Cours 8

Question 1

Les lipides incluent quoi?

Answer 1

les cires, les stérols, les vitamines liposolubles, les mono-, di- et triglycérides (graisse) et les phospholipides

Question 2

_______ et _______ sont des constituants majeurs des graisses, mais on y rencontre également d’autres atomes organiques.

Answer 2

Le carbone et l’hydrogène

Question 3

Il y a plusieurs classes structurales de lipides avec des propriétés distinctes: ces propriétés ont un impact sur le comportement des membranes biologiques. Comme les membranes biologiques sont composés d’un mélange (variable) de lipides, leurs propriétés ne sont pas _________

Answer 3

homogènes

Question 4

Les lipides sont codé indirectement à travers les enzymes donc:

Answer 4

il y a donc potentiellement une grande diversité et variabilité dans la nature des lipides d’un organisme à l’autre

Question 5

Le seul lien entres les lipides est qu’ils sont tous _________

Answer 5

hydrophobe

Question 6

Quelles sont les Fonction des lipides?

Answer 6

Stockage d’énergie

Structure des membranes biologiques donc au centre de la vie

communication intracellulaire

Question 7

Quelle est la Propriété centrale des lipides?

Answer 7

leur caractère amphiphile

Le caractère amphiphile est la propriété qui a le plus large impact sur le comportement des lipides
dans l’eau. Elle détermine la nature de barrière que la membrane lipidique joue entre l’intérieur et
l’extérieur de la cellule, ce que l’on peut appeler leur rôle structural dans la formation des membranes cellulaires.

Question 8

Les lipides les plus simples sont….

Answer 8

les acides gras

Question 9

Comment est formé les acides gras?

Answer 9

Leur nature amphiphile réside dans une tête polaire composée d’un groupement acide carboxylique (sous la forme carboxylate à pH physiologique) et dans la queue non polaire composée d’une chaîne hydrocarbonées (généralement de 12-24 C).

Question 10

Comment s’appelle les 2 extrémités de l’acide gras?

Answer 10

L’extrémité carboxylique est appelée alpha (α).

L’extrémité méthylique est appelée oméga (ω). – celle la plus éloigné de la tête

Question 11

Quelle est la différence entre un acide gras saturé et insaturé?

Answer 11

Saturé – seulement liaisons simple
Insaturer = double liason cis

Question 12

Quand est-ce qu’on retrouve des acides gras insaturé trans?

Answer 12

il y a uniquement un faible pourcentage de gras trans d’origine naturelle, en particulier dans les gras animaux (particulièrement les produits laitiers et le bœuf). Les gras trans sont synthétisés par l’homme et utilisés dans l’industrie alimentaire. Il y a donc un fort pourcentage de gras trans dans les produits transformés (pizza, viennoiseries, fritures, restauration rapide etc.). Les gras trans sont susceptibles de provoquer des maladies cardiovasculaires même lorsqu’ils sont régulièrement consommés à faible dose. Ils sont donc beaucoup plus toxiques que les gras insaturés.

Question 13

Les liaisons double des acides gras sont habituellement ______

Answer 13

cis

Question 14

Les carbones sont numérotés à partir de quoi?

Answer 14

l’acide carboxylique de l’acide gras

Question 15

Quels sont les acides gras saturé et insaturé essentiels?

Answer 15

Saturé
- Caprique
- Laurique
- Myristique
- Palmitique
- Arachidique
- Cerotique

Acide gras insaturé (cis uniquement chez la plupart des organismes)
- Palmitoléique
- Oléique
- Linolénique
- Arachidonique

Question 16

Comment fonctionne la nomenclature des acide gras?

Answer 16

Chiffre 1 = # de carbone
Chiffre 2 = # de lien double
Si lien double sa va être indiqué si cis (c) ou trans (t)
Si plusieurs lien les numéros sont en ordre de sur quel carbone commence la liaison

Question 17

Comment fonctionne la température de fusion pour les acides gras?

Answer 17

Plus la chaine de carbone est longue, plus la temp est élevé. Plus il y a de lien double plus la temp diminue

Question 18

Les acides gras trans étant droits peuvent optimiser quoi?

Answer 18

la formation de leurs interactions de Van der Waals.
point de fusion plus élevé
Pas beaucoup de bactrie qui peut digéré les trans, et peut mieux etre cuit à temp plus haute

Question 19

Les triglycérides sont utilisés pour quoi?

Answer 19

le stockage des lipides

Question 20

Les triglycérides sont également connus sous le nom de _________

Answer 20

triacylglycérols ou plus simplement graisse

Question 21

La tristéarine est un triacylglycérol composé de quoi?

Answer 21

trois molécules d’acides stéariques formant chacun une liaison ester avec un des groupements hydroxyle du glycérol (C57H110O6).

Question 22

Les acides gras ont une forme cônique et auront tendances à former quoi?

