gi Flashcards

1
Q

metode jednolikog obilježavanja molekula nukleinskih kiselina

A

pomak zareza, nasumično započivanje, PCR, transkripcija in vitro

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

detekcija neradioaktivne probe

A

neposredno (fluorescentne probe), posredno

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

metode pretraživanja genomske banke

A

komplementacija mutacije, umnažanje željene DNA PCR-om, imunološka detekcija, hibridizacijske metode

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

metode obilježavanja nukleinskih kiselina

A

radioaktivno (obilježavanje krajeva i jednoliko obilježavanje nukleinskih kiselina)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

obilježavanje krajeva nukleinskih kiselina

A

3’-kraj je uvučen (koristimo polimerazu KLenow fragment), Taq polimeraza, polinukleotid fosfataza/kinaza, terminalna deoksiribonukleotidil transferaza

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

analiza mRNA primjena

A

razina ekspresije gena, određivanje broja egzona

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

metode za analizu polimorfizma

A

RFLP, VNTR, fAFLP, RAPD, SSCP, FISH, DNA-mikropolja, DGGE (TGGE), Analiza heterodupleksa, Sekvencioniranje DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

sekvence pogodne za genetičku analizu

A

cjelokupni genom, mitohondrijska DNA, ponovljene sekvencije, specifični geni, rDNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

rDNA

A

najčešća sekvencija za genotipizaciju, sadrži jako sačuvane (konzervirane) i varijabilne regije, nalazi se u genomima svih organizma, kod prokariota imamo jednu ili više kopija (sedam u e.coli), kod eukariota više stotina uzastopno direktno ponovljenih kopija

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

sekvencioniranje DNA

A

zasniva se na mogućnosti razdvajanja obilježenih polinukleotidnih lanaca čija se duljina razlikuje u jednom nukleotidu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

postupak sekvencioniranja DNA

A

priprema DNA prije ef, dvije metode (kemijska i sangerova), vizualizacija DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

ef za sekvencioniranje

A

razdvajanje polinukleotidnih lanaca čija se duljina razlikuje za samo jedan nukleotid, poliakrilamidna, denaturirajući uvjeti

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

strategije sekvencioniranja cjelokupnog genoma

A

shotgun sekvencioniranje i hijararhijsko sekvencioniranje

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

metode sekvencioniranja DNA

A

sekvencioniranje nove generacije, kemijska metoda i Sangerova metoda

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

broj gena u kvascu

A

5800

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

što nakon sekvencioniranja?

A

genomska istraživanja(bioinformatika i eksperimentalni genomski pristupi) i ne-genomski eskperimenti

17
Q

transformirajuća DNA za transformaciju kvasca može biti

A

replikativna i nereplikativna(integrativna)

18
Q

replikativni vektori

A

YEp, YRp, YCp, YAC

19
Q

integrativni vektori

A

1.YIp- plazmidi koji ne sadrže ishodište replikacije u kvascu, za transformaciju mogu se koristiti u kružnom i lineariziranom obliku i 2.linearni fragmenti

20
Q

primjena integrativnih i replikativnih plazmida

A

precizna modifikacija kvaščevog genoma, kloniranje točno određenog gena ili neke sekvence, inaktivacija, razaranje gena (gene disruption), zamjena gena (primjena fragmenata DNA za rekombinaciju ends-out)

21
Q

svrha mutageneze in vitro

A

analiza uloge gena i proteina, proteinski i metabolički inženjering

22
Q

tehnike unošenja DNA u biljnje i životinjske stanice

A

protoplastiranje i fuzija protoplasta, injektiranje direktno u jezgru, virusi (retrovirusi)-transdukcija, liposomi-DNA okružena lipofilnim slojem, elektroporacija-kratki puls visokog napona, biolistička transformacija-bombardiranje česticama na kojima se nalazi DNA (gene gun), Agrobacterium tumefaciens-Ti plazmid, gentičke modifikacije biljaka, konjugacija između različitih vrsti

23
Q

podloga HAT

A

sadrži hipoksantin, aminopterin, timidin