vib.genomica estructural

Question 1

determinacion de la funcion biologica e interacciones de los genes y su regulacion
descubrumiento de genes

Answer 1

genomica estructural

Question 2

identificacion y estudio de la secuencia del genoma y sus variantes, polimorfismos,mutaciones, repeticones, inserciones.
localizacion y construccion de mapas
identificar y predecir la conformacion tridimensional y funciones de las proteinas codificas

Answer 2

genomica estructural

Question 3

estudio comparativo estructural y funcional de los genomas para explicar las relaciones evolutivas y funcionales

Answer 3

genomica comparativa

Question 4

estructura del genoma

todos los sujetos que integran una especie muestran el mismo grupo de genes,si bien los diferentes poseen

Answer 4

ligeras diferencias (alelos) de muchos de estos genes

Question 5

estructura del genoma

cada especie muestra un contenido unico de informacion

Answer 5

genetica, el cual se conoce como genoma

Question 6

es el centro de todos los procesos que conciernen a los acidos nucleicos

Answer 6

apareamiento complementario de bases

Question 7

desnaturalizacion de dna

Answer 7

separacion de las 2 hebras

Question 8

Tm (t° de fusion)

Answer 8

-temperatura a la cual la doble cadena de dna se desnaturaliza
-depende de la longitud de la cadena y de la produccion de G-C
-a mayor proporcion de G-C mayot tm

Question 9

renaturalizacion del dna

fenomeno por el que 2 hebras separadas y complementarias reconstituyen

Answer 9

una doble helice

Question 10

renaturalizacion

entre 2 secuencias complementarias que previamente fueron

Answer 10

separadas por desnaturalizacion

Question 11

renaturalizacion

disminucion gradual de la

Answer 11

t°

Question 12

renaturalizacion

inicialmente se aparean algunas bases de diferentes zaonas entre las cadenas

Answer 12

complementarias y despues se extienden estas zonas mediante un mecanismo de cremallera

Question 13

hibridacion

cuando los acidos nucleicos implicados proceden de

Answer 13

fuentes diferentes

Question 14

hibridacion

no estaban previamente formando una doble cadena

ej

Answer 14

sondas de acidos nucleicos

Question 15

tm

la temperatura que corresponde a la mitad del incremento de la

Answer 15

absorbancia

Question 16

tm

una secuancia con alto contenido de GC exhibe

Answer 16

una alta tm

Question 17

complejidad de los genomas

la cinetica de renaturaliacion brinda informacion de la

Answer 17

complejidad del genoma

Question 18

complejidad de los genomas

los genomas se

Answer 18

fragmentan inicialmente

Question 19

complejidad de los genomas

cuanto menor sea el tamaño del genoma, mayor es el numero de genomas en un peso particular de dna y mas

Answer 19

probable la colision entre fragmentos complementarios

Question 20

complejidad de los genomas

concentracion inicial de DNA (c09 y tiiempo de

Answer 20

incubacion (t)

Question 21

complejidad de los genomas

una solucion con elevada (DNA) incubada por breve tiempo tiene la misma C0t que una

Answer 21

de baja (dna) incubada en un mayor lapso de tiempo

Question 22

los genomas eucariotas son mas complejos que los

Answer 22

virales y bacterianos

Question 23

los fragmentos de dna se renaturalizan a distintas

Answer 23

velocidades

Question 24

estas diferencias reflejan el hecho de que, en una preparacion de fragmentos de dna eucariota, las diferentes secuencias de

Answer 24

nucleotidos se encuentran presentes en concentraciones muy variables

Question 25

primer indicio de que el dna eucariota no es tan solo la sucesion de un gen tras otro, como

Answer 25

en bacterias o virus, si no que posee una organizacion mucho mas compleja

Question 26

SNP variaciones en un unico nucleotido presentes en al menos

Answer 26

1% de poblacion

Question 27

SNP el tipo mas

Answer 27

comun de variaciones en humanos

Question 28

-la mayoria exiten como 2 alelos alternos -2 genoms humanos elegidos al azar tienen 3 millones de diferencias en SNPs /1 cada 1000pb) 99.9% similares -pueden estar o no en la region codificante del gen

