vc. pcr y sus variantes Flashcards

(50 cards)

1
Q

pcr,puede amplificar selectivamente una secuencia deseasa de adn de copia unica que se encuentra presente en una mezcla compleja de

A

moleculas de adn sin purificacion previa de la secuencia de interes

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2
Q

sintesis de adn durante la pcr

los primers o cebadores (oligonucleotidos) logran que solo se amplifique una zona del adn en

A

la pcr

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3
Q

sintesis de adn durante la pcr

la adn polimerasa termoestable sintetiza la hebra complementaria incorporando los deoxinucleotidos trifosfato (dNTPs) libres (A T G C) del medio de reacción, inicialmente dirigida por

A

los primers o cebadores

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4
Q

sintesis de adn durante la pcr

ciclos controlados de temperaturas de desaturalizacion,

A

alineamiento y elongacion

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5
Q

mezcla de reaccion

A

dna
primers o cebadores (oligonucleotidos)
taq polimerasa
dNTPs (A T G C)

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6
Q

aumentos de t° para romper

A

los puentes de hidrogeno

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7
Q

la t° de desnaturalizacion usualmente es de

A

94 a 95°c

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8
Q

t° mayor o igual a 90°c evitan la

A

renaturalizacion del dna

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9
Q

oligonucleotidos especificos (20-23nt) cuya secuencia es complementaria a los extremos del fragmento (zona del DNA) que se desea amplificar

A

primers o cebadores

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10
Q

al disminuir la t° los primers hibridan especificamente en los extremos de la secuencia

A

blanco

*un primer en cada hebra

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11
Q

los primers dirigen a la adn polimerasa que sintetiza la hebra complementaria incorporando

A

los nucleotidos libres ( A T G C) del medio de reacción

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12
Q

al final del 1er ciclo se obtienen

A

2 moleculas de ADN doble cadena parcial que contienen la secuencia blanco

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13
Q

solo el ADN que contiene la secuencia blanco es copiado ya que la polimerasa solo puede

A

copiar moleculas que tienen el cebador unido

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14
Q

al final de 2do ciclo se han obtenido 4 moleculas de adn doble cadena parcial que contienen

A

la secuecia blanco

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15
Q

al final del 3er ciclo se han sintetizado 8 moleculas de ADN doble cadena que contienen la

A

secuencia blanco

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16
Q

al final del 4to ciclo se han sintetizado

A

16 moleculas de ADN doble cadena que contienen la secuencia blanco

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17
Q

al final de 5to ciclo se tienen

A

32 moleculas de ADN doble cadena que contienen la secuencia blanco

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18
Q

despues de 30 ciclos hay mas de

A

1x10*9 moleculas del producto especifico y solamente 60 moleculas parcialmente doble cadena mas largas

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19
Q

tiene la capacidad de mantener cambios de temperatura ciclicos de forma precisa

A

maquina de pcr

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20
Q

pcr punto final o convencional

podemos considerar que un mayor numero de copias de dna molde da una banda mas

A

intensa del amplificado (hasta cierto punto ya que cantidades excesivas de dna molde inhiben la reaccion)

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21
Q

a mayor numero de ciclos

A

mayor cantidad del producto de pcr (amplificado)

22
Q

variantes de la pcr

A

-con adaptadores
-inversa
-mutagenesis dirigida
-rt-pcr
-tiempo real
-rt.qpcr
-multiplex

23
Q

pcr, con adaptadores

amplificar una region de and de secuencia

24
Q

pcr, con adaptadores

se unen adaptadores a los fragmentos de restricción de

A

extremos cohesivos

25
pcr, con adaptadores se añaden primers específicos para las secuencias
de los adaptadores
26
pcr, inversa permite amplificar secuencias desconocidas con la condición de que
se encuentran al lado de una secuencia desconocida
27
se refiere a una amplia variedad de técnicas in vitro que modifican la secuencia silvestre
mutagenes dirigida
28
mutagenes dirigida p, ej. cuando no hay sitios de restricción localizados en
el lugar deseado, se puede emplear un enfoque de pcr
29
mutagenes dirigida se pueden cambiar de 1 a 3 bases en un segmento de dna determinado
sintetizando primers de pcr que lleven a estos cambios
30
rt-pcr se emplean
2 enzimas polimerasas
31
rt-pcr la dna polimerasa rna dependediente (retrotranscriptasa) realiza la
síntesis de cDNA a partir de mRNA
32
rt-pcr los clones de cDNA contienen secuencias codificantes que son
discontinuas (mayoría de genes eucariotas)
33
rt-pcr después el cDNA se amplifica por
PCR (dna pol dna dependiente)
34
pcr tiempo real fluorescencia
-syber green -sondas taqman
35
no es un agente intercalante sino que se asocia a la molecula de and interactuando con la hendidura MENOR
sybergreen
36
el complejo resultante adn-syber green presenta el pico de absorción en 495nm y el de emisión en
522nm (zona verde del espectro, de ahí su nombre)
37
qpcr también conocida como pcr
cuantitativa
38
qpcr amplifica y simultaneamente cuantifica de forma absoluta el producto especifico de la
amplificación
39
qpcr a la mezcla de reacción se adiciona un fluoroforo que emite fluorescencia en función de
la abundancia del producto de amplificación
40
qpcr la medición de la fluorescencia se realiza luego de cada ciclo de amplificación y es
por esto que se le denomina pcr en tiempo real
41
numero de ciclos requeridos para que la fluorescencia especifica sobrepase la fluorescencia de fondo inespecifica
ct
42
ct inversamente proporcional a la cantidad de adn
blanco inicial
43
sondas taq man el principio de la sonda taq man se basa en la
actividad 5'-3' exonucleasa de la polimerasa
44
sondas taq man se aumenta significativamente la especificidad
de la detección
45
sondas taq man al igual que en los otros métodos de qPCR, la fluorescencia resultante de la acumulación del producto se mide durante
la fase exponencial de la pcr
46
Rt-qPCR la primera reacción de retrotranscripcion se lleva a cabo de la misma manera por la dna pol rna dependiente obteniendose el
cDNA a partir del mRNA
47
Rt-qPCR después de cDNA se amplifica por PCR
cuantitativa
48
Rt-qPCR los niveles de expresión de un gen en particular se normalizan con respecto al nivel de expresión de un gen
constitutivo para poder hacer la comparación entre muestras, tratamientos y/o condiciones de la célula
49
pcr multiplex se amplifica mas de una secuencia en una
misma reacción
50
pcr multiplex emplea 2 o + pares de primers en un unico tubo de reacción con el fin de
amplificar simultaneamente multiples segmentos de adna