6.pred (1.dio) Flashcards
(27 cards)
transdukcija
prijenost DNA iz stanice-donor u stanicu-recepijent pomoću bakteriofaga
konjugacija
prijenos DNA pomoću F-pilusa
vektori definicija
DNA molekule u koje možemo jednostavno integrirati (insertirati, ugraditi) fragment DNA koji želimo klonirati u svrhu umnažanja u odgovarajućem domaćinu
domaćin
organizam (najčešće bakterija E.coli) koji se koristi za umnažanje vektora odnosno vektora s insertom
kako se označava alel
specifični alel označava se brojem npr leuB6
prisutnost ili odsutnost F-faktora
navodi se na početku opisa genotipa (F’, F)
prisutnost profaga i plazmida kako se označava
zagradama
rezistencija je oznaka čega
fenotipa
inaktivacija gena insercijom
leuB::Tn10(TetR)
F-faktor
-plazmid, dvolančana kružna DNA
-može se samostalno replicirati i prenositi iz stanice donor u stanicu recipijent
-sadrži ishodište replikacije oriV, ishodište prijenosa DNA- oriT, sekevnce koje ima i u kromosomu E.coli (insercijske sekvence i transpozon), gene neophodne za konjugacijski prijenos DNA (geni tra)
muške stanice (donori)
mogu biti F+ (imaju konjugacijski plazmid)
Hfr (konjugacijski plazmid/epizom je integriran u genom bakterije)
F’ (ima konjugacijski epizom- sadrži i djelove genoma bakterije, nastaje integracijom plazmida homolognom rekombinacijom)
dcm
metilacija CCWGG sekvence
profag
genom faga koji je umetnut i integrira u kružni kromosom bakterijske DNA ili postoji kao ekstrakromosomski plazmid
genom faga koji je ugrađen u bakterijski genom
transpozon
poktretni genetički element koji sadrži i dodatne gene koji9 nisu povezani sa njihovim premještanjem, kao npr geni za rezistenciju na antibiotik
recA
kodira za protein RecA koji sudjeluje u homolognoj rekombinaciji, tj. popravku DNA koji ne rezultira pojavi mutacija, sudjeluje u SOS-odgovoru
recF i recJ
homologna rekombinacija među plazmidima
ung
kosira ua uracil-N-glikozidazu
važna kod baznog ekcizijskog popravka, cijepa N-glikozidnu vezu između baze (uracil) i šećera
dut
kodira za deoksiuridin trifosfatazu dUTPazu
alel lacΔM15
alel koji kodira za C-terminalni dio beta galaktozidaze
kada je stanica u neinduciranom stanju onda se sporadična oštećenja
popravljaju error free popravcima
homologna rekombinacija, nukleotidni
ekscizijskim i bazni ekscizijskim popravak
lacI na q
prekomjerna ekspresija lac represora LacI
shuttle-vektori
mogu se koristiti (umnažati, replicirati) u dva ili više različitih organizama (e.coli i s.cerevisiae)
pSC101
prvi platmid korišten kao vektor
prirodni plazmid u bakteriji Salmonalla panama
rezistencija na tetraciklin i ishodište replikacije
više o 9 kb, mana je što je velik
pBR322- karakteristike i koji geni se nalaze
manje od 4,5 kb, rezistencija na dva antibiotika, oko 20 plazmida po stanici e.coli
-geni; bla, tet, rep i rop
-ima puno jedinstvrnih restrikcijskih mjesta