à haute tension. Si de l’oxygène avait été présent, le ballon aurait sauté, mais Miller a plutôt préparé un mélange de gaz réducteurs tel que le méthane et l’ammoniac. La décharge électrique causant l’excitations et l’ionisation des molécules de gaz a déclenché des réactions chimiques. Le mélange complexe de produits a été séparé et analysé par chromatographie en phase gazeuse.
Quels sont les Produits de l’expérience de Miller et Urey?
Acides Acides aminés
acide formique glycine
Acide acétique isoleucine
Acide succinique proline
Acide cyanhydrique +nombreux autres (11/20 acides aminés protéionogènes)
V ou F: D’autres scientifiques s’inspirant de cette expérience démontreront que les bases (entre autres l’adénine) et des sucres retrouvés dans les acides nucléiques (ribose) peuvent être obtenues dans des conditions expérimentales “prébiotiques”.
Vrai
Avec de l’énergie et du temps, on peut créer quoi?
un environnement réducteur peut donc produire à partir de précurseurs chimiques simples des produits organiques complexes qui constituent les matériaux de base de la vie
Quel est Un exemple de chimie organique prébiotique?
L’HCN est synthétisé dans l’expérience de Miller
CO1+NH3 → HCN+H2O
CH4+NH3 → HCN+H2O
L’adénine ressemble à un pentamère d’acide
cyanhydrique (HCN)
Il y a certaines différences entre le contenu du ballon de Miller et certains modèles modernes de l’atmosphère prébiotique. Quels éléments étaient dans l’atmosphère prébiotiques?
(en ordre décroissant d’abondance):
N2
CO2
H2O
CH4
NH3
C’est quoi la Conclusion préliminaire?
La vie a évolué à partir de composés inorganiques et inanimés
Les principes chimiques fondamentaux sont donc au cœur de la biochimie
C’est quoi Abiogenèse: évolution chimique prébiotique?
L’abiogenèse est la théorie scientifique sur l’apparition de la vie à partie de composés simples organique ou inorganiques.
longtemps avant l’apparition de la vie telle qu’on la connaît…
Les petites molécules organiques (bases, acides aminés) se sont combinées pour former des polymères.
Polymères ont alors acquis la capacité de se répliquer.
Sur ces bases, c’est l’hypothèse du monde à ARN qui apparaît la plus plausible pour décrire l’apparition de la vie.
Quelle est la différence entre l’ADN et l’ARN?
L’ARN a une capacité génétique et catalytique unique indiquant qu’il ait pu être à la base des formes de vie primordiales.
L’ARN peut guider sa propre réplication et se replier seul (structure 3D).
Repliement permet l’activité catalytique.
*ARN a une meilleur capacité enzymatique alors que ADN non donc on pense que L’ARN a aussi pu être le premier matériel génétique cellulaire, avant que les cellules à ADN les fassent probablement disparaître.
Les polymères en particulier les acides nucléiques permettent quoi?
l’auto-assemblage, condition sine qua non de la transmission génétique
Leur compartimentation, via la formation de membrane, ont assuré quoi?
la stabilité/transmission de ce matériel génétique.
Ces propriétés et évènements qui caractérisent l’évolution chimique prébiotique ont permis quoi?
l’apparition de la vie «moderne».
Quels sont les relations dans L’arbre phylogénétique entre les eubactéries, archées (aussi connues sous le nom d’archaea et d’archébactéries) et eucaryotes?
l’arbre phylogénétique a été réalisé en comparant les séquences de l’ARN ribosomique des différents embranchements au sein des trois domaines de l’arbre. La parentalité évolutive entre les espèces est inférée par la comparaison de leur séquence. Des espèces très proches évolutivement ont des séquence plus similaires que les espèces éloignées.
Les eubactéries sont les bactéries classiques.
Les archées bien que similaire en forme aux eubactéries ont plusieurs similarités aux niveaux moléculaires avec les eucaryotes.
Les eubactéries et les archées ne possèdent pas de noyau.
Les eucaryotes possèdent un noyau et de organites tels que les mitochondries et les chloroplastes
Quels sont les differences entre les procaryotes et eucaryotes?
Procaryotes:
Bactéries,
Archées
1-10 µm
ADN libre et peu ou pas de compartimentation membranaire dans le cytoplasme
Eucaryotes:
Champignons, Protistes,
Animaux, Plantes
10-100 µm
Cellule animale: ADN dans le noyau et compartimentation dans le cytoplasme
Cellule végétale: Paroi cellulaire très épaisse.
Présence de chloroplastes essentiels à la photosynthèse.
Quels sont les Complexité cellulaire extraordinaire?
Les propriétés structurelles et fonctionnelles de la cellule sont conférées par les biomolécules qui la composent:
Les biomolécules sont des polymères.
Les biopolymères sont composés d’un nombre limité d’unités monomériques distinctes.
La diversité des biopolymères émane de l’agencement des monomères (nombre et ordre).
Quels sont les sous-unités monomériques?
nucléotide, acide aminé, glucose, acide gras
C’est quoi un homopolymères vs un hétéropolymères?
Les polymères composé de sous-unités monomériques identiques sont appelés homopolymères.
Les polymères composé de sous-unités monomériques distinctes sont appelés hétéropolymères.