Answer 28

snp

Question 29

-cualquiera puede estar relacionado con una enfermedad pero en la region codificante (60,000) tiene mas impacto sobre la fx de la proteina -pueden no estar involucrados en la enfermedad pero si estan asociados a los genes relacionados a ella pueden usar como marcaores moleculares

Answer 29

snp

Question 30

conjunto de variaciones del adn o polimofismos que tienden a ser herdados juntos porque estan muy cerca en el mismo cromosoma (no se forman quiasmas de recombinacion entre ellos)

Answer 30

haplotipos

Question 31

combinacion de alelos o conjunto de SNPs

Answer 31

haplotipos

Question 32

cada haplotipo tiene un determinado numero de

Answer 32

variantes

Question 33

cada variante se caracteriza por un grupo especifico de alelos o SNPs que se

Answer 33

encuentran juntos en una combinacion especifica en cada cromosoma de diferentes miembros de una poblacion

Question 34

contruccion de mapas baja resolucion

Answer 34

mapa genetico

Question 35

contruccion de mapas alta resolucion

Answer 35

mapa fisico distancia real entre marcadores basada en pares de bases (secuenciacion)

Question 36

mapas geneticos (ligamiento) diagrama que muestra la posicion relativa de una secuencia o

Answer 36

gen especifico a lo largo el cromosoma

Question 37

mapas geneticos (ligamiento) dos loci cercanos en una misma hebra de dna tienden a

Answer 37

heredarse juntos (haplotipo), con baja frecuencia de recombinacion durante la meiosis

Question 38

mapas geneticos (ligamiento) 0,5 es la maxima

Answer 38

frecuencia de recombinacion de dos loci (50%) que posteriormente quedara sobre el cromosoma separados

Question 39

unidad de mapa genetico un centimorgan (abreviado cM) es la unidad de los

Answer 39

mapas geneticos de ligamiento realizados por recombinacion en eucariotas diploides

Question 40

unidad de mapa genetico se trata de una unidad indivisible: el prefijo centi en este caso no significa

Answer 40

centesima parte

Question 41

unidad de mapa genetico equivale a un 1% de frecuencia de recombinacion, a lo que es lo mismo, a

Answer 41

1 unidad de mapa

Question 42

digestion parcial el tamaño promedio de los fragmentos producidos por la digestion con la enzima de restriccion se puede

Answer 42

incrementar simplemente terminando la reaccion antes de que se complete el corte de todos los sitios de reconocimiento

Question 43

estrategia para ensamblar el genoma serie de contings en el orden correcto pero no

Answer 43

necesariamente conectados en una secuancia continia

Question 44

es un grupo de segmentos traslapantes de dna que juntos representan una region consenso de dna

Answer 44

coting

Question 45

coting se utilizan algoritmos computacionales para ensamblar contigs derivados de

Answer 45

miles de secuencias traslpantes

Question 46

coting se obtiene un redundancia de

Answer 46

5-10%

Question 47

coting el alineamiento ensambla clones contiguos y aumenta la exactitud de

Answer 47

la secuencia creando una consenso

Question 48

determinacion de la secuencia de los gaps gap filling project

Answer 48

-diseño de primers -pcr -secuenciacion

Question 49

determinacion de la secuencia de los gaps genome annotation project

Answer 49

-blast nueva secuenica vs ncbi data base -identificacion de genes ortologos -identificacion de codones de inicio y paro

Question 50

determinacion de la secuencia de los gaps genome finishing project

Answer 50

-evaluacion de la calidad de la secuencia -resecuenciacion

Question 51

anotacion del genoma proceso de añadir capas de analisis y interpretacion necesarias para extraer el significado biologico

Answer 51

de las secuencias genomicas y ponerlas en el contexto de los proceso biologicos