Control epigenético Flashcards
(34 cards)
epigenetica
-conjunto de modificaciones quimicas y demas procesos que modifican la activida del DNA genomico sin alterar su secuencia, cambiando el patron de expresion genica, activando o silenciando genes
-tiene consecuencias en el fenotipo y puede explicar diversidad morfologica
-son heredables(no toda la info esta determinada por la secuencia de DNA)
modificación de las histonas
-modificaciones reversibles en aa especificos del N-t
-pueden cambiar la estructura de la cromatina o conducir al reconocimiento de moleculas efectoras (las histonas compactan al adn en la heterocromatina)
-el inicio de la trnascripcion queda impedida si la region promotora esta organizada en nucleosomas
codigo de histonas
-suma de las modificaciones de las histonas
-podrian extender la info potencial del material genetico, almacenandola en la cromatina de forma epigenetica
-diferente en regiones distinas del genoma
mecanismo epigeneticos
control epigenetico y sus posibles alteraciones son dificiles de descifrar
-modificacion de histonas
-remodelacion de cromatina
-organizacion espacial de la cromatina
-metilacion del dna
-miRNAs
acetilacion de histonas:
-catalizada por la histona acetil transferasa (HAT)
-se asocia con la actividad transcripcional
-abre la estructura de la cromatina permitiendo el acceso a la maquinaria de transcripcion
eliminacion del grupo acetilo en histonas
-histona desacetilasa (hdac) restaura la carga postiva de lisinas, la cromatina se compacta y es menos accesible a las proteinas reguladoras para la transcripcion (ej. HDAC1 y HDAC2 en humano
-ej. subacetilacion de la histona H4 en el cromosoma X inactivo de hembras de mamiferos
histonas no acetiladas
-a ph fisiologico, los grupos amino primarios de la cadena lateral de lisina estan protonados
-la existencia de multiples lys y arg en cada histona les confiere fuerte carga positiva, base de su interaccion con el DNA
-bajo grado de acetilacion
-cromatina mas condensada
-transcripcionalmente inactiva
-genes reprimidos, no se expresan
histonas acetiladas
-la acetilacion de las lisinas produce grupos amida, que no se protonan a ph fisiologico
-las histonas pierden cargas positivas
-la cromatina se descondensa mas facilmente
-alto grado de acetilacion
-cromatina menos condensada
-transcripcionalmente activa
-genes activos, se expresan
coactivadores con HAT
-p300/cbp
-pcaf
-actr
p300/cbp
-acetilacion a h4
-interactua con factores de transcripcion receptores hormonales, AP-1 (c-jun y c-fos) y myod
pcaf
-acetila a h3
actr
-acetila a h3 y h4
-recluta a p300/cbp y PCAF
fosforilacion de histonas
- promueve la expresion genica abriendo la estructura de la cromatina al añadir carga negativa
- en residuos de ser y treonina medianada por cinsas y eliminada por fosfatasas
remodelacion de la cromatina
proceso general de induccion de cambios en la estructura de la cromatina
-modelo de pre-vaciado
-modelo dinamico
-complejos remodeladores
cromatina
sustancia que forma los cromosomas y consiste en la combinacion de adn con proteinas
modelo prevaciado
-las histonas y los factores de transcripcion compiten por el dna y una vez que uno de ellos tome posesion, no puede ser desplazado
-ej. histonas vs tfiiid o tfiiia (transcripcion de rRNA 5s)
-los promotores libres durante la replicacion deben mantenerse ocupados por los factores de transcripcion evitando la llegada de histonas
-importante para estableer in vitro que hay una competencia mas que demostrar que efectivamente se utiliza in vivo
modelo dinamino
-existencia de factores de transcripcion que utilizan la energia proporcionada por el atp para desplazar nucleosomas
-gran numero de contactos pro-pro y pro-dna que deben ser interrumpidos para liberar histonas de la cromatina hace improbable que las histonas libres esten en equilibrio espontaneo con los octameros
-ej. factor de transcripcion gaga en el promotor de hsp de drosophila puede romper el cromosoma y relocalizarlo
la cromatina no solo empaqueta o inactiva
-algunos factores de transcripcion no pueden unirse al dna lineal pero si sobre el nucleosoma
-provocan rearreglos posteriores mediante interacciones con las histonas que resultan necesarias para la activacion transcripcional
-ej. receptores de hormonas esteroideas
complejos remodeladores de la cromatina
-tienen actividad atp asa
-permiten que activadores transcripcionales tengan acceso a sitios diana
-algunos poseen tafs
-provocan:
+cambio conformacional del dna en la superficie del octamero
+que los nucleosomas cambien su posicion(deslizamiento)
+cambio en la composicion de histonas del octamero
+perdida parcial (h2a-h2b) o total del octamero
-ej. complejo SWI/SNF
organizacion espacial de la cromatina
-la organizacion de los 46 cromosomas interfascicos humanos en el nucleo no es al azar sino que ocupan zonas especificas conocidas como territorios cromosomicos
-en general los cromosomas homologos no colocalizan
regiones ricas en genes del genoma humano
-regiones ricas en genes hacia el centro del nucleo
-la heterocromatina esta estrechamente asociada a la lamina nuclear
-ej. posibilidad de utilizar la conformacion de la cromatina para clasificar subtipo de leucemia
la posicion de un gen cambia en fx de su tasa de transcripcion
-la region de un cromosoma adyacente a un gen altamente activo transcripcionalmente abandona el territorio cromosomal cuando el gen se transcribe
-genes menos activos transcripcionalmente se mantienen dentro del territorio cromosomal cuando se transcriben
-facilitaria el acceso a las as de 100 proteinas de la maquinaria transcripcional
metilacion de dna
-reaccion catalizada por la dna metiltransferasa (DNMT) asociada con la ausencia de transcripcion
-posicion 5 de la citosina (4% del genoma)
-puede dar lugar a diferencias en la expresion de los alelos maternos y paternos, tejido especificas o en el cromosoma X silente
-ej. en adenocarcinoma pulmonar asociado al tabaco existen dif significativas en la metilacion de islas CpG
hipometilacion
necesaria pero no suficiente para transcripcion activa