Answer 22

des micelles sphériques

Question 23

Les phospholipides ont une forme cylindrique et auront tendances à former quoi?

Answer 23

Une membrane bicouche

Question 24

Les membranes sont principalement constituées de deux classes lipides amphiphiles:

Answer 24

• glycérophospholipides: coeur glycérol
• sphingolipide: coeur sphingosine

Coeur = le group qui forme liaison covalente avec acides gras

Question 25

Quelle est la forme des glycérophospholipides?

Answer 25

Centre chiral (C2) 2 acide gras (queues) R3 = ajout d’une tête polaire plus grosse La tête peut varié Les phospholipides se distinguent par les propriétés de leur queue non polaire (taille et saturation), soit R1 et R2 et par les propriétés variables de leur tête polaire soit R3.

Question 26

Quelle est la stéréochimies des glycérophospholipides?

Answer 26

Par convention le deuxième glycérol (sn-2) est toujours placé à la gauche. Le sn-1 est donc le groupement glycérol qui se retrouve en haut et le sn-3 celui qui se retrouve en bas. Donc la stéréochimie est indiquée dans le nom. Ex: sn-glycéro-1-acide phosphorique (la tête polaire est en position sn-1); sn-glycéro-3-acide phosphorique (la tête polaire est en position sn-3); ces deux molécules sont donc des énantiomères.

Question 27

Quelles sont différentes têtes polaires rencontrées chez les glycérophospho- lipides?

Answer 27

Acide phosphatidique: H- (ionisé à pH neutre) Phosphatidylethanolamine: H3N+ - CH2 - CH2 - Phosphatidylcholine: (CH3)3N+ - CH2 - CH2 Phosphatidylsérine: H3N+ - C(COOH) - CH2 - Phosphatidyl inositol: Cycle

Question 28

Le lien vers la droite de chaque groupement R3 est relié au _________

Answer 28

Phosphate du glycérophosphate

Question 29

C'est quoi un sphingolipides?

Answer 29

Dans les sphingolipides, un groupement aminodialcool (2-amino-1,3-propanediol) remplace le glycérol. Les sphingolipides contiennent nécessairement un groupement sphingosine un type de chaine hydrocarbone). Cette dernière est liée à un carbone du groupement amino dialcool, mais le groupement hydroxyle n’est pas impliqué. Les sphingolipides ont également un acide gras variable (R) qui est lié via une liaison amide.

Question 30

C'est quoi un céramide?

Answer 30

correspond à une chaine hydrocarbone variable. Sur la fonction alcool en position 1 sera ajoutée la tête polaire.

Question 31

C'est quoi une sphingomyéline?

Answer 31

Type de sphingolipide constitué d'une unité céramide liée à un résidu de choline par une liaison phosphodiester. Il constitue la gaine de myéline, mais il se retrouve également dans la membrane plasmique et certains compartiments endomembranaires

Question 32

Quelles sont les 2 parties du sphingomyéline?

Answer 32

Phosphocholine et Céramide

Question 33

C'est quoi le type de glycosphingolipides: les cérébrosides?

Answer 33

lipides construits autour de la sphingosine qui ont des saccharides (glucide ou sucre) dans leur tête polaire. Les cérébrosides comportent un ou plusieurs sucres neutres (non chargé) dans leur tête polaire. Notez bien l’absence d’un phosphate.

Question 34

C'est quoi le type de glycosphingolipides: les gangliosides?

Answer 34

Certains glycosphingolipides ont plusieurs saccharides (globosides) dans leur tête polaire. Celui ci-contre appartient à la sous-classe des gangliosides, car au moins un des mono-saccharides est chargé négativement Ont plusieurs sucres dans tete polaire et 1 d'entre eux est chargé négativement. En ayant une tete gigantesque ils interagissent moins avec d’autre lipides mais mieux entre eux les gangliosides comportent au moins deux sucres dans leur tête polaire dont l’un d’eux est obligatoirement un acide sialique (ou acide N-acétylneuraminique). Donc les gangliosides comportent au moins une charge négative. Notez bien l’absence d’un phosphate comme c’était le cas pour les cérébrosides.

Question 35

C'est quoi la différence entre les sphingosines, gagliosides et cérébroside?

Answer 35

Sphingosine = nouvelle liaison carbone Ganglioside = plusiqeurs sucres (aussi globoside) Cérébroside = 1 sucre dans la tête

Question 36

C'est quoi le cholestérol et que fait-il?

Answer 36

Le cholestérol est également un composant de la membrane plasmique chez les mammifères (les levures et les plantes ont un analogue du cholestérol) Il est cependant très différent des autres lipides, bien qu’il soit également amphiphile. Sa structure rigide et massive diminue considérablement la fluidité de la membrane. Comme sa concentration peut atteindre jusqu’à 25% du contenu en lipide de la membrane, il peut induire une rigidification significative de la membrane, entrainant des conséquences fonctionnelles Partie polaire (tête) est minuscule Partie non polaire (queue) grande car aromatiques dedans

Question 37

V ou F: les membranes biologiques ont des compositions en lipides et en protéines très variables

Answer 37

Vrai Membrane, Protéines, Lipides, Glucides Myéline 18 79 3 Membrane plasmique (globule rouge) 49 43 8 Mitochondrie (membrane externe) 52 48 0 Réticulum sarcoplasmique 67 33 0 Bactérie Gram-positive 75 25 0 Mitochondrie (membrane interne) 76 24 0

Question 38

V ou F: La composition lipidique des feuillets internes et externe est différente?

Answer 38

Vrai

Question 39

Comment fonctionne les Protéines membranaires: tonneau-b?

Answer 39

En forme de tonneau à un endroit dans la membrane La partie transmembranaire est non-polaire (hydrophobe) et les extrémités et le tonneau à l'intérieur est polaire (hydrophile) pour interagir avec acides gras Tonneau b antiparallel est souvent retrouvé dans mem et utilisé par les porines

Question 40

Comment fonctionne les Protéines membranaires: hélice-a?

Answer 40

Plusieurs hélices dans la membrane La partie transmembranaire est non-polaire (hydrophobe) et les extrémités et le tonneau à l'intérieur est polaire (hydrophile) pour interagir avec acides gras

Question 41

V ou F: Des résidus hydrophobes contigus peuvent indiquer la présence d’un passage transmembranaire.

Answer 41

Vrai

Question 42

Un indexe d’hydrophobicité peut être calculé sur la structure primaire d’une protéine en se servant de l’échelle d’hydrophobicité de ________________

Answer 42

Kyte et Doolittle (voir slide 30)

Question 43

V ou F: Certaines protéines sont ciblées vers des régions précises de la membrane

Answer 43

Vrai Ex: têtes polaire gig que rend cntact de sériosine asser defavorable donc ils se retoruve a un endroit condenser. On les appelle un radeau qui flotte sur la membrane Par exemple, les glycosphingolipides complexes sont plus épais et rigides permettant l’insertion de protéines membranaires plus épaisses que dans les domaines qui en sont exempts (riche en glycérophospholipdes par exemple). Les microdomaines formés pas les glycosphingolipides en particulier les gangliosides (GM1, GM2 et GM3) Ainsi la protéine transmembranaire 1 s’insère uniquement dans les régions de la membrane riche en glycérophospholipides. Ainsi la protéine transmembranaire 2 s’insère uniquement dans les régions de la membrane riche en glycosphingolipides complexes (gangliosides tels GM1).

Question 44

Comment est-ce que certaines protéines membranaire périphériques s'associent à la membrane?

Answer 44

certaines protéines s’associent à la membrane par la formation d’interactions non-covalentes avec certains lipides D’autres se retrouvent à la membrane via une ancre lipidique: sur le feuillet interne ou le feuillet externe

Question 45

Quels sont les noms des ancrages à la membrane les plus fréquents chez les eucaryotes?

Answer 45

Milieu extracellulaire: - Ancre GPI (est un peu différente en taille (trois acides gras) et inclut également des sucres) Cytoplasme: - Palmytoyle - N-Myristoyle - Géranylgéranyle - Farnésyle

Question 46

Comment se fait la lipidation des protéines?

Answer 46

est la plupart du temps la formation d’un lien covalent entre des acides gras et certains acides aminés de la structure primaire de la protéine en question.

Question 47

En utilisant des détergents, on peut faire quoi?

Answer 47

dissoudre les membranes et les protéines membranaires, c’est-à-dire que l’on peut solubiliser des substances hydrophobes dans le surnageant aqueux

Question 48

C'est quoi un détergent?

Answer 48

est un composé amphiphile qui forme des micelles et peut donc solubiliser les membranes et leur contenu

Question 49

C'est quoi La CMC (concentration micellaire critique) d'un détergent?

Answer 49

est la concentration à partir de laquelle les micelles se forment pour un détergent donné. On utilise habituellement les détergents à 10x leur CMC. la concentration minimal au detergent à la capacité de commencer a former des micelles pour aller solubiliser les proteins

Question 50

Cela signifie que des détergents plus faibles serait suffisant pour récupérer sous forme solubles les protéines _________

Answer 50

protéines plus faiblement associées à la membrane (en périphérie) mais qu’il faudrait un détergent plus fort pour solubiliser la protéine transmembranaire

Question 51

Pour extraire efficacement, une protéine associée à une membrane, il faut donc choisir un détergent de la force appropriées (empiriquement) et l’utiliser à 10x sa CMC. Quelle est la différence entre un faible et fort détergent?

Answer 51

Fort: dénature la protéine et c'est ionique Faible: ne dénature pas la protéine et est non-ionique. Il peut extraire les protéines de la membrane tout en maintenant leur structure native